More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0178 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_0178  ammonium transporter  100 
 
 		 482 aa  949    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2331  ammonium transporter  65.62 
 
 		 446 aa  530  1e-149  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.708148 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4373  ammonium transporter  60.44 
 
 		 439 aa  473  1e-132  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.679539 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0257  ammonium transporter  58.25 
 
 		 501 aa  473  1e-132  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0408  ammonium transporter  57.04 
 
 		 469 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.737141  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2876  ammonium transporter  57.04 
 
 		 500 aa  464  1e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0601179  normal  0.287688 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3217  ammonium transporter  56.55 
 
 		 444 aa  464  1e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1401  ammonium transporter  56.55 
 
 		 466 aa  465  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2828  ammonium transporter  56.55 
 
 		 466 aa  465  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0438  ammonium transporter  56.31 
 
 		 500 aa  462  1e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.481032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0653  ammonium transporter  56.55 
 
 		 478 aa  464  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6194  ammonium transporter  56.59 
 
 		 504 aa  464  1e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0488  ammonium transporter  56.55 
 
 		 500 aa  465  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.256418  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4189  ammonium transporter  57.52 
 
 		 499 aa  464  1e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.793194 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2251  ammonium transporter  57.04 
 
 		 500 aa  464  1e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.112232  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2865  ammonium transporter  57.04 
 
 		 500 aa  464  1e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00160968  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0192  ammonium transporter  56.55 
 
 		 466 aa  465  1e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0469  ammonium transporter  56.55 
 
 		 500 aa  465  1e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.929058  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0526  ammonium transporter  57.52 
 
 		 502 aa  464  1e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2782  ammonium transporter  57.04 
 
 		 503 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0900246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2920  ammonium transporter  57.04 
 
 		 497 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0617737  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1305  ammonium transporter  53.35 
 
 		 444 aa  432  1e-120  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179882 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1129  ammonium transporter  53.48 
 
 		 431 aa  423  1e-117  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0598  ammonium transporter  53.57 
 
 		 463 aa  419  1e-116  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00419594 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2526  ammonium transporter  53.38 
 
 		 438 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2911  ammonium transporter  53.38 
 
 		 438 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2356  ammonium transporter  54.7 
 
 		 435 aa  414  1e-114  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1303  ammonium transporter  53.57 
 
 		 459 aa  403  1e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2065  ammonium transporter  49.52 
 
 		 431 aa  394  1e-108  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000790161  normal  0.636143 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0276  ammonium transporter  50.57 
 
 		 443 aa  394  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3728  ammonium transporter  48.8 
 
 		 437 aa  391  1e-107  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1101  ammonium transporter  48.15 
 
 		 432 aa  390  1e-107  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.991152  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1182  ammonium transporter  48.71 
 
 		 432 aa  391  1e-107  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000100846 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3537  ammonium transporter  48.32 
 
 		 437 aa  385  1e-106  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.945825  decreased coverage  0.00000925998 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3605  ammonium transporter  48.8 
 
 		 437 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3995  ammonium transporter  49.04 
 
 		 445 aa  385  1e-106  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.121366  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5505  ammonium transporter  52.76 
 
 		 445 aa  386  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.698175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0706  ammonium transporter  48.56 
 
 		 437 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0994  ammonium transporter  48.41 
 
 		 436 aa  386  1e-106  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.540241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0292  ammonium transporter  49.66 
 
 		 513 aa  383  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0807  ammonium transporter  44.63 
 
 		 466 aa  382  1e-105  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0549  ammonium transporter  50.97 
 
 		 427 aa  383  1e-105  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3160  ammonium transporter  48.32 
 
 		 466 aa  379  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6029  ammonium transporter  53.61 
 
 		 442 aa  379  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0959  ammonium transporter  52.08 
 
 		 433 aa  376  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0343  ammonium transporter  47.71 
 
 		 436 aa  376  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0199  ammonium transporter  47.48 
 
 		 515 aa  377  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.356507 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0241  ammonium transporter  48.17 
 
 		 510 aa  376  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.60924  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0218  ammonium transporter  47.48 
 
 		 524 aa  376  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000738069 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0377  ammonium transporter  49.52 
 
 		 433 aa  378  1e-103  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.182782  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69795  ammonium transporter AmtB  53.59 
 
 		 442 aa  376  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.155925  normal  0.25807 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0778  ammonium transporter  48.08 
 
 		 466 aa  378  1e-103  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3855  ammonium transporter  49.41 
 
 		 466 aa  373  1e-102  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0800844 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1956  ammonium transporter  46.82 
 
 		 494 aa  375  1e-102  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2878  ammonium transporter  50.7 
 
 		 439 aa  373  1e-102  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0084  ammonium transporter  54.85 
 
 		 449 aa  373  1e-102  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0294  ammonium transporter  49.29 
 
 		 436 aa  374  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.509038 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0239  ammonium transporter  52.89 
 
 		 444 aa  371  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.050651  normal  0.714996 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0434  ammonium transporter  46.6 
 
 		 434 aa  365  1e-100  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0771346  normal  0.5124 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2708  ammonium transporter  50 
 
 		 515 aa  363  3e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000035421 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1508  ammonium transporter  50 
 
 		 515 aa  363  3e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0218  ammonium transporter  53.92 
 
 		 445 aa  362  6e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0189  ammonium transporter  54.39 
 
 		 445 aa  362  7.0000000000000005e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3941  ammonium transporter  47.39 
 
 		 504 aa  362  9e-99  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0940  ammonium transporter  49.88 
 
 		 489 aa  361  1e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0303  ammonium transporter  50.25 
 
 		 457 aa  360  2e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1019  ammonium transporter  49.88 
 
 		 451 aa  361  2e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal  0.642415 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0490  ammonium transporter  47.2 
 
 		 431 aa  360  3e-98  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.641765  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0270  ammonium transporter  50.82 
 
 		 433 aa  360  3e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.3359 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2514  ammonium transporter  46.5 
 
 		 461 aa  360  3e-98  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0323636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0448  ammonium transporter  46.37 
 
 		 480 aa  360  3e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.595017  normal  0.335861 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0184  ammonium transporter  48.75 
 
 		 515 aa  360  4e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5294  ammonium transporter  53.25 
 
 		 443 aa  360  4e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1061  ammonium transporter  49.27 
 
 		 428 aa  359  5e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3250  ammonium transporter  49.27 
 
 		 430 aa  360  5e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5233  ammonium transporter  53.72 
 
 		 443 aa  359  6e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.265886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0192  ammonium transporter  47.88 
 
 		 467 aa  359  6e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47780  Ammonium transporter  51.56 
 
 		 438 aa  359  6e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.261032  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5142  ammonium transporter  53.72 
 
 		 443 aa  359  6e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1889  ammonium transporter  49.64 
 
 		 434 aa  358  9.999999999999999e-98  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.39856  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1896  ammonium transporter  52.08 
 
 		 433 aa  358  9.999999999999999e-98  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.786334  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0054  ammonium transporter  47.13 
 
 		 499 aa  357  1.9999999999999998e-97  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0265828  normal  0.286755 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0695  ammonium transporter  48.33 
 
 		 488 aa  357  2.9999999999999997e-97  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.7335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2862  ammonium transporter  47.79 
 
 		 457 aa  356  5e-97  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.33659  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03566  ammonium transporter  50 
 
 		 480 aa  355  1e-96  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0523  ammonium transporter  48.42 
 
 		 428 aa  354  2e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.536777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3365  ammonium transporter  49.16 
 
 		 485 aa  354  2e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0471  ammonium transporter  48.82 
 
 		 496 aa  354  2e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.122427  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0507  ammonium transporter  48.42 
 
 		 428 aa  354  2e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0487  ammonium transporter  47.97 
 
 		 507 aa  354  2e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0565  ammonium transporter  46.4 
 
 		 428 aa  353  5e-96  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000907445  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0504  ammonium transporter  47.93 
 
 		 428 aa  352  8.999999999999999e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0177698  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0513  ammonium transporter  48.18 
 
 		 428 aa  352  1e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3219  ammonium transporter  49.02 
 
 		 430 aa  352  1e-95  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3038  ammonium transporter  49.02 
 
 		 430 aa  352  1e-95  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.447574 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0919  ammonium transporter  47.93 
 
 		 428 aa  351  1e-95  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0566  ammonium transporter  48.18 
 
 		 428 aa  352  1e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.887749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3077  ammonium transporter  49.02 
 
 		 430 aa  352  1e-95  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.822444  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0473  ammonium transporter  50.11 
 
 		 522 aa  350  4e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0378  ammonium transporter  47.63 
 
 		 428 aa  350  4e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>