More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3111 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_3900  serine palmitoyltransferase  75.94 
 
 
400 aa  649    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.673344  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3111  serine palmitoyltransferase  100 
 
 
399 aa  824    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2171  glycine C-acetyltransferase  84.71 
 
 
400 aa  714    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.515105  normal  0.926821 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1685  8-amino-7-oxononanoate synthase  51.64 
 
 
405 aa  426  1e-118  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.888348  normal  0.418034 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5431  8-amino-7-oxononanoate synthase  49.37 
 
 
407 aa  409  1e-113  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2767  8-amino-7-oxononanoate synthase  50.65 
 
 
399 aa  397  1e-109  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3421  8-amino-7-oxononanoate synthase  46.35 
 
 
400 aa  370  1e-101  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.909101  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44240  8-amino-7-oxononanoate synthase-like protein  47.73 
 
 
391 aa  365  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0228  8-amino-7-oxononanoate synthase  45.48 
 
 
395 aa  364  1e-99  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00625814  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3076  serine palmitoyltransferase  43.62 
 
 
393 aa  343  2e-93  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.473722  normal  0.645206 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3263  putative serine palmitoyltransferase  44.7 
 
 
390 aa  339  4e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3158  putative serine palmitoyltransferase  44.7 
 
 
390 aa  339  4e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02854  conserved hypothetical protein  44.44 
 
 
390 aa  337  9.999999999999999e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000161764  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02803  hypothetical protein  44.44 
 
 
390 aa  337  9.999999999999999e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000119299  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0715  8-amino-7-oxononanoate synthase  44.44 
 
 
390 aa  337  9.999999999999999e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3445  aminotransferase, class I/II  44.44 
 
 
390 aa  337  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0699  aminotransferase class I and II  40.85 
 
 
396 aa  311  9e-84  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1185  glycine C-acetyltransferase  42.16 
 
 
396 aa  303  4.0000000000000003e-81  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0448  aminotransferase class I and II  40.71 
 
 
428 aa  288  2e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.341482  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2195  Glycine C-acetyltransferase  37.67 
 
 
401 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.880865  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1635  Glycine C-acetyltransferase  38.37 
 
 
424 aa  257  3e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.17443 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2557  Glycine C-acetyltransferase  37.33 
 
 
403 aa  256  4e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.470257  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1780  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.12 
 
 
395 aa  254  1.0000000000000001e-66  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2397  Glycine C-acetyltransferase  35.57 
 
 
401 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.135893  normal  0.0678456 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2203  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.57 
 
 
400 aa  253  6e-66  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.679365 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2306  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.48 
 
 
404 aa  247  3e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1835  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.78 
 
 
384 aa  243  3e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2152  8-amino-7-oxononanoate synthase  33.92 
 
 
404 aa  244  3e-63  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00977448  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2207  Glycine C-acetyltransferase  37.92 
 
 
416 aa  243  3.9999999999999997e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.35112  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0669  glycine C-acetyltransferase  33.58 
 
 
446 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.236778  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1967  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.22 
 
 
400 aa  241  2e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0257  8-amino-7-oxononanoate synthase  33.42 
 
 
400 aa  241  2e-62  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2629  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.19 
 
 
391 aa  237  3e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2579  8-amino-7-oxononanoate synthase  33.7 
 
 
400 aa  236  6e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1326  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.57 
 
 
384 aa  235  8e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0842  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.08 
 
 
396 aa  233  6e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4009  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.17 
 
 
398 aa  230  3e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0774739  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4045  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.37 
 
 
398 aa  230  4e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00116611  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0831  8-amino-7-oxononanoate synthase  33.7 
 
 
389 aa  229  5e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0101  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.53 
 
 
397 aa  229  5e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.396382 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0779  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  33.24 
 
 
395 aa  229  8e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2045  8-amino-7-oxononanoate synthase  33.7 
 
 
390 aa  229  9e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0152681  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0088  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.11 
 
 
398 aa  228  1e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4990  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.11 
 
 
398 aa  228  1e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00350174  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3709  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.53 
 
 
397 aa  228  1e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.556629  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4121  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.11 
 
 
398 aa  228  1e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.54608  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0065  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.66 
 
 
397 aa  228  1e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000130332  hitchhiker  0.000000319123 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0118  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.57 
 
 
398 aa  227  2e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3954  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.11 
 
 
398 aa  228  2e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0183173  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0292  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.17 
 
 
393 aa  228  2e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03475  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.11 
 
 
398 aa  227  3e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0123868  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0091  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.11 
 
 
398 aa  227  3e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.541224  normal  0.282383 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3246  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.09 
 
 
391 aa  227  3e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03426  hypothetical protein  35.11 
 
 
398 aa  227  3e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00829119  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3615  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.83 
 
 
397 aa  227  3e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.011325  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3829  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.11 
 
 
398 aa  227  3e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0155741  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4285  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.8 
 
 
397 aa  226  6e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.560532  hitchhiker  0.0000435103 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3938  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.83 
 
 
397 aa  226  6e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.542648  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2093  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.93 
 
 
391 aa  226  6e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0065  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.27 
 
 
413 aa  226  7e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4340  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.8 
 
 
397 aa  225  8e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0071  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.27 
 
 
403 aa  226  8e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0058  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.8 
 
 
397 aa  225  8e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0257506  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4145  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.27 
 
 
403 aa  226  8e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4087  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.13 
 
 
398 aa  225  8e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3908  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.84 
 
 
398 aa  225  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0785377 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4095  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.84 
 
 
398 aa  225  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3989  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.84 
 
 
398 aa  225  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.879002  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3927  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.84 
 
 
398 aa  225  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4824  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.57 
 
 
398 aa  225  1e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000213173 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4034  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.84 
 
 
398 aa  225  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1346  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  31.75 
 
 
391 aa  225  1e-57  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.583033  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4480  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.27 
 
 
397 aa  224  2e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0239819 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8853  Glycine C-acetyltransferase  34.01 
 
 
390 aa  223  4e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275408  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4993  glycine C-acetyltransferase  34.66 
 
 
407 aa  223  6e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2967  8-amino-7-oxononanoate synthase  33.15 
 
 
396 aa  222  9e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0107  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.73 
 
 
398 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.407437  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3901  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.47 
 
 
397 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0192612  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0022  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  33.7 
 
 
388 aa  222  9.999999999999999e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0282575  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05000  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  33.07 
 
 
397 aa  221  1.9999999999999999e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1307  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  33.61 
 
 
395 aa  221  1.9999999999999999e-56  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0587  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  32.79 
 
 
395 aa  221  1.9999999999999999e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0573  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  32.79 
 
 
395 aa  221  1.9999999999999999e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.709963  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0120  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.84 
 
 
402 aa  220  3e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3992  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.73 
 
 
397 aa  220  3e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.837057  normal  0.061688 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3430  8-amino-7-oxononanoate synthase  33.43 
 
 
389 aa  220  3e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0707061 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0698  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  33.6 
 
 
397 aa  220  3e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4674  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.47 
 
 
397 aa  220  3.9999999999999997e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2687  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.85 
 
 
394 aa  219  5e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000288731  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4536  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.99 
 
 
399 aa  219  6e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3919  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  33.88 
 
 
404 aa  219  6e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0458222 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3900  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.73 
 
 
397 aa  219  6e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.339123  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4104  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.73 
 
 
397 aa  219  6e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0130063  normal  0.534575 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2194  8-amino-7-oxononanoate synthase, putative  32.79 
 
 
395 aa  218  1e-55  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4159  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  33.67 
 
 
399 aa  218  1e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5158  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.74 
 
 
399 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4368  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.96 
 
 
398 aa  218  1e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5701  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.74 
 
 
399 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00514262 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0098  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.56 
 
 
397 aa  219  1e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.189992  hitchhiker  0.000233483 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0836  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  32.53 
 
 
398 aa  218  2e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0972896  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>