More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_2306 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_2579  8-amino-7-oxononanoate synthase  89.75 
 
 
400 aa  755    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1967  8-amino-7-oxononanoate synthase  86.75 
 
 
400 aa  731    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0257  8-amino-7-oxononanoate synthase  88.25 
 
 
400 aa  745    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0226  8-amino-7-oxononanoate synthase  90.15 
 
 
401 aa  729    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2203  8-amino-7-oxononanoate synthase  81.75 
 
 
400 aa  691    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.679365 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2306  8-amino-7-oxononanoate synthase  100 
 
 
404 aa  832    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2152  8-amino-7-oxononanoate synthase  93.32 
 
 
404 aa  786    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00977448  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0448  aminotransferase class I and II  51 
 
 
428 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.341482  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0699  aminotransferase class I and II  49.25 
 
 
396 aa  402  1e-111  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1185  glycine C-acetyltransferase  43.94 
 
 
396 aa  367  1e-100  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2195  Glycine C-acetyltransferase  43.29 
 
 
401 aa  362  5.0000000000000005e-99  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.880865  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2557  Glycine C-acetyltransferase  45.36 
 
 
403 aa  354  1e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.470257  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2397  Glycine C-acetyltransferase  45.97 
 
 
401 aa  353  2e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.135893  normal  0.0678456 
 
 
-
 
NC_002950  PG1780  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.42 
 
 
395 aa  335  7e-91  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0022  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  40 
 
 
388 aa  301  2e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0282575  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0779  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  38.54 
 
 
395 aa  292  7e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0586  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.79 
 
 
396 aa  287  2e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0530  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.79 
 
 
396 aa  287  2e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0530  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.79 
 
 
396 aa  287  2e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4680  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.79 
 
 
396 aa  287  2e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.721634  hitchhiker  3.77656e-21 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0620  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.79 
 
 
396 aa  287  2e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0534  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  37.05 
 
 
396 aa  288  2e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0675  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.79 
 
 
396 aa  287  2e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.36128e-18 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0657  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.79 
 
 
396 aa  287  2e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.111241  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0748  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.79 
 
 
396 aa  287  2e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00398054  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0688  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.79 
 
 
396 aa  286  4e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2235  glycine C-acetyltransferase  37.63 
 
 
424 aa  286  5e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0533  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  37.31 
 
 
396 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.801462  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2194  8-amino-7-oxononanoate synthase, putative  37.86 
 
 
395 aa  280  3e-74  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0842  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.16 
 
 
396 aa  278  1e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0831  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.39 
 
 
389 aa  278  1e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2767  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.71 
 
 
399 aa  276  4e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2629  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.64 
 
 
391 aa  276  6e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3246  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.54 
 
 
391 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1346  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  35.79 
 
 
391 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.583033  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3430  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.54 
 
 
389 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0707061 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0669  glycine C-acetyltransferase  36.18 
 
 
446 aa  270  2e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.236778  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1635  Glycine C-acetyltransferase  37.34 
 
 
424 aa  268  8.999999999999999e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.17443 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3421  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.14 
 
 
400 aa  264  2e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.909101  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0292  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.53 
 
 
393 aa  264  2e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1307  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  35.92 
 
 
395 aa  261  2e-68  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5431  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.26 
 
 
407 aa  259  5.0000000000000005e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3919  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  33.68 
 
 
404 aa  259  7e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0458222 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0147  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  34.43 
 
 
395 aa  258  1e-67  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1549  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  36.41 
 
 
393 aa  258  1e-67  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000387483  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44240  8-amino-7-oxononanoate synthase-like protein  37.16 
 
 
391 aa  257  2e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0908  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.94 
 
 
395 aa  257  3e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0537628  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1652  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  35.77 
 
 
393 aa  256  3e-67  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1685  8-amino-7-oxononanoate synthase  33.25 
 
 
405 aa  256  4e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.888348  normal  0.418034 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2687  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.81 
 
 
394 aa  255  1.0000000000000001e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000288731  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3628  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.88 
 
 
395 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2207  Glycine C-acetyltransferase  34.67 
 
 
416 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.35112  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0731  Glycine C-acetyltransferase  37.44 
 
 
396 aa  254  2.0000000000000002e-66  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.000138233  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0481  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.75 
 
 
396 aa  252  7e-66  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4009  8-amino-7-oxononanoate synthase  32.64 
 
 
398 aa  252  1e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0774739  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10031  8-amino-7-oxononanoate synthase bioF2  36.9 
 
 
771 aa  251  1e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.863563  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05000  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.4 
 
 
397 aa  252  1e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3900  serine palmitoyltransferase  34.16 
 
 
400 aa  250  3e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.673344  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3445  aminotransferase, class I/II  34.31 
 
 
390 aa  249  6e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0352  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.13 
 
 
397 aa  249  8e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3263  putative serine palmitoyltransferase  34.31 
 
 
390 aa  249  9e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0699  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  35.08 
 
 
395 aa  249  9e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3158  putative serine palmitoyltransferase  34.31 
 
 
390 aa  249  9e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02854  conserved hypothetical protein  34.31 
 
 
390 aa  248  1e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000161764  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0715  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.31 
 
 
390 aa  248  1e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02803  hypothetical protein  34.31 
 
 
390 aa  248  1e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000119299  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0587  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.9 
 
 
395 aa  248  2e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0077  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  37.03 
 
 
399 aa  248  2e-64  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0554618  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0756  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.42 
 
 
394 aa  247  2e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0573  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.9 
 
 
395 aa  248  2e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.709963  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0738  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.42 
 
 
394 aa  247  3e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3111  serine palmitoyltransferase  34.48 
 
 
399 aa  247  3e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001212  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.06 
 
 
397 aa  246  6.999999999999999e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2658  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.5 
 
 
396 aa  245  9e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0836  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.14 
 
 
398 aa  244  1.9999999999999999e-63  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0972896  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2171  glycine C-acetyltransferase  33.42 
 
 
400 aa  243  3.9999999999999997e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.515105  normal  0.926821 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4407  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.03 
 
 
395 aa  242  9e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0228  8-amino-7-oxononanoate synthase  33.51 
 
 
395 aa  242  1e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00625814  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0049  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  36.53 
 
 
396 aa  240  4e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0098  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.34 
 
 
397 aa  240  4e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.189992  hitchhiker  0.000233483 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0048  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  36.53 
 
 
396 aa  239  6.999999999999999e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000159697 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0200  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.55 
 
 
396 aa  239  9e-62  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1996  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.55 
 
 
396 aa  239  9e-62  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.112082  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3615  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.81 
 
 
397 aa  238  1e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.011325  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3709  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.06 
 
 
397 aa  238  2e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.556629  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4480  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.82 
 
 
397 aa  238  2e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0239819 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4340  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.57 
 
 
397 aa  237  3e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1662  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.92 
 
 
391 aa  237  3e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0058  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.57 
 
 
397 aa  237  3e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0257506  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2816  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.72 
 
 
395 aa  236  4e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0698  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.03 
 
 
397 aa  236  7e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4285  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.31 
 
 
397 aa  236  7e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.560532  hitchhiker  0.0000435103 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4159  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  33.59 
 
 
399 aa  235  8e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0107  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.5 
 
 
398 aa  235  8e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.407437  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2093  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.84 
 
 
391 aa  236  8e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2930  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  33.77 
 
 
397 aa  235  9e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.573934  normal  0.531158 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1784  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  33.93 
 
 
396 aa  235  9e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.060875  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4834  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.19 
 
 
380 aa  235  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.348424 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3873  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.68 
 
 
395 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2473  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.51 
 
 
389 aa  234  2.0000000000000002e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00670549  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>