More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_0419 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011206  Lferr_0419  8-amino-7-oxononanoate synthase  100 
 
 
389 aa  767    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00014037 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0243  8-amino-7-oxononanoate synthase  100 
 
 
389 aa  767    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4686  8-amino-7-oxononanoate synthase  48.82 
 
 
396 aa  309  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2435  8-amino-7-oxononanoate synthase  48.02 
 
 
391 aa  307  3e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0783032 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3138  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.41 
 
 
397 aa  304  2.0000000000000002e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.743244  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0022  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  42.22 
 
 
388 aa  300  3e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0282575  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0495  8-amino-7-oxononanoate synthase  47.77 
 
 
396 aa  298  1e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2100  8-amino-7-oxononanoate synthase  46.23 
 
 
386 aa  298  1e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1130  8-amino-7-oxononanoate synthase  47.01 
 
 
396 aa  298  1e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3456  8-amino-7-oxononanoate synthase  47.25 
 
 
403 aa  297  2e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0094566  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1979  8-amino-7-oxononanoate synthase  47.01 
 
 
397 aa  297  2e-79  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0601  8-amino-7-oxononanoate synthase  46.97 
 
 
401 aa  296  4e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4839  8-amino-7-oxononanoate synthase  48.4 
 
 
390 aa  295  7e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.908198 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0393  8-amino-7-oxononanoate synthase  47.98 
 
 
390 aa  294  1e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.221946  normal  0.405547 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06510  8-amino-7-oxononanoate synthase  46.17 
 
 
401 aa  293  4e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0267336  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5175  8-amino-7-oxononanoate synthase  47.31 
 
 
392 aa  292  8e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.701145  normal  0.281343 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2629  8-amino-7-oxononanoate synthase  47.48 
 
 
391 aa  290  2e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0831  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.38 
 
 
389 aa  290  2e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3430  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.28 
 
 
389 aa  290  3e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0707061 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2068  8-amino-7-oxononanoate synthase  46.61 
 
 
387 aa  289  5.0000000000000004e-77  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2755  8-amino-7-oxononanoate synthase  46.44 
 
 
394 aa  287  2e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.611384  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2897  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.04 
 
 
387 aa  283  3.0000000000000004e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.786658  normal  0.0952013 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2288  8-amino-7-oxononanoate synthase  46.84 
 
 
393 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.50363  normal  0.0796001 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1835  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.64 
 
 
384 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2816  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.79 
 
 
395 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0133  8-amino-7-oxononanoate synthase  45.12 
 
 
392 aa  283  4.0000000000000003e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0363  8-amino-7-oxononanoate synthase  47.87 
 
 
390 aa  280  5e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4087  8-amino-7-oxononanoate synthase  46.72 
 
 
389 aa  279  7e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.996565  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05990  8-amino-7-oxononanoate synthase  45.95 
 
 
391 aa  278  1e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0842  8-amino-7-oxononanoate synthase  44.3 
 
 
396 aa  277  3e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2967  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.94 
 
 
396 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0779  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  39.73 
 
 
395 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1126  8-amino-7-oxononanoate synthase  46.17 
 
 
387 aa  273  3e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2093  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.82 
 
 
391 aa  271  1e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1009  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.37 
 
 
395 aa  271  2e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2856  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.39 
 
 
390 aa  270  4e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3246  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.95 
 
 
391 aa  268  1e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4228  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.11 
 
 
395 aa  268  1e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.323305  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4187  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.37 
 
 
395 aa  268  2e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3919  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  38.05 
 
 
404 aa  268  2e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0458222 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4834  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.9 
 
 
380 aa  268  2e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.348424 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0292  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  38.3 
 
 
393 aa  268  2e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4251  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.21 
 
 
394 aa  266  5.999999999999999e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3873  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.58 
 
 
395 aa  265  8.999999999999999e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0389  8-amino-7-oxononanoate synthase  47.98 
 
 
390 aa  265  1e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.598299 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1665  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.8 
 
 
390 aa  264  2e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000158621  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3949  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.85 
 
 
395 aa  263  4e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0699  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  40.83 
 
 
395 aa  263  4.999999999999999e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0530  8-amino-7-oxononanoate synthase  46.78 
 
 
396 aa  262  6.999999999999999e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.8149  normal  0.730891 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6894  8-amino-7-oxononanoate synthase  41.71 
 
 
399 aa  262  8.999999999999999e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1346  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  38.4 
 
 
391 aa  261  1e-68  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.583033  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3859  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.79 
 
 
395 aa  261  1e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2473  8-amino-7-oxononanoate synthase  40.41 
 
 
389 aa  261  2e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00670549  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2045  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.27 
 
 
390 aa  261  2e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0152681  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0065  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.33 
 
 
381 aa  260  3e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00162329  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4026  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.52 
 
 
395 aa  259  4e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4339  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.52 
 
 
395 aa  259  4e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4141  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.52 
 
 
395 aa  259  4e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0067  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.04 
 
 
381 aa  259  5.0000000000000005e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3561  8-amino-7-oxononanoate synthase  46.84 
 
 
397 aa  259  5.0000000000000005e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0270592 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1549  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  36.95 
 
 
393 aa  259  5.0000000000000005e-68  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000387483  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0859  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.44 
 
 
383 aa  259  5.0000000000000005e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4032  8-amino-7-oxononanoate synthase  45.95 
 
 
410 aa  259  5.0000000000000005e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.749674 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0962  8-amino-7-oxononanoate synthase  49.86 
 
 
402 aa  258  8e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0636992  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1307  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  37.14 
 
 
395 aa  257  2e-67  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0317  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.73 
 
 
385 aa  256  4e-67  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0039  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.78 
 
 
395 aa  256  6e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1185  glycine C-acetyltransferase  36.15 
 
 
396 aa  255  9e-67  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3534  8-amino-7-oxononanoate synthase  47.26 
 
 
398 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3452  8-amino-7-oxononanoate synthase  48.04 
 
 
397 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.427892  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1346  8-amino-7-oxononanoate synthase  46.7 
 
 
392 aa  253  3e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.404227  normal  0.0485323 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2194  8-amino-7-oxononanoate synthase, putative  37.83 
 
 
395 aa  253  4.0000000000000004e-66  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2819  8-amino-7-oxononanoate synthase  41.6 
 
 
386 aa  253  6e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.238306 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1662  8-amino-7-oxononanoate synthase  44.2 
 
 
391 aa  253  6e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4264  8-amino-7-oxononanoate synthase  47.18 
 
 
394 aa  252  1e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.122877 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0446  8-amino-7-oxononanoate synthase  46.33 
 
 
394 aa  250  3e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0002  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.58 
 
 
370 aa  249  5e-65  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0106  8-amino-7-oxononanoate synthase  45.17 
 
 
392 aa  249  5e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.209917  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3602  8-amino-7-oxononanoate synthase  47.26 
 
 
398 aa  249  6e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1832  8-amino-7-oxononanoate synthase  44.94 
 
 
405 aa  249  7e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1570  8-amino-7-oxononanoate synthase  47.49 
 
 
501 aa  249  8e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.537635  normal  0.306191 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2163  8-amino-7-oxononanoate synthase  45.2 
 
 
399 aa  248  1e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1802  aminotransferase class I and II  44.41 
 
 
397 aa  248  1e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00743  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.86 
 
 
384 aa  248  2e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000953076  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2397  Glycine C-acetyltransferase  37.92 
 
 
401 aa  247  2e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.135893  normal  0.0678456 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00760  hypothetical protein  43.86 
 
 
384 aa  248  2e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00012618  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2775  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.92 
 
 
396 aa  247  2e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00358245  normal  0.0206135 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2867  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.86 
 
 
384 aa  248  2e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00148387  normal  0.0589709 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0830  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.86 
 
 
384 aa  248  2e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000670257  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2576  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.86 
 
 
384 aa  247  3e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000828217  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2556  8-amino-7-oxononanoate synthase  40.45 
 
 
410 aa  247  3e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00135119  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0839  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.86 
 
 
384 aa  246  4e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000113881  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0924  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.86 
 
 
384 aa  246  4e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00304993  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1096  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.58 
 
 
370 aa  246  4e-64  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.177322  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0423  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.47 
 
 
384 aa  246  4.9999999999999997e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0799  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.6 
 
 
384 aa  246  6e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000322202  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1166  8-amino-7-oxononanoate synthase  44.7 
 
 
386 aa  246  6.999999999999999e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.609374  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2195  Glycine C-acetyltransferase  36.08 
 
 
401 aa  245  9e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.880865  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0352  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.95 
 
 
393 aa  245  9.999999999999999e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.367028 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1326  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.77 
 
 
384 aa  245  9.999999999999999e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>