More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1344 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_1344  hypothetical protein  100 
 
 
265 aa  544  1e-154  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.321071  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1677  NUDIX hydrolase  64.09 
 
 
192 aa  259  3e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.855535  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1544  NUDIX hydrolase  66.1 
 
 
186 aa  255  7e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1495  NUDIX hydrolase  62.57 
 
 
182 aa  254  8e-67  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.403846  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0982  NUDIX hydrolase  61.36 
 
 
177 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.76015  normal  0.0931916 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6545  NUDIX hydrolase  52.25 
 
 
188 aa  202  4e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3069  NUDIX hydrolase  39.88 
 
 
188 aa  143  3e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3605  NUDIX hydrolase  42.94 
 
 
181 aa  136  4e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1424  NUDIX hydrolase  41.42 
 
 
188 aa  135  5e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.884669  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2771  NUDIX hydrolase  36.05 
 
 
192 aa  122  5e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3513  NUDIX hydrolase  40.94 
 
 
184 aa  119  4.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.200164 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0039  NUDIX hydrolase  39.08 
 
 
183 aa  119  6e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3899  NUDIX hydrolase  41.45 
 
 
187 aa  113  3e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1221  NUDIX hydrolase  37.11 
 
 
190 aa  112  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3586  NUDIX hydrolase  36.48 
 
 
186 aa  108  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.150118 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0055  NUDIX hydrolase  32.02 
 
 
196 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5000  NUDIX hydrolase  35.96 
 
 
180 aa  108  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20966  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5410  NUDIX hydrolase  37.64 
 
 
208 aa  98.2  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.999676 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1222  NUDIX hydrolase  35.26 
 
 
166 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.524014  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1024  NUDIX hydrolase  37.58 
 
 
180 aa  92.4  6e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00585419  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2467  NUDIX hydrolase  34.59 
 
 
181 aa  90.5  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5882  NUDIX hydrolase  36.62 
 
 
191 aa  88.6  9e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119823  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2794  NUDIX hydrolase  33.73 
 
 
181 aa  87.4  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5434  NUDIX hydrolase  37.14 
 
 
213 aa  87.4  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000494994  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0963  NUDIX hydrolase  34.38 
 
 
180 aa  87  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000383094  normal  0.278011 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25410  NTP pyrophosphohydrolase  32.79 
 
 
210 aa  85.5  8e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.584509 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3241  NUDIX hydrolase  35.4 
 
 
200 aa  85.1  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.021012  normal  0.962326 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1439  NUDIX hydrolase  37.34 
 
 
204 aa  84.7  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0555  NUDIX hydrolase  32.89 
 
 
177 aa  84  0.000000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00848301  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1488  NUDIX hydrolase  29.76 
 
 
212 aa  83.6  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.587819  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2822  NUDIX hydrolase  34.39 
 
 
210 aa  84  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.38785  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11715  hypothetical protein  31.74 
 
 
207 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.191182 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0271  NUDIX hydrolase  33.95 
 
 
180 aa  82.8  0.000000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.443042  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1552  NUDIX hydrolase  35.44 
 
 
179 aa  82.8  0.000000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0673  NUDIX hydrolase  34.15 
 
 
191 aa  82.8  0.000000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0835  NUDIX hydrolase  34.21 
 
 
199 aa  82.4  0.000000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.773833  normal  0.937872 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3282  NUDIX hydrolase  31.18 
 
 
211 aa  82.4  0.000000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2376  NUDIX hydrolase  30.29 
 
 
215 aa  81.6  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2263  NUDIX hydrolase  32.94 
 
 
186 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1905  NUDIX hydrolase  32.69 
 
 
179 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000619655  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0819  NUDIX hydrolase  38.18 
 
 
180 aa  81.3  0.00000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1694  NUDIX hydrolase  34.62 
 
 
177 aa  80.5  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.204755  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1043  NUDIX hydrolase  36.08 
 
 
196 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.603681  normal  0.391418 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3501  NUDIX hydrolase  30.48 
 
 
211 aa  80.1  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.368602  normal  0.313364 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3199  ADP-ribose phosphorylase  37.84 
 
 
194 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000680603  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5562  NUDIX hydrolase  35.44 
 
 
196 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.531481 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2991  NUDIX hydrolase  30.73 
 
 
208 aa  79.3  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2272  NUDIX hydrolase  35.44 
 
 
196 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2151  NUDIX hydrolase  35.44 
 
 
196 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0499113  normal  0.401781 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1242  NUDIX hydrolase  33.85 
 
 
216 aa  79.3  0.00000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.141201  normal  0.571829 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3000  NUDIX hydrolase  34.67 
 
 
199 aa  79  0.00000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2835  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
210 aa  79  0.00000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0310181  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1358  NUDIX hydrolase  34.18 
 
 
194 aa  78.6  0.00000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0573417  hitchhiker  0.00856079 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1325  NUDIX hydrolase  36.54 
 
 
177 aa  78.2  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2258  NUDIX hydrolase  34.81 
 
 
196 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0157  NUDIX hydrolase  32.5 
 
 
180 aa  78.2  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0179624  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0010  MutT/nudix family protein  36.96 
 
 
188 aa  77.8  0.0000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1418  ADP-ribose pyrophosphatase  34.84 
 
 
207 aa  77.4  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.656759  normal  0.0166929 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1901  NUDIX hydrolase  32.74 
 
 
178 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1037  NUDIX hydrolase  31.65 
 
 
199 aa  77.8  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1622  NUDIX hydrolase  34.81 
 
 
196 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.443471  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3495  NUDIX hydrolase  34.18 
 
 
204 aa  77.8  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.760748  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2234  NUDIX hydrolase  34.81 
 
 
196 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2486  NUDIX hydrolase  31.58 
 
 
193 aa  77.4  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.253943  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1504  NUDIX hydrolase  37.01 
 
 
178 aa  76.6  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1076  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  34.18 
 
 
196 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2943  NUDIX hydrolase  30.13 
 
 
209 aa  77  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2065  NUDIX family hydrolase  30.95 
 
 
176 aa  77  0.0000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.862102  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1779  adp-ribose pyrophosphatase  30.95 
 
 
176 aa  77  0.0000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2987  NUDIX hydrolase  30.13 
 
 
209 aa  77  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.114525 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1451  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  34.18 
 
 
196 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1638  NUDIX hydrolase  31.55 
 
 
179 aa  75.9  0.0000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05669  ADP-ribose pyrophosphatase  32.14 
 
 
171 aa  75.9  0.0000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6699  NUDIX hydrolase  28.18 
 
 
215 aa  75.5  0.0000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.121967 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13740  NTP pyrophosphohydrolase  34.62 
 
 
215 aa  75.5  0.0000000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0362  NUDIX hydrolase  31.05 
 
 
186 aa  75.5  0.0000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1814  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  33.54 
 
 
196 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.660622  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0428  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  33.54 
 
 
196 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1652  NUDIX hydrolase  29.63 
 
 
186 aa  74.7  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.568517  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1305  NUDIX family hydrolase  33.54 
 
 
196 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.9435  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1314  NUDIX family hydrolase  33.54 
 
 
196 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.861294  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1342  NUDIX hydrolase  30.82 
 
 
183 aa  75.1  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000039196  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03661  NUDIX hydrolase  29.63 
 
 
186 aa  75.1  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1145  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  33.54 
 
 
196 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.107087  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0722  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  33.54 
 
 
196 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4063  NUDIX hydrolase  31.34 
 
 
228 aa  75.1  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0818284  normal  0.284545 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0333  MutT/nudix family protein  30.85 
 
 
189 aa  74.7  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0452702  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2348  NUDIX hydrolase  31.95 
 
 
210 aa  74.7  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00912328  normal  0.0106592 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1242  NUDIX hydrolase  30.3 
 
 
182 aa  73.9  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2958  NUDIX hydrolase  29.49 
 
 
209 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.682992  normal  0.58041 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1994  NUDIX hydrolase  31.01 
 
 
196 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0156913  normal  0.284552 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2672  NUDIX hydrolase  29.45 
 
 
184 aa  73.2  0.000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.687973  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2046  NUDIX hydrolase  32.05 
 
 
194 aa  73.2  0.000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0722  NUDIX hydrolase  27.61 
 
 
184 aa  72.8  0.000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2029  NUDIX hydrolase  30.34 
 
 
184 aa  72.4  0.000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.40025  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1026  NUDIX hydrolase  30.97 
 
 
183 aa  72  0.000000000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0948  NUDIX hydrolase  34.45 
 
 
182 aa  71.6  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3745  NUDIX hydrolase  33.11 
 
 
182 aa  71.6  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_398  MutT/nudix, ADP-ribose pyrophosphatase  31.64 
 
 
176 aa  71.6  0.00000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.148699  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1829  NUDIX hydrolase  28.24 
 
 
176 aa  71.6  0.00000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>