More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2943 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_2943  aminotransferase class I and II  100 
 
 
400 aa  803    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.064626  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0485  hypothetical protein  38.81 
 
 
414 aa  210  4e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0016  hypothetical protein  36.76 
 
 
429 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.986681 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0672  hypothetical protein  35.65 
 
 
414 aa  197  3e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000206571 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1956  hypothetical protein  35.19 
 
 
411 aa  191  2.9999999999999997e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3515  hypothetical protein  35.8 
 
 
415 aa  188  1e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0456  hypothetical protein  34.99 
 
 
389 aa  187  2e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.882052  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2656  hypothetical protein  33.83 
 
 
416 aa  187  3e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2787  hypothetical protein  33.53 
 
 
416 aa  184  2.0000000000000003e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4048  hypothetical protein  34.51 
 
 
417 aa  180  4.999999999999999e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.139975 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000288  8-amino-7-oxononanoate synthase/CqsA  33.04 
 
 
393 aa  176  6e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.331723  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06088  hypothetical protein  30.82 
 
 
433 aa  163  4.0000000000000004e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0106  8-amino-7-oxononanoate synthase  33.42 
 
 
392 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.209917  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06510  8-amino-7-oxononanoate synthase  31.96 
 
 
401 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0267336  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3138  8-amino-7-oxononanoate synthase  31.47 
 
 
397 aa  148  2.0000000000000003e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.743244  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4368  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  31.27 
 
 
398 aa  147  3e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1185  glycine C-acetyltransferase  29.28 
 
 
396 aa  147  4.0000000000000006e-34  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1311  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  30.29 
 
 
402 aa  147  4.0000000000000006e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.616211  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0601  8-amino-7-oxononanoate synthase  31.96 
 
 
401 aa  145  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1835  8-amino-7-oxononanoate synthase  32.45 
 
 
384 aa  144  2e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5175  8-amino-7-oxononanoate synthase  31.72 
 
 
392 aa  145  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.701145  normal  0.281343 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10060  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  31.74 
 
 
399 aa  145  2e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.251094  normal  0.644816 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2967  8-amino-7-oxononanoate synthase  29.8 
 
 
396 aa  145  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0699  aminotransferase class I and II  31.83 
 
 
396 aa  144  2e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7064  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  30.61 
 
 
394 aa  144  3e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0443  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  28.53 
 
 
395 aa  144  3e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.504807  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8853  Glycine C-acetyltransferase  30.72 
 
 
390 aa  144  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275408  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0779  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  29.97 
 
 
395 aa  143  4e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4009  8-amino-7-oxononanoate synthase  30.48 
 
 
398 aa  143  6e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0774739  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3076  serine palmitoyltransferase  33.43 
 
 
393 aa  143  6e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.473722  normal  0.645206 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3945  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  30.97 
 
 
398 aa  143  7e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1346  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  28.24 
 
 
391 aa  142  7e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.583033  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0393  8-amino-7-oxononanoate synthase  32.65 
 
 
390 aa  142  8e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.221946  normal  0.405547 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0317  8-amino-7-oxononanoate synthase  27.22 
 
 
385 aa  142  9.999999999999999e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4087  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  29.32 
 
 
398 aa  142  9.999999999999999e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4686  8-amino-7-oxononanoate synthase  31.64 
 
 
396 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2225  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  32.02 
 
 
395 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0731  Glycine C-acetyltransferase  26.72 
 
 
396 aa  140  3e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.000138233  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3246  8-amino-7-oxononanoate synthase  31.43 
 
 
391 aa  140  3e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0699  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  30.51 
 
 
395 aa  140  3e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0861  5-aminolevulinate synthase  30.4 
 
 
409 aa  140  3e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.787076  normal  0.0986028 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1570  8-amino-7-oxononanoate synthase  33.73 
 
 
501 aa  140  3e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.537635  normal  0.306191 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4839  8-amino-7-oxononanoate synthase  32.83 
 
 
390 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.908198 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1852  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  29.71 
 
 
397 aa  140  3.9999999999999997e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.14136 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3792  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  26.18 
 
 
406 aa  139  7e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000577388  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0088  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  30.86 
 
 
398 aa  139  1e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2194  8-amino-7-oxononanoate synthase, putative  30.06 
 
 
395 aa  139  1e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4990  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  30.86 
 
 
398 aa  139  1e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00350174  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0005  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  30.83 
 
 
399 aa  138  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2045  8-amino-7-oxononanoate synthase  27.84 
 
 
390 aa  139  1e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0152681  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4121  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  30.86 
 
 
398 aa  139  1e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.54608  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0118  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  29.15 
 
 
398 aa  139  1e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0174  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  29.47 
 
 
398 aa  138  1e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05990  8-amino-7-oxononanoate synthase  31.25 
 
 
391 aa  138  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3954  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  30.86 
 
 
398 aa  138  2e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0183173  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0495  8-amino-7-oxononanoate synthase  30.88 
 
 
396 aa  138  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4045  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  30.86 
 
 
398 aa  138  2e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00116611  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03475  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  30.86 
 
 
398 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0123868  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3927  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  30.14 
 
 
398 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4034  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  30.14 
 
 
398 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0005  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  30.56 
 
 
451 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0091  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  30.86 
 
 
398 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.541224  normal  0.282383 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3989  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  30.14 
 
 
398 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.879002  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3829  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  30.86 
 
 
398 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0155741  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03426  hypothetical protein  30.86 
 
 
398 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00829119  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4824  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  29.32 
 
 
398 aa  137  3.0000000000000003e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000213173 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4095  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  30.14 
 
 
398 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3908  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  30.14 
 
 
398 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0785377 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1029  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  28.78 
 
 
392 aa  137  4e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0005  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  30.56 
 
 
399 aa  137  4e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.410368  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1510  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  30.56 
 
 
399 aa  137  5e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0574329  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2701  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  29.68 
 
 
395 aa  136  6.0000000000000005e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.114226  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0448  aminotransferase class I and II  26.21 
 
 
428 aa  136  6.0000000000000005e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.341482  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2629  8-amino-7-oxononanoate synthase  30.17 
 
 
391 aa  136  7.000000000000001e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2658  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  28.53 
 
 
396 aa  136  7.000000000000001e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3561  8-amino-7-oxononanoate synthase  32.73 
 
 
397 aa  136  7.000000000000001e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0270592 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0228  8-amino-7-oxononanoate synthase  31.56 
 
 
395 aa  135  9e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00625814  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0838  5-aminolevulinate synthase  27.06 
 
 
409 aa  135  9e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.876251 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1353  8-amino-7-oxononanoate synthase  30.86 
 
 
409 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0593044 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2789  Glycine C-acetyltransferase  28.9 
 
 
428 aa  135  9.999999999999999e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1354  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  29.03 
 
 
398 aa  135  9.999999999999999e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000120772 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2059  Glycine C-acetyltransferase  29.61 
 
 
440 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000332392  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1652  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  28.86 
 
 
393 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0120  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  29.24 
 
 
402 aa  135  1.9999999999999998e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0005  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  30.28 
 
 
399 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0242  5-aminolevulinate synthase  28.87 
 
 
409 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1665  8-amino-7-oxononanoate synthase  31 
 
 
390 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000158621  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1111  8-amino-7-oxononanoate synthase  32.29 
 
 
450 aa  135  1.9999999999999998e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0567781 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6894  8-amino-7-oxononanoate synthase  32.88 
 
 
399 aa  134  1.9999999999999998e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0006  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  30.28 
 
 
399 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.432129  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4366  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  28.87 
 
 
400 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000000326291  normal  0.183649 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10110  8-amino-7-oxononanoate synthase  31.3 
 
 
395 aa  134  1.9999999999999998e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1431  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  30.28 
 
 
399 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1310  2-amino-3-ketobutyrate CoA ligase (glycine acetyltransferase)  27.61 
 
 
414 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.817113  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1151  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  30.28 
 
 
399 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.326917  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2557  Glycine C-acetyltransferase  26.37 
 
 
403 aa  134  3e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.470257  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4023  5-aminolevulinate synthase  29.83 
 
 
410 aa  134  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.510651 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5349  5-aminolevulinate synthase  27.72 
 
 
405 aa  134  3e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2789  8-amino-7-oxononanoate synthase  31.58 
 
 
380 aa  134  3e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5271  5-aminolevulinate synthase  27.99 
 
 
405 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.702119  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>