More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0046 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_0046  GMP synthase  100 
 
 
507 aa  1029    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.214128  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1001  GMP synthase  59.33 
 
 
501 aa  628  1e-179  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1105  GMP synthase  59.33 
 
 
501 aa  626  1e-178  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0237  GMP synthase  54.42 
 
 
512 aa  590  1e-167  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0724  GMP synthase  53.63 
 
 
510 aa  588  1e-167  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.139485  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2105  GMP synthase  52.06 
 
 
516 aa  582  1.0000000000000001e-165  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0748059  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1628  GMP synthase  55.23 
 
 
511 aa  581  1.0000000000000001e-165  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.948363  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0677  GMP synthase, large subunit  53.27 
 
 
522 aa  578  1e-164  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.476602  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1116  GMP synthase  52.85 
 
 
510 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1432  GMP synthase  55.69 
 
 
511 aa  574  1.0000000000000001e-162  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0118817  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2557  GMP synthase  52.27 
 
 
509 aa  573  1.0000000000000001e-162  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2260  GMP synthase  52.47 
 
 
509 aa  573  1.0000000000000001e-162  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0392  GMP synthase, large subunit  50.69 
 
 
509 aa  569  1e-161  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.932564  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0231  GMP synthase  52.45 
 
 
517 aa  570  1e-161  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.233055  hitchhiker  2.8816700000000002e-18 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2315  GMP synthase, large subunit  53.53 
 
 
514 aa  567  1e-160  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02020  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  53.92 
 
 
510 aa  567  1e-160  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0247  GMP synthase  51.67 
 
 
512 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000963805  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1635  GMP synthase  50.49 
 
 
513 aa  563  1.0000000000000001e-159  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0515  GMP synthase  54.03 
 
 
512 aa  561  1.0000000000000001e-159  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000605671  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1806  GMP synthase  51.97 
 
 
511 aa  564  1.0000000000000001e-159  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.150874  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0253  GMP synthase  51.47 
 
 
512 aa  560  1e-158  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00590273  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0291  GMP synthase  51.28 
 
 
512 aa  560  1e-158  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000390147  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0294  GMP synthase  50.88 
 
 
512 aa  558  1e-158  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0254  GMP synthase  50.88 
 
 
515 aa  558  1e-158  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0140882  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0240  GMP synthase  50.88 
 
 
515 aa  560  1e-158  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000319798  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0243  GMP synthase  50.88 
 
 
515 aa  558  1e-158  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0151075  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0319  GMP synthase  51.28 
 
 
515 aa  560  1e-158  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000015999  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5024  GMP synthase  51.08 
 
 
512 aa  559  1e-158  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000319692  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0268  GMP synthase  50.88 
 
 
512 aa  558  1e-158  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000477204  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0816  GMP synthase  51.28 
 
 
506 aa  560  1e-158  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1583  GMP synthase  51.37 
 
 
513 aa  560  1e-158  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2375  GMP synthase  51.47 
 
 
513 aa  561  1e-158  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0414714  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1385  GMP synthase  52.85 
 
 
511 aa  558  1e-157  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0300  GMP synthase  50.69 
 
 
512 aa  556  1e-157  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00113361  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1228  GMP synthase, large subunit  49.9 
 
 
513 aa  555  1e-157  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1264  GMP synthase  52.86 
 
 
510 aa  556  1e-157  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1264  GMP synthase  52.85 
 
 
511 aa  557  1e-157  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1617  GMP synthase  50.88 
 
 
517 aa  556  1e-157  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.322127  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0501  GMP synthase  51.87 
 
 
511 aa  553  1e-156  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0477  GMP synthase  52.26 
 
 
511 aa  552  1e-156  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2589  GMP synthase  50.67 
 
 
528 aa  555  1e-156  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0037  GMP synthase  52.82 
 
 
528 aa  554  1e-156  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.344786  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0189  GMP synthase  50.58 
 
 
575 aa  552  1e-156  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3123  GMP synthase  51.47 
 
 
516 aa  552  1e-156  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2132  GMP synthase  50.39 
 
 
512 aa  555  1e-156  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0959  GMP synthase, large subunit  53.24 
 
 
531 aa  553  1e-156  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0718  GMP synthase  52.43 
 
 
513 aa  554  1e-156  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0907  GMP synthase  51.16 
 
 
575 aa  551  1e-156  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1901  GMP synthase  51.27 
 
 
517 aa  555  1e-156  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.783209  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1739  GMP synthase  50.59 
 
 
512 aa  551  1e-156  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.929225 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2123  GMP synthase  51.18 
 
 
518 aa  552  1e-156  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.69459  hitchhiker  0.00100541 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0765  GMP synthase  50.68 
 
 
516 aa  551  1e-156  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1950  GMP synthase  52.35 
 
 
515 aa  553  1e-156  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0638  GMP synthase  52.27 
 
 
511 aa  550  1e-155  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0782  GMP synthase  50.49 
 
 
516 aa  550  1e-155  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0294  GMP synthase  50.58 
 
 
537 aa  548  1e-155  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.223502  normal  0.0574353 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1793  GMP synthase  51.46 
 
 
515 aa  550  1e-155  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3125  GMP synthase  52.35 
 
 
515 aa  550  1e-155  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0979227 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2496  GMP synthase  53.22 
 
 
515 aa  548  1e-155  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.1964  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2862  GMP synthase, large subunit  53.54 
 
 
510 aa  549  1e-155  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.339374  normal  0.56979 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1521  GMP synthase  49.9 
 
 
518 aa  548  1e-155  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0467837  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1525  GMP synthase  49.9 
 
 
518 aa  548  1e-154  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1470  GMP synthase  51.66 
 
 
516 aa  547  1e-154  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000562648  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1616  GMP synthase  49.71 
 
 
518 aa  546  1e-154  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2348  GMP synthase  49.51 
 
 
518 aa  545  1e-154  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598137  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1454  GMP synthase, large subunit  48.83 
 
 
514 aa  548  1e-154  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0229211  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1875  GMP synthase, large subunit  48.63 
 
 
533 aa  546  1e-154  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.124967  decreased coverage  0.00513433 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0934  GMP synthase  53.54 
 
 
509 aa  546  1e-154  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0445641  normal  0.514334 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1778  GMP synthase  48.83 
 
 
514 aa  548  1e-154  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4247  GMP synthase, large subunit  50.39 
 
 
527 aa  546  1e-154  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0912  GMP synthase  52.24 
 
 
520 aa  548  1e-154  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00396953  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00361  GMP synthase  51.84 
 
 
528 aa  546  1e-154  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.819005  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00361  GMP synthase  52.23 
 
 
528 aa  548  1e-154  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2880  GMP synthase  49.22 
 
 
542 aa  541  1e-153  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1438  GMP synthase  49.71 
 
 
510 aa  543  1e-153  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000788209  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1423  GMP synthase, large subunit  52.35 
 
 
512 aa  544  1e-153  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1751  GMP synthase  49.81 
 
 
520 aa  543  1e-153  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.485294  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1139  GMP synthase  50.95 
 
 
526 aa  543  1e-153  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.137379 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0634  GMP synthase  50.39 
 
 
537 aa  544  1e-153  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.324774 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0375  GMP synthase  52.55 
 
 
511 aa  542  1e-153  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00216851  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39720  GMP synthase  48.85 
 
 
526 aa  539  9.999999999999999e-153  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5989  GMP synthase  47.49 
 
 
534 aa  539  9.999999999999999e-153  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.319605  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1718  GMP synthase  53.14 
 
 
523 aa  541  9.999999999999999e-153  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0887175  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0967  GMP synthase  51.07 
 
 
520 aa  540  9.999999999999999e-153  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0246397  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02972  GMP synthase  50 
 
 
525 aa  538  9.999999999999999e-153  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0438  GMP synthase  50.29 
 
 
513 aa  538  9.999999999999999e-153  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2644  GMP synthase  51.54 
 
 
513 aa  540  9.999999999999999e-153  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1543  GMP synthase, large subunit  51.57 
 
 
507 aa  540  9.999999999999999e-153  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0449  GMP synthase  50.29 
 
 
513 aa  538  9.999999999999999e-153  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1555  GMP synthase  51.48 
 
 
510 aa  539  9.999999999999999e-153  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0645  GMP synthase  47.68 
 
 
556 aa  539  9.999999999999999e-153  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.559088  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2269  GMP synthase  51.66 
 
 
556 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.541083  normal  0.141727 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3478  GMP synthase  50.98 
 
 
514 aa  539  9.999999999999999e-153  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0421  GMP synthase  50.29 
 
 
523 aa  541  9.999999999999999e-153  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1784  GMP synthase  50.49 
 
 
510 aa  539  9.999999999999999e-153  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0148865  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0241  GMP synthase  51.35 
 
 
513 aa  540  9.999999999999999e-153  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.212928  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2498  GMP synthase  50.88 
 
 
565 aa  539  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.78922  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0738  GMP synthase  49.8 
 
 
517 aa  539  9.999999999999999e-153  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4147  GMP synthase  50.58 
 
 
525 aa  537  1e-151  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.712191  normal  0.0751509 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0598  GMP synthase  50.2 
 
 
505 aa  538  1e-151  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.57475 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>