More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2457 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2457  CrcB protein  100 
 
 		 127 aa  249  6e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000828061  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02112  camphor resistance protein CrcB  55.12 
 
 		 127 aa  143  9e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00000584991  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2756  camphor resistance protein CrcB  63.93 
 
 		 133 aa  135  2e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2981  camphor resistance protein CrcB  51.61 
 
 		 126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1798  camphor resistance protein CrcB  55.65 
 
 		 124 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00100672  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2453  camphor resistance protein CrcB  53.39 
 
 		 126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2309  camphor resistance protein CrcB  53.04 
 
 		 124 aa  125  3e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2159  camphor resistance protein CrcB  53.91 
 
 		 124 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0154034  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2194  camphor resistance protein CrcB  53.91 
 
 		 124 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000253648  normal  0.211581 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1966  camphor resistance protein CrcB  53.04 
 
 		 124 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000505957  normal  0.854467 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2010  camphor resistance protein CrcB  53.04 
 
 		 124 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000369188  hitchhiker  0.000296247 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2053  camphor resistance protein CrcB  53.04 
 
 		 124 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0174627  hitchhiker  0.00029045 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1746  camphor resistance protein CrcB  50.86 
 
 		 124 aa  124  5e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00274275  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1775  camphor resistance protein CrcB  55.17 
 
 		 124 aa  124  5e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00911899  hitchhiker  0.00720449 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2320  camphor resistance protein CrcB  53.91 
 
 		 124 aa  124  6e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000583526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2212  camphor resistance protein CrcB  53.91 
 
 		 124 aa  124  6e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000881037  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002071  CrbC-like protein  52.46 
 
 		 127 aa  123  7e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2008  camphor resistance protein CrcB  52.17 
 
 		 124 aa  122  1e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00493999  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00367  camphor resistance protein CrcB  51.67 
 
 		 127 aa  122  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2021  camphor resistance protein CrcB  50.86 
 
 		 124 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000176643  hitchhiker  0.000131067 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1665  camphor resistance protein CrcB  53.91 
 
 		 128 aa  119  1.9999999999999998e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0623118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2480  camphor resistance protein CrcB  51.69 
 
 		 124 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000701119  hitchhiker  0.00000263281 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2130  camphor resistance protein CrcB  51.69 
 
 		 124 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000104865  normal  0.0132896 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2230  camphor resistance protein CrcB  52.59 
 
 		 124 aa  104  4e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00947563  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0714  camphor resistance protein CrcB  44.07 
 
 		 124 aa  95.1  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51179e-22 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0702  camphor resistance protein CrcB  43.22 
 
 		 124 aa  94.4  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0834947  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1673  camphor resistance protein CrcB  45.13 
 
 		 123 aa  94.4  5e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180087 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0545  crcB protein  47.41 
 
 		 122 aa  94  6e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0472858  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0624  hypothetical protein  47.41 
 
 		 122 aa  93.6  8e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1973  crcB protein domain-containing protein  43.81 
 
 		 228 aa  93.2  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4547  camphor resistance protein CrcB  44.92 
 
 		 132 aa  90.5  7e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.73644  normal  0.557218 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1258  camphor resistance protein CrcB  42.37 
 
 		 124 aa  89.4  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.415853  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2599  camphor resistance protein CrcB  42.86 
 
 		 126 aa  89  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1029  CrcB protein  42.98 
 
 		 124 aa  88.2  3e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0154206  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0767  crcB protein  45.08 
 
 		 132 aa  87.4  5e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0701738  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1038  CrcB family protein  43.36 
 
 		 124 aa  87.4  6e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0704  putative camphor resistance protein CrcB  42.24 
 
 		 122 aa  86.3  1e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3016  camphor resistance protein CrcB  41.38 
 
 		 124 aa  85.5  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.120468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0835  camphor resistance protein CrcB  39.64 
 
 		 129 aa  80.9  0.000000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.320485  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0236  camphor resistance protein CrcB  42.24 
 
 		 129 aa  80.5  0.000000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.966722  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0954  camphor resistance protein CrcB  37.93 
 
 		 125 aa  80.5  0.000000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3612  CrcB protein  42.48 
 
 		 142 aa  80.5  0.000000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0121733  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1711  CrcB protein  42.37 
 
 		 126 aa  79.3  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00823549  normal  0.187821 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2473  CrcB protein  42.24 
 
 		 124 aa  77.8  0.00000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0590  camphor resistance protein CrcB  44.83 
 
 		 122 aa  77.8  0.00000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0950  CrcB protein  41.13 
 
 		 128 aa  77  0.00000000000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.238115  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0503  camphor resistance protein CrcB  37.07 
 
 		 140 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0574  camphor resistance protein CrcB  37.19 
 
 		 134 aa  75.1  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0550  camphor resistance protein CrcB  37.19 
 
 		 134 aa  74.7  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0313  camphor resistance protein CrcB  45.95 
 
 		 122 aa  74.7  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2396  CrcB protein  43.1 
 
 		 124 aa  74.3  0.0000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0524  camphor resistance protein CrcB  45.05 
 
 		 122 aa  73.9  0.0000000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.184364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1395  camphor resistance protein CrcB  45.05 
 
 		 122 aa  73.2  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.283613  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2292  CrcB protein  42.37 
 
 		 117 aa  73.2  0.000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2087  camphor resistance protein CrcB  36.21 
 
 		 125 aa  72.8  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0239295  normal  0.26829 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1023  camphor resistance protein CrcB  35 
 
 		 124 aa  72.4  0.000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0304  CrcB protein  34.65 
 
 		 193 aa  72  0.000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.643284  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1873  CrcB protein  37.93 
 
 		 130 aa  71.6  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1696  camphor resistance protein CrcB  43.01 
 
 		 99 aa  72  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.153881 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2101  crcB protein  37.93 
 
 		 126 aa  71.6  0.000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3454  hypothetical protein  37.3 
 
 		 136 aa  71.2  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.767422  normal  0.0839513 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1885  camphor resistance protein CrcB  35.34 
 
 		 125 aa  71.2  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.230802  normal  0.0214416 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2998  CrcB protein  38.14 
 
 		 121 aa  71.2  0.000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0975  camphor resistance protein CrcB  37.61 
 
 		 131 aa  70.1  0.000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00880668 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0566  CrcB protein  36.11 
 
 		 151 aa  69.7  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.431956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3567  camphor resistance protein CrcB  37.93 
 
 		 126 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.366637  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2546  crcB protein  39.17 
 
 		 131 aa  69.3  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.926417  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2423  CrcB protein  38.89 
 
 		 127 aa  68.9  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.541327  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2768  CrcB protein  35.88 
 
 		 133 aa  68.9  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1553  CrcB protein  39.47 
 
 		 123 aa  68.6  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1535  CrcB protein  35.25 
 
 		 124 aa  68.6  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.235581  normal  0.972453 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2060  CrcB protein  43.56 
 
 		 118 aa  68.2  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000119505  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2926  crcB protein, putative  38.98 
 
 		 125 aa  67.8  0.00000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0708  camphor resistance protein CrcB  42.53 
 
 		 133 aa  67.8  0.00000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.610565  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2541  Camphor resistance CrcB protein  38.98 
 
 		 125 aa  67.8  0.00000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2720  CrcB protein  34.51 
 
 		 123 aa  67.8  0.00000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.177615 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1284  camphor resistance protein CrcB  34.48 
 
 		 128 aa  67.8  0.00000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0693229  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5216  camphor resistance protein CrcB  39.36 
 
 		 137 aa  67  0.00000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0036  CrcB protein  39.56 
 
 		 134 aa  66.2  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000868029  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3253  CrcB protein  35.05 
 
 		 123 aa  66.2  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00499061  hitchhiker  0.0000000448266 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1020  camphor resistance protein CrcB  36.21 
 
 		 128 aa  66.2  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.712483 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3649  camphor resistance protein CrcB  41.67 
 
 		 162 aa  66.6  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.109393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2690  camphor resistance protein CrcB  36.52 
 
 		 131 aa  66.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.190372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4479  CrcB protein  35.83 
 
 		 143 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.29462  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0797  camphor resistance protein CrcB  41.38 
 
 		 133 aa  66.6  0.0000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.682484  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2979  camphor resistance protein CrcB  37.93 
 
 		 133 aa  66.2  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3600  camphor resistance protein CrcB  38.89 
 
 		 137 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0581659 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4001  camphor resistance protein CrcB  36.36 
 
 		 124 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.197793  hitchhiker  0.00247949 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3606  camphor resistance protein CrcB  35.54 
 
 		 124 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.898209 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1832  camphor resistance protein CrcB  36.36 
 
 		 124 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.396081  hitchhiker  0.000454146 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1744  camphor resistance protein CrcB  36.44 
 
 		 124 aa  64.7  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.377174  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0981  camphor resistance protein CrcB  39.32 
 
 		 123 aa  64.7  0.0000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0390  camphor resistance protein CrcB  36.44 
 
 		 124 aa  64.7  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0815  CrcB protein  35.65 
 
 		 116 aa  63.9  0.0000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0493  camphor resistance protein CrcB  40.95 
 
 		 122 aa  64.3  0.0000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2102  camphor resistance protein CrcB  41.24 
 
 		 124 aa  64.3  0.0000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5442  CrcB protein  37.19 
 
 		 125 aa  63.9  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.258176  normal  0.897038 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0821  camphor resistance protein CrcB  38.05 
 
 		 119 aa  64.3  0.0000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000515091  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2949  camphor resistance protein CrcB  35.54 
 
 		 131 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.478651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3030  camphor resistance protein CrcB  42.31 
 
 		 127 aa  62.8  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0482718  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>