More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_3076 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_3076  serine palmitoyltransferase  100 
 
 
393 aa  794    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.473722  normal  0.645206 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0228  8-amino-7-oxononanoate synthase  54.73 
 
 
395 aa  431  1e-119  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00625814  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2767  8-amino-7-oxononanoate synthase  54.34 
 
 
399 aa  429  1e-119  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02854  conserved hypothetical protein  52.15 
 
 
390 aa  398  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000161764  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44240  8-amino-7-oxononanoate synthase-like protein  55.5 
 
 
391 aa  398  9.999999999999999e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02803  hypothetical protein  52.15 
 
 
390 aa  398  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000119299  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0715  8-amino-7-oxononanoate synthase  52.15 
 
 
390 aa  398  9.999999999999999e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3263  putative serine palmitoyltransferase  52.66 
 
 
390 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3445  aminotransferase, class I/II  52.41 
 
 
390 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3158  putative serine palmitoyltransferase  52.66 
 
 
390 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3900  serine palmitoyltransferase  48.98 
 
 
400 aa  385  1e-106  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.673344  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1685  8-amino-7-oxononanoate synthase  48.84 
 
 
405 aa  378  1e-103  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.888348  normal  0.418034 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5431  8-amino-7-oxononanoate synthase  49.61 
 
 
407 aa  374  1e-102  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2171  glycine C-acetyltransferase  46.17 
 
 
400 aa  368  1e-100  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.515105  normal  0.926821 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3421  8-amino-7-oxononanoate synthase  49.23 
 
 
400 aa  355  6.999999999999999e-97  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.909101  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3111  serine palmitoyltransferase  43.62 
 
 
399 aa  349  5e-95  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0699  aminotransferase class I and II  40.82 
 
 
396 aa  298  1e-79  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1185  glycine C-acetyltransferase  38.84 
 
 
396 aa  276  6e-73  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0448  aminotransferase class I and II  39.84 
 
 
428 aa  266  4e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.341482  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2195  Glycine C-acetyltransferase  39.17 
 
 
401 aa  259  4e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.880865  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0257  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.68 
 
 
400 aa  251  2e-65  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2203  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.6 
 
 
400 aa  248  1e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.679365 
 
 
-
 
NC_002950  PG1780  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.35 
 
 
395 aa  243  5e-63  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1635  Glycine C-acetyltransferase  40.48 
 
 
424 aa  242  6e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.17443 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2579  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.41 
 
 
400 aa  242  1e-62  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1967  8-amino-7-oxononanoate synthase  33.6 
 
 
400 aa  240  2.9999999999999997e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2306  8-amino-7-oxononanoate synthase  33.87 
 
 
404 aa  240  2.9999999999999997e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2557  Glycine C-acetyltransferase  37.7 
 
 
403 aa  238  1e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.470257  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1973  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.17 
 
 
544 aa  236  8e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2397  Glycine C-acetyltransferase  37.6 
 
 
401 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.135893  normal  0.0678456 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2435  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.72 
 
 
391 aa  233  5e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0783032 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0779  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  33.62 
 
 
395 aa  232  7.000000000000001e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2152  8-amino-7-oxononanoate synthase  33.33 
 
 
404 aa  232  7.000000000000001e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00977448  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1312  amino acid adenylation domain protein  38.9 
 
 
1225 aa  228  2e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2207  Glycine C-acetyltransferase  35.07 
 
 
416 aa  226  6e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.35112  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0573  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.14 
 
 
395 aa  225  1e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.709963  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0587  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.14 
 
 
395 aa  225  1e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0022  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.34 
 
 
388 aa  224  1e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0282575  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4009  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.09 
 
 
398 aa  224  2e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0774739  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2629  8-amino-7-oxononanoate synthase  40.46 
 
 
391 aa  223  6e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6894  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.94 
 
 
399 aa  221  1.9999999999999999e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0226  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.13 
 
 
401 aa  220  3e-56  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1549  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  33.53 
 
 
393 aa  220  3e-56  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000387483  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0842  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.99 
 
 
396 aa  218  1e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3138  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.18 
 
 
397 aa  218  2e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.743244  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1835  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.15 
 
 
384 aa  217  2.9999999999999998e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1144  Glycine C-acetyltransferase  36.19 
 
 
453 aa  217  2.9999999999999998e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0699  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  35.03 
 
 
395 aa  216  8e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2194  8-amino-7-oxononanoate synthase, putative  32.28 
 
 
395 aa  215  9.999999999999999e-55  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0669  glycine C-acetyltransferase  36.06 
 
 
446 aa  214  9.999999999999999e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.236778  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2045  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.17 
 
 
390 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0152681  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1346  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  32.75 
 
 
391 aa  213  4.9999999999999996e-54  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.583033  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1307  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  33.62 
 
 
395 aa  212  9e-54  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0292  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.38 
 
 
393 aa  212  1e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1979  8-amino-7-oxononanoate synthase  33.71 
 
 
397 aa  211  2e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8853  Glycine C-acetyltransferase  36.57 
 
 
390 aa  211  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275408  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2967  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.93 
 
 
396 aa  210  3e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2728  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.56 
 
 
464 aa  208  1e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3919  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  33.24 
 
 
404 aa  208  1e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0458222 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0443  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.44 
 
 
395 aa  208  1e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.504807  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2235  glycine C-acetyltransferase  35.21 
 
 
424 aa  208  1e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4251  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.91 
 
 
394 aa  207  3e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1353  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.51 
 
 
409 aa  207  3e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0593044 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4839  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.6 
 
 
390 aa  206  8e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.908198 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1946  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.56 
 
 
457 aa  205  9e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.800887 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3246  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.64 
 
 
391 aa  205  9e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2100  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.96 
 
 
386 aa  205  9e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2816  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.02 
 
 
395 aa  205  9e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0363  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.19 
 
 
390 aa  205  1e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1166  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.72 
 
 
386 aa  205  1e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.609374  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0688  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  32.18 
 
 
396 aa  204  2e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2222  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.56 
 
 
457 aa  204  2e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.475476  normal  0.501295 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2294  8-amino-7-oxononanoate synthase  40.9 
 
 
399 aa  204  3e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3873  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.51 
 
 
395 aa  204  3e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3561  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.21 
 
 
397 aa  203  4e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0270592 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1126  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.69 
 
 
387 aa  203  5e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4187  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.81 
 
 
395 aa  203  5e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4407  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  32.03 
 
 
395 aa  203  5e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0533  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  30.68 
 
 
396 aa  203  5e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.801462  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4686  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.08 
 
 
396 aa  202  6e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1652  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  34.11 
 
 
393 aa  202  6e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1837  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.46 
 
 
456 aa  202  6e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.688566  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0534  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  30.96 
 
 
396 aa  202  8e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1326  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.91 
 
 
384 aa  202  9.999999999999999e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0057  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  36.1 
 
 
396 aa  202  9.999999999999999e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1029  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.34 
 
 
392 aa  202  9.999999999999999e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0065  8-amino-7-oxononanoate synthase  32.6 
 
 
381 aa  202  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00162329  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0586  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  31.9 
 
 
396 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0530  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  31.9 
 
 
396 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0530  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  31.9 
 
 
396 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0393  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.81 
 
 
390 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.221946  normal  0.405547 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0675  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  31.9 
 
 
396 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.36128e-18 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0620  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  31.9 
 
 
396 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0657  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  31.9 
 
 
396 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.111241  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0748  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  31.9 
 
 
396 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00398054  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0731  Glycine C-acetyltransferase  31.37 
 
 
396 aa  200  3e-50  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.000138233  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0423  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.96 
 
 
384 aa  200  3.9999999999999996e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0424  8-amino-7-oxononanoate synthase  40.47 
 
 
381 aa  200  3.9999999999999996e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.369907  normal  0.0974656 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1009  8-amino-7-oxononanoate synthase  33.33 
 
 
395 aa  200  5e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3949  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.51 
 
 
395 aa  199  5e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>