More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1223 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1223  major facilitator transporter  100 
 
 		 393 aa  761    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3546  major facilitator transporter  54.47 
 
 		 398 aa  389  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38000  MFS permease  55.24 
 
 		 401 aa  375  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2509  major facilitator superfamily MFS_1  54.22 
 
 		 402 aa  372  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3062  transporter  51.72 
 
 		 389 aa  367  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0534836  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3302  transporter  51.72 
 
 		 389 aa  367  1e-100  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5822  major facilitator transporter  51.14 
 
 		 405 aa  365  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7020  major facilitator transporter  50.26 
 
 		 405 aa  364  1e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.303658  normal  0.0738208 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1474  major facilitator transporter  50.26 
 
 		 405 aa  364  1e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00116593  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6354  major facilitator transporter  50.26 
 
 		 405 aa  364  1e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.623556  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5605  major facilitator transporter  50.77 
 
 		 405 aa  362  6e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.919705 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2763  major facilitator superfamily MFS_1  52.53 
 
 		 402 aa  353  4e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.689815  normal  0.779689 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3304  major facilitator family transporter  53.02 
 
 		 398 aa  352  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4954  major facilitator transporter  50.54 
 
 		 405 aa  349  6e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.960972  normal  0.410728 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5762  major facilitator transporter  51.19 
 
 		 404 aa  348  7e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3138  major facilitator transporter  52.53 
 
 		 398 aa  347  3e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.82105 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2393  major facilitator superfamily drug efflux transporter  50.53 
 
 		 404 aa  347  3e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.988182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1589  major facilitator transporter  50.52 
 
 		 395 aa  345  7e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.24766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7383  major facilitator superfamily (MSF) transporter  51.22 
 
 		 396 aa  339  4e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0684  major facilitator family transporter  48.81 
 
 		 400 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.837842  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1982  major facilitator family transporter  48.81 
 
 		 400 aa  332  8e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.21038  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3805  major facilitator transporter  52.69 
 
 		 408 aa  331  1e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0591  major facilitator family transporter  48.81 
 
 		 400 aa  331  1e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2790  MFS permease  50.13 
 
 		 406 aa  331  2e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.68726  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3754  major facilitator transporter  47.68 
 
 		 407 aa  323  3e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.503769  normal  0.0279175 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5502  major facilitator superfamily MFS_1  51.91 
 
 		 388 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0812471  normal  0.0619637 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1438  major facilitator superfamily MFS_1  46.41 
 
 		 447 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1033  major facilitator superfamily transporter  48.22 
 
 		 413 aa  292  6e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.854206  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03770  major facilitator family (MFS) transporter  51.31 
 
 		 401 aa  288  1e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0871  major facilitator transporter  44.05 
 
 		 416 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0610  major facilitator transporter  42.06 
 
 		 399 aa  281  9e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0971506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0160  major facilitator transporter  41.8 
 
 		 399 aa  280  2e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2355  major facilitator transporter  50.39 
 
 		 399 aa  280  2e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.235883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5649  major facilitator transporter  47.85 
 
 		 400 aa  278  8e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2449  major facilitator transporter  51.94 
 
 		 399 aa  277  2e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2208  major facilitator transporter  49.12 
 
 		 399 aa  273  3e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3566  major facilitator family transporter  49.37 
 
 		 399 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3729  major facilitator transporter  40.51 
 
 		 399 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.487409  normal  0.452524 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0643  major facilitator transporter  42.35 
 
 		 385 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2743  major facilitator transporter  40.92 
 
 		 399 aa  262  6e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0608632  normal  0.943249 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3344  bicyclomycin resistance protein  40 
 
 		 392 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0949  transporter  38.9 
 
 		 406 aa  258  1e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.800881  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1014  transporter  38.9 
 
 		 406 aa  258  1e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.32709  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1182  putative transporter  38.9 
 
 		 403 aa  258  2e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000458101  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2479  major facilitator transporter  50.28 
 
 		 402 aa  256  5e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.469359 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3455  major facilitator transporter  41.07 
 
 		 399 aa  254  2.0000000000000002e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3334  major facilitator transporter  41.07 
 
 		 399 aa  254  2.0000000000000002e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3197  major facilitator transporter  41.07 
 
 		 399 aa  254  2.0000000000000002e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0912  major facilitator transporter  45.16 
 
 		 405 aa  253  4.0000000000000004e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.973164  normal  0.300944 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0970  major facilitator transporter  41.09 
 
 		 395 aa  244  1.9999999999999999e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.586357 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3162  major facilitator superfamily MFS_1  40.37 
 
 		 397 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0630  major facilitator transporter  50.67 
 
 		 409 aa  239  8e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0823424  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02536  predicted transporter  41.53 
 
 		 394 aa  237  2e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3925  major facilitator family transporter  41.53 
 
 		 394 aa  238  2e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.51646 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2190  major facilitator transporter  37.67 
 
 		 394 aa  237  2e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.637684  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2817  major facilitator family transporter  41.53 
 
 		 394 aa  237  2e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1026  major facilitator transporter  41.53 
 
 		 394 aa  237  2e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.164339 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3161  major facilitator transporter  41.92 
 
 		 394 aa  234  2.0000000000000002e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2964  major facilitator family transporter  41.26 
 
 		 394 aa  233  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4137  major facilitator superfamily MFS_1  40.96 
 
 		 389 aa  230  2e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3408  major facilitator transporter  41.67 
 
 		 431 aa  231  2e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000015695  normal  0.276957 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3120  major facilitator family transporter  40.61 
 
 		 422 aa  230  2e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00127728  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1462  major facilitator transporter  38.66 
 
 		 400 aa  231  2e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.22661 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2956  major facilitator superfamily MFS_1  42.42 
 
 		 419 aa  230  3e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.127266  hitchhiker  0.000719262 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1242  major facilitator transporter  39.13 
 
 		 433 aa  230  3e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3303  major facilitator superfamily MFS_1  42.78 
 
 		 419 aa  229  4e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00459923  normal  0.0115406 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2654  major facilitator superfamily MFS_1  37.56 
 
 		 399 aa  229  5e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.400382  normal  0.458588 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1506  major facilitator transporter  38.74 
 
 		 404 aa  228  1e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2803  major facilitator family transporter  41.8 
 
 		 394 aa  228  2e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.188499  normal  0.0180883 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1473  major facilitator transporter  38.38 
 
 		 389 aa  224  2e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2079  major facilitator transporter  40.51 
 
 		 399 aa  223  7e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.154057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2929  major facilitator family transporter  40.42 
 
 		 394 aa  220  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3118  major facilitator family protein  40.21 
 
 		 394 aa  220  3.9999999999999997e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.126701 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3012  major facilitator family transporter  40.42 
 
 		 394 aa  219  3.9999999999999997e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00472083 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2995  major facilitator family transporter  40.42 
 
 		 394 aa  219  3.9999999999999997e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00244716 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0212  major facilitator transporter  41.84 
 
 		 427 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000448649  unclonable  0.0000000000115228 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2797  major facilitator transporter  43.51 
 
 		 427 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0004999  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0309  major facilitator transporter  43.51 
 
 		 427 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000378785  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2274  major facilitator superfamily transporter  37.03 
 
 		 411 aa  217  2.9999999999999998e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.670451  hitchhiker  0.000000383306 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3465  MFS transporter  38.81 
 
 		 405 aa  216  4e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3428  major facilitator family transporter  38.81 
 
 		 399 aa  216  4e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0289  major facilitator transporter  43.24 
 
 		 427 aa  216  4e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000369004  unclonable  0.0000000000514998 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2960  major facilitator family transporter  40.98 
 
 		 394 aa  216  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0152929 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5771  major facilitator superfamily MFS_1  45.05 
 
 		 413 aa  216  4e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.926843 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3326  major facilitator superfamily MFS_1  40.92 
 
 		 406 aa  216  5e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3320  putative transporter  38.81 
 
 		 399 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2467  transporter, putative  38.81 
 
 		 399 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3465  major facilitator family transporter  38.81 
 
 		 399 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0386  putative transporter  38.81 
 
 		 399 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1246  putative transporter  38.81 
 
 		 399 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.580202  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3738  major facilitator transporter  42.43 
 
 		 399 aa  216  7e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.346583 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1197  major facilitator family transporter  38.7 
 
 		 399 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1704  major facilitator transporter  37.5 
 
 		 426 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.136946  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0024  major facilitator transporter  38.15 
 
 		 383 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0151304 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3539  major facilitator superfamily MFS_1  38.5 
 
 		 415 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3477  major facilitator transporter  41.76 
 
 		 405 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.222248  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0257  major facilitator superfamily MFS_1  39.19 
 
 		 403 aa  213  4.9999999999999996e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.209561  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2415  major facilitator transporter  40.87 
 
 		 415 aa  212  1e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0245324  normal  0.166892 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3482  major facilitator superfamily MFS_1  40.83 
 
 		 406 aa  212  1e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0894  major facilitator superfamily MFS_1  38.56 
 
 		 399 aa  210  3e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0703604  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>