More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0456 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009456  VC0395_0456  hypothetical protein  100 
 
 
389 aa  811    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.882052  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06088  hypothetical protein  57.18 
 
 
433 aa  471  1e-132  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000288  8-amino-7-oxononanoate synthase/CqsA  57.88 
 
 
393 aa  469  1.0000000000000001e-131  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.331723  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1956  hypothetical protein  50.4 
 
 
411 aa  390  1e-107  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0672  hypothetical protein  51.44 
 
 
414 aa  378  1e-104  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000206571 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0485  hypothetical protein  50.27 
 
 
414 aa  375  1e-103  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0016  hypothetical protein  48.81 
 
 
429 aa  361  1e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.986681 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4048  hypothetical protein  44.85 
 
 
417 aa  333  2e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.139975 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2787  hypothetical protein  45.43 
 
 
416 aa  329  5.0000000000000004e-89  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3515  hypothetical protein  45.53 
 
 
415 aa  329  5.0000000000000004e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2656  hypothetical protein  45.43 
 
 
416 aa  324  1e-87  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0774  hypothetical protein  49.08 
 
 
255 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.638698 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2943  aminotransferase class I and II  34.99 
 
 
400 aa  187  2e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.064626  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0448  aminotransferase class I and II  28.69 
 
 
428 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.341482  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2195  Glycine C-acetyltransferase  31.41 
 
 
401 aa  161  2e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.880865  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3111  serine palmitoyltransferase  28.95 
 
 
399 aa  160  3e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0771  hypothetical protein  48.15 
 
 
187 aa  157  3e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.403865 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5431  8-amino-7-oxononanoate synthase  30.12 
 
 
407 aa  152  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2767  8-amino-7-oxononanoate synthase  30.48 
 
 
399 aa  150  3e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1835  8-amino-7-oxononanoate synthase  28.77 
 
 
384 aa  150  4e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1185  glycine C-acetyltransferase  29.33 
 
 
396 aa  149  8e-35  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2397  Glycine C-acetyltransferase  29.65 
 
 
401 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.135893  normal  0.0678456 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2207  Glycine C-acetyltransferase  29.07 
 
 
416 aa  146  7.0000000000000006e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.35112  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4009  8-amino-7-oxononanoate synthase  30.46 
 
 
398 aa  145  1e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0774739  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4993  glycine C-acetyltransferase  29.9 
 
 
407 aa  144  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1685  8-amino-7-oxononanoate synthase  28.2 
 
 
405 aa  143  4e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.888348  normal  0.418034 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2235  glycine C-acetyltransferase  27.7 
 
 
424 aa  143  5e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0699  aminotransferase class I and II  28.12 
 
 
396 aa  142  9.999999999999999e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3900  serine palmitoyltransferase  26.3 
 
 
400 aa  142  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.673344  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2171  glycine C-acetyltransferase  26.67 
 
 
400 aa  142  9.999999999999999e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.515105  normal  0.926821 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0669  glycine C-acetyltransferase  28.9 
 
 
446 aa  140  3e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.236778  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02854  conserved hypothetical protein  29.75 
 
 
390 aa  140  4.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000161764  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02803  hypothetical protein  29.75 
 
 
390 aa  140  4.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000119299  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0715  8-amino-7-oxononanoate synthase  29.75 
 
 
390 aa  140  4.999999999999999e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44240  8-amino-7-oxononanoate synthase-like protein  30.52 
 
 
391 aa  139  6e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2856  8-amino-7-oxononanoate synthase  28.83 
 
 
390 aa  139  7e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3263  putative serine palmitoyltransferase  29.75 
 
 
390 aa  139  8.999999999999999e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3158  putative serine palmitoyltransferase  29.75 
 
 
390 aa  139  8.999999999999999e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3445  aminotransferase, class I/II  29.75 
 
 
390 aa  139  1e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3076  serine palmitoyltransferase  27.85 
 
 
393 aa  136  5e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.473722  normal  0.645206 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1742  5-aminolevulinate synthase  28.36 
 
 
403 aa  136  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2457  8-amino-7-oxononanoate synthase  28.69 
 
 
399 aa  135  9.999999999999999e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2557  Glycine C-acetyltransferase  28.65 
 
 
403 aa  134  3e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.470257  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2435  8-amino-7-oxononanoate synthase  27.99 
 
 
391 aa  134  3.9999999999999996e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0783032 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3724  5-aminolevulinate synthase  27.27 
 
 
403 aa  133  5e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00666631  hitchhiker  0.00153498 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1182  5-aminolevulinate synthase  26.51 
 
 
407 aa  133  6e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.508928  normal  0.489366 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2045  8-amino-7-oxononanoate synthase  27.83 
 
 
390 aa  133  6e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0152681  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0317  8-amino-7-oxononanoate synthase  26.57 
 
 
385 aa  133  6e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2441  8-amino-7-oxononanoate synthase  27.65 
 
 
382 aa  133  6e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0723004  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1429  8-amino-7-oxononanoate synthase  28.2 
 
 
380 aa  133  6.999999999999999e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1979  8-amino-7-oxononanoate synthase  29.14 
 
 
397 aa  133  6.999999999999999e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0142  8-amino-7-oxononanoate synthase  28.1 
 
 
407 aa  132  6.999999999999999e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0560736 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0945  8-amino-7-oxononanoate synthase  26.76 
 
 
385 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0094418  normal  0.966825 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1393  8-amino-7-oxononanoate synthase  26.92 
 
 
387 aa  132  1.0000000000000001e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0360461  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5175  8-amino-7-oxononanoate synthase  27.73 
 
 
392 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.701145  normal  0.281343 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06510  8-amino-7-oxononanoate synthase  27.06 
 
 
401 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0267336  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4824  5-aminolevulinate synthase  27.58 
 
 
409 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6894  8-amino-7-oxononanoate synthase  29.89 
 
 
399 aa  130  4.0000000000000003e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0831  8-amino-7-oxononanoate synthase  26.79 
 
 
385 aa  130  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000743948  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3456  8-amino-7-oxononanoate synthase  26.79 
 
 
403 aa  130  4.0000000000000003e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0094566  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0842  8-amino-7-oxononanoate synthase  28.02 
 
 
396 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0106  8-amino-7-oxononanoate synthase  28.37 
 
 
392 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.209917  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0922  8-amino-7-oxononanoate synthase  26.76 
 
 
385 aa  130  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2967  8-amino-7-oxononanoate synthase  28.24 
 
 
396 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0601  8-amino-7-oxononanoate synthase  26.76 
 
 
401 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2030  5-aminolevulinate synthase  27.78 
 
 
408 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1354  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  25.84 
 
 
398 aa  129  6e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000120772 
 
 
-
 
NC_002950  PG1780  8-amino-7-oxononanoate synthase  29.45 
 
 
395 aa  129  7.000000000000001e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2288  8-amino-7-oxononanoate synthase  27.91 
 
 
393 aa  129  8.000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.50363  normal  0.0796001 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1166  8-amino-7-oxononanoate synthase  28.78 
 
 
386 aa  129  8.000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.609374  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4805  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  29.61 
 
 
400 aa  129  8.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.730908  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3138  8-amino-7-oxononanoate synthase  25.43 
 
 
397 aa  129  9.000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.743244  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0890  8-amino-7-oxononanoate synthase  26.76 
 
 
385 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.866629  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3969  5-aminolevulinate synthase  27.3 
 
 
403 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0108645  normal  0.403503 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4839  8-amino-7-oxononanoate synthase  26.55 
 
 
390 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.908198 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2789  Glycine C-acetyltransferase  27.95 
 
 
428 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1311  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  25.89 
 
 
402 aa  128  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.616211  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2755  8-amino-7-oxononanoate synthase  27.86 
 
 
394 aa  128  2.0000000000000002e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.611384  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1555  8-amino-7-oxononanoate synthase  27.43 
 
 
381 aa  127  3e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1665  8-amino-7-oxononanoate synthase  27.73 
 
 
390 aa  127  3e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000158621  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0393  8-amino-7-oxononanoate synthase  27.78 
 
 
390 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.221946  normal  0.405547 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03475  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  28.15 
 
 
398 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0123868  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0088  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  28.15 
 
 
398 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0699  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  27.41 
 
 
395 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3829  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  28.15 
 
 
398 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0155741  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0091  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  28.15 
 
 
398 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.541224  normal  0.282383 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4990  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  28.15 
 
 
398 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00350174  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4121  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  28.15 
 
 
398 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.54608  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03426  hypothetical protein  28.15 
 
 
398 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00829119  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1325  5-aminolevulinate synthase  25.99 
 
 
403 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0148844  normal  0.108489 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2429  8-amino-7-oxononanoate synthase  27.58 
 
 
388 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0838  5-aminolevulinate synthase  27.02 
 
 
409 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.876251 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4824  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  27.89 
 
 
398 aa  127  4.0000000000000003e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000213173 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0961  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  30.36 
 
 
399 aa  126  5e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.185356 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3954  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  28.15 
 
 
398 aa  127  5e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0183173  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1041  8-amino-7-oxononanoate synthase  26.39 
 
 
384 aa  127  5e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.660772  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4045  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  28.15 
 
 
398 aa  126  5e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00116611  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1029  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  26.19 
 
 
392 aa  126  5e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0495  8-amino-7-oxononanoate synthase  26.05 
 
 
396 aa  126  6e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3421  8-amino-7-oxononanoate synthase  26.96 
 
 
400 aa  126  6e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.909101  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>