More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2728 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_2728  8-amino-7-oxononanoate synthase  100 
 
 
464 aa  939    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0951  8-amino-7-oxononanoate synthase  65.14 
 
 
455 aa  548  1e-155  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0318  8-amino-7-oxononanoate synthase  65.27 
 
 
455 aa  547  1e-154  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.213492  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2222  8-amino-7-oxononanoate synthase  61.96 
 
 
457 aa  541  1e-153  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.475476  normal  0.501295 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1944  aminotransferase class I and II  65.21 
 
 
455 aa  544  1e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.49804  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1837  8-amino-7-oxononanoate synthase  62.64 
 
 
456 aa  544  1e-153  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.688566  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1946  8-amino-7-oxononanoate synthase  62.19 
 
 
457 aa  542  1e-153  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.800887 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1111  8-amino-7-oxononanoate synthase  59.82 
 
 
450 aa  534  1e-150  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0567781 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1540  8-amino-7-oxononanoate synthase  52.47 
 
 
445 aa  461  1e-129  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1508  8-amino-7-oxononanoate synthase  57.39 
 
 
445 aa  462  1e-129  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0753  glycine C-acetyltransferase  58.44 
 
 
442 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1144  Glycine C-acetyltransferase  55.17 
 
 
453 aa  459  9.999999999999999e-129  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0301  8-amino-7-oxononanoate synthase  54.71 
 
 
442 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.454104  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0784  8-amino-7-oxononanoate synthase  54.71 
 
 
442 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2618  8-amino-7-oxononanoate synthase  56.92 
 
 
441 aa  457  1e-127  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3011  8-amino-7-oxononanoate synthase, putative  56.92 
 
 
441 aa  457  1e-127  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3875  glycine C-acetyltransferase  53.79 
 
 
442 aa  451  1e-125  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.264237  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3283  aminotransferase class-I  54.67 
 
 
439 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0541  putative 8-amino-7-oxononanoate synthase  54.67 
 
 
439 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1059  putative 8-amino-7-oxononanoate synthase  54.67 
 
 
439 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3269  putative 8-amino-7-oxononanoate synthase  54.67 
 
 
439 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2164  putative 8-amino-7-oxononanoate synthase  54.67 
 
 
439 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4329  Aminotransferase protein  54.25 
 
 
455 aa  437  1e-121  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.617372  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3233  putative 8-amino-7-oxononanoate synthase  54.44 
 
 
439 aa  436  1e-121  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0211359  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2287  8-amino-7-oxononanoate synthase, putative  57.94 
 
 
390 aa  429  1e-119  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1343  8-amino-7-oxononanoate synthase  57.47 
 
 
440 aa  430  1e-119  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.144248  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3920  8-amino-7-oxononanoate synthase  51.22 
 
 
450 aa  429  1e-119  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.193624  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0196  8-amino-7-oxononanoate synthase  49.89 
 
 
470 aa  431  1e-119  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2601  glycine C-acetyltransferase  51.4 
 
 
450 aa  427  1e-118  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3804  8-amino-7-oxononanoate synthase  53.03 
 
 
444 aa  419  1e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.785245 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1973  8-amino-7-oxononanoate synthase  47.85 
 
 
544 aa  418  1e-116  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0641  8-amino-7-oxononanoate synthase  51.75 
 
 
428 aa  419  1e-116  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.367441  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2059  Glycine C-acetyltransferase  53.32 
 
 
440 aa  415  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000332392  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1353  8-amino-7-oxononanoate synthase  47.21 
 
 
409 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0593044 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0795  8-amino-7-oxononanoate synthase  45.11 
 
 
487 aa  330  3e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3012  8-amino-7-oxononanoate synthase  45.11 
 
 
408 aa  330  4e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.295664 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0699  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  40.33 
 
 
395 aa  249  7e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0779  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  35.97 
 
 
395 aa  246  8e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2397  Glycine C-acetyltransferase  37.1 
 
 
401 aa  241  2e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.135893  normal  0.0678456 
 
 
-
 
NC_002950  PG1780  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.02 
 
 
395 aa  239  1e-61  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2207  Glycine C-acetyltransferase  35.77 
 
 
416 aa  238  1e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.35112  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3919  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.91 
 
 
404 aa  237  4e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0458222 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0699  aminotransferase class I and II  35.58 
 
 
396 aa  236  7e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1346  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  36.73 
 
 
391 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.583033  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1307  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  37.57 
 
 
395 aa  233  4.0000000000000004e-60  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0292  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  37.78 
 
 
393 aa  232  9e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2195  Glycine C-acetyltransferase  34.83 
 
 
401 aa  232  1e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.880865  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1549  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  36.41 
 
 
393 aa  232  1e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000387483  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2194  8-amino-7-oxononanoate synthase, putative  34.53 
 
 
395 aa  231  3e-59  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0393  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.74 
 
 
390 aa  231  3e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.221946  normal  0.405547 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1835  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.03 
 
 
384 aa  230  5e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4087  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.03 
 
 
398 aa  228  1e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4839  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.01 
 
 
390 aa  227  3e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.908198 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2967  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.09 
 
 
396 aa  227  3e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3138  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.62 
 
 
397 aa  226  5.0000000000000005e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.743244  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1652  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  35.85 
 
 
393 aa  225  1e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0039  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.78 
 
 
395 aa  224  2e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0048  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  36.76 
 
 
396 aa  224  3e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000159697 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0049  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  36.49 
 
 
396 aa  223  4.9999999999999996e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4368  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.77 
 
 
398 aa  223  7e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4251  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.44 
 
 
394 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1009  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.75 
 
 
395 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2045  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.52 
 
 
390 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0152681  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0363  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.27 
 
 
390 aa  221  3e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4187  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.07 
 
 
395 aa  221  3e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2100  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.24 
 
 
386 aa  219  6e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5175  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.09 
 
 
392 aa  219  7e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.701145  normal  0.281343 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3927  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  37.22 
 
 
398 aa  219  7.999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4095  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  37.22 
 
 
398 aa  219  7.999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3989  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  37.22 
 
 
398 aa  219  7.999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.879002  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0071  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.55 
 
 
403 aa  219  7.999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4145  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.55 
 
 
403 aa  219  7.999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4034  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  37.22 
 
 
398 aa  219  7.999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0065  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.55 
 
 
413 aa  219  7.999999999999999e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3908  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  37.22 
 
 
398 aa  219  7.999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0785377 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1635  Glycine C-acetyltransferase  38.12 
 
 
424 aa  219  8.999999999999998e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.17443 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3873  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.69 
 
 
395 aa  218  1e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0088  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.51 
 
 
398 aa  218  2e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2629  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.99 
 
 
391 aa  218  2e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2557  Glycine C-acetyltransferase  34.25 
 
 
403 aa  218  2e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.470257  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4121  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.51 
 
 
398 aa  218  2e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.54608  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3859  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.69 
 
 
395 aa  218  2e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4990  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.51 
 
 
398 aa  218  2e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00350174  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4045  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.51 
 
 
398 aa  218  2e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00116611  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3954  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.51 
 
 
398 aa  218  2e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0183173  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0065  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.75 
 
 
381 aa  217  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00162329  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0814  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.5 
 
 
386 aa  218  2.9999999999999998e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2816  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.89 
 
 
395 aa  218  2.9999999999999998e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03475  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.51 
 
 
398 aa  217  4e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0123868  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4026  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.69 
 
 
395 aa  217  4e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0091  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.51 
 
 
398 aa  217  4e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.541224  normal  0.282383 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4339  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.69 
 
 
395 aa  217  4e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4228  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.2 
 
 
395 aa  217  4e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.323305  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2856  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.07 
 
 
390 aa  217  4e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3829  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.51 
 
 
398 aa  217  4e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0155741  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4141  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.69 
 
 
395 aa  217  4e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03426  hypothetical protein  35.51 
 
 
398 aa  217  4e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00829119  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06510  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.57 
 
 
401 aa  216  5e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0267336  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0601  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.57 
 
 
401 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0118  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.93 
 
 
398 aa  216  7e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>