247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1584 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_1584  heat-inducible transcription repressor HrcA  100 
 
 
355 aa  710    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0405407  normal  0.92109 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0852  heat-inducible transcription repressor HrcA  75.57 
 
 
352 aa  531  1e-150  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000798952  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1693  heat-inducible transcription repressor HrcA  66.57 
 
 
357 aa  473  1e-132  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.608682  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1086  heat-inducible transcription repressor HrcA  67.33 
 
 
350 aa  473  1e-132  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0111351  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1874  heat-inducible transcription repressor HrcA  65.83 
 
 
357 aa  468  1.0000000000000001e-131  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00580637  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1489  negative regulator of class I heat shock protein  63.61 
 
 
357 aa  449  1e-125  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1424  negative regulator of class I heat shock protein  61.65 
 
 
348 aa  435  1e-121  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2127  heat-inducible transcription repressor HrcA  41.69 
 
 
373 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0209  heat-inducible transcription repressor HrcA  36.71 
 
 
343 aa  210  3e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000018934  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1034  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.52 
 
 
348 aa  202  8e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00468429  hitchhiker  0.0007913 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2831  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.83 
 
 
344 aa  199  6e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.304325  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0031  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.87 
 
 
342 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.820963  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3534  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.29 
 
 
343 aa  194  2e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000167088  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2499  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.33 
 
 
347 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000196344  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0305  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.85 
 
 
342 aa  189  5.999999999999999e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2439  heat-inducible transcription repressor  31.55 
 
 
344 aa  188  1e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000794362  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1406  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.23 
 
 
343 aa  187  2e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1181  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.09 
 
 
343 aa  187  3e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00891806 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2060  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.36 
 
 
344 aa  185  1.0000000000000001e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4301  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.07 
 
 
345 aa  182  8.000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000482249  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2081  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.46 
 
 
343 aa  180  4e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0109  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.84 
 
 
357 aa  179  4.999999999999999e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000620435  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4476  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.04 
 
 
354 aa  179  7e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.457422 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1800  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.99 
 
 
348 aa  179  7e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.478668  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3507  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.62 
 
 
343 aa  179  8e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.848963  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1011  heat-inducible transcription repressor  30.06 
 
 
344 aa  178  2e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12820  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.41 
 
 
347 aa  177  4e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.428207  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4449  heat-inducible transcription repressor  31.81 
 
 
338 aa  176  5e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000694366  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3576  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.33 
 
 
343 aa  176  5e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1998  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.62 
 
 
344 aa  176  7e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.503074  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4397  heat-inducible transcription repressor  31.52 
 
 
338 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.332663  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3224  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.17 
 
 
345 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00005295  hitchhiker  0.00493399 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1553  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.01 
 
 
343 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000153808  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4215  heat-inducible transcription repressor  32.26 
 
 
338 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4053  heat-inducible transcription repressor  32.26 
 
 
338 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00744253  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4541  heat-inducible transcription repressor  32.26 
 
 
338 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0123825  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4330  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.23 
 
 
355 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.22068  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0801  heat-inducible transcription repressor  31.23 
 
 
338 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000436482  hitchhiker  4.70073e-19 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4338  heat-inducible transcription repressor  32.26 
 
 
338 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.3771500000000003e-32 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4063  heat-inducible transcription repressor  32.16 
 
 
338 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.526253  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4435  heat-inducible transcription repressor  31.23 
 
 
338 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000489937  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5123  heat-inducible transcription repressor  31.37 
 
 
364 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.779513  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4167  heat-inducible transcription repressor  30.95 
 
 
338 aa  171  3e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00317032  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0583  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.07 
 
 
344 aa  170  4e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3042  heat-inducible transcription repressor  30.97 
 
 
343 aa  169  7e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00211057  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4466  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.62 
 
 
353 aa  169  8e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.769802  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4485  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.62 
 
 
353 aa  169  8e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0604  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.83 
 
 
343 aa  168  1e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0458  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.2 
 
 
351 aa  167  2e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.482284  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1902  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.78 
 
 
350 aa  167  2e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.807416  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2882  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.64 
 
 
338 aa  168  2e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.483845  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1324  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.2 
 
 
351 aa  167  2e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3642  heat-inducible transcription repressor  30.2 
 
 
352 aa  166  4e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.175788  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0773  heat-inducible transcription repressor  31.34 
 
 
339 aa  166  4e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000164751 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1026  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.93 
 
 
354 aa  166  5e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3966  heat-inducible transcription repressor  32.48 
 
 
339 aa  166  5e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0692211 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0732  heat-inducible transcription repressor  32.76 
 
 
339 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2549  heat-inducible transcription repressor HrcA  30 
 
 
357 aa  166  8e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.330864 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2639  heat-inducible transcription repressor  33.52 
 
 
340 aa  165  9e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1302  heat-inducible transcription repressor  34.28 
 
 
340 aa  165  9e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.132578  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1401  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.62 
 
 
345 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0715  heat-inducible transcription repressor  33.24 
 
 
340 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0261  heat-inducible transcription repressor  33.24 
 
 
340 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0745  heat-inducible transcription repressor  33.24 
 
 
340 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.211832  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0494  heat-inducible transcription repressor  33.99 
 
 
385 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1105  heat-inducible transcription repressor  33.99 
 
 
385 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.854557  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2331  heat-inducible transcription repressor  33.99 
 
 
340 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3327  heat-inducible transcription repressor  33.99 
 
 
340 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3244  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.99 
 
 
347 aa  164  2.0000000000000002e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.488784  normal  0.0534413 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3284  heat-inducible transcription repressor  33.99 
 
 
340 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.245483  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3317  heat-inducible transcription repressor  33.99 
 
 
340 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2212  heat-inducible transcription repressor  33.99 
 
 
340 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0663  heat-inducible transcription repressor  33.24 
 
 
340 aa  164  3e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2649  heat-inducible transcription repressor  32.31 
 
 
352 aa  163  3e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.414753  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1183  heat-inducible transcription repressor  30.62 
 
 
345 aa  164  3e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000556143  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1581  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.94 
 
 
341 aa  164  3e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00115825  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0639  heat-inducible transcription repressor  33.24 
 
 
340 aa  164  3e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0868  negative regulator of class I heat shock protein  30.95 
 
 
342 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2886  heat-inducible transcription repressor  33.24 
 
 
352 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0905  heat-inducible transcription repressor  32.95 
 
 
334 aa  163  5.0000000000000005e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2503  heat-inducible transcription repressor  31.82 
 
 
339 aa  161  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.113084  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2480  heat-inducible transcription repressor  32.49 
 
 
352 aa  161  1e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07690  heat shock gene repressor HrcA  33.52 
 
 
336 aa  162  1e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.809347 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0847  heat-inducible transcription repressor  32.95 
 
 
334 aa  160  3e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.617842  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1478  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.28 
 
 
351 aa  160  3e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0102  heat-inducible transcription repressor HrcA  27.37 
 
 
363 aa  160  4e-38  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.354305  normal  0.141179 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1648  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.33 
 
 
337 aa  159  7e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.685607  normal  0.0242929 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01183  heat-inducible transcription repressor  30.66 
 
 
343 aa  158  1e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.180018  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3593  heat-inducible transcription repressor  32.38 
 
 
334 aa  159  1e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.294148  hitchhiker  0.00295463 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1210  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.34 
 
 
345 aa  158  2e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000297014  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1661  heat-inducible transcription repressor  31.12 
 
 
365 aa  157  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.10502  normal  0.194823 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2423  heat-inducible transcription repressor  30.29 
 
 
339 aa  157  2e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.557325  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4390  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.29 
 
 
359 aa  158  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.320448 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1162  heat-inducible transcription repressor  29.7 
 
 
360 aa  158  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1036  heat-inducible transcription repressor  31.14 
 
 
345 aa  157  4e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.672204  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1973  heat-inducible transcription repressor  31.09 
 
 
337 aa  156  5.0000000000000005e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000596176 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3462  heat-inducible transcription repressor HrcA  27.81 
 
 
359 aa  156  6e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000760738 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0438  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.08 
 
 
354 aa  155  9e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000928252  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1333  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.13 
 
 
343 aa  155  1e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000176294  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2313  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.01 
 
 
345 aa  154  2.9999999999999998e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000876043  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>