More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1080 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1080  ribonuclease PH  100 
 
 		 246 aa  504  9.999999999999999e-143  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2280  ribonuclease PH  76.17 
 
 		 238 aa  380  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.865381 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1960  ribonuclease PH  76.6 
 
 		 238 aa  379  1e-104  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0244748  normal  0.445772 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2159  ribonuclease PH  75.74 
 
 		 238 aa  376  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0019254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0477  RNAse PH  74.47 
 
 		 244 aa  374  1e-103  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4105  ribonuclease PH  72.38 
 
 		 243 aa  369  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.12332  normal  0.156755 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0957  ribonuclease PH  72.38 
 
 		 246 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.88797  normal  0.461387 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0518  ribonuclease PH  72.38 
 
 		 246 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0997  ribonuclease PH  72.38 
 
 		 246 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2705  tRNA nucleotidyltransferase  76.27 
 
 		 241 aa  370  1e-101  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0869  ribonuclease PH  70.71 
 
 		 246 aa  365  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2403  ribonuclease PH  71.97 
 
 		 246 aa  366  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4325  ribonuclease PH  74.17 
 
 		 243 aa  367  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1339  ribonuclease PH  74.17 
 
 		 243 aa  367  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0852  ribonuclease PH  74.47 
 
 		 238 aa  366  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0159871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0857  ribonuclease PH  70.71 
 
 		 246 aa  364  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2477  ribonuclease PH  72.77 
 
 		 239 aa  362  3e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.804398  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0858  ribonuclease PH  70.66 
 
 		 244 aa  359  2e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1584  ribonuclease PH  71.19 
 
 		 243 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0923  ribonuclease PH  71.01 
 
 		 244 aa  356  1.9999999999999998e-97  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0027923 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1629  ribonuclease PH  72.08 
 
 		 243 aa  356  1.9999999999999998e-97  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.230363  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0813  ribonuclease PH  70.76 
 
 		 243 aa  354  7.999999999999999e-97  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.696355  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2098  ribonuclease PH  70.76 
 
 		 243 aa  354  7.999999999999999e-97  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3051  ribonuclease PH  70.76 
 
 		 243 aa  354  7.999999999999999e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3017  ribonuclease PH  70.76 
 
 		 243 aa  354  7.999999999999999e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.109379  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1966  ribonuclease PH  70.76 
 
 		 243 aa  354  7.999999999999999e-97  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.211424  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2646  ribonuclease PH  70.76 
 
 		 243 aa  354  7.999999999999999e-97  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2951  ribonuclease PH  70.76 
 
 		 243 aa  353  1e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.304043  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3087  ribonuclease PH  71.19 
 
 		 246 aa  352  4e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.775447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0903  ribonuclease PH  70.29 
 
 		 246 aa  350  1e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.398117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0705  ribonuclease PH  71.19 
 
 		 241 aa  348  4e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.531661 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02369  ribonuclease PH  72.15 
 
 		 241 aa  348  6e-95  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0667  ribonuclease PH  70.34 
 
 		 246 aa  347  9e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.500053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3270  ribonuclease PH  70.26 
 
 		 241 aa  342  4e-93  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3579  ribonuclease PH  67.48 
 
 		 253 aa  340  1e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.114203  normal  0.335877 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3851  ribonuclease PH  68.51 
 
 		 238 aa  339  2.9999999999999998e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.92407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0043  ribonuclease PH  69.36 
 
 		 238 aa  338  5.9999999999999996e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0845  ribonuclease PH  68.07 
 
 		 241 aa  330  2e-89  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0758  ribonuclease PH  68.07 
 
 		 241 aa  330  2e-89  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2446  ribonuclease PH  67.37 
 
 		 238 aa  329  2e-89  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354995 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0973  ribonuclease PH  65.53 
 
 		 238 aa  320  9.000000000000001e-87  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0066  ribonuclease PH  64.41 
 
 		 238 aa  320  1.9999999999999998e-86  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2960  ribonuclease PH  64.41 
 
 		 239 aa  319  1.9999999999999998e-86  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.552332  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70420  ribonuclease PH  64.98 
 
 		 239 aa  314  7e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6110  ribonuclease PH  64.98 
 
 		 239 aa  314  8e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.229557  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0548  ribonuclease PH  63.4 
 
 		 238 aa  313  9.999999999999999e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4361  ribonuclease PH  62.77 
 
 		 239 aa  313  1.9999999999999998e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.889932  hitchhiker  0.00892611 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0010  ribonuclease PH  63.29 
 
 		 241 aa  312  2.9999999999999996e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0051  ribonuclease PH  64.94 
 
 		 243 aa  312  3.9999999999999997e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.264051  normal  0.249454 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3463  ribonuclease PH  64.94 
 
 		 237 aa  311  4.999999999999999e-84  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2474  ribonuclease PH  63.2 
 
 		 242 aa  310  9e-84  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3488  ribonuclease PH  64.26 
 
 		 237 aa  308  4e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3844  ribonuclease PH  64.26 
 
 		 237 aa  308  5.9999999999999995e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3024  ribonuclease PH  62.55 
 
 		 243 aa  306  1.0000000000000001e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2343  ribonuclease PH  64.38 
 
 		 242 aa  306  2.0000000000000002e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1977  ribonuclease PH  64.38 
 
 		 242 aa  306  2.0000000000000002e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.87042  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02850  ribonuclease PH  63.52 
 
 		 239 aa  306  2.0000000000000002e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3683  ribonuclease PH  61.18 
 
 		 239 aa  305  6e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0449428 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2872  ribonuclease PH  64.07 
 
 		 237 aa  305  6e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.51038  normal  0.0590595 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2442  ribonuclease PH  60.85 
 
 		 239 aa  304  7e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.987543  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4024  ribonuclease PH  67.8 
 
 		 243 aa  303  2.0000000000000002e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0385  ribonuclease PH  63.29 
 
 		 239 aa  302  3.0000000000000004e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0971657  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0112  ribonuclease PH  63.83 
 
 		 237 aa  302  4.0000000000000003e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4386  ribonuclease PH  60.76 
 
 		 239 aa  301  5.000000000000001e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0782226 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0319  ribonuclease PH  62.13 
 
 		 237 aa  301  5.000000000000001e-81  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0207  ribonuclease PH  61.28 
 
 		 238 aa  301  6.000000000000001e-81  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2191  ribonuclease PH  62.98 
 
 		 238 aa  300  1e-80  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.184109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3604  ribonuclease PH  62.29 
 
 		 237 aa  300  1e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0352  ribonuclease PH  62.29 
 
 		 237 aa  300  1e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.666936 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3777  ribonuclease PH  62.29 
 
 		 237 aa  300  1e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4256  ribonuclease PH  61.86 
 
 		 237 aa  299  2e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0456  ribonuclease PH  62.13 
 
 		 237 aa  300  2e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2035  ribonuclease PH  62.07 
 
 		 238 aa  299  2e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4389  ribonuclease PH  61.8 
 
 		 247 aa  299  3e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000316498  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1292  ribonuclease PH  65.2 
 
 		 238 aa  299  3e-80  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0523013  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1994  ribonuclease PH  60.17 
 
 		 235 aa  298  5e-80  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1989  ribonuclease PH  60.17 
 
 		 235 aa  298  5e-80  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3206  ribonuclease PH  61.7 
 
 		 245 aa  298  5e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2882  ribonuclease PH  64.26 
 
 		 237 aa  296  1e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1221  ribonuclease PH  64.26 
 
 		 241 aa  297  1e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0468806  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3361  ribonuclease PH  61.44 
 
 		 239 aa  297  1e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.32981  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0254  ribonuclease PH  66.35 
 
 		 238 aa  296  2e-79  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.41574 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3580  ribonuclease PH  61.02 
 
 		 238 aa  296  2e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0213  ribonuclease PH  61.11 
 
 		 240 aa  296  3e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0320  ribonuclease PH  61.02 
 
 		 237 aa  295  3e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1865  ribonuclease PH  60.85 
 
 		 238 aa  295  4e-79  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2154  ribonuclease PH  60.85 
 
 		 238 aa  295  4e-79  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4568  ribonuclease PH  63.4 
 
 		 237 aa  295  5e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000188043 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0077  ribonuclease PH  60.68 
 
 		 240 aa  295  5e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5547  ribonuclease PH  59.66 
 
 		 240 aa  295  5e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.376694 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0378  ribonuclease PH  63.4 
 
 		 237 aa  294  9e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000579905 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3965  ribonuclease PH  61.7 
 
 		 238 aa  294  1e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0503837  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04048  ribonuclease PH  60 
 
 		 237 aa  293  1e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2684  ribonuclease PH  61.04 
 
 		 245 aa  293  2e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0123009  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4282  ribonuclease PH  61.02 
 
 		 237 aa  293  2e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.887311  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3443  ribonuclease PH  61.44 
 
 		 239 aa  292  4e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.12235  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3507  ribonuclease PH  61.44 
 
 		 239 aa  292  4e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15390  ribonuclease PH  60.5 
 
 		 246 aa  291  5e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.547924  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5342  ribonuclease PH  59.24 
 
 		 240 aa  291  6e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.452896  normal  0.0235575 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3836  ribonuclease PH  62.55 
 
 		 237 aa  291  6e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>