More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2789 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_2789  Glycine C-acetyltransferase  100 
 
 
428 aa  888    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2207  Glycine C-acetyltransferase  39.45 
 
 
416 aa  298  9e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.35112  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1312  amino acid adenylation domain protein  40.65 
 
 
1225 aa  296  5e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0699  aminotransferase class I and II  40.62 
 
 
396 aa  265  1e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2397  Glycine C-acetyltransferase  38.33 
 
 
401 aa  256  7e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.135893  normal  0.0678456 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2557  Glycine C-acetyltransferase  37.86 
 
 
403 aa  255  1.0000000000000001e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.470257  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1835  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.18 
 
 
384 aa  249  5e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0779  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  36.39 
 
 
395 aa  249  6e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0699  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  34.87 
 
 
395 aa  249  6e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0586  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.28 
 
 
396 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0620  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.28 
 
 
396 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3263  putative serine palmitoyltransferase  37.18 
 
 
390 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3158  putative serine palmitoyltransferase  37.18 
 
 
390 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02854  conserved hypothetical protein  37.18 
 
 
390 aa  244  3e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000161764  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02803  hypothetical protein  37.18 
 
 
390 aa  244  3e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000119299  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0715  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.18 
 
 
390 aa  244  3e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0688  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.03 
 
 
396 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3445  aminotransferase, class I/II  37.18 
 
 
390 aa  243  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0675  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.03 
 
 
396 aa  243  5e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.36128e-18 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0748  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.03 
 
 
396 aa  243  5e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00398054  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0530  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.03 
 
 
396 aa  243  5e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0530  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.03 
 
 
396 aa  243  5e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4680  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.03 
 
 
396 aa  243  6e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.721634  hitchhiker  3.77656e-21 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0534  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.8 
 
 
396 aa  243  7e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1346  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  33.59 
 
 
391 aa  242  9e-63  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.583033  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0657  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.03 
 
 
396 aa  242  1e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.111241  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2195  Glycine C-acetyltransferase  36 
 
 
401 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.880865  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2767  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.93 
 
 
399 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0533  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.24 
 
 
396 aa  238  1e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.801462  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2045  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.6 
 
 
390 aa  238  2e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0152681  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1307  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  33.81 
 
 
395 aa  238  2e-61  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3919  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.94 
 
 
404 aa  236  6e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0458222 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0022  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.93 
 
 
388 aa  236  9e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0282575  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0731  Glycine C-acetyltransferase  30.77 
 
 
396 aa  233  7.000000000000001e-60  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.000138233  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44240  8-amino-7-oxononanoate synthase-like protein  36.76 
 
 
391 aa  232  8.000000000000001e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2235  glycine C-acetyltransferase  33.25 
 
 
424 aa  232  1e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0049  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  32.89 
 
 
396 aa  231  2e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0048  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  32.36 
 
 
396 aa  228  2e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000159697 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1185  glycine C-acetyltransferase  34.16 
 
 
396 aa  228  2e-58  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1780  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.18 
 
 
395 aa  227  3e-58  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2967  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.78 
 
 
396 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0587  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.23 
 
 
395 aa  226  7e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0573  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.23 
 
 
395 aa  226  7e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.709963  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2194  8-amino-7-oxononanoate synthase, putative  34.07 
 
 
395 aa  223  4.9999999999999996e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0448  aminotransferase class I and II  33.89 
 
 
428 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.341482  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1685  8-amino-7-oxononanoate synthase  33.05 
 
 
405 aa  222  9.999999999999999e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.888348  normal  0.418034 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1326  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.86 
 
 
384 aa  218  2e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3138  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.1 
 
 
397 aa  218  2e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.743244  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5431  8-amino-7-oxononanoate synthase  32.2 
 
 
407 aa  217  4e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0065  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.69 
 
 
381 aa  216  5e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00162329  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1652  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  31.7 
 
 
393 aa  216  5.9999999999999996e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0067  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.4 
 
 
381 aa  215  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0292  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  33.14 
 
 
393 aa  214  2.9999999999999995e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2816  8-amino-7-oxononanoate synthase  33.52 
 
 
395 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1996  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  33.43 
 
 
396 aa  213  7e-54  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.112082  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0200  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  33.43 
 
 
396 aa  213  7e-54  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4009  8-amino-7-oxononanoate synthase  33.71 
 
 
398 aa  212  1e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0774739  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4993  glycine C-acetyltransferase  32.09 
 
 
407 aa  211  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3011  8-amino-7-oxononanoate synthase, putative  34.27 
 
 
441 aa  211  2e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2618  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.27 
 
 
441 aa  211  2e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1508  8-amino-7-oxononanoate synthase  33.52 
 
 
445 aa  210  3e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0795  8-amino-7-oxononanoate synthase  31.99 
 
 
487 aa  210  5e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0393  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.31 
 
 
390 aa  209  9e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.221946  normal  0.405547 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3421  8-amino-7-oxononanoate synthase  30.59 
 
 
400 aa  208  1e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.909101  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4834  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.6 
 
 
380 aa  208  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.348424 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4839  8-amino-7-oxononanoate synthase  33.82 
 
 
390 aa  207  4e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.908198 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1549  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  32.47 
 
 
393 aa  207  4e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000387483  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0842  8-amino-7-oxononanoate synthase  33.15 
 
 
396 aa  206  5e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0228  8-amino-7-oxononanoate synthase  33.81 
 
 
395 aa  206  5e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00625814  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3628  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  31.18 
 
 
395 aa  206  6e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1973  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.1 
 
 
544 aa  206  6e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0669  glycine C-acetyltransferase  32.58 
 
 
446 aa  206  7e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.236778  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0196  8-amino-7-oxononanoate synthase  33.92 
 
 
470 aa  206  9e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0147  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  32.66 
 
 
395 aa  205  1e-51  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2435  8-amino-7-oxononanoate synthase  33.43 
 
 
391 aa  205  1e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0783032 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1742  5-aminolevulinate synthase  31.77 
 
 
403 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0698  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  31.93 
 
 
397 aa  204  3e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5175  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.31 
 
 
392 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.701145  normal  0.281343 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10060  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  31.28 
 
 
399 aa  201  1.9999999999999998e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.251094  normal  0.644816 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0908  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  31.25 
 
 
395 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0537628  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3969  5-aminolevulinate synthase  30.94 
 
 
403 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0108645  normal  0.403503 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1325  5-aminolevulinate synthase  31.32 
 
 
403 aa  200  3e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0148844  normal  0.108489 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2306  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.08 
 
 
404 aa  200  3e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0804  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  31.16 
 
 
402 aa  200  3.9999999999999996e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.145956  normal  0.0180987 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1009  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.01 
 
 
395 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1111  8-amino-7-oxononanoate synthase  33.43 
 
 
450 aa  200  5e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0567781 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3724  5-aminolevulinate synthase  30.94 
 
 
403 aa  199  5e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00666631  hitchhiker  0.00153498 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4228  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.01 
 
 
395 aa  199  6e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.323305  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8853  Glycine C-acetyltransferase  31.01 
 
 
390 aa  199  7.999999999999999e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275408  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4805  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  31.93 
 
 
400 aa  199  9e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.730908  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0831  8-amino-7-oxononanoate synthase  32.58 
 
 
389 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1664  Glycine C-acetyltransferase  31.33 
 
 
413 aa  199  1.0000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2687  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  28.68 
 
 
394 aa  198  2.0000000000000003e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000288731  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4187  8-amino-7-oxononanoate synthase  32.85 
 
 
395 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2152  8-amino-7-oxononanoate synthase  33.89 
 
 
404 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00977448  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2093  8-amino-7-oxononanoate synthase  31.75 
 
 
391 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2629  8-amino-7-oxononanoate synthase  31.56 
 
 
391 aa  197  3e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2579  8-amino-7-oxononanoate synthase  32.96 
 
 
400 aa  197  3e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3873  8-amino-7-oxononanoate synthase  33.14 
 
 
395 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0098  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  30.9 
 
 
397 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.189992  hitchhiker  0.000233483 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>