More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4048 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_4048  hypothetical protein  100 
 
 		 417 aa  858    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.139975 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3515  hypothetical protein  82.13 
 
 		 415 aa  721    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0016  hypothetical protein  50.12 
 
 		 429 aa  409  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.986681 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0672  hypothetical protein  47.78 
 
 		 414 aa  378  1e-103  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000206571 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1956  hypothetical protein  49.06 
 
 		 411 aa  376  1e-103  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0485  hypothetical protein  47 
 
 		 414 aa  358  8e-98  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0456  hypothetical protein  44.85 
 
 		 389 aa  333  2e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.882052  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2787  hypothetical protein  42.02 
 
 		 416 aa  322  6e-87  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2656  hypothetical protein  42.62 
 
 		 416 aa  321  1.9999999999999998e-86  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000288  8-amino-7-oxononanoate synthase/CqsA  44.06 
 
 		 393 aa  319  5e-86  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.331723  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06088  hypothetical protein  43.26 
 
 		 433 aa  319  6e-86  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0774  hypothetical protein  48.29 
 
 		 255 aa  229  5e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.638698 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2943  aminotransferase class I and II  34.51 
 
 		 400 aa  180  4.999999999999999e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.064626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1185  glycine C-acetyltransferase  29.45 
 
 		 396 aa  170  5e-41  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8853  Glycine C-acetyltransferase  29.41 
 
 		 390 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4009  8-amino-7-oxononanoate synthase  29.3 
 
 		 398 aa  161  2e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0774739  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2207  Glycine C-acetyltransferase  30.68 
 
 		 416 aa  161  2e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.35112  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0448  aminotransferase class I and II  28.85 
 
 		 428 aa  159  9e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.341482  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2045  8-amino-7-oxononanoate synthase  24.48 
 
 		 390 aa  159  1e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0152681  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1780  8-amino-7-oxononanoate synthase  30 
 
 		 395 aa  156  6e-37  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2195  Glycine C-acetyltransferase  28.25 
 
 		 401 aa  155  2e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.880865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3755  5-aminolevulinate synthase  30.56 
 
 		 407 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.940743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6614  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  28.92 
 
 		 394 aa  155  2e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0794675 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0699  aminotransferase class I and II  27.3 
 
 		 396 aa  154  2e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0113  8-amino-7-oxononanoate synthase  29.1 
 
 		 394 aa  152  8.999999999999999e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2930  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  30.42 
 
 		 397 aa  151  2e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.573934  normal  0.531158 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4805  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  29.89 
 
 		 400 aa  152  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.730908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2967  8-amino-7-oxononanoate synthase  27.64 
 
 		 396 aa  151  2e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0961  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  30.65 
 
 		 399 aa  150  4e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.185356 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3028  5-aminolevulinate synthase  30 
 
 		 407 aa  150  4e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0669  glycine C-acetyltransferase  29.36 
 
 		 446 aa  149  6e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.236778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7064  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  28.4 
 
 		 394 aa  149  7e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6894  8-amino-7-oxononanoate synthase  32.57 
 
 		 399 aa  149  1.0000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4993  glycine C-acetyltransferase  28.12 
 
 		 407 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3938  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  27.6 
 
 		 397 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.542648  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3873  8-amino-7-oxononanoate synthase  26.8 
 
 		 395 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1009  8-amino-7-oxononanoate synthase  26.91 
 
 		 395 aa  147  3e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4251  8-amino-7-oxononanoate synthase  26.01 
 
 		 394 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2789  Glycine C-acetyltransferase  26.74 
 
 		 428 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0147  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  28.01 
 
 		 395 aa  146  6e-34  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2557  Glycine C-acetyltransferase  26.97 
 
 		 403 aa  146  6e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.470257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2838  8-amino-7-oxononanoate synthase  28.38 
 
 		 389 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4803  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  29.46 
 
 		 400 aa  146  8.000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2397  Glycine C-acetyltransferase  28.07 
 
 		 401 aa  146  8.000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.135893  normal  0.0678456 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4228  8-amino-7-oxononanoate synthase  26.51 
 
 		 395 aa  146  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.323305  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3709  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  27.22 
 
 		 397 aa  145  1e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.556629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4407  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  27.35 
 
 		 395 aa  145  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1470  8-amino-7-oxononanoate synthase  29.51 
 
 		 402 aa  145  1e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.000728084  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0101  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  26.85 
 
 		 397 aa  145  1e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.396382 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2457  8-amino-7-oxononanoate synthase  28.3 
 
 		 399 aa  145  1e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3076  serine palmitoyltransferase  32.31 
 
 		 393 aa  145  1e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.473722  normal  0.645206 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4026  8-amino-7-oxononanoate synthase  26.22 
 
 		 395 aa  144  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05000  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  27.67 
 
 		 397 aa  144  2e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3949  8-amino-7-oxononanoate synthase  26.7 
 
 		 395 aa  145  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4339  8-amino-7-oxononanoate synthase  26.22 
 
 		 395 aa  144  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4141  8-amino-7-oxononanoate synthase  26.22 
 
 		 395 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10060  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  27.78 
 
 		 399 aa  145  2e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.251094  normal  0.644816 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44240  8-amino-7-oxononanoate synthase-like protein  29.22 
 
 		 391 aa  144  3e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2194  8-amino-7-oxononanoate synthase, putative  26.54 
 
 		 395 aa  144  3e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0771  hypothetical protein  43.04 
 
 		 187 aa  144  3e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.403865 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0922  5-aminolevulinate synthase  29.43 
 
 		 409 aa  144  3e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1665  8-amino-7-oxononanoate synthase  29.21 
 
 		 390 aa  144  3e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000158621  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2658  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  29.22 
 
 		 396 aa  144  4e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3901  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  27.01 
 
 		 397 aa  144  4e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0192612  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0065  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  27.07 
 
 		 397 aa  143  5e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000130332  hitchhiker  0.000000319123 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4187  8-amino-7-oxononanoate synthase  26.05 
 
 		 395 aa  143  6e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3859  8-amino-7-oxononanoate synthase  25.94 
 
 		 395 aa  143  6e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0228  8-amino-7-oxononanoate synthase  29.07 
 
 		 395 aa  143  7e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00625814  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10031  8-amino-7-oxononanoate synthase bioF2  29.08 
 
 		 771 aa  142  7e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.863563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5321  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  28.27 
 
 		 399 aa  142  8e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4674  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  26.72 
 
 		 397 aa  142  9e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3111  serine palmitoyltransferase  27.83 
 
 		 399 aa  142  9e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0699  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  27.79 
 
 		 395 aa  142  9e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001212  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  27.67 
 
 		 397 aa  142  9.999999999999999e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0098  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  28.41 
 
 		 397 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.189992  hitchhiker  0.000233483 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0831  8-amino-7-oxononanoate synthase  28.01 
 
 		 389 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2225  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  27.7 
 
 		 395 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0058  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  26.35 
 
 		 397 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0257506  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2048  8-amino-7-oxononanoate synthase  30.7 
 
 		 379 aa  141  1.9999999999999998e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0908  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  25.63 
 
 		 395 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0537628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4285  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  26.35 
 
 		 397 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.560532  hitchhiker  0.0000435103 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4340  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  26.35 
 
 		 397 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4480  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  26.44 
 
 		 397 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0239819 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0838  5-aminolevulinate synthase  28.21 
 
 		 409 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.876251 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0107  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  26.05 
 
 		 398 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.407437  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3900  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  26.35 
 
 		 397 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.339123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3992  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  26.72 
 
 		 397 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.837057  normal  0.061688 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4104  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  26.35 
 
 		 397 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0130063  normal  0.534575 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1029  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  26.28 
 
 		 392 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1685  8-amino-7-oxononanoate synthase  26.63 
 
 		 405 aa  140  3.9999999999999997e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.888348  normal  0.418034 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0779  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  25.57 
 
 		 395 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2429  8-amino-7-oxononanoate synthase  26.82 
 
 		 388 aa  140  4.999999999999999e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3456  8-amino-7-oxononanoate synthase  27.95 
 
 		 403 aa  140  4.999999999999999e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0094566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15881  putative 8-amino-7-oxononanoate synthase  28.16 
 
 		 376 aa  140  4.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.516348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4536  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  27.68 
 
 		 399 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1835  8-amino-7-oxononanoate synthase  31.02 
 
 		 384 aa  139  6e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3179  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  27.46 
 
 		 399 aa  139  7e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5431  8-amino-7-oxononanoate synthase  25.87 
 
 		 407 aa  139  7e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2755  8-amino-7-oxononanoate synthase  29.66 
 
 		 394 aa  139  7.999999999999999e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.611384  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16701  putative 8-amino-7-oxononanoate synthase  28.37 
 
 		 379 aa  139  8.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.601431  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>