More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0016 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0016  hypothetical protein  100 
 
 		 429 aa  879    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.986681 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4048  hypothetical protein  50.12 
 
 		 417 aa  409  1e-113  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.139975 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3515  hypothetical protein  49.87 
 
 		 415 aa  402  1e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0672  hypothetical protein  49.51 
 
 		 414 aa  399  9.999999999999999e-111  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000206571 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1956  hypothetical protein  51.13 
 
 		 411 aa  398  1e-109  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0485  hypothetical protein  50.9 
 
 		 414 aa  394  1e-108  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0456  hypothetical protein  48.81 
 
 		 389 aa  361  1e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.882052  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2656  hypothetical protein  44.8 
 
 		 416 aa  358  9e-98  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2787  hypothetical protein  44.57 
 
 		 416 aa  353  2e-96  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06088  hypothetical protein  43.6 
 
 		 433 aa  325  1e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000288  8-amino-7-oxononanoate synthase/CqsA  44.33 
 
 		 393 aa  320  3e-86  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.331723  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0774  hypothetical protein  54.24 
 
 		 255 aa  266  4e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.638698 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2943  aminotransferase class I and II  36.76 
 
 		 400 aa  199  9e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.064626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0147  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  27.82 
 
 		 395 aa  170  4e-41  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1354  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  29.28 
 
 		 398 aa  162  1e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000120772 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1185  glycine C-acetyltransferase  28.19 
 
 		 396 aa  161  2e-38  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2045  8-amino-7-oxononanoate synthase  26.91 
 
 		 390 aa  159  7e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0152681  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44240  8-amino-7-oxononanoate synthase-like protein  28.99 
 
 		 391 aa  157  2e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0022  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  29.77 
 
 		 388 aa  157  3e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0282575  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3445  aminotransferase, class I/II  28.7 
 
 		 390 aa  157  4e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3263  putative serine palmitoyltransferase  28.7 
 
 		 390 aa  157  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0448  aminotransferase class I and II  28.08 
 
 		 428 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.341482  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3158  putative serine palmitoyltransferase  28.7 
 
 		 390 aa  157  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0113  8-amino-7-oxononanoate synthase  31.42 
 
 		 394 aa  156  6e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02854  conserved hypothetical protein  28.7 
 
 		 390 aa  156  9e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000161764  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0715  8-amino-7-oxononanoate synthase  28.7 
 
 		 390 aa  156  9e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02803  hypothetical protein  28.7 
 
 		 390 aa  156  9e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000119299  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2207  Glycine C-acetyltransferase  27.59 
 
 		 416 aa  155  1e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.35112  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4009  8-amino-7-oxononanoate synthase  29.15 
 
 		 398 aa  155  2e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0774739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2195  Glycine C-acetyltransferase  25.97 
 
 		 401 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.880865  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5431  8-amino-7-oxononanoate synthase  26.3 
 
 		 407 aa  152  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4805  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  29.13 
 
 		 400 aa  152  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.730908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16481  putative 8-amino-7-oxononanoate synthase  29.34 
 
 		 381 aa  152  1e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1311  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  27.11 
 
 		 402 aa  151  2e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.616211  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0228  8-amino-7-oxononanoate synthase  28.45 
 
 		 395 aa  150  3e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00625814  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2397  Glycine C-acetyltransferase  27.49 
 
 		 401 aa  150  3e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.135893  normal  0.0678456 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2856  8-amino-7-oxononanoate synthase  29.68 
 
 		 390 aa  150  6e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0680  8-amino-7-oxononanoate synthase  28.41 
 
 		 385 aa  149  8e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1346  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  26.54 
 
 		 391 aa  149  8e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.583033  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2194  8-amino-7-oxononanoate synthase, putative  25.35 
 
 		 395 aa  149  1.0000000000000001e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1685  8-amino-7-oxononanoate synthase  26.58 
 
 		 405 aa  149  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.888348  normal  0.418034 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1029  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  28.65 
 
 		 392 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4834  8-amino-7-oxononanoate synthase  27.14 
 
 		 380 aa  147  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.348424 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2429  8-amino-7-oxononanoate synthase  30.33 
 
 		 388 aa  147  3e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0779  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  24.93 
 
 		 395 aa  147  3e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0276  5-aminolevulinate synthase  27.16 
 
 		 409 aa  147  4.0000000000000006e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.121176  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2755  8-amino-7-oxononanoate synthase  28.11 
 
 		 394 aa  147  5e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.611384  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5158  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  28.74 
 
 		 399 aa  146  6e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5701  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  28.74 
 
 		 399 aa  146  6e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00514262 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3945  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  30.26 
 
 		 398 aa  146  7.0000000000000006e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2959  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  28.18 
 
 		 395 aa  146  7.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.464612 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2789  Glycine C-acetyltransferase  27.95 
 
 		 428 aa  146  8.000000000000001e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4536  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  28.45 
 
 		 399 aa  145  9e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0669  glycine C-acetyltransferase  28.07 
 
 		 446 aa  145  1e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.236778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4993  glycine C-acetyltransferase  27.94 
 
 		 407 aa  145  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2557  Glycine C-acetyltransferase  26.03 
 
 		 403 aa  145  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.470257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1549  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  25.88 
 
 		 393 aa  144  3e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000387483  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05000  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  26.9 
 
 		 397 aa  144  3e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2225  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  26.6 
 
 		 395 aa  144  3e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3456  8-amino-7-oxononanoate synthase  27.46 
 
 		 403 aa  144  4e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0094566  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1780  8-amino-7-oxononanoate synthase  28.05 
 
 		 395 aa  144  4e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1652  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  26.76 
 
 		 393 aa  144  4e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0317  8-amino-7-oxononanoate synthase  25.27 
 
 		 385 aa  143  5e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3756  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  29 
 
 		 397 aa  143  5e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.399455  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0699  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  26.84 
 
 		 395 aa  143  6e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4563  5-aminolevulinate synthase  28.41 
 
 		 409 aa  143  6e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0101  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  26.09 
 
 		 397 aa  143  6e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.396382 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0861  5-aminolevulinate synthase  29.17 
 
 		 409 aa  143  6e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.787076  normal  0.0986028 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4023  5-aminolevulinate synthase  27.7 
 
 		 410 aa  143  7e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.510651 
 
 
-
 
NC_002950  PG1195  8-amino-7-oxononanoate synthase  30.43 
 
 		 382 aa  142  9e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.760383 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1051  8-amino-7-oxononanoate synthase  30.27 
 
 		 398 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.307967  normal  0.238477 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3179  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  28.24 
 
 		 399 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2701  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  27.62 
 
 		 395 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.114226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0771  hypothetical protein  42.24 
 
 		 187 aa  142  9.999999999999999e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.403865 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001212  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  26.9 
 
 		 397 aa  142  9.999999999999999e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4407  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  26.6 
 
 		 395 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02780  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  26.09 
 
 		 405 aa  141  1.9999999999999998e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1561  putative 8-amino-7-oxononanoate synthase  27.51 
 
 		 379 aa  141  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.158607  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0836  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  28.11 
 
 		 395 aa  141  1.9999999999999998e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.425647 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0699  aminotransferase class I and II  26.69 
 
 		 396 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4824  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  27.79 
 
 		 398 aa  141  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000213173 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0443  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  28.34 
 
 		 395 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.504807  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2767  8-amino-7-oxononanoate synthase  26.16 
 
 		 399 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5321  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  27.95 
 
 		 399 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2967  8-amino-7-oxononanoate synthase  26.9 
 
 		 396 aa  141  3e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4824  5-aminolevulinate synthase  26.82 
 
 		 409 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3115  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  27.38 
 
 		 399 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.601738  normal  0.545145 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7004  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  27.93 
 
 		 399 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0838  5-aminolevulinate synthase  27.86 
 
 		 409 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.876251 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3755  5-aminolevulinate synthase  27.78 
 
 		 407 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.940743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0005  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  28.12 
 
 		 399 aa  140  6e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1325  5-aminolevulinate synthase  27.71 
 
 		 403 aa  140  6e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0148844  normal  0.108489 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4803  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  27.73 
 
 		 400 aa  139  7e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2816  8-amino-7-oxononanoate synthase  25 
 
 		 395 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1835  8-amino-7-oxononanoate synthase  27.71 
 
 		 384 aa  139  8.999999999999999e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0071  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  26.76 
 
 		 403 aa  139  8.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7064  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  28.02 
 
 		 394 aa  139  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0242  5-aminolevulinate synthase  27.32 
 
 		 409 aa  139  1e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0065  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  26.76 
 
 		 413 aa  139  1e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4972  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  27.38 
 
 		 399 aa  139  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.439865  normal  0.402945 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>