More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06088 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013457  VEA_000288  8-amino-7-oxononanoate synthase/CqsA  81.63 
 
 
393 aa  684    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.331723  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06088  hypothetical protein  100 
 
 
433 aa  905    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0456  hypothetical protein  57.18 
 
 
389 aa  471  1.0000000000000001e-131  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.882052  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1956  hypothetical protein  49.06 
 
 
411 aa  384  1e-105  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0485  hypothetical protein  50.13 
 
 
414 aa  381  1e-104  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0672  hypothetical protein  50.13 
 
 
414 aa  379  1e-104  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000206571 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0016  hypothetical protein  43.6 
 
 
429 aa  325  1e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.986681 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2787  hypothetical protein  41.53 
 
 
416 aa  319  7e-86  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4048  hypothetical protein  43.26 
 
 
417 aa  319  7e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.139975 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3515  hypothetical protein  45.17 
 
 
415 aa  317  3e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2656  hypothetical protein  41.27 
 
 
416 aa  315  9e-85  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0774  hypothetical protein  53.21 
 
 
255 aa  239  5.999999999999999e-62  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.638698 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2943  aminotransferase class I and II  30.82 
 
 
400 aa  163  5.0000000000000005e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.064626  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0228  8-amino-7-oxononanoate synthase  28.49 
 
 
395 aa  159  6e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00625814  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0771  hypothetical protein  47.17 
 
 
187 aa  157  3e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.403865 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0448  aminotransferase class I and II  25.41 
 
 
428 aa  150  3e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.341482  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2767  8-amino-7-oxononanoate synthase  26.47 
 
 
399 aa  150  3e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1549  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  30.23 
 
 
393 aa  151  3e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000387483  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2045  8-amino-7-oxononanoate synthase  27.16 
 
 
390 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0152681  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3111  serine palmitoyltransferase  24.35 
 
 
399 aa  146  8.000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44240  8-amino-7-oxononanoate synthase-like protein  27.51 
 
 
391 aa  145  1e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2397  Glycine C-acetyltransferase  28.24 
 
 
401 aa  143  6e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.135893  normal  0.0678456 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1835  8-amino-7-oxononanoate synthase  28.27 
 
 
384 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2195  Glycine C-acetyltransferase  25.9 
 
 
401 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.880865  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1185  glycine C-acetyltransferase  25 
 
 
396 aa  141  3e-32  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02854  conserved hypothetical protein  25.86 
 
 
390 aa  140  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000161764  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02803  hypothetical protein  25.86 
 
 
390 aa  140  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000119299  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1307  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  28.19 
 
 
395 aa  140  3.9999999999999997e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0715  8-amino-7-oxononanoate synthase  25.86 
 
 
390 aa  140  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0669  glycine C-acetyltransferase  27.3 
 
 
446 aa  140  4.999999999999999e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.236778  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3263  putative serine palmitoyltransferase  25.86 
 
 
390 aa  139  7e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3158  putative serine palmitoyltransferase  25.86 
 
 
390 aa  139  7e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3445  aminotransferase, class I/II  25.86 
 
 
390 aa  139  7.999999999999999e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1051  8-amino-7-oxononanoate synthase  29.25 
 
 
398 aa  139  8.999999999999999e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.307967  normal  0.238477 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2789  Glycine C-acetyltransferase  27.25 
 
 
428 aa  138  2e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0860  5-aminolevulinate synthase  26.58 
 
 
409 aa  138  2e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.63511  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0106  8-amino-7-oxononanoate synthase  28.03 
 
 
392 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.209917  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4993  glycine C-acetyltransferase  26.29 
 
 
407 aa  137  4e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00066  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  26.63 
 
 
398 aa  137  5e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0699  aminotransferase class I and II  26.72 
 
 
396 aa  136  7.000000000000001e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1780  8-amino-7-oxononanoate synthase  26.03 
 
 
395 aa  136  8e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0292  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  28.23 
 
 
393 aa  136  8e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2967  8-amino-7-oxononanoate synthase  27.63 
 
 
396 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2856  8-amino-7-oxononanoate synthase  25.27 
 
 
390 aa  134  3e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3076  serine palmitoyltransferase  26.38 
 
 
393 aa  134  3.9999999999999996e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.473722  normal  0.645206 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1393  8-amino-7-oxononanoate synthase  28.32 
 
 
387 aa  133  5e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0360461  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2376  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  29.24 
 
 
396 aa  133  6e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1685  8-amino-7-oxononanoate synthase  26.78 
 
 
405 aa  133  6.999999999999999e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.888348  normal  0.418034 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10060  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  27.16 
 
 
399 aa  133  6.999999999999999e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.251094  normal  0.644816 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2171  glycine C-acetyltransferase  22.9 
 
 
400 aa  132  9e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.515105  normal  0.926821 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6614  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  27.08 
 
 
394 aa  132  1.0000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0794675 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2207  Glycine C-acetyltransferase  26.47 
 
 
416 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.35112  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0022  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  26.49 
 
 
388 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0282575  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4251  8-amino-7-oxononanoate synthase  24.43 
 
 
394 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1910  8-amino-7-oxononanoate synthase  29.23 
 
 
410 aa  131  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1036  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  28.95 
 
 
396 aa  131  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0674458  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4824  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  26.33 
 
 
398 aa  130  5.0000000000000004e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000213173 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0699  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  26.39 
 
 
395 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1635  Glycine C-acetyltransferase  26.5 
 
 
424 aa  129  8.000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.17443 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10110  8-amino-7-oxononanoate synthase  26.02 
 
 
395 aa  129  1.0000000000000001e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3949  8-amino-7-oxononanoate synthase  24.44 
 
 
395 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0443  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  24.4 
 
 
395 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.504807  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1311  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  26.1 
 
 
402 aa  128  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.616211  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1009  8-amino-7-oxononanoate synthase  24.08 
 
 
395 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18681  putative 8-amino-7-oxononanoate synthase  26.57 
 
 
380 aa  128  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3873  8-amino-7-oxononanoate synthase  24.12 
 
 
395 aa  127  3e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0628  8-amino-7-oxononanoate synthase  27.68 
 
 
401 aa  127  3e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2235  glycine C-acetyltransferase  25.15 
 
 
424 aa  128  3e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4228  8-amino-7-oxononanoate synthase  24.08 
 
 
395 aa  127  3e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.323305  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0710  8-amino-7-oxononanoate synthase  27.68 
 
 
401 aa  127  3e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1312  amino acid adenylation domain protein  25.86 
 
 
1225 aa  127  4.0000000000000003e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0061  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  25.44 
 
 
398 aa  127  6e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5431  8-amino-7-oxononanoate synthase  26.18 
 
 
407 aa  126  7e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0317  8-amino-7-oxononanoate synthase  26.33 
 
 
385 aa  126  8.000000000000001e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0065  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  25.35 
 
 
397 aa  126  8.000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000130332  hitchhiker  0.000000319123 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0836  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  26.04 
 
 
398 aa  126  8.000000000000001e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0972896  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2288  8-amino-7-oxononanoate synthase  26.15 
 
 
393 aa  126  9e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.50363  normal  0.0796001 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4368  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  26.04 
 
 
398 aa  126  9e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4187  8-amino-7-oxononanoate synthase  23.51 
 
 
395 aa  125  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2963  8-amino-7-oxononanoate synthase  26.33 
 
 
385 aa  125  1e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.11537  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0101  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  25.35 
 
 
397 aa  125  1e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.396382 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0423  8-amino-7-oxononanoate synthase  26.02 
 
 
384 aa  125  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1561  putative 8-amino-7-oxononanoate synthase  27.81 
 
 
379 aa  125  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.158607  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0534  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  26.33 
 
 
396 aa  124  3e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0120  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  26.04 
 
 
402 aa  124  3e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0586  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  25.39 
 
 
396 aa  124  3e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1429  8-amino-7-oxononanoate synthase  26.52 
 
 
380 aa  124  3e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0065  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  25.15 
 
 
413 aa  124  3e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0620  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  25.39 
 
 
396 aa  124  3e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4145  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  25.15 
 
 
403 aa  124  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10031  8-amino-7-oxononanoate synthase bioF2  26.78 
 
 
771 aa  124  3e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.863563  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0147  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  26.82 
 
 
395 aa  124  3e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4680  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  25.39 
 
 
396 aa  124  3e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.721634  hitchhiker  3.77656e-21 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0071  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  25.15 
 
 
403 aa  124  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2457  8-amino-7-oxononanoate synthase  27 
 
 
399 aa  124  4e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1900  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  28.36 
 
 
396 aa  124  4e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.257137  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4805  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  27.69 
 
 
400 aa  123  5e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.730908  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02780  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  25.33 
 
 
405 aa  123  5e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16481  putative 8-amino-7-oxononanoate synthase  27.44 
 
 
381 aa  124  5e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1354  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  24.72 
 
 
398 aa  123  6e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000120772 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>