More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2643 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_1945  penicillin-binding protein 1A  73.97 
 
 		 752 aa  1132    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.419198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0590  penicillin-binding protein 1A  76.11 
 
 		 762 aa  1149    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0316  penicillin-binding protein, 1A family  64.98 
 
 		 750 aa  958    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.223118 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2643  penicillin-binding protein, 1A family  100 
 
 		 755 aa  1563    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0301  1A family penicillin-binding protein  73.7 
 
 		 760 aa  1147    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0343  penicillin-binding protein, 1A family  65.29 
 
 		 774 aa  974    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.314658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0242  penicillin-binding protein, 1A family  75.24 
 
 		 730 aa  1162    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000113999  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0274  penicillin-binding protein, 1A family  40.92 
 
 		 783 aa  487  1e-136  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0392  peptidoglycan glycosyltransferase  42.36 
 
 		 742 aa  466  1e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.431383 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5259  peptidoglycan glycosyltransferase  41.47 
 
 		 743 aa  456  1e-127  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.297119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3108  peptidoglycan glycosyltransferase  41.47 
 
 		 743 aa  456  1e-127  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0981  hypothetical protein  38.18 
 
 		 786 aa  453  1.0000000000000001e-126  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.250374 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5014  peptidoglycan glycosyltransferase  41.32 
 
 		 743 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0205014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2329  glycosyl transferase family protein  40.55 
 
 		 801 aa  449  1e-125  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.212398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0176  glycosyltransferase  36.62 
 
 		 762 aa  452  1e-125  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.368405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3455  peptidoglycan glycosyltransferase  40.55 
 
 		 787 aa  445  1e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.19889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2197  putative penicillin-binding 1 (peptidoglycansynthetase) transmembrane protein, MrcA  40.75 
 
 		 838 aa  445  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.633683  decreased coverage  0.00350534 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2013  Peptidoglycan glycosyltransferase  40.13 
 
 		 834 aa  439  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.155902 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5146  peptidoglycan glycosyltransferase  40.71 
 
 		 732 aa  438  1e-121  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.725403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1888  glycosyltransferase  38.38 
 
 		 743 aa  436  1e-121  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0246487 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4618  glycosyl transferase family protein  41.1 
 
 		 728 aa  434  1e-120  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6609  glycosyl transferase family 51  36.75 
 
 		 794 aa  434  1e-120  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.911258  normal  0.0344936 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0889  glycosyl transferase family protein  35.97 
 
 		 768 aa  434  1e-120  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4361  peptidoglycan glycosyltransferase  38.56 
 
 		 857 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.885871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0388  glycosyl transferase family 51  38.1 
 
 		 740 aa  430  1e-119  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0887  peptidoglycan glycosyltransferase  37.96 
 
 		 841 aa  429  1e-119  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.24195 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4006  peptidoglycan glycosyltransferase  38.56 
 
 		 857 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237546  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1659  peptidoglycan glycosyltransferase  38.4 
 
 		 862 aa  426  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0514214  normal  0.169753 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4244  peptidoglycan glycosyltransferase  38.56 
 
 		 857 aa  425  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0164258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4835  peptidoglycan glycosyl transferase  38.56 
 
 		 826 aa  423  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.191037  normal  0.0433282 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3899  peptidoglycan glycosyltransferase  39.25 
 
 		 821 aa  425  1e-117  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2061  glycosyl transferase family protein  39.16 
 
 		 810 aa  424  1e-117  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3770  peptidoglycan glycosyltransferase  38.4 
 
 		 870 aa  424  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.345724  normal  0.277872 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5993  peptidoglycan glycosyltransferase  38.24 
 
 		 858 aa  422  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1474  glycosyl transferase family 51  36.06 
 
 		 772 aa  418  9.999999999999999e-116  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0249209  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5029  glycosyl transferase family 51  37.5 
 
 		 765 aa  417  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4259  peptidoglycan glycosyltransferase  38.71 
 
 		 888 aa  419  9.999999999999999e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.990931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2469  glycosyl transferase family protein  39.72 
 
 		 846 aa  418  9.999999999999999e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0192266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3131  glycosyltransferase  38.25 
 
 		 759 aa  418  9.999999999999999e-116  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.47312  normal  0.698693 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1080  penicillin-binding protein  38.24 
 
 		 844 aa  414  1e-114  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.366397  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3113  penicillin-binding protein  38.24 
 
 		 839 aa  414  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.988566  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2055  1A family penicillin-binding protein  38.24 
 
 		 839 aa  414  1e-114  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.635838  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1451  penicillin-binding protein  38.24 
 
 		 928 aa  414  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.49387  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2324  1A family penicillin-binding protein  38.24 
 
 		 787 aa  414  1e-114  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1363  penicillin-binding protein  38.24 
 
 		 844 aa  414  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3229  membrane carboxypeptidase/penicillin-binding protein  38.24 
 
 		 844 aa  414  1e-114  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.258839  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1305  glycosyl transferase family 51  36.51 
 
 		 767 aa  412  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.551332 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2346  penicillin-binding protein  38.24 
 
 		 844 aa  414  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4875  peptidoglycan glycosyltransferase  38.4 
 
 		 850 aa  411  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1252  glycosyltransferase  36.21 
 
 		 776 aa  410  1e-113  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.314687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3074  glycosyl transferase family 51  36.89 
 
 		 854 aa  412  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.846458 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1674  Peptidoglycan glycosyltransferase  39.49 
 
 		 846 aa  405  1e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.339847  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2081  glycosyl transferase family protein  39.65 
 
 		 846 aa  405  1e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.45351  normal  0.431878 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3220  glycosyl transferase family 51  37.29 
 
 		 785 aa  404  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259437  normal  0.206704 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4764  glycosyl transferase family 51  34.44 
 
 		 850 aa  402  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193555  normal  0.0626376 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2676  1A family penicillin-binding protein  35.85 
 
 		 795 aa  401  9.999999999999999e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.21019 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2065  glycosyl transferase family protein  38.5 
 
 		 686 aa  400  9.999999999999999e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.56119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1773  glycosyl transferase family penicillin-binding protein transpeptidase  38.3 
 
 		 698 aa  393  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.488731  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0794  penicillin-binding protein 1A, putative  34.85 
 
 		 786 aa  390  1e-107  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4058  glycosyl transferase family protein  37.38 
 
 		 678 aa  390  1e-107  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1120  glycosyl transferase family 51  35.02 
 
 		 907 aa  384  1e-105  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03455  penicillin-binding protein 1A  35.01 
 
 		 773 aa  378  1e-103  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2084  peptidoglycan glycosyltransferase  37.04 
 
 		 675 aa  379  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1300  penicillin-binding protein, 1A family  37.18 
 
 		 648 aa  375  1e-102  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.396458  hitchhiker  0.0031785 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1915  glycosyl transferase family 51  34.88 
 
 		 815 aa  375  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.70734 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0135  1A family penicillin-binding protein  36.21 
 
 		 646 aa  367  1e-100  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000146416  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0754  penicillin-binding protein, 1A family  32.85 
 
 		 818 aa  358  1.9999999999999998e-97  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000281003  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2078  penicillin-binding protein 1A  32.56 
 
 		 777 aa  353  8.999999999999999e-96  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1369  1A family penicillin-binding protein  33.8 
 
 		 765 aa  351  2e-95  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2321  1A family penicillin-binding protein  31.5 
 
 		 862 aa  350  5e-95  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.10527  normal  0.723891 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2430  1A family penicillin-binding protein  32.77 
 
 		 667 aa  349  1e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000145418  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4231  penicillin-binding protein 1A  33.33 
 
 		 748 aa  349  1e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0754  penicillin-binding protein, 1A family  33.82 
 
 		 796 aa  348  2e-94  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3136  penicillin-binding protein 1A  33.75 
 
 		 791 aa  346  1e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3274  penicillin-binding protein 1A  33.91 
 
 		 792 aa  345  1e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2534  1A family penicillin-binding protein  30.32 
 
 		 804 aa  345  2e-93  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.401637  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4831  1A family penicillin-binding protein  35.68 
 
 		 709 aa  345  2e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.982435 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5424  penicillin-binding protein 1A  35.68 
 
 		 709 aa  344  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.122893  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5438  1A family penicillin-binding protein  35.68 
 
 		 709 aa  344  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.899041 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2100  1A family penicillin-binding protein  34.05 
 
 		 661 aa  343  7e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05690  penicillin-binding protein, 1A family  33.73 
 
 		 806 aa  343  9e-93  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1128  penicillin-binding protein, 1A family  34.55 
 
 		 648 aa  342  2e-92  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1773  1A family penicillin-binding protein  35.38 
 
 		 713 aa  341  4e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0339  1A family penicillin-binding protein  35.38 
 
 		 713 aa  341  4e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0432  1A family penicillin-binding protein  35.38 
 
 		 713 aa  341  4e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1832  1A family penicillin-binding protein  35.32 
 
 		 713 aa  340  5e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.421648  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0832  1A family penicillin-binding protein  35.32 
 
 		 713 aa  340  5e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.313161  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1123  1A family penicillin-binding protein  35.32 
 
 		 713 aa  340  5e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.438177  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0214  penicillin-binding protein 1A  34.39 
 
 		 707 aa  339  9.999999999999999e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.560264 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2145  1A family penicillin-binding protein  34.5 
 
 		 710 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3949  penicillin-binding protein, 1A family  32.25 
 
 		 805 aa  336  7.999999999999999e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.665129 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0163  1A family penicillin-binding protein  33.2 
 
 		 713 aa  336  1e-90  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1696  penicillin-binding protein, 1A family  34.84 
 
 		 761 aa  336  1e-90  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.235679  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2462  penicillin-binding protein 1A  32.5 
 
 		 791 aa  336  1e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5582  1A family penicillin-binding protein  34.2 
 
 		 824 aa  335  1e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5322  1A family penicillin-binding protein  35.53 
 
 		 714 aa  335  2e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4779  1A family penicillin-binding protein  35.53 
 
 		 705 aa  335  2e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.819685 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2535  penicillin-binding protein, 1A family  34.35 
 
 		 643 aa  334  4e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0217  penicillin-binding protein, 1A family  34.54 
 
 		 643 aa  332  1e-89  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.380595  hitchhiker  0.00649941 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0444  1A family penicillin-binding protein  33.99 
 
 		 654 aa  332  1e-89  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>