More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0078 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_0078  flavoredoxin  100 
 
 
189 aa  391  1e-108  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00025705  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3486  flavin reductase domain protein FMN-binding  62.77 
 
 
192 aa  258  5e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2846  flavin reductase domain-containing protein  63.64 
 
 
200 aa  254  7e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  5.00824e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0642  flavin reductase domain protein FMN-binding  61.7 
 
 
190 aa  251  3e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0563737  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1443  flavin reductase-like, FMN-binding  59.57 
 
 
189 aa  249  1e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0126  flavin reductase domain protein FMN-binding  59.26 
 
 
194 aa  248  3e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0805  flavin reductase-like, FMN-binding  60.64 
 
 
188 aa  246  2e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2210  flavin reductase domain-containing protein  56.61 
 
 
189 aa  245  2e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3349  flavoredoxin Flr  59.36 
 
 
188 aa  246  2e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0445888 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0520  flavin reductase domain protein FMN-binding  58.51 
 
 
189 aa  243  9e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2036  flavin reductase domain protein FMN-binding  59.57 
 
 
190 aa  243  2e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  4.23527e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2181  flavin reductase domain protein FMN-binding  58.51 
 
 
190 aa  241  5e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0259  flavoredoxin  56.91 
 
 
189 aa  231  7e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0187  flavoredoxin  55.85 
 
 
190 aa  226  2e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.871882  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1572  flavin reductase domain protein FMN-binding  53.72 
 
 
190 aa  223  1e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2701  flavin reductase domain protein FMN-binding  50 
 
 
189 aa  218  3e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0347  flavin reductase domain-containing protein  47.59 
 
 
191 aa  206  1e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.643208  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2549  flavin reductase domain-containing protein  48.94 
 
 
190 aa  203  2e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.355058  normal  0.136226 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0922  flavin reductase domain protein FMN-binding  51.06 
 
 
195 aa  193  2e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1144  flavin reductase-like, FMN-binding  40.86 
 
 
189 aa  173  1e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.467484  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3881  flavin reductase domain-containing protein  38.33 
 
 
209 aa  152  3e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0343  flavin reductase-like, FMN-binding  36.46 
 
 
200 aa  131  7e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.37872  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0359  flavin reductase domain-containing protein  35.98 
 
 
195 aa  130  1e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.184245 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2225  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.11 
 
 
195 aa  128  5e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3444  flavin reductase domain-containing protein  36.32 
 
 
216 aa  126  2e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.280033  unclonable  7.09652e-06 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1855  flavin reductase domain-containing protein  37.1 
 
 
186 aa  122  3e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.165677  normal  0.56563 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25740  conserved protein of DIM6/NTAB family  34.95 
 
 
187 aa  121  6e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0678  flavoredoxin  36.36 
 
 
184 aa  115  5e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.616599 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00650  conserved protein of DIM6/NTAB family  32.6 
 
 
194 aa  113  2e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2479  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.87 
 
 
186 aa  112  3e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.261608 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1661  flavoredoxin  32.53 
 
 
192 aa  110  1e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.600705  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1399  flavin reductase, putative  32.53 
 
 
192 aa  110  1e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0187374  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2040  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.58 
 
 
186 aa  108  5e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.228084  hitchhiker  4.89831e-08 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0014  flavin reductase domain-containing protein  36.72 
 
 
189 aa  104  7e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0249  flavoredoxin, putative  35.08 
 
 
187 aa  104  9e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  3.03002e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0995  hypothetical protein  28.49 
 
 
185 aa  101  7e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.418174  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1555  flavin reductase domain-containing protein  31.72 
 
 
186 aa  99  3e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1189  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.69 
 
 
186 aa  94.7  6e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00243403  normal  0.450798 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1524  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.71 
 
 
215 aa  87  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0437  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.28 
 
 
185 aa  84.3  9e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0123004 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0743  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.92 
 
 
185 aa  82.8  3e-15  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1592  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  29.1 
 
 
193 aa  79.3  3e-14  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06661  hypothetical protein  31.25 
 
 
229 aa  79.3  3e-14  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0382  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  31.88 
 
 
160 aa  77.8  8e-14  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.610168  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40150  Flavin reductase-like protein  33.33 
 
 
177 aa  77  1e-13  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.710187  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2781  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  29.11 
 
 
167 aa  75.5  4e-13  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  3.73643e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1141  flavin reductase domain-containing protein  30.6 
 
 
183 aa  73.6  2e-12  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.494396  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1145  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  33.33 
 
 
197 aa  73.6  2e-12  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1150  flavoprotein oxygenase  28.22 
 
 
207 aa  73.2  2e-12  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.462825 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1925  flavin reductase-like protein  28.75 
 
 
178 aa  72  4e-12  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.802506 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2037  hypothetical protein  27.39 
 
 
202 aa  71.6  6e-12  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.902665  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3626  flavoprotein oxygenase  26.4 
 
 
209 aa  71.2  9e-12  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1469  flavoprotein oxygenase  26.14 
 
 
212 aa  70.9  1e-11  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0883  hypothetical protein  25.36 
 
 
165 aa  70.1  2e-11  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0253557  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2041  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.88 
 
 
203 aa  70.5  2e-11  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0801878  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1228  flavin reductase domain-containing protein  27.86 
 
 
192 aa  69.3  3e-11  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2444  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  30 
 
 
199 aa  69.3  3e-11  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3068  flavin reductase domain-containing protein  30.14 
 
 
176 aa  69.7  3e-11  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.293275  normal  0.441099 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0502  flavoprotein oxygenase  26.4 
 
 
208 aa  68.9  4e-11  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0503  flavoprotein oxygenase  26.4 
 
 
208 aa  68.9  5e-11  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03932  hypothetical protein  30.46 
 
 
209 aa  68.6  5e-11  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3528  flavoprotein oxygenase  26.4 
 
 
208 aa  67.8  8e-11  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2559  hypothetical protein  24.24 
 
 
183 aa  67.8  8e-11  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3355  flavoprotein oxygenase  26.4 
 
 
210 aa  67  1e-10  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.522125  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1948  hypothetical protein  27.65 
 
 
215 aa  67  1e-10  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00544645  normal  0.0118846 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5713  flavin reductase domain protein FMN-binding  30 
 
 
189 aa  67.4  1e-10  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.483715  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0492  flavoprotein oxygenase  25.28 
 
 
209 aa  66.6  2e-10  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0762  flavin reductase domain protein FMN-binding  24.86 
 
 
203 aa  66.2  3e-10  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2915  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.97 
 
 
203 aa  66.2  3e-10  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3293  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  27.74 
 
 
216 aa  65.9  4e-10  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.902968  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2205  flavin reductase-like, FMN-binding  31.58 
 
 
162 aa  65.9  4e-10  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.361259  normal  0.347764 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1083  hypothetical protein  24.84 
 
 
204 aa  65.1  6e-10  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.2808  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0524  hypothetical protein  31.06 
 
 
184 aa  65.1  6e-10  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  4.40007e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2217  hypothetical protein  25.68 
 
 
207 aa  65.1  6e-10  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0565603 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1820  hypothetical protein  29.19 
 
 
207 aa  64.7  8e-10  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0452  flavoprotein oxygenase  25.28 
 
 
209 aa  64.7  9e-10  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3722  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.82 
 
 
176 aa  63.9  1e-09  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0423931 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4215  hypothetical protein  32.28 
 
 
184 aa  63.9  1e-09  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.380151  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3807  flavin reductase domain protein FMN-binding  25.29 
 
 
209 aa  63.9  1e-09  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2530  hypothetical protein  32.31 
 
 
169 aa  63.5  2e-09  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0339415  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2682  hypothetical protein  28.38 
 
 
205 aa  63.2  2e-09  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0500  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.75 
 
 
294 aa  63.2  2e-09  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5786  hypothetical protein  24.36 
 
 
208 aa  63.5  2e-09  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.756136  hitchhiker  0.00296108 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3989  flavoprotein oxygenase  24.72 
 
 
209 aa  62.8  3e-09  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0458  flavoprotein oxygenase  24.72 
 
 
209 aa  62.8  3e-09  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0863  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.38 
 
 
209 aa  62.8  3e-09  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3128  flavin reductase domain-containing protein  30.95 
 
 
185 aa  62.4  3e-09  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3864  flavoprotein oxygenase  24.71 
 
 
209 aa  62.8  3e-09  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1916  hypothetical protein  26.92 
 
 
203 aa  62.8  3e-09  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0862  flavin reductase-like, FMN-binding  29.93 
 
 
178 aa  62.4  4e-09  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.374228  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2703  hypothetical protein  28.38 
 
 
206 aa  62  5e-09  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.113365  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1270  flavin reductase domain-containing protein  30.56 
 
 
181 aa  62  5e-09  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.285703  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1226  flavin reductase domain-containing protein  30 
 
 
248 aa  61.6  6e-09  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.384707 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02270  conserved protein of DIM6/NTAB family  28.66 
 
 
168 aa  61.6  6e-09  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.759277  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01680  hypothetical protein  26.67 
 
 
292 aa  61.6  7e-09  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_78913  flavoprotein oxygenase  29.82 
 
 
287 aa  61.6  7e-09  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0498  flavoprotein oxygenase  25.28 
 
 
209 aa  61.2  8e-09  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2151  hypothetical protein  28.12 
 
 
203 aa  61.2  8e-09  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0053  hypothetical protein  29.14 
 
 
210 aa  61.2  8e-09  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.234931  normal  0.568294 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0597  hypothetical protein  32.08 
 
 
168 aa  61.2  9e-09  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>