More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1715 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_1715  HAD family hydrolase  100 
 
 
195 aa  385  1e-106  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.101498 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1427  HAD family hydrolase  67.71 
 
 
191 aa  268  4e-71  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.828576  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0904  HAD family hydrolase  64.25 
 
 
197 aa  261  3e-69  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1887  HAD family hydrolase  63.08 
 
 
196 aa  259  2e-68  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02545  predicted hydrolase  34.5 
 
 
188 aa  88.2  6e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00348702  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02510  hypothetical protein  34.5 
 
 
188 aa  88.2  6e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00621233  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1017  fructose-1-phosphatase  34.5 
 
 
188 aa  88.2  6e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0370364  hitchhiker  0.0042534 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2826  fructose-1-phosphatase  34.5 
 
 
188 aa  88.2  6e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000139827  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2973  fructose-1-phosphatase  34.5 
 
 
188 aa  88.2  7e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000945965  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2812  fructose-1-phosphatase  34.5 
 
 
188 aa  88.2  7e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000062421  hitchhiker  0.000278868 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3936  fructose-1-phosphatase  34.5 
 
 
188 aa  88.2  7e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00199329  normal  0.845186 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3209  fructose-1-phosphatase  33.92 
 
 
188 aa  87.4  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000636798  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0994  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  33.92 
 
 
188 aa  85.5  4e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000122872  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3186  fructose-1-phosphatase  34.5 
 
 
187 aa  85.1  6e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000354509  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2970  fructose-1-phosphatase  33.33 
 
 
269 aa  84.7  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00804181  decreased coverage  0.0000706363 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3129  fructose-1-phosphatase  33.33 
 
 
188 aa  84.3  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000901286  normal  0.0148605 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3005  fructose-1-phosphatase  33.33 
 
 
188 aa  84.3  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0313059  hitchhiker  0.0000277628 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3991  HAD family hydrolase  32.11 
 
 
223 aa  84  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0589691  normal  0.286342 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3022  fructose-1-phosphatase  33.33 
 
 
188 aa  83.6  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0218888  decreased coverage  0.00000512461 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0845  fructose-1-phosphatase  33.92 
 
 
188 aa  82.4  0.000000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012907  hitchhiker  0.000000242912 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0985  fructose-1-phosphatase  29.78 
 
 
188 aa  81.6  0.000000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000117667  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2939  fructose-1-phosphatase  32.75 
 
 
188 aa  81.6  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000320797  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1118  fructose-1-phosphatase  33.92 
 
 
188 aa  81.6  0.000000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000766383  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03237  phosphoglycolate phosphatase  35.82 
 
 
252 aa  80.9  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0328  phosphoglycolate phosphatase  35.82 
 
 
252 aa  80.9  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03189  hypothetical protein  35.82 
 
 
252 aa  80.9  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3581  phosphoglycolate phosphatase  33.98 
 
 
252 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.284383  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4689  phosphoglycolate phosphatase  33.98 
 
 
252 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.663349  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0328  phosphoglycolate phosphatase  33.98 
 
 
252 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.372389  normal  0.201922 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3854  phosphoglycolate phosphatase  33.98 
 
 
252 aa  80.1  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00525883  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3661  phosphoglycolate phosphatase  33.98 
 
 
252 aa  80.1  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.29844  normal  0.025681 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3168  pyrophosphatase PpaX  30.39 
 
 
222 aa  80.1  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0160  HAD family hydrolase  34.05 
 
 
224 aa  79.3  0.00000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.300128  normal  0.21286 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4360  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.58 
 
 
223 aa  79.7  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2984  pyrophosphatase PpaX  30.39 
 
 
215 aa  79  0.00000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.417941  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3762  phosphoglycolate phosphatase  33.5 
 
 
252 aa  79  0.00000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.40481  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6064  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.78 
 
 
215 aa  79  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.219512  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1944  pyrophosphatase PpaX  28.73 
 
 
214 aa  79.3  0.00000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2065  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  36.52 
 
 
201 aa  79  0.00000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000166842  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0581  HAD family hydrolase  37.06 
 
 
207 aa  79  0.00000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.696178  normal  0.657435 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3787  HAD family hydrolase  30.64 
 
 
238 aa  78.6  0.00000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.85061  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1461  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.15 
 
 
211 aa  78.2  0.00000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3371  fructose-1-phosphatase  29.21 
 
 
188 aa  78.2  0.00000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000166362  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0893  fructose-1-phosphatase  29.21 
 
 
188 aa  78.2  0.00000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000160736  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3236  fructose-1-phosphatase  29.21 
 
 
188 aa  78.2  0.00000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000293158  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2232  pyrophosphatase PpaX  28.18 
 
 
214 aa  77.8  0.00000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0397  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  30.96 
 
 
223 aa  77  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3170  fructose-1-phosphatase  32.16 
 
 
188 aa  77  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00217793  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0100  HAD family hydrolase  28.49 
 
 
468 aa  76.6  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0368988  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2263  beta-phosphoglucomutase  33.9 
 
 
218 aa  76.3  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000132741  hitchhiker  0.000000451899 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4472  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.11 
 
 
223 aa  76.3  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3933  HAD family hydrolase  30.39 
 
 
271 aa  75.5  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1980  HAD family hydrolase  35.26 
 
 
202 aa  75.1  0.0000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000561924  normal  0.0500569 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1994  HAD family hydrolase  33.52 
 
 
202 aa  75.1  0.0000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000168215  unclonable  0.0000194697 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3310  HAD family hydrolase  33.33 
 
 
232 aa  75.1  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2067  HAD family hydrolase  35.03 
 
 
202 aa  75.1  0.0000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000117425  hitchhiker  0.0000127527 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4954  pyrophosphatase PpaX  26.7 
 
 
215 aa  75.1  0.0000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1478  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.35 
 
 
220 aa  74.7  0.0000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0104021  normal  0.265718 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1317  HAD family hydrolase  35.52 
 
 
224 aa  74.7  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.716581  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6512  HAD family hydrolase  35.52 
 
 
224 aa  74.7  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6309  HAD family hydrolase  34.97 
 
 
224 aa  74.7  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.403057 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6102  HAD family hydrolase  35.52 
 
 
224 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.524869  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1114  HAD family hydrolase  30.68 
 
 
218 aa  73.9  0.000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.35546  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3681  phosphoglycolate phosphatase  33.98 
 
 
252 aa  73.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.123155  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1593  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  32.76 
 
 
202 aa  74.3  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.113259 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4817  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.35 
 
 
235 aa  73.9  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.821962  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1284  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.71 
 
 
227 aa  73.9  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.153215  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5246  pyrophosphatase PpaX  26.7 
 
 
216 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5583  HAD family hydrolase  34.22 
 
 
224 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0647  HAD family hydrolase  28.88 
 
 
221 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.496334  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3850  phosphoglycolate phosphatase  33.98 
 
 
252 aa  73.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2242  phosphatases  30.46 
 
 
256 aa  73.6  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3788  phosphoglycolate phosphatase  32.52 
 
 
252 aa  73.2  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1117  phosphoglycolate phosphatase  34.41 
 
 
209 aa  73.6  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.31485  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1040  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.79 
 
 
211 aa  73.2  0.000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1761  HAD family hydrolase  35.68 
 
 
230 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0120798  normal  0.0416472 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3754  phosphoglycolate phosphatase  33.98 
 
 
252 aa  73.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3915  HAD family hydrolase  30.85 
 
 
238 aa  73.6  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2141  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.39 
 
 
200 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.189137  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3679  phosphoglycolate phosphatase  33.98 
 
 
252 aa  73.6  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.966867  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0794  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  29.24 
 
 
197 aa  73.6  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0913327  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0525  HAD family hydrolase  30.22 
 
 
209 aa  73.2  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00124351  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1807  HAD superfamily hydrolase  29.94 
 
 
212 aa  73.6  0.000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5624  HAD family hydrolase  34.97 
 
 
228 aa  72.8  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147818  normal  0.407625 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0595  HAD family hydrolase  28.09 
 
 
215 aa  72.8  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0609  HAD family hydrolase  28.09 
 
 
215 aa  72.8  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0822  HAD family hydrolase  35.71 
 
 
224 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.923988 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2449  HAD family hydrolase  27.84 
 
 
217 aa  72.8  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0190416  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1177  phosphoglycolate phosphatase  36.16 
 
 
209 aa  72.4  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1000  fructose-1-phosphatase  30.99 
 
 
188 aa  72.4  0.000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.341629  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4411  HAD family hydrolase  35.36 
 
 
224 aa  72  0.000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.981308  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0770  putative phosphatase  32.95 
 
 
200 aa  72  0.000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.737749  normal  0.0504873 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4503  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.16 
 
 
224 aa  72  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5010  pyrophosphatase PpaX  26.14 
 
 
216 aa  71.6  0.000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5390  pyrophosphatase PpaX  26.14 
 
 
216 aa  71.6  0.000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0072  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.26 
 
 
230 aa  71.6  0.000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5265  pyrophosphatase PpaX  26.14 
 
 
216 aa  71.6  0.000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4839  pyrophosphatase PpaX  26.14 
 
 
216 aa  71.6  0.000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4854  pyrophosphatase PpaX  26.14 
 
 
216 aa  71.6  0.000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1245  phosphoglycolate phosphatase  36.72 
 
 
209 aa  71.6  0.000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>