More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4009 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_4009  8-amino-7-oxononanoate synthase  100 
 
 
398 aa  827    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0774739  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0448  aminotransferase class I and II  39.49 
 
 
428 aa  322  6e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.341482  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1185  glycine C-acetyltransferase  40.87 
 
 
396 aa  314  1.9999999999999998e-84  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0699  aminotransferase class I and II  41.3 
 
 
396 aa  313  3.9999999999999997e-84  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2397  Glycine C-acetyltransferase  40.89 
 
 
401 aa  310  2e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.135893  normal  0.0678456 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2195  Glycine C-acetyltransferase  36.88 
 
 
401 aa  302  5.000000000000001e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.880865  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2557  Glycine C-acetyltransferase  37.5 
 
 
403 aa  290  4e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.470257  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1780  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.59 
 
 
395 aa  279  7e-74  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0779  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  36.17 
 
 
395 aa  263  4.999999999999999e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2203  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.46 
 
 
400 aa  262  1e-68  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.679365 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0699  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  38.03 
 
 
395 aa  261  1e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1652  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  37.89 
 
 
393 aa  258  1e-67  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1967  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.56 
 
 
400 aa  256  6e-67  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1835  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.35 
 
 
384 aa  251  1e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2235  glycine C-acetyltransferase  36.56 
 
 
424 aa  251  1e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2152  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.44 
 
 
404 aa  252  1e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00977448  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2306  8-amino-7-oxononanoate synthase  32.64 
 
 
404 aa  252  1e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2207  Glycine C-acetyltransferase  34.56 
 
 
416 aa  249  4e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.35112  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2767  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.39 
 
 
399 aa  249  5e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3919  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.5 
 
 
404 aa  249  7e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0458222 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0257  8-amino-7-oxononanoate synthase  32.64 
 
 
400 aa  249  8e-65  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2579  8-amino-7-oxononanoate synthase  33.61 
 
 
400 aa  249  9e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1346  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  34.06 
 
 
391 aa  248  1e-64  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.583033  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3158  putative serine palmitoyltransferase  38.11 
 
 
390 aa  247  2e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3263  putative serine palmitoyltransferase  38.11 
 
 
390 aa  247  2e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02854  conserved hypothetical protein  38.11 
 
 
390 aa  247  3e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000161764  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2194  8-amino-7-oxononanoate synthase, putative  35.21 
 
 
395 aa  247  3e-64  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0669  glycine C-acetyltransferase  35.53 
 
 
446 aa  247  3e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.236778  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02803  hypothetical protein  38.11 
 
 
390 aa  247  3e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000119299  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3445  aminotransferase, class I/II  38.11 
 
 
390 aa  247  3e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0715  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.11 
 
 
390 aa  247  3e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44240  8-amino-7-oxononanoate synthase-like protein  38.08 
 
 
391 aa  247  3e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0688  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.24 
 
 
396 aa  246  4e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0292  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.75 
 
 
393 aa  246  6.999999999999999e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0533  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.24 
 
 
396 aa  246  6.999999999999999e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.801462  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5431  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.96 
 
 
407 aa  246  6.999999999999999e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4680  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.24 
 
 
396 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.721634  hitchhiker  3.77656e-21 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0586  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.97 
 
 
396 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0620  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.97 
 
 
396 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0530  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.97 
 
 
396 aa  243  5e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0530  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.97 
 
 
396 aa  243  5e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0675  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.97 
 
 
396 aa  243  5e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.36128e-18 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0657  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.97 
 
 
396 aa  243  5e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.111241  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0748  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.97 
 
 
396 aa  243  5e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00398054  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0057  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  36.26 
 
 
396 aa  242  9e-63  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0587  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.6 
 
 
395 aa  242  1e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0573  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.6 
 
 
395 aa  242  1e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.709963  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0534  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.97 
 
 
396 aa  240  2e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1685  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.76 
 
 
405 aa  239  5e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.888348  normal  0.418034 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0226  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.72 
 
 
401 aa  239  5.999999999999999e-62  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0147  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  34.93 
 
 
395 aa  238  2e-61  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1307  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  35.14 
 
 
395 aa  238  2e-61  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0049  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  35.92 
 
 
396 aa  236  4e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3246  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.92 
 
 
391 aa  236  4e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3421  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.34 
 
 
400 aa  236  6e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.909101  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0048  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  35.63 
 
 
396 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000159697 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3900  serine palmitoyltransferase  33.42 
 
 
400 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.673344  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0842  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.03 
 
 
396 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0228  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.1 
 
 
395 aa  233  6e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00625814  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05000  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.55 
 
 
397 aa  231  2e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3111  serine palmitoyltransferase  34.17 
 
 
399 aa  230  3e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1549  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  32.07 
 
 
393 aa  230  4e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000387483  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4805  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.36 
 
 
400 aa  229  7e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.730908  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001212  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.27 
 
 
397 aa  229  7e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0961  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.57 
 
 
399 aa  229  9e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.185356 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4993  glycine C-acetyltransferase  36.94 
 
 
407 aa  229  9e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0196  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.83 
 
 
470 aa  228  1e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1326  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.5 
 
 
384 aa  227  3e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2171  glycine C-acetyltransferase  34.07 
 
 
400 aa  227  3e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.515105  normal  0.926821 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3138  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.73 
 
 
397 aa  225  1e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.743244  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0352  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  33.7 
 
 
397 aa  224  1e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4803  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.34 
 
 
400 aa  224  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2658  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.99 
 
 
396 aa  224  2e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4145  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  33.33 
 
 
403 aa  221  9.999999999999999e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0065  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  33.33 
 
 
413 aa  221  9.999999999999999e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8853  Glycine C-acetyltransferase  33.14 
 
 
390 aa  221  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275408  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4407  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.31 
 
 
395 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0071  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  33.33 
 
 
403 aa  221  1.9999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05990  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.44 
 
 
391 aa  220  3e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0831  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.07 
 
 
389 aa  219  6e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0836  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  33.8 
 
 
398 aa  219  7e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0972896  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2629  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.57 
 
 
391 aa  219  8.999999999999998e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3076  serine palmitoyltransferase  36.09 
 
 
393 aa  219  8.999999999999998e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.473722  normal  0.645206 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3804  8-amino-7-oxononanoate synthase  33.79 
 
 
444 aa  218  1e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.785245 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1784  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.71 
 
 
396 aa  218  1e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.060875  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1570  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.15 
 
 
501 aa  217  2.9999999999999998e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.537635  normal  0.306191 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5175  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.34 
 
 
392 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.701145  normal  0.281343 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0022  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  31.69 
 
 
388 aa  217  2.9999999999999998e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0282575  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4824  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  33.62 
 
 
398 aa  216  5e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000213173 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2930  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  33.52 
 
 
397 aa  216  5.9999999999999996e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.573934  normal  0.531158 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0393  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.34 
 
 
390 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.221946  normal  0.405547 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0601  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.07 
 
 
401 aa  216  7e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4087  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  33.06 
 
 
398 aa  216  7e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0077  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  31.91 
 
 
399 aa  215  9e-55  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0554618  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3430  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.69 
 
 
389 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0707061 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3938  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  32.66 
 
 
397 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.542648  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06510  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.07 
 
 
401 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0267336  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0067  8-amino-7-oxononanoate synthase  32.76 
 
 
381 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2094  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.34 
 
 
396 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.491729  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1598  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.06 
 
 
400 aa  214  1.9999999999999998e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.50805 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>