282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2462 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2462  phosphoserine phosphatase SerB  100 
 
 		 296 aa  589  1e-167  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.228127 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6089  phosphoserine phosphatase  56.08 
 
 		 296 aa  315  4e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.562071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3347  phosphoserine phosphatase SerB  58.31 
 
 		 297 aa  306  3e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0178674 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1348  phosphoserine phosphatase SerB  57.68 
 
 		 299 aa  304  1.0000000000000001e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.561677  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1391  phosphoserine phosphatase  57.34 
 
 		 299 aa  302  4.0000000000000003e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.115011  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2809  phosphoserine phosphatase  54.61 
 
 		 296 aa  300  2e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.117358  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2012  phosphoserine phosphatase SerB  56.61 
 
 		 295 aa  300  2e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3257  phosphoserine phosphatase SerB  57.91 
 
 		 297 aa  299  5e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.230695 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1800  phosphoserine phosphatase SerB  57 
 
 		 299 aa  298  5e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.695243  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2797  phosphoserine phosphatase SerB  54.24 
 
 		 296 aa  297  1e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.538623 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2538  phosphoserine phosphatase SerB  53.87 
 
 		 296 aa  296  3e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.84987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6707  phosphoserine phosphatase SerB  55.03 
 
 		 298 aa  294  1e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.572271  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3347  phosphoserine phosphatase SerB  59.68 
 
 		 289 aa  293  2e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3019  phosphoserine phosphatase  54.23 
 
 		 291 aa  289  3e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.426286 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2240  phosphoserine phosphatase SerB  58.31 
 
 		 297 aa  289  4e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.110047  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2345  phosphoserine phosphatase SerB  56.08 
 
 		 297 aa  288  6e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.419363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1756  phosphoserine phosphatase SerB  55.22 
 
 		 309 aa  288  7e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1744  phosphoserine phosphatase  52.56 
 
 		 295 aa  281  7.000000000000001e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.121425  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3139  phosphoserine phosphatase SerB  55.74 
 
 		 325 aa  280  2e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.598874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2882  phosphoserine phosphatase SerB  54.21 
 
 		 298 aa  279  4e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2655  phosphoserine phosphatase SerB  54.55 
 
 		 298 aa  279  5e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.607459 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1660  phosphoserine phosphatase SerB  55.74 
 
 		 299 aa  277  2e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.922143  normal  0.466601 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2777  phosphoserine phosphatase SerB  54.39 
 
 		 298 aa  276  2e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.64316  normal  0.211606 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0018  phosphoserine phosphatase SerB  55.94 
 
 		 291 aa  276  3e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.395606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3316  phosphoserine phosphatase  52.94 
 
 		 292 aa  273  2.0000000000000002e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.979977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0008  phosphoserine phosphatase SerB  52.94 
 
 		 291 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197314 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1350  phosphoserine phosphatase  55.94 
 
 		 291 aa  272  6e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2096  phosphoserine phosphatase SerB  63.96 
 
 		 226 aa  272  6e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.646648  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6188  phosphoserine phosphatase SerB  51.6 
 
 		 298 aa  261  8.999999999999999e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0252  phosphoserine phosphatase  50 
 
 		 291 aa  261  1e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0607  phosphoserine phosphatase  56.25 
 
 		 292 aa  258  6e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.122548  normal  0.443205 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4531  phosphoserine phosphatase SerB  53.4 
 
 		 297 aa  258  7e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.545382 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2724  phosphoserine phosphatase SerB  59.15 
 
 		 241 aa  258  9e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0465  phosphoserine phosphatase  53.99 
 
 		 299 aa  255  7e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.67766  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2835  phosphoserine phosphatase SerB  50.85 
 
 		 332 aa  255  8e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.978803  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0812  phosphoserine phosphatase SerB  54.23 
 
 		 291 aa  244  1.9999999999999999e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1777  phosphoserine phosphatase SerB  50 
 
 		 298 aa  239  5e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1468  phosphoserine phosphatase SerB  50 
 
 		 294 aa  207  1e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2283  3-phosphoserine phosphatase  41.67 
 
 		 398 aa  201  9.999999999999999e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000752134  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1890  phosphoserine phosphatase  50 
 
 		 302 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0136  phosphoserine phosphatase  48.03 
 
 		 432 aa  195  1e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.357065  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2574  phosphoserine phosphatase  45.82 
 
 		 420 aa  193  3e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.335719  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5336  phosphoserine phosphatase SerB  45.53 
 
 		 419 aa  189  4e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.414905  normal  0.119609 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1350  phosphoserine phosphatase SerB  44.71 
 
 		 419 aa  189  5e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0225  phosphoserine phosphatase SerB  42.71 
 
 		 406 aa  186  3e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1620  phosphoserine phosphatase SerB  42.57 
 
 		 275 aa  187  3e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2240  phosphoserine phosphatase SerB  50.23 
 
 		 281 aa  187  3e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00113806  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0990  phosphoserine phosphatase SerB  42.19 
 
 		 406 aa  186  5e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1598  phosphoserine phosphatase SerB  43.09 
 
 		 408 aa  186  5e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4962  phosphoserine phosphatase SerB  38.39 
 
 		 404 aa  185  7e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414119 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4909  phosphoserine phosphatase SerB  39.68 
 
 		 415 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.45946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0500  Phosphoserine phosphatase  44.86 
 
 		 407 aa  183  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.652147  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07410  Phosphoserine phosphatase  48.61 
 
 		 404 aa  183  3e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.403165  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4785  phosphoserine phosphatase SerB  38.06 
 
 		 404 aa  183  3e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1492  phosphoserine phosphatase SerB  42.91 
 
 		 281 aa  183  3e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.806128  normal  0.053472 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0264  phosphoserine phosphatase SerB  39.3 
 
 		 404 aa  182  5.0000000000000004e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2786  phosphoserine phosphatase SerB  45.87 
 
 		 410 aa  182  5.0000000000000004e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5077  phosphoserine phosphatase  51.22 
 
 		 281 aa  182  6e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6301  phosphoserine phosphatase SerB  51.22 
 
 		 316 aa  182  6e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.463475  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65560  phosphoserine phosphatase  45.02 
 
 		 429 aa  182  6e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1778  phosphoserine phosphatase SerB  51.22 
 
 		 316 aa  182  6e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.685999  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1803  phosphoserine phosphatase SerB  51.22 
 
 		 281 aa  182  7e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0615896  normal  0.554721 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4957  ACT domain protein/phosphoserine phosphatase SerB  44.49 
 
 		 418 aa  182  7e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0636  phosphoserine phosphatase SerB  47.06 
 
 		 276 aa  182  8.000000000000001e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.458304  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4701  phosphoserine phosphatase SerB  39.37 
 
 		 404 aa  181  9.000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.995062 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5689  phosphoserine phosphatase SerB  44.62 
 
 		 404 aa  181  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0618  phosphoserine phosphatase  44.49 
 
 		 429 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0557  phosphoserine phosphatase SerB  44.08 
 
 		 418 aa  179  4e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29300  phosphoserine phosphatase  39.14 
 
 		 409 aa  179  5.999999999999999e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.78907  normal  0.19351 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0978  phosphoserine phosphatase SerB  40.99 
 
 		 279 aa  179  7e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.485159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5506  phosphoserine phosphatase SerB  38.87 
 
 		 306 aa  178  8e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.933575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5907  phosphoserine phosphatase SerB  38.87 
 
 		 306 aa  178  8e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.580138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1690  phosphoserine phosphatase SerB  50.24 
 
 		 281 aa  177  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.656788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1718  phosphoserine phosphatase SerB  50.24 
 
 		 316 aa  176  3e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2184  phosphoserine phosphatase SerB  45.5 
 
 		 435 aa  176  4e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0738013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0928  phosphoserine phosphatase SerB  49.29 
 
 		 296 aa  176  5e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.215666  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4820  phosphoserine phosphatase SerB  45.18 
 
 		 403 aa  175  7e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2803  phosphoserine phosphatase SerB  40.78 
 
 		 398 aa  175  9.999999999999999e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.749544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0506  phosphoserine phosphatase  37.1 
 
 		 404 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.138167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3292  phosphoserine phosphatase SerB  48.84 
 
 		 297 aa  174  1.9999999999999998e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.117576  normal  0.403499 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2331  phosphoserine phosphatase  47.42 
 
 		 279 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.124383  normal  0.106642 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2041  phosphoserine phosphatase  41.94 
 
 		 404 aa  174  1.9999999999999998e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.143406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3280  phosphoserine phosphatase SerB  39.41 
 
 		 414 aa  174  1.9999999999999998e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1962  phosphoserine phosphatase  48.04 
 
 		 279 aa  173  2.9999999999999996e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.436827  normal  0.668349 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2504  phosphoserine phosphatase SerB  40.08 
 
 		 278 aa  173  2.9999999999999996e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000000707909  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2310  phosphoserine phosphatase SerB  47.37 
 
 		 429 aa  173  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.54597 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0666  phosphoserine phosphatase  43.97 
 
 		 325 aa  173  2.9999999999999996e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0913  phosphoserine phosphatase SerB  46.75 
 
 		 296 aa  172  5e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.697374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13058  phosphoserine phosphatase  45.37 
 
 		 409 aa  172  6.999999999999999e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.128552 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03372  phosphoserine phosphatase  46.53 
 
 		 326 aa  171  2e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0341  phosphoserine phosphatase SerB  43.78 
 
 		 412 aa  171  2e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2577  phosphoserine phosphatase SerB  48 
 
 		 237 aa  170  3e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.7758  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2542  phosphoserine phosphatase  44.86 
 
 		 411 aa  170  3e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1640  putative phosphoserine phosphatase protein  47.09 
 
 		 285 aa  169  4e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.791178  normal  0.179226 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0314  phosphoserine phosphatase SerB  42.54 
 
 		 410 aa  169  5e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0906615 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1855  phosphoserine phosphatase SerB  46.01 
 
 		 279 aa  168  9e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.247202 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2157  phosphoserine phosphatase  40.43 
 
 		 281 aa  168  1e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.752004  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0094  phosphoserine phosphatase  40.43 
 
 		 281 aa  168  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.188283  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1073  phosphoserine phosphatase  40.43 
 
 		 281 aa  168  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002634  phosphoserine phosphatase  45.05 
 
 		 326 aa  167  1e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>