243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2079 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2079  hypothetical protein  100 
 
 		 348 aa  721    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2765  methyltransferase type 12  76.15 
 
 		 348 aa  568  1e-161  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.306767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2845  methyltransferase type 11  76.72 
 
 		 348 aa  556  1e-157  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.292154 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2927  hypothetical protein  75.86 
 
 		 348 aa  552  1e-156  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0580788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2124  methyltransferase type 11  75.29 
 
 		 348 aa  553  1e-156  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0899557  normal  0.31011 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3092  Methyltransferase type 12  57.59 
 
 		 351 aa  414  1e-114  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.684965  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3193  Methyltransferase type 12  57.88 
 
 		 351 aa  414  1e-114  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0507607  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2993  methyltransferase type 12  57.02 
 
 		 351 aa  409  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0698289  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6880  Methyltransferase type 12  55.46 
 
 		 353 aa  409  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.541401  normal  0.545312 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0990  methyltransferase type 12  56.45 
 
 		 351 aa  405  1.0000000000000001e-112  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.165588 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0328  hypothetical protein  55.87 
 
 		 351 aa  403  1e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.621774 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5910  Methyltransferase type 12  54.89 
 
 		 353 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.512688 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6246  Methyltransferase type 12  51.73 
 
 		 349 aa  372  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.106567  normal  0.283014 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5022  methyltransferase type 11  51 
 
 		 353 aa  374  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.371366  normal  0.128681 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1171  hypothetical protein  50.72 
 
 		 351 aa  367  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2433  putative methyltransferase  52.74 
 
 		 348 aa  368  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0150817 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1034  Methyltransferase type 12  52.15 
 
 		 360 aa  365  1e-100  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0623  methyltransferase type 12  52.72 
 
 		 357 aa  355  5e-97  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0596  Methyltransferase type 12  50 
 
 		 357 aa  354  1e-96  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.579149 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1828  Methyltransferase type 11  49.3 
 
 		 351 aa  351  1e-95  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.225649  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2696  Methyltransferase type 12  48.29 
 
 		 358 aa  351  1e-95  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.362393 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4241  Methyltransferase type 12  49 
 
 		 360 aa  350  2e-95  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1706  methyltransferase type 12  48.14 
 
 		 353 aa  341  1e-92  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.266061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1600  methyltransferase type 12  49.86 
 
 		 359 aa  337  1.9999999999999998e-91  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1551  methyltransferase type 12  46.13 
 
 		 350 aa  329  5.0000000000000004e-89  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.100961 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3870  methyltransferase type 12  44.41 
 
 		 357 aa  317  2e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.623103 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2188  Methyltransferase type 12  42.27 
 
 		 343 aa  277  2e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18860  hypothetical protein  36.18 
 
 		 357 aa  219  6e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.478854  normal  0.0386506 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1632  hypothetical protein  35.04 
 
 		 357 aa  215  9e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2319  hypothetical protein  32.16 
 
 		 356 aa  167  4e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1290  Methyltransferase type 12  36.39 
 
 		 341 aa  166  5e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.830154  normal  0.108647 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2462  hypothetical protein  32.16 
 
 		 356 aa  166  6.9999999999999995e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0108  Methyltransferase type 11  33.02 
 
 		 363 aa  162  1e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.082076  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5517  methyltransferase type 11  30.89 
 
 		 355 aa  151  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00770643  normal  0.912188 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3711  methyltransferase type 12  30.81 
 
 		 360 aa  149  7e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0550  Methyltransferase type 11  31.34 
 
 		 356 aa  147  3e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1645  Methyltransferase type 12  32.12 
 
 		 365 aa  139  6e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3928  methyltransferase type 11  32.14 
 
 		 363 aa  139  1e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.959556 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2608  Methyltransferase type 12  29.97 
 
 		 380 aa  136  5e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000000476854  hitchhiker  0.00248794 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3378  methyltransferase type 11  27.32 
 
 		 355 aa  135  7.000000000000001e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3440  methyltransferase type 11  27.32 
 
 		 355 aa  135  7.000000000000001e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0151153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3389  methyltransferase type 11  27.32 
 
 		 355 aa  135  7.000000000000001e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2044  methyltransferase type 12  31.53 
 
 		 369 aa  133  5e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.204275  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12286  transcriptional regulator  28.83 
 
 		 353 aa  132  6.999999999999999e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1457  methyltransferase type 11  28.01 
 
 		 344 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6570  methyltransferase type 12  27.61 
 
 		 416 aa  126  5e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1328  Methyltransferase type 12  25 
 
 		 365 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.352621 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2768  methyltransferase type 11  26.93 
 
 		 360 aa  123  4e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.447224  normal  0.663756 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1502  methyltransferase type 11  28.74 
 
 		 360 aa  123  5e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.576413  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2574  Methyltransferase type 11  28.16 
 
 		 363 aa  123  6e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1793  Methyltransferase type 11  28.94 
 
 		 360 aa  121  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000694862 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3765  methyltransferase type 12  26 
 
 		 376 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.578435  normal  0.774005 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43981  predicted protein  30.43 
 
 		 418 aa  114  2.0000000000000002e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.321285  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2836  methyltransferase type 11  28.21 
 
 		 362 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.251768  normal  0.501241 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2327  Methyltransferase type 11  28.4 
 
 		 367 aa  107  3e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.28435 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5751  Methyltransferase type 11  26.65 
 
 		 356 aa  106  5e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229157  normal  0.171597 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1453  Methyltransferase type 11  27.12 
 
 		 366 aa  105  1e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000488747  normal  0.299769 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4806  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  27.06 
 
 		 280 aa  61.2  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2641  Methyltransferase type 11  28.67 
 
 		 268 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.307371  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3475  Methyltransferase type 11  28.67 
 
 		 268 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2551  Methyltransferase type 11  33.59 
 
 		 248 aa  57.8  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0729  putative methyltransferase  30.61 
 
 		 246 aa  56.6  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1808  Methyltransferase type 11  25.88 
 
 		 286 aa  56.2  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2225  Methyltransferase type 11  29.91 
 
 		 281 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.449222  normal  0.183181 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1929  Methyltransferase type 11  36 
 
 		 228 aa  54.7  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000245244  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3931  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 271 aa  53.9  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2596  methyltransferase type 11  29.53 
 
 		 271 aa  52.8  0.000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0340316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2106  Methyltransferase type 12  25.84 
 
 		 352 aa  52.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.139734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4232  methyltransferase type 11  25.35 
 
 		 234 aa  52.4  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1686  hypothetical protein  32.17 
 
 		 287 aa  52  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.280854  hitchhiker  0.00385522 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3331  type 11 methyltransferase  28.68 
 
 		 395 aa  52  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5718  O-methyltransferase family 2  24.04 
 
 		 338 aa  52  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0628  methyltransferase type 11  26.9 
 
 		 235 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.690506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  30.63 
 
 		 282 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2596  Methyltransferase type 11  30.68 
 
 		 311 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1508  Methyltransferase type 11  28.67 
 
 		 226 aa  52  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.670253 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0160  UbiE/COQ5 methyltransferase  23.44 
 
 		 293 aa  50.8  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0851  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  30.63 
 
 		 297 aa  50.8  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0252199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1275  putative methyltransferase  26.88 
 
 		 234 aa  50.8  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.151489  normal  0.89967 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2956  methyltransferase type 11  25.42 
 
 		 304 aa  51.2  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.626473  normal  0.0682436 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1069  hypothetical protein  55.81 
 
 		 140 aa  51.2  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5675  Methyltransferase type 12  24.79 
 
 		 340 aa  50.8  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.196275  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1737  Methyltransferase type 11  26.5 
 
 		 283 aa  50.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0817864  normal  0.19788 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10980  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  29.82 
 
 		 296 aa  50.1  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3189  methyltransferase type 11  30.36 
 
 		 187 aa  50.1  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1462  methyltransferase type 11  30.58 
 
 		 285 aa  50.1  0.00006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.032097 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1664  polyketide synthase, putative  29.36 
 
 		 2082 aa  50.1  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.685154  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1781  methyltransferase type 11  31.4 
 
 		 285 aa  50.1  0.00006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.33334  hitchhiker  0.000337573 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2252  methyltransferase type 11  20.71 
 
 		 266 aa  50.1  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0607  methyltransferase type 11  31.4 
 
 		 285 aa  50.1  0.00006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.21069  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4778  Methyltransferase type 11  28.32 
 
 		 242 aa  49.7  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.683048  normal  0.945308 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3701  Methyltransferase type 11  28.32 
 
 		 242 aa  49.7  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.260893 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3463  type 11 methyltransferase  25.64 
 
 		 280 aa  49.7  0.00008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04910  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  26.23 
 
 		 386 aa  49.7  0.00008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0335  Methyltransferase type 11  25 
 
 		 283 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1780  Methyltransferase type 12  26.74 
 
 		 481 aa  48.9  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0574181 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2188  hypothetical protein  23.89 
 
 		 411 aa  48.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.636735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1425  modification methylase HemK  32.71 
 
 		 297 aa  48.1  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1999  Methyltransferase type 11  26.47 
 
 		 444 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0647  HemK family modification methylase  36.67 
 
 		 319 aa  48.1  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.307152  normal  0.250746 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>