More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3373 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_3373  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 136 aa  274  3e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0297855  normal  0.469131 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3209  MerR family transcriptional regulator  79.7 
 
 		 138 aa  218  1.9999999999999999e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3680  transcriptional regulator, MerR family  65.91 
 
 		 133 aa  179  2e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.446637  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3726  MerR family transcriptional regulator  68.94 
 
 		 140 aa  178  2e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3133  MerR family transcriptional regulator  65.91 
 
 		 139 aa  174  3e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.845727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3237  MerR family transcriptional regulator  64.12 
 
 		 137 aa  171  1.9999999999999998e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1097  transcriptional regulator, MerR family  60 
 
 		 133 aa  160  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4116  transcriptional regulator, MerR family  59.23 
 
 		 133 aa  159  2e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2572  MerR family transcriptional regulator  56.69 
 
 		 141 aa  150  8e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.957862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3623  MerR family transcriptional regulator  53.54 
 
 		 142 aa  141  2e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3961  MerR family transcriptional regulator  53.54 
 
 		 142 aa  141  2e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.146237  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3797  transcriptional regulator, MerR family  52.31 
 
 		 140 aa  141  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.360833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2343  MerR family transcriptional regulator  53.44 
 
 		 146 aa  141  3e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.264422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2152  MerR family transcriptional regulator  49.23 
 
 		 137 aa  140  4e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.845816  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5562  transcriptional regulator  53.54 
 
 		 139 aa  140  8e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21316  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3502  transcriptional regulator, MerR family  51.54 
 
 		 140 aa  140  8e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.733746 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0993  MerR family transcriptional regulator  50.39 
 
 		 137 aa  139  9.999999999999999e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.335093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3339  MerR family transcriptional regulator  52.27 
 
 		 157 aa  137  7e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.88053  normal  0.266963 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3979  MerR family transcriptional regulator  53.03 
 
 		 174 aa  136  8.999999999999999e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00581953  normal  0.426596 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1129  MerR family transcriptional regulator  51.16 
 
 		 131 aa  134  6.0000000000000005e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.560457  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1504  regulatory protein, MerR  50 
 
 		 141 aa  134  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1790  transcriptional regulator  52.34 
 
 		 141 aa  132  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.269282  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0920  MerR family transcriptional regulator  50 
 
 		 141 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.320526  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0437  MerR family transcriptional regulator  51.97 
 
 		 161 aa  130  6.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3410  hypothetical protein  55.12 
 
 		 142 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2017  MerR family transcriptional regulator  52.38 
 
 		 140 aa  127  6e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1941  MerR family transcriptional regulator  52.38 
 
 		 140 aa  127  6e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0137  MerR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 145 aa  126  1.0000000000000001e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1026  MerR family transcriptional regulator  47.24 
 
 		 140 aa  123  8.000000000000001e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.120689  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0211  MerR family transcriptional regulator  46.56 
 
 		 140 aa  122  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2848  MerR family transcriptional regulator  46.46 
 
 		 142 aa  121  3e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2300  MerR family transcriptional regulator  48.03 
 
 		 134 aa  121  4e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.639917  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3563  transcriptional regulator, MerR family  47.66 
 
 		 143 aa  120  6e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2509  MerR family transcriptional regulator  46.83 
 
 		 151 aa  118  3e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.591979 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2558  MerR family transcriptional regulator  48.06 
 
 		 139 aa  118  3e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5280  transcriptional regulator CadR  44.27 
 
 		 148 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4072  transcriptional regulator, MerR family  45.38 
 
 		 140 aa  117  6e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.44146 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4070  transcriptional regulator, MerR family  49.55 
 
 		 132 aa  117  6e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.336663 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4217  MerR family transcriptional regulator  44.53 
 
 		 137 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5372  MerR family transcriptional regulator  44.7 
 
 		 149 aa  114  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3444  transcriptional regulator, MerR family  46.09 
 
 		 144 aa  114  3.9999999999999997e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0545873  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4838  regulatory protein, MerR  44.27 
 
 		 148 aa  114  6e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5193  MerR family transcriptional regulator  44.27 
 
 		 147 aa  114  6e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2352  MerR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 152 aa  114  6e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2900  MerR family transcriptional regulator  46.28 
 
 		 140 aa  113  7.999999999999999e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0325  MerR family transcriptional regulator  44.27 
 
 		 147 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.634832 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5140  MerR family transcriptional regulator  42.75 
 
 		 147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5013  MerR family transcriptional regulator  42.75 
 
 		 147 aa  111  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0800  MerR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 142 aa  111  4.0000000000000004e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.876996 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2333  MerR family transcriptional regulator  43.51 
 
 		 162 aa  110  6e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00701798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0593  MerR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 137 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.429444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3156  MerR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 146 aa  107  4.0000000000000004e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.215145  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4226  MerR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 150 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.795335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2633  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  42.31 
 
 		 162 aa  105  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.673518 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2325  MerR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 147 aa  106  1e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16670  putative transcriptional regulator CadR  41.48 
 
 		 156 aa  106  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2256  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 		 144 aa  105  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1449  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  43.55 
 
 		 156 aa  105  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4579  MerR family transcriptional regulator  40.77 
 
 		 134 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.923905  decreased coverage  0.00324593 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2443  MerR family transcriptional regulator  44.88 
 
 		 140 aa  105  3e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2809  putative transcriptional regulator, MerR family  43.75 
 
 		 186 aa  104  5e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0495  MerR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 139 aa  103  6e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.292362  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0749  transcriptional regulator, heavy metal-dependent  40 
 
 		 133 aa  103  7e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0203  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  39.23 
 
 		 135 aa  103  8e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2686  MerR family transcriptional regulator  41.32 
 
 		 172 aa  103  8e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1336  MerR family transcriptional regulator  42.54 
 
 		 146 aa  103  8e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.200551  normal  0.195494 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1816  transcriptional regulator, MerR family  40.46 
 
 		 144 aa  103  8e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.228936 
 
 
-
 
NC_003296  RS05447  transcription regulator protein  40 
 
 		 170 aa  103  9e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.015587 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1346  MerR family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 136 aa  103  9e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.24451 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0585  MerR family transcriptional regulator  38.17 
 
 		 136 aa  102  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.853287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0624  MerR family transcriptional regulator  38.17 
 
 		 136 aa  102  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0630  MerR family transcriptional regulator  38.17 
 
 		 136 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000318098 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3790  MerR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 132 aa  102  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0361759  normal  0.548118 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4066  MerR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 132 aa  102  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4622  transcriptional regulator, MerR family  42.19 
 
 		 144 aa  102  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.821242  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2931  MerR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 138 aa  102  2e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.68732 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0747  MerR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 141 aa  102  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3563  transcriptional regulator, MerR family  40.6 
 
 		 157 aa  101  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5579  transcriptional regulator, MerR family  42.97 
 
 		 144 aa  101  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0802  transcriptional regulator, MerR family  41.98 
 
 		 142 aa  102  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2814  transcriptional regulator, MerR family  42.86 
 
 		 138 aa  101  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4834  transcriptional regulator, MerR family  40.48 
 
 		 144 aa  101  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.300455  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4119  MerR family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 137 aa  101  3e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2104  transcriptional regulator, MerR family  43.75 
 
 		 151 aa  101  4e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2391  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  43.75 
 
 		 151 aa  101  4e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0284263  normal  0.3053 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2836  transcriptional regulator, MerR family  41.73 
 
 		 135 aa  100  5e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.906455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0442  transcriptional regulator, MerR family  41.86 
 
 		 132 aa  100  5e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.856657  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0853  MerR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 146 aa  100  6e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0812  MerR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 143 aa  100  6e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3461  transcriptional regulator, MerR family protein  40.98 
 
 		 146 aa  100  6e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4323  MerR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 146 aa  100  6e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0660  MerR family transcriptional regulator  40.31 
 
 		 137 aa  100  7e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5351  transcriptional regulator, MerR family  41.54 
 
 		 144 aa  99.8  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0379309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3585  MerR family transcriptional regulator  39.55 
 
 		 152 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229473 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3347  transcription regulator protein  39.69 
 
 		 159 aa  99.4  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.445877  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46190  cadmium responsive transcriptional regulator, merR family  43.75 
 
 		 152 aa  99  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.719382  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0034  MerR family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 144 aa  99  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2326  MerR family transcriptional regulator  42.06 
 
 		 150 aa  99.4  2e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0028  transcriptional regulator, MerR family  40.62 
 
 		 143 aa  99  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.234521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1639  MerR family transcriptional regulator  37.69 
 
 		 159 aa  99.4  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.270848  normal  0.040207 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>