More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0672 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_0672  hypothetical protein  100 
 
 
414 aa  855    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000206571 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0485  hypothetical protein  70.02 
 
 
414 aa  597  1e-169  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1956  hypothetical protein  67.95 
 
 
411 aa  549  1e-155  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0016  hypothetical protein  49.51 
 
 
429 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.986681 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06088  hypothetical protein  50.13 
 
 
433 aa  379  1e-104  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0456  hypothetical protein  51.44 
 
 
389 aa  378  1e-103  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.882052  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4048  hypothetical protein  47.78 
 
 
417 aa  378  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.139975 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000288  8-amino-7-oxononanoate synthase/CqsA  49.87 
 
 
393 aa  377  1e-103  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.331723  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3515  hypothetical protein  47.3 
 
 
415 aa  362  7.0000000000000005e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2656  hypothetical protein  44.25 
 
 
416 aa  327  3e-88  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2787  hypothetical protein  41.99 
 
 
416 aa  326  5e-88  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0774  hypothetical protein  66.95 
 
 
255 aa  322  9.999999999999999e-87  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.638698 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0771  hypothetical protein  61.35 
 
 
187 aa  221  3e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.403865 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2943  aminotransferase class I and II  35.65 
 
 
400 aa  197  4.0000000000000005e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.064626  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2045  8-amino-7-oxononanoate synthase  28.17 
 
 
390 aa  172  1e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0152681  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2195  Glycine C-acetyltransferase  29.28 
 
 
401 aa  170  4e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.880865  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2207  Glycine C-acetyltransferase  29.47 
 
 
416 aa  170  4e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.35112  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1185  glycine C-acetyltransferase  29.36 
 
 
396 aa  168  2e-40  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0779  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  26.28 
 
 
395 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2194  8-amino-7-oxononanoate synthase, putative  28.57 
 
 
395 aa  163  4.0000000000000004e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2767  8-amino-7-oxononanoate synthase  27.79 
 
 
399 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02854  conserved hypothetical protein  30.25 
 
 
390 aa  163  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000161764  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02803  hypothetical protein  30.25 
 
 
390 aa  163  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000119299  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0715  8-amino-7-oxononanoate synthase  30.25 
 
 
390 aa  163  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1780  8-amino-7-oxononanoate synthase  30.35 
 
 
395 aa  162  8.000000000000001e-39  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44240  8-amino-7-oxononanoate synthase-like protein  31.41 
 
 
391 aa  161  2e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3263  putative serine palmitoyltransferase  29.97 
 
 
390 aa  161  2e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3445  aminotransferase, class I/II  29.97 
 
 
390 aa  161  2e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3158  putative serine palmitoyltransferase  29.97 
 
 
390 aa  161  2e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0699  aminotransferase class I and II  28.93 
 
 
396 aa  159  8e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0699  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  27.17 
 
 
395 aa  159  9e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0448  aminotransferase class I and II  27.37 
 
 
428 aa  158  2e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.341482  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1307  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  28.45 
 
 
395 aa  158  2e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4009  8-amino-7-oxononanoate synthase  28.13 
 
 
398 aa  156  7e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0774739  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0228  8-amino-7-oxononanoate synthase  29.71 
 
 
395 aa  155  8e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00625814  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2397  Glycine C-acetyltransferase  28.65 
 
 
401 aa  155  1e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.135893  normal  0.0678456 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0022  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  28.12 
 
 
388 aa  155  1e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0282575  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2930  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  29.46 
 
 
397 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.573934  normal  0.531158 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0292  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  26.03 
 
 
393 aa  154  2.9999999999999998e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3111  serine palmitoyltransferase  27.02 
 
 
399 aa  154  4e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2905  5-aminolevulinate synthase  30.29 
 
 
408 aa  154  4e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0410765  hitchhiker  0.000282174 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1346  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  26.84 
 
 
391 aa  152  1e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.583033  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1549  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  27.97 
 
 
393 aa  151  2e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000387483  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3076  serine palmitoyltransferase  26.76 
 
 
393 aa  150  3e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.473722  normal  0.645206 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0669  glycine C-acetyltransferase  28.74 
 
 
446 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.236778  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3873  8-amino-7-oxononanoate synthase  26.96 
 
 
395 aa  147  3e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1652  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  28.21 
 
 
393 aa  147  3e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1009  8-amino-7-oxononanoate synthase  25.89 
 
 
395 aa  146  5e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4228  8-amino-7-oxononanoate synthase  25.89 
 
 
395 aa  146  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.323305  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1195  8-amino-7-oxononanoate synthase  30.09 
 
 
382 aa  146  8.000000000000001e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.760383 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3949  8-amino-7-oxononanoate synthase  25.52 
 
 
395 aa  145  9e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2816  8-amino-7-oxononanoate synthase  25.46 
 
 
395 aa  145  1e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3755  5-aminolevulinate synthase  26.83 
 
 
407 aa  145  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.940743  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0113  8-amino-7-oxononanoate synthase  27.69 
 
 
394 aa  145  1e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1665  8-amino-7-oxononanoate synthase  27.02 
 
 
390 aa  145  2e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000158621  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1146  5-aminolevulinate synthase  29.13 
 
 
421 aa  144  2e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0527812  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2557  Glycine C-acetyltransferase  27.92 
 
 
403 aa  144  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.470257  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4187  8-amino-7-oxononanoate synthase  25.6 
 
 
395 aa  144  4e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3724  5-aminolevulinate synthase  27.97 
 
 
403 aa  144  4e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00666631  hitchhiker  0.00153498 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4141  8-amino-7-oxononanoate synthase  26.38 
 
 
395 aa  143  5e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4026  8-amino-7-oxononanoate synthase  26.38 
 
 
395 aa  143  5e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4339  8-amino-7-oxononanoate synthase  26.38 
 
 
395 aa  143  5e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4251  8-amino-7-oxononanoate synthase  25.67 
 
 
394 aa  143  5e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1742  5-aminolevulinate synthase  28.74 
 
 
403 aa  143  5e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6894  8-amino-7-oxononanoate synthase  29.52 
 
 
399 aa  143  6e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3859  8-amino-7-oxononanoate synthase  26.38 
 
 
395 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3969  5-aminolevulinate synthase  27.97 
 
 
403 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0108645  normal  0.403503 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2171  glycine C-acetyltransferase  26.59 
 
 
400 aa  142  9.999999999999999e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.515105  normal  0.926821 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3028  5-aminolevulinate synthase  26.29 
 
 
407 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0533  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  26.87 
 
 
396 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.801462  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16481  putative 8-amino-7-oxononanoate synthase  28.12 
 
 
381 aa  140  4.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84331  palmitoyl transferase  27.91 
 
 
566 aa  139  7.999999999999999e-32  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1325  5-aminolevulinate synthase  27.12 
 
 
403 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0148844  normal  0.108489 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3900  serine palmitoyltransferase  26.63 
 
 
400 aa  139  8.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.673344  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0922  5-aminolevulinate synthase  29.64 
 
 
409 aa  138  1e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0688  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  27.15 
 
 
396 aa  139  1e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0831  8-amino-7-oxononanoate synthase  27.7 
 
 
389 aa  138  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1470  8-amino-7-oxononanoate synthase  29.97 
 
 
402 aa  139  1e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.000728084  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0573  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  25.56 
 
 
395 aa  138  2e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.709963  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10060  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  25.48 
 
 
399 aa  138  2e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.251094  normal  0.644816 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1570  8-amino-7-oxononanoate synthase  29.12 
 
 
501 aa  138  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.537635  normal  0.306191 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0587  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  25.56 
 
 
395 aa  138  2e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4993  glycine C-acetyltransferase  28.48 
 
 
407 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2789  Glycine C-acetyltransferase  26.22 
 
 
428 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0317  8-amino-7-oxononanoate synthase  27.09 
 
 
385 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2298  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  25.27 
 
 
395 aa  137  4e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000248128  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4023  5-aminolevulinate synthase  28.45 
 
 
410 aa  137  4e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.510651 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3938  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  25.6 
 
 
397 aa  137  4e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.542648  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2856  8-amino-7-oxononanoate synthase  26.65 
 
 
390 aa  136  5e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0731  Glycine C-acetyltransferase  25.49 
 
 
396 aa  136  6.0000000000000005e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.000138233  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0534  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  26.2 
 
 
396 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1830  5-aminolevulinate synthase  28.07 
 
 
403 aa  136  7.000000000000001e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1797  5-aminolevulinate synthase  26.12 
 
 
406 aa  136  7.000000000000001e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4680  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  26.87 
 
 
396 aa  136  8e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.721634  hitchhiker  3.77656e-21 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0530  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  26.87 
 
 
396 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0530  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  26.87 
 
 
396 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0147  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  27.58 
 
 
395 aa  135  9.999999999999999e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0675  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  26.87 
 
 
396 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.36128e-18 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0748  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  26.87 
 
 
396 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00398054  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0620  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  26.59 
 
 
396 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>