More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2595 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2595  Cl- channel, voltage gated  100 
 
 		 544 aa  1073    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.4857  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1620  chloride channel protein EriC  40.72 
 
 		 606 aa  335  9e-91  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1447  Cl- channel voltage-gated family protein  44.6 
 
 		 598 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000054528  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0176  chloride channel core  43.18 
 
 		 586 aa  298  1e-79  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.406579 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0583  Chloride channel core  40.99 
 
 		 462 aa  292  9e-78  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.602788  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1465  Cl- channel, voltage-gated family protein  40.95 
 
 		 580 aa  286  5.999999999999999e-76  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0939  Cl- channel voltage-gated family protein  40 
 
 		 582 aa  278  1e-73  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.564922  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0357  Cl- channel, voltage-gated family protein  40.16 
 
 		 588 aa  256  9e-67  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1543  Cl- channel, voltage-gated family protein  41.72 
 
 		 582 aa  252  1e-65  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.445538 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1622  Cl- channel, voltage-gated family protein  38.27 
 
 		 754 aa  251  2e-65  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1059  Chloride channel core  41.23 
 
 		 625 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1071  hypothetical protein  40.82 
 
 		 457 aa  244  3e-63  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2352  Cl- channel, voltage-gated family protein  42.65 
 
 		 612 aa  235  2.0000000000000002e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3504  chloride channel family protein  37.6 
 
 		 602 aa  226  7e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1761  Chloride channel core  41.18 
 
 		 605 aa  216  9e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2452  Cl- channel voltage-gated family protein  38.36 
 
 		 603 aa  215  1.9999999999999998e-54  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2453  Cl- channel voltage-gated family protein  35.47 
 
 		 605 aa  214  3.9999999999999995e-54  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2495  Cl- channel voltage-gated family protein  35.04 
 
 		 651 aa  213  5.999999999999999e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  0.575116 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0928  Cl- channel, voltage-gated family protein  40.1 
 
 		 612 aa  208  3e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.453543  hitchhiker  0.000208416 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1107  Chloride channel core  36.51 
 
 		 470 aa  205  2e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1039  Chloride channel core  37.9 
 
 		 453 aa  202  9.999999999999999e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2485  Cl- channel, voltage-gated family protein  37.31 
 
 		 603 aa  199  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6434  Chloride channel core  35.51 
 
 		 600 aa  197  3e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.741309 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0041  Cl- channel, voltage-gated family protein  33.71 
 
 		 587 aa  196  1e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10144  transmembrane protein  38.17 
 
 		 492 aa  193  6e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0310  CBS  34.54 
 
 		 615 aa  192  1e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1863  Cl- channel, voltage gated  32.1 
 
 		 569 aa  191  4e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3181  chloride channel core  34.33 
 
 		 669 aa  189  8e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11720  Chloride channel core  35.47 
 
 		 402 aa  187  3e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000807988  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1102  Cl- channel voltage-gated family protein  36.36 
 
 		 584 aa  187  4e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2501  Cl- channel, voltage gated  35.6 
 
 		 626 aa  186  8e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.169723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3129  voltage-gated chloride channel  34.62 
 
 		 467 aa  184  3e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.831797  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2728  Chloride channel core  34.62 
 
 		 474 aa  184  3e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.969759  hitchhiker  0.00000000119016 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5033  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  30.45 
 
 		 598 aa  177  4e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1241  Cl- channel, voltage-gated family protein  36.13 
 
 		 428 aa  176  9e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.730218 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2971  Chloride channel core  37.08 
 
 		 605 aa  173  9e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2363  chloride channel family protein, putative  29.8 
 
 		 614 aa  172  1e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.325858  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3482  Cl- channel, voltage-gated family protein  32.45 
 
 		 582 aa  172  1e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1443  Cl- channel, voltage gated  36.75 
 
 		 638 aa  171  4e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2504  Chloride channel core  36.75 
 
 		 634 aa  169  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.244911  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2794  chloride channel protein EriC  29.65 
 
 		 608 aa  169  2e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000831422  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2417  chloride channel core protein  36.5 
 
 		 612 aa  168  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1448  Chloride channel core  33.59 
 
 		 627 aa  166  8e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.132053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3819  Cl- channel voltage-gated family protein  33.72 
 
 		 456 aa  166  1.0000000000000001e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2293  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.31 
 
 		 636 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3470  Cl- channel, voltage gated  30.24 
 
 		 613 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0956  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.31 
 
 		 579 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872651  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2160  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.31 
 
 		 579 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2101  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.31 
 
 		 579 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.516415  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1750  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  30.75 
 
 		 589 aa  163  7e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2291  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.31 
 
 		 628 aa  163  9e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.369864  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1522  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  32.31 
 
 		 589 aa  162  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.457794 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6342  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.96 
 
 		 589 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.867968  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1737  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.96 
 
 		 589 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2950  Cl- channel, voltage gated  28.51 
 
 		 613 aa  161  3e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.952562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1975  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.45 
 
 		 591 aa  160  7e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224056  normal  0.0566649 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  30.55 
 
 		 593 aa  160  7e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  30.55 
 
 		 593 aa  159  9e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1953  Chloride channel core  30.62 
 
 		 429 aa  159  1e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0629221  normal  0.933518 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1400  chloride channel, putative  32.6 
 
 		 631 aa  159  2e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1514  Chloride channel core  35.66 
 
 		 627 aa  156  1e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1246  Cl- channel, voltage-gated family protein  35 
 
 		 620 aa  155  2e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1184  Chloride channel core  35.03 
 
 		 628 aa  154  4e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0945746  normal  0.895336 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2437  chloride channel core  33.18 
 
 		 629 aa  154  5e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.276438  normal  0.470563 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1431  Chloride channel core  34.74 
 
 		 605 aa  152  1e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1258  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.39 
 
 		 577 aa  151  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.725584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1639  Cl- channel voltage-gated family protein  34.43 
 
 		 597 aa  151  3e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2388  chloride channel core  35.49 
 
 		 650 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.360488 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2412  putative chloride channel protein  32.98 
 
 		 562 aa  147  3e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.03983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0919  chloride channel, putative  30.08 
 
 		 624 aa  147  5e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.870319  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2283  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.11 
 
 		 591 aa  144  4e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2543  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  30.21 
 
 		 591 aa  142  1.9999999999999998e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.232119  normal  0.0827659 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4536  Chloride channel core  29.04 
 
 		 603 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.143283 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1352  Cl- channel, voltage gated  30.09 
 
 		 577 aa  141  3.9999999999999997e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2090  Cl- channel, voltage gated  30.12 
 
 		 434 aa  139  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0263619  hitchhiker  0.00000244814 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6390  Chloride channel core  30.32 
 
 		 604 aa  137  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.315587  normal  0.638262 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0224  chloride channel protein  31.32 
 
 		 473 aa  137  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.154288  normal  0.638237 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0226  chloride channel protein  31.32 
 
 		 473 aa  137  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0240  chloride channel protein  31.32 
 
 		 473 aa  137  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2173  voltage-gated chloride channel family protein  28.82 
 
 		 519 aa  137  6.0000000000000005e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0241  chloride channel protein  31.32 
 
 		 473 aa  137  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0165964  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0223  chloride channel protein  31.32 
 
 		 473 aa  137  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.230311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1884  voltage gated chloride channel family protein  29.89 
 
 		 519 aa  137  7.000000000000001e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3939  chloride channel core  30.33 
 
 		 600 aa  135  3e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.194745  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0695  chloride channel protein  31.45 
 
 		 466 aa  134  5e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.750689  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3102  chloride channel protein  31.02 
 
 		 471 aa  134  5e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.965417  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1084  Chloride channel core  30.28 
 
 		 606 aa  133  9e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2446  chloride channel core  28.07 
 
 		 603 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3914  Chloride channel core  27.46 
 
 		 464 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3801  Chloride channel core  27.46 
 
 		 464 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.101597 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0367  Chloride channel core  28.07 
 
 		 595 aa  130  4.0000000000000003e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2746  Cl- channel, voltage gated  29.71 
 
 		 543 aa  130  5.0000000000000004e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.43501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0693  Cl- channel, voltage gated  29.74 
 
 		 564 aa  130  5.0000000000000004e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0559233  hitchhiker  0.000374815 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0845  Chloride channel core  33.33 
 
 		 640 aa  130  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0525209 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6375  Chloride channel core  31.61 
 
 		 595 aa  130  8.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0433  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.19 
 
 		 575 aa  129  9.000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.346865  normal  0.0128311 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0292  chloride channel core protein  31.87 
 
 		 455 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.158347  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5804  Chloride channel core  29.23 
 
 		 633 aa  128  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4701  Chloride channel core  31.89 
 
 		 471 aa  128  3e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.10029 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4484  chloride channel core  30 
 
 		 605 aa  126  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.529319 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>