More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_1144 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_0753  glycine C-acetyltransferase  72.41 
 
 
442 aa  676    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3283  aminotransferase class-I  74.78 
 
 
439 aa  664    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3233  putative 8-amino-7-oxononanoate synthase  74.56 
 
 
439 aa  660    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0211359  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3875  glycine C-acetyltransferase  72.19 
 
 
442 aa  676    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.264237  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1144  Glycine C-acetyltransferase  100 
 
 
453 aa  924    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1059  putative 8-amino-7-oxononanoate synthase  74.78 
 
 
439 aa  664    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1343  8-amino-7-oxononanoate synthase  74.56 
 
 
440 aa  665    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.144248  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2164  putative 8-amino-7-oxononanoate synthase  74.78 
 
 
439 aa  664    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0301  8-amino-7-oxononanoate synthase  72.41 
 
 
442 aa  678    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.454104  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3269  putative 8-amino-7-oxononanoate synthase  74.78 
 
 
439 aa  664    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0784  8-amino-7-oxononanoate synthase  72.41 
 
 
442 aa  678    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0541  putative 8-amino-7-oxononanoate synthase  74.78 
 
 
439 aa  664    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2287  8-amino-7-oxononanoate synthase, putative  79.49 
 
 
390 aa  629  1e-179  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1540  8-amino-7-oxononanoate synthase  59.06 
 
 
445 aa  538  1e-151  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3920  8-amino-7-oxononanoate synthase  59.51 
 
 
450 aa  525  1e-148  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.193624  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2601  glycine C-acetyltransferase  58.48 
 
 
450 aa  523  1e-147  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3011  8-amino-7-oxononanoate synthase, putative  55.3 
 
 
441 aa  498  1e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2618  8-amino-7-oxononanoate synthase  55.3 
 
 
441 aa  498  1e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1508  8-amino-7-oxononanoate synthase  59.25 
 
 
445 aa  481  1e-134  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1111  8-amino-7-oxononanoate synthase  56.46 
 
 
450 aa  459  9.999999999999999e-129  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0567781 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1973  8-amino-7-oxononanoate synthase  52.44 
 
 
544 aa  452  1.0000000000000001e-126  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0318  8-amino-7-oxononanoate synthase  55.5 
 
 
455 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.213492  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1837  8-amino-7-oxononanoate synthase  55.64 
 
 
456 aa  450  1e-125  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.688566  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0951  8-amino-7-oxononanoate synthase  54.15 
 
 
455 aa  449  1e-125  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1946  8-amino-7-oxononanoate synthase  54.87 
 
 
457 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.800887 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2222  8-amino-7-oxononanoate synthase  55.38 
 
 
457 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.475476  normal  0.501295 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1944  aminotransferase class I and II  55.02 
 
 
455 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.49804  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2728  8-amino-7-oxononanoate synthase  55.17 
 
 
464 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0196  8-amino-7-oxononanoate synthase  52.83 
 
 
470 aa  425  1e-118  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0641  8-amino-7-oxononanoate synthase  54.17 
 
 
428 aa  421  1e-116  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.367441  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4329  Aminotransferase protein  52.79 
 
 
455 aa  412  1e-114  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.617372  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2059  Glycine C-acetyltransferase  47.34 
 
 
440 aa  383  1e-105  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000332392  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3804  8-amino-7-oxononanoate synthase  46.75 
 
 
444 aa  380  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.785245 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0795  8-amino-7-oxononanoate synthase  45.5 
 
 
487 aa  346  5e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1353  8-amino-7-oxononanoate synthase  46 
 
 
409 aa  302  7.000000000000001e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0593044 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3012  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.98 
 
 
408 aa  289  7e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.295664 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1307  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  37.03 
 
 
395 aa  248  1e-64  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1346  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  36.31 
 
 
391 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.583033  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3919  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.56 
 
 
404 aa  243  3.9999999999999997e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0458222 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2194  8-amino-7-oxononanoate synthase, putative  34.89 
 
 
395 aa  242  7.999999999999999e-63  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1780  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.86 
 
 
395 aa  241  2e-62  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0484  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.78 
 
 
399 aa  240  4e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0779  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  33.33 
 
 
395 aa  240  4e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0065  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.33 
 
 
381 aa  238  2e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00162329  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0067  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.05 
 
 
381 aa  237  3e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0292  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.33 
 
 
393 aa  236  9e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0699  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  36.41 
 
 
395 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2195  Glycine C-acetyltransferase  33.25 
 
 
401 aa  234  3e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.880865  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2045  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.21 
 
 
390 aa  233  7.000000000000001e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0152681  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4834  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.89 
 
 
380 aa  232  1e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.348424 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1549  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  34.78 
 
 
393 aa  229  6e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000387483  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1185  glycine C-acetyltransferase  34.93 
 
 
396 aa  228  2e-58  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2819  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.74 
 
 
386 aa  227  3e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.238306 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2816  8-amino-7-oxononanoate synthase  33.25 
 
 
395 aa  227  3e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0352  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.51 
 
 
393 aa  226  7e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.367028 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2473  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.48 
 
 
389 aa  224  3e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00670549  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2397  Glycine C-acetyltransferase  33.88 
 
 
401 aa  224  4e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.135893  normal  0.0678456 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0699  aminotransferase class I and II  35.85 
 
 
396 aa  223  4.9999999999999996e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4087  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.73 
 
 
398 aa  222  9.999999999999999e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7004  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.57 
 
 
399 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2687  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.31 
 
 
394 aa  219  6e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000288731  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2967  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.96 
 
 
396 aa  218  1e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4159  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.77 
 
 
399 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0022  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  33.6 
 
 
388 aa  216  5e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0282575  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0669  glycine C-acetyltransferase  33.24 
 
 
446 aa  216  5e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.236778  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2093  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.85 
 
 
391 aa  216  7e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3179  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.03 
 
 
399 aa  216  8e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2207  Glycine C-acetyltransferase  32.39 
 
 
416 aa  215  1.9999999999999998e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.35112  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0731  Glycine C-acetyltransferase  33.62 
 
 
396 aa  214  1.9999999999999998e-54  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.000138233  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0065  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  33 
 
 
413 aa  214  1.9999999999999998e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3021  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.29 
 
 
399 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0071  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  33 
 
 
403 aa  214  1.9999999999999998e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4145  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  33 
 
 
403 aa  214  1.9999999999999998e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1598  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  32.28 
 
 
400 aa  214  2.9999999999999995e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.50805 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4368  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  33.61 
 
 
398 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2298  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  33.24 
 
 
395 aa  214  3.9999999999999995e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000248128  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2629  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.68 
 
 
391 aa  213  5.999999999999999e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1685  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.14 
 
 
405 aa  212  1e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.888348  normal  0.418034 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5321  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.11 
 
 
399 aa  211  2e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0005  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.13 
 
 
399 aa  211  3e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4993  glycine C-acetyltransferase  32.76 
 
 
407 aa  210  4e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4972  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.62 
 
 
399 aa  210  4e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.439865  normal  0.402945 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3115  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.57 
 
 
399 aa  210  5e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.601738  normal  0.545145 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4824  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.08 
 
 
398 aa  210  5e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000213173 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4536  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.31 
 
 
399 aa  209  6e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4045  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  32.56 
 
 
398 aa  209  6e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00116611  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0448  aminotransferase class I and II  33.06 
 
 
428 aa  209  9e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.341482  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1635  Glycine C-acetyltransferase  35.68 
 
 
424 aa  209  9e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.17443 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1029  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.35 
 
 
392 aa  209  9e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0088  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  32.31 
 
 
398 aa  208  1e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4990  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  32.31 
 
 
398 aa  208  1e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00350174  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3908  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.44 
 
 
398 aa  208  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0785377 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4095  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.44 
 
 
398 aa  208  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3989  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.44 
 
 
398 aa  208  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.879002  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4034  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.44 
 
 
398 aa  208  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0573  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  31.98 
 
 
395 aa  209  1e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.709963  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4121  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  32.31 
 
 
398 aa  208  1e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.54608  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0587  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  31.98 
 
 
395 aa  209  1e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2171  glycine C-acetyltransferase  31.41 
 
 
400 aa  208  1e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.515105  normal  0.926821 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3927  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.44 
 
 
398 aa  208  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>