More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000288 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013457  VEA_000288  8-amino-7-oxononanoate synthase/CqsA  100 
 
 
393 aa  816    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.331723  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06088  hypothetical protein  81.63 
 
 
433 aa  684    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0456  hypothetical protein  57.88 
 
 
389 aa  469  1.0000000000000001e-131  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.882052  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0672  hypothetical protein  49.87 
 
 
414 aa  377  1e-103  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000206571 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0485  hypothetical protein  49.07 
 
 
414 aa  377  1e-103  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1956  hypothetical protein  47.99 
 
 
411 aa  370  1e-101  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0016  hypothetical protein  44.33 
 
 
429 aa  320  3e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.986681 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4048  hypothetical protein  44.06 
 
 
417 aa  319  3.9999999999999996e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.139975 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3515  hypothetical protein  43.54 
 
 
415 aa  319  3.9999999999999996e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2787  hypothetical protein  39.64 
 
 
416 aa  307  2.0000000000000002e-82  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2656  hypothetical protein  40.21 
 
 
416 aa  303  3.0000000000000004e-81  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0774  hypothetical protein  54.13 
 
 
255 aa  238  1e-61  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.638698 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2943  aminotransferase class I and II  33.04 
 
 
400 aa  176  6e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.064626  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0771  hypothetical protein  46.88 
 
 
187 aa  158  2e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.403865 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0228  8-amino-7-oxononanoate synthase  28.49 
 
 
395 aa  157  3e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00625814  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0448  aminotransferase class I and II  26.52 
 
 
428 aa  152  8e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.341482  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2767  8-amino-7-oxononanoate synthase  25 
 
 
399 aa  152  1e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3111  serine palmitoyltransferase  25.93 
 
 
399 aa  149  6e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2789  Glycine C-acetyltransferase  28.7 
 
 
428 aa  147  3e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1835  8-amino-7-oxononanoate synthase  29.29 
 
 
384 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44240  8-amino-7-oxononanoate synthase-like protein  26.85 
 
 
391 aa  144  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2045  8-amino-7-oxononanoate synthase  26.57 
 
 
390 aa  144  2e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0152681  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2397  Glycine C-acetyltransferase  27.75 
 
 
401 aa  143  5e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.135893  normal  0.0678456 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02854  conserved hypothetical protein  26.18 
 
 
390 aa  143  6e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000161764  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02803  hypothetical protein  26.18 
 
 
390 aa  143  6e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000119299  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0715  8-amino-7-oxononanoate synthase  26.18 
 
 
390 aa  143  6e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3445  aminotransferase, class I/II  26.18 
 
 
390 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3263  putative serine palmitoyltransferase  26.18 
 
 
390 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3158  putative serine palmitoyltransferase  26.18 
 
 
390 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2171  glycine C-acetyltransferase  24.22 
 
 
400 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.515105  normal  0.926821 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1185  glycine C-acetyltransferase  25.83 
 
 
396 aa  139  7e-32  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2195  Glycine C-acetyltransferase  26.23 
 
 
401 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.880865  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1685  8-amino-7-oxononanoate synthase  26.65 
 
 
405 aa  137  3.0000000000000003e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.888348  normal  0.418034 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3076  serine palmitoyltransferase  25.8 
 
 
393 aa  137  3.0000000000000003e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.473722  normal  0.645206 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0860  5-aminolevulinate synthase  26.76 
 
 
409 aa  137  5e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.63511  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5431  8-amino-7-oxononanoate synthase  26.42 
 
 
407 aa  136  7.000000000000001e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2856  8-amino-7-oxononanoate synthase  26.98 
 
 
390 aa  135  8e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0106  8-amino-7-oxononanoate synthase  27.75 
 
 
392 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.209917  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0669  glycine C-acetyltransferase  25.96 
 
 
446 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.236778  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1393  8-amino-7-oxononanoate synthase  28.03 
 
 
387 aa  134  3e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0360461  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1549  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  27.49 
 
 
393 aa  133  3.9999999999999996e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000387483  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0699  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  26.84 
 
 
395 aa  133  5e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0317  8-amino-7-oxononanoate synthase  26.56 
 
 
385 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0586  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  27.08 
 
 
396 aa  130  3e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0620  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  27.08 
 
 
396 aa  130  3e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3900  serine palmitoyltransferase  23.48 
 
 
400 aa  130  3e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.673344  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4680  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  26.1 
 
 
396 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.721634  hitchhiker  3.77656e-21 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0657  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  26.81 
 
 
396 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.111241  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0688  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  26.81 
 
 
396 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0530  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  26.81 
 
 
396 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0530  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  26.81 
 
 
396 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0675  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  26.81 
 
 
396 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.36128e-18 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0748  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  26.81 
 
 
396 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00398054  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0534  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  26.1 
 
 
396 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2207  Glycine C-acetyltransferase  26.18 
 
 
416 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.35112  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0699  aminotransferase class I and II  25.34 
 
 
396 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4993  glycine C-acetyltransferase  25.51 
 
 
407 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0533  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  26.81 
 
 
396 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.801462  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0443  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  24.7 
 
 
395 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.504807  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2288  8-amino-7-oxononanoate synthase  27.16 
 
 
393 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.50363  normal  0.0796001 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10031  8-amino-7-oxononanoate synthase bioF2  27.68 
 
 
771 aa  127  3e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.863563  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1910  8-amino-7-oxononanoate synthase  28.94 
 
 
410 aa  127  4.0000000000000003e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0601  8-amino-7-oxononanoate synthase  26.25 
 
 
401 aa  126  7e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0922  8-amino-7-oxononanoate synthase  27.25 
 
 
385 aa  126  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1326  8-amino-7-oxononanoate synthase  26.33 
 
 
384 aa  125  9e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00066  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  25.15 
 
 
398 aa  125  1e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2978  8-amino-7-oxononanoate synthase  27.73 
 
 
374 aa  125  1e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.748921 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2235  glycine C-acetyltransferase  24.85 
 
 
424 aa  125  1e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1051  8-amino-7-oxononanoate synthase  28.7 
 
 
398 aa  125  2e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.307967  normal  0.238477 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0292  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  26.43 
 
 
393 aa  125  2e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2557  Glycine C-acetyltransferase  25.41 
 
 
403 aa  124  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.470257  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0945  8-amino-7-oxononanoate synthase  27.25 
 
 
385 aa  125  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0094418  normal  0.966825 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0022  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  25.6 
 
 
388 aa  124  2e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0282575  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0147  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  26.56 
 
 
395 aa  124  2e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0890  8-amino-7-oxononanoate synthase  27.25 
 
 
385 aa  125  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.866629  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0419  8-amino-7-oxononanoate synthase  25.37 
 
 
389 aa  124  3e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00014037 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3873  8-amino-7-oxononanoate synthase  25 
 
 
395 aa  124  3e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0831  8-amino-7-oxononanoate synthase  27.25 
 
 
385 aa  124  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000743948  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0243  8-amino-7-oxononanoate synthase  25.37 
 
 
389 aa  124  3e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1780  8-amino-7-oxononanoate synthase  25.21 
 
 
395 aa  124  4e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0393  8-amino-7-oxononanoate synthase  25.07 
 
 
390 aa  124  4e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.221946  normal  0.405547 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6614  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  25.89 
 
 
394 aa  123  4e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0794675 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1312  amino acid adenylation domain protein  24.93 
 
 
1225 aa  123  5e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6894  8-amino-7-oxononanoate synthase  28.03 
 
 
399 aa  123  5e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0573  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  24.3 
 
 
395 aa  123  5e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.709963  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0587  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  24.3 
 
 
395 aa  123  5e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3534  8-amino-7-oxononanoate synthase  28.45 
 
 
398 aa  123  7e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06510  8-amino-7-oxononanoate synthase  25.66 
 
 
401 aa  123  7e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0267336  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0859  8-amino-7-oxononanoate synthase  26.95 
 
 
385 aa  122  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.123721  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2376  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  27.5 
 
 
396 aa  122  8e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1307  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  24.56 
 
 
395 aa  122  8e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3949  8-amino-7-oxononanoate synthase  24.71 
 
 
395 aa  122  8e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3927  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  25.29 
 
 
398 aa  122  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2974  8-amino-7-oxononanoate synthase  26.69 
 
 
402 aa  122  9.999999999999999e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0120  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  24.85 
 
 
402 aa  122  9.999999999999999e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2225  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  25.37 
 
 
395 aa  122  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3908  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  25.29 
 
 
398 aa  122  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0785377 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1009  8-amino-7-oxononanoate synthase  23.77 
 
 
395 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4095  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  25.29 
 
 
398 aa  122  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3628  8-amino-7-oxononanoate synthase  29.67 
 
 
380 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.398519  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>