More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2767 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013457  VEA_001560  putative oxidoreductase oxygen dependent FAD-dependent protein  63.26 
 
 
461 aa  638    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1506  FAD linked oxidase-like  80.04 
 
 
461 aa  783    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.290263  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2767  FAD linked oxidase domain-containing protein  100 
 
 
461 aa  946    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0847094 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1488  FAD linked oxidase domain-containing protein  62.47 
 
 
461 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3469  FAD linked oxidase-like protein  61.69 
 
 
463 aa  603  1.0000000000000001e-171  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5365  FAD linked oxidase domain-containing protein  62.47 
 
 
464 aa  600  1e-170  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.874918 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2335  FAD linked oxidase-like  58.94 
 
 
474 aa  584  1.0000000000000001e-165  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.822844  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0773  putative FAD/FMN-containing oxidoreductase  62.91 
 
 
462 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.563549  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4422  FAD linked oxidase domain-containing protein  57.33 
 
 
479 aa  558  1e-158  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.344156  normal  0.908517 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2459  FAD linked oxidase-like  57.52 
 
 
479 aa  560  1e-158  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.6744  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2203  FAD linked oxidase domain protein  57.52 
 
 
479 aa  557  1e-157  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.614292  normal  0.138199 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4454  FAD linked oxidase domain protein  61.39 
 
 
462 aa  554  1e-156  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0421641  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1992  FAD linked oxidase domain protein  56.19 
 
 
479 aa  547  1e-154  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.918522 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1606  FAD linked oxidase domain-containing protein  56.43 
 
 
472 aa  540  9.999999999999999e-153  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.935495 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3463  FAD linked oxidase domain protein  57.17 
 
 
465 aa  516  1.0000000000000001e-145  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1804  FAD linked oxidase-like  49.46 
 
 
473 aa  464  1e-129  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1025  FAD linked oxidase domain protein  51.11 
 
 
465 aa  452  1.0000000000000001e-126  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3377  FAD linked oxidase-like  46.62 
 
 
473 aa  435  1e-121  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0469731  normal  0.191861 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2962  FAD linked oxidase domain protein  47.69 
 
 
465 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0158537  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2737  FAD linked oxidase domain protein  46.92 
 
 
459 aa  405  1e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000391962  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2408  FAD linked oxidase domain protein  45.81 
 
 
469 aa  387  1e-106  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.359898  decreased coverage  0.00141792 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4138  FAD linked oxidase domain protein  44.81 
 
 
470 aa  384  1e-105  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2627  FAD linked oxidase domain protein  45.08 
 
 
468 aa  384  1e-105  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0898791  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1085  FAD linked oxidase-like  42.67 
 
 
478 aa  383  1e-105  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.439426  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3657  FAD linked oxidase domain protein  47.87 
 
 
456 aa  382  1e-104  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0260627  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1926  FAD linked oxidase domain protein  43.98 
 
 
476 aa  380  1e-104  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47869  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4911  FAD linked oxidase domain-containing protein  47.89 
 
 
465 aa  377  1e-103  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1775  FAD linked oxidase-like protein  44.96 
 
 
463 aa  374  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.719303 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4023  FAD linked oxidase domain protein  42.64 
 
 
602 aa  372  1e-102  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1762  FAD linked oxidase domain protein  41.7 
 
 
499 aa  366  1e-100  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000896481 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1030  FAD linked oxidase domain protein  44.86 
 
 
477 aa  367  1e-100  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1864  FAD linked oxidase domain protein  43.98 
 
 
458 aa  366  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.105212  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5399  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.32 
 
 
478 aa  368  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2398  FAD linked oxidase domain protein  44.54 
 
 
461 aa  355  5.999999999999999e-97  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.349533  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3462  FAD linked oxidase domain protein  43.29 
 
 
477 aa  354  2e-96  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1637  FAD linked oxidase, N-terminal  45.53 
 
 
461 aa  354  2e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1407  FAD linked oxidase-like  44.49 
 
 
460 aa  352  5.9999999999999994e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0426  FAD linked oxidase-like protein  42.51 
 
 
465 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1360  FAD/FMN-containing dehydrogenase  39.61 
 
 
473 aa  341  1e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00315473  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0071  FAD linked oxidase domain protein  43.08 
 
 
466 aa  335  1e-90  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4415  FAD linked oxidase, N-terminal  44.64 
 
 
456 aa  330  2e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1304  FAD linked oxidase domain protein  44.49 
 
 
456 aa  325  8.000000000000001e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0717469  normal  0.684944 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3750  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.63 
 
 
444 aa  318  2e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.589145  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04780  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  38.43 
 
 
469 aa  292  7e-78  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.62663  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11743  oxidoreductase  38.61 
 
 
461 aa  292  1e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0117669  normal  0.752588 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2260  FAD linked oxidase domain protein  42.09 
 
 
466 aa  291  2e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00839199  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3339  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.67 
 
 
448 aa  290  4e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.235624  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0060  putative oxidoreductase, oxygen dependent, FAD-dependent protein  37.15 
 
 
465 aa  280  3e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2731  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.74 
 
 
472 aa  260  3e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0114478  normal  0.981249 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2025  FAD-binding protein  31.64 
 
 
448 aa  224  2e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4344  FAD linked oxidase domain protein  39.2 
 
 
450 aa  222  9e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.577793 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1883  FAD linked oxidase domain protein  33.19 
 
 
462 aa  217  4e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000001515  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3666  FAD linked oxidase domain protein  36.77 
 
 
446 aa  217  4e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.979447  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3122  FAD linked oxidase domain protein  36.62 
 
 
449 aa  216  5e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.461384  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4534  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.16 
 
 
490 aa  215  9.999999999999999e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.021743 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4113  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.82 
 
 
492 aa  215  1.9999999999999998e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.974698  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0351  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.48 
 
 
466 aa  207  5e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3943  FAD linked oxidase domain protein  30.84 
 
 
448 aa  204  3e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2149  FAD linked oxidase domain protein  36.7 
 
 
458 aa  204  4e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2435  oxidoreductase, FAD-binding, putative  32.02 
 
 
471 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0684957  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0426  FAD-dependent oxidase  28.85 
 
 
444 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0166645  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1767  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.65 
 
 
484 aa  196  9e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.778905  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4892  FAD-dependent oxidase  28.41 
 
 
444 aa  194  2e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.070023  normal  0.492965 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1471  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.65 
 
 
462 aa  194  4e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1816  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.13 
 
 
460 aa  193  6e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0655989  normal  0.012595 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00332  FAD linked oxidase, N-terminal  27.21 
 
 
705 aa  192  1e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1448  histidine kinase  33.33 
 
 
487 aa  191  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.253596 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1435  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.65 
 
 
462 aa  190  4e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.910534  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1417  FAD linked oxidase-like protein  30.65 
 
 
462 aa  190  4e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4161  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.28 
 
 
481 aa  190  5e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.127366 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0404  putative reticuline oxidase  27.25 
 
 
448 aa  187  4e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.993736  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1637  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.51 
 
 
449 aa  186  7e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1131  FAD linked oxidase domain protein  36.03 
 
 
447 aa  185  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1027  FAD/FMN-containing dehydrogenase  30.97 
 
 
436 aa  181  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.548155  normal  0.360167 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0061  FAD linked oxidase domain protein  31.28 
 
 
474 aa  178  2e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2044  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.55 
 
 
490 aa  177  3e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.412161  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05846  FAD binding oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G14630)  31.38 
 
 
472 aa  177  5e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6811  FAD/FMN-containing dehydrogenase-like protein  32.62 
 
 
596 aa  176  7e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4754  FAD linked oxidase domain protein  31.37 
 
 
467 aa  176  9e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.13941 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0408  putative reticuline oxidase  27.05 
 
 
448 aa  176  9.999999999999999e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.486233  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4792  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.11 
 
 
462 aa  173  6.999999999999999e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.528841  normal  0.944989 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0926  FAD linked oxidase domain protein  32.89 
 
 
764 aa  171  2e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0376  FAD linked oxidase domain protein  31.68 
 
 
753 aa  168  1e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3628  FAD linked oxidase domain protein  31.6 
 
 
451 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4651  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.43 
 
 
462 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.338628  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3087  FAD linked oxidase-like protein  31.02 
 
 
752 aa  164  3e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3488  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.27 
 
 
474 aa  164  4.0000000000000004e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.953836  normal  0.585034 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0043  twin-arginine translocation pathway signal  32.32 
 
 
532 aa  163  7e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.162495  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1620  FAD linked oxidase domain protein  30.53 
 
 
465 aa  162  1e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.600504  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2404  FAD linked oxidase domain protein  34.07 
 
 
495 aa  159  8e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.173158  hitchhiker  0.00629594 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2448  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.85 
 
 
476 aa  159  8e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.370857  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09308  FAD binding domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G00730)  30.56 
 
 
473 aa  159  1e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.898615 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3376  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.75 
 
 
726 aa  157  4e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.082286  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0347  FAD linked oxidase-like  30.69 
 
 
459 aa  157  6e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.604176  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6331  FAD linked oxidase domain protein  31.2 
 
 
480 aa  155  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00000929143  hitchhiker  0.000833417 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2430  FAD linked oxidase domain protein  30.7 
 
 
459 aa  153  8e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000620146  normal  0.138472 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06290  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  30.16 
 
 
734 aa  152  2e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.945102  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4807  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.27 
 
 
507 aa  150  4e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.658991  normal  0.754825 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5613  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.16 
 
 
445 aa  150  4e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3115  putative F420-dependent oxidoreductase  29.65 
 
 
754 aa  149  8e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000129974 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>