More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1956 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1956  hypothetical protein  100 
 
 
411 aa  851    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0672  hypothetical protein  67.95 
 
 
414 aa  549  1e-155  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000206571 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0485  hypothetical protein  65.84 
 
 
414 aa  548  1e-155  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0016  hypothetical protein  51.13 
 
 
429 aa  398  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.986681 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0456  hypothetical protein  50.4 
 
 
389 aa  390  1e-107  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.882052  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06088  hypothetical protein  49.06 
 
 
433 aa  384  1e-105  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4048  hypothetical protein  49.06 
 
 
417 aa  376  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.139975 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3515  hypothetical protein  48.38 
 
 
415 aa  374  1e-102  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000288  8-amino-7-oxononanoate synthase/CqsA  47.99 
 
 
393 aa  370  1e-101  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.331723  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2787  hypothetical protein  44.56 
 
 
416 aa  341  1e-92  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2656  hypothetical protein  45.45 
 
 
416 aa  341  2e-92  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0774  hypothetical protein  64.1 
 
 
255 aa  326  4.0000000000000003e-88  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.638698 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0771  hypothetical protein  56.44 
 
 
187 aa  197  3e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.403865 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2943  aminotransferase class I and II  35.19 
 
 
400 aa  191  2.9999999999999997e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.064626  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3076  serine palmitoyltransferase  33.22 
 
 
393 aa  169  9e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.473722  normal  0.645206 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2207  Glycine C-acetyltransferase  28.73 
 
 
416 aa  160  4e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.35112  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2045  8-amino-7-oxononanoate synthase  28.9 
 
 
390 aa  158  2e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0152681  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0779  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  27.11 
 
 
395 aa  158  2e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0669  glycine C-acetyltransferase  29.33 
 
 
446 aa  157  3e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.236778  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2194  8-amino-7-oxononanoate synthase, putative  26.7 
 
 
395 aa  157  4e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1346  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  28.37 
 
 
391 aa  156  5.0000000000000005e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.583033  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0317  8-amino-7-oxononanoate synthase  28.75 
 
 
385 aa  155  8e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0228  8-amino-7-oxononanoate synthase  30.14 
 
 
395 aa  155  1e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00625814  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1195  8-amino-7-oxononanoate synthase  29.07 
 
 
382 aa  154  2.9999999999999998e-36  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.760383 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1470  8-amino-7-oxononanoate synthase  28.61 
 
 
402 aa  152  8.999999999999999e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.000728084  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0699  aminotransferase class I and II  28.8 
 
 
396 aa  152  1e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0351  8-amino-7-oxononanoate synthase  31.77 
 
 
380 aa  152  1e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0240485  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0113  8-amino-7-oxononanoate synthase  27.2 
 
 
394 aa  151  2e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0699  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  28.37 
 
 
395 aa  151  2e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1387  8-amino-7-oxononanoate synthase  30.34 
 
 
374 aa  150  3e-35  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1835  8-amino-7-oxononanoate synthase  29.87 
 
 
384 aa  150  4e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0890  8-amino-7-oxononanoate synthase  28.2 
 
 
385 aa  150  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.866629  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0328  8-amino-7-oxononanoate synthase  31.77 
 
 
380 aa  150  4e-35  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.971003  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1307  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  28.9 
 
 
395 aa  150  5e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4993  glycine C-acetyltransferase  28.48 
 
 
407 aa  150  6e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02854  conserved hypothetical protein  29.17 
 
 
390 aa  149  7e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000161764  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0715  8-amino-7-oxononanoate synthase  29.17 
 
 
390 aa  149  7e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02803  hypothetical protein  29.17 
 
 
390 aa  149  7e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000119299  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3456  8-amino-7-oxononanoate synthase  26.67 
 
 
403 aa  149  7e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0094566  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0106  8-amino-7-oxononanoate synthase  28.39 
 
 
392 aa  149  8e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.209917  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1549  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  28.41 
 
 
393 aa  149  1.0000000000000001e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000387483  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3263  putative serine palmitoyltransferase  28.45 
 
 
390 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3111  serine palmitoyltransferase  24.93 
 
 
399 aa  149  1.0000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3900  serine palmitoyltransferase  25.93 
 
 
400 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.673344  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3445  aminotransferase, class I/II  29.17 
 
 
390 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3158  putative serine palmitoyltransferase  28.45 
 
 
390 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0292  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  29.07 
 
 
393 aa  148  2.0000000000000003e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0922  8-amino-7-oxononanoate synthase  27.91 
 
 
385 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0945  8-amino-7-oxononanoate synthase  27.91 
 
 
385 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0094418  normal  0.966825 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44240  8-amino-7-oxononanoate synthase-like protein  29.29 
 
 
391 aa  148  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0022  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  29.74 
 
 
388 aa  147  3e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0282575  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1780  8-amino-7-oxononanoate synthase  31.18 
 
 
395 aa  146  7.0000000000000006e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0831  8-amino-7-oxononanoate synthase  28.41 
 
 
385 aa  146  8.000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000743948  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1185  glycine C-acetyltransferase  26.24 
 
 
396 aa  145  1e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6894  8-amino-7-oxononanoate synthase  30.73 
 
 
399 aa  145  2e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3628  8-amino-7-oxononanoate synthase  29.57 
 
 
380 aa  145  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.398519  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0859  8-amino-7-oxononanoate synthase  27.62 
 
 
385 aa  144  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.123721  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1659  8-amino-7-oxononanoate synthase  26.85 
 
 
380 aa  144  4e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1267  8-amino-7-oxononanoate synthase  30.24 
 
 
384 aa  143  4e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.123615  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3094  8-amino-7-oxononanoate synthase  29.18 
 
 
382 aa  143  5e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.607978  normal  0.0492982 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2069  8-amino-7-oxononanoate synthase  28.07 
 
 
388 aa  143  6e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16481  putative 8-amino-7-oxononanoate synthase  29 
 
 
381 aa  142  7e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2171  glycine C-acetyltransferase  25.94 
 
 
400 aa  142  9e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.515105  normal  0.926821 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0448  aminotransferase class I and II  26.46 
 
 
428 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.341482  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2235  glycine C-acetyltransferase  28.16 
 
 
424 aa  142  9.999999999999999e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0573  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  27.32 
 
 
395 aa  141  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.709963  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0147  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  26.88 
 
 
395 aa  142  1.9999999999999998e-32  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4834  8-amino-7-oxononanoate synthase  28.95 
 
 
380 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.348424 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1146  5-aminolevulinate synthase  27.34 
 
 
421 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0527812  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3077  8-amino-7-oxononanoate synthase  29.18 
 
 
382 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4251  8-amino-7-oxononanoate synthase  26.81 
 
 
394 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0587  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  27.32 
 
 
395 aa  141  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3137  8-amino-7-oxononanoate synthase  29.18 
 
 
382 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.820035 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1570  8-amino-7-oxononanoate synthase  29.97 
 
 
501 aa  140  3e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.537635  normal  0.306191 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2195  Glycine C-acetyltransferase  26.1 
 
 
401 aa  141  3e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.880865  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4228  8-amino-7-oxononanoate synthase  27.22 
 
 
395 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.323305  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1009  8-amino-7-oxononanoate synthase  26.73 
 
 
395 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0698  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  27.46 
 
 
397 aa  138  1e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3792  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  28.85 
 
 
406 aa  139  1e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000577388  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0443  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  26.3 
 
 
395 aa  139  1e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.504807  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2967  8-amino-7-oxononanoate synthase  26.88 
 
 
396 aa  138  2e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5431  8-amino-7-oxononanoate synthase  27.22 
 
 
407 aa  138  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2767  8-amino-7-oxononanoate synthase  24.93 
 
 
399 aa  138  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4368  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  29.57 
 
 
398 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0799  8-amino-7-oxononanoate synthase  28.19 
 
 
384 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000322202  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2225  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  28.57 
 
 
395 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2629  8-amino-7-oxononanoate synthase  27.98 
 
 
391 aa  137  4e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2856  8-amino-7-oxononanoate synthase  27.53 
 
 
390 aa  137  4e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3190  5-aminolevulinate synthase  29.82 
 
 
407 aa  137  4e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1830  5-aminolevulinate synthase  28.73 
 
 
403 aa  137  4e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10031  8-amino-7-oxononanoate synthase bioF2  29.63 
 
 
771 aa  136  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.863563  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2457  8-amino-7-oxononanoate synthase  28.39 
 
 
399 aa  136  6.0000000000000005e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1652  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  27.87 
 
 
393 aa  136  6.0000000000000005e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2789  8-amino-7-oxononanoate synthase  28.82 
 
 
380 aa  136  7.000000000000001e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3873  8-amino-7-oxononanoate synthase  26.73 
 
 
395 aa  136  9e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0243  8-amino-7-oxononanoate synthase  27.87 
 
 
389 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0088  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  27.43 
 
 
398 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4990  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  27.43 
 
 
398 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00350174  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0419  8-amino-7-oxononanoate synthase  27.87 
 
 
389 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00014037 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4121  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  27.43 
 
 
398 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.54608  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>