More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0496 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_0496  hypothetical protein  100 
 
 
250 aa  509  1e-143  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.813063  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0165  hypothetical protein  78.23 
 
 
250 aa  416  9.999999999999999e-116  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0475  hypothetical protein  77.91 
 
 
250 aa  413  1e-114  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0657  hypothetical protein  76.71 
 
 
250 aa  408  1e-113  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.384968  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0538  hypothetical protein  77.11 
 
 
250 aa  408  1e-113  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0542  hypothetical protein  77.2 
 
 
250 aa  404  1.0000000000000001e-112  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1643  hypothetical protein  76.71 
 
 
250 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0743  hypothetical protein  55.24 
 
 
247 aa  287  9e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000326938  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0371  hypothetical protein  54.55 
 
 
246 aa  284  1.0000000000000001e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00064064  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1074  hypothetical protein  54.03 
 
 
247 aa  280  2e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.414553  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1416  hypothetical protein  53.23 
 
 
247 aa  278  8e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000254749  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1487  hypothetical protein  56.2 
 
 
247 aa  277  1e-73  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000223264  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0933  hypothetical protein  52.02 
 
 
247 aa  276  3e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000814789 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3313  hypothetical protein  52.02 
 
 
247 aa  275  4e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2673  hypothetical protein  52.82 
 
 
247 aa  274  9e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000969674  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1245  hypothetical protein  51.21 
 
 
247 aa  269  2.9999999999999997e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.136267  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0996  hypothetical protein  51.81 
 
 
249 aa  269  2.9999999999999997e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.140664  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2125  hypothetical protein  51.21 
 
 
248 aa  265  7e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2335  hypothetical protein  52.24 
 
 
248 aa  264  8.999999999999999e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000225431  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12350  hypothetical protein  51.39 
 
 
253 aa  263  3e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.242675  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0060  hypothetical protein  52.4 
 
 
250 aa  261  8e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0149328  normal  0.895421 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0059  hypothetical protein  52.4 
 
 
250 aa  261  8e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.852085  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3911  protein of unknown function DUF28  50.62 
 
 
249 aa  259  3e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.662224  normal  0.0433199 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0137  hypothetical protein  49.19 
 
 
248 aa  258  6e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.153689  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0685  hypothetical protein  48.4 
 
 
251 aa  258  6e-68  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1800  hypothetical protein  49.2 
 
 
250 aa  258  8e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00453018 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2078  hypothetical protein  49.4 
 
 
248 aa  252  5.000000000000001e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.283628  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1151  hypothetical protein  48.19 
 
 
250 aa  249  4e-65  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2365  hypothetical protein  48.19 
 
 
247 aa  248  5e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00180131  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1658  hypothetical protein  51.04 
 
 
242 aa  248  6e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0469  hypothetical protein  48.61 
 
 
253 aa  246  3e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1449  hypothetical protein  50.41 
 
 
246 aa  246  3e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2574  hypothetical protein  49 
 
 
248 aa  245  4e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000592568  hitchhiker  0.00160004 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0924  hypothetical protein  49.38 
 
 
246 aa  246  4e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1748  hypothetical protein  47.18 
 
 
249 aa  245  4.9999999999999997e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.649879 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0986  hypothetical protein  48.79 
 
 
247 aa  245  4.9999999999999997e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.226909 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0454  hypothetical protein  48.21 
 
 
253 aa  245  6e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.588948  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2422  hypothetical protein  50 
 
 
248 aa  244  6.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000138795  normal  0.0717978 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1103  hypothetical protein  49.59 
 
 
243 aa  244  9e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000610466  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2041  hypothetical protein  49.6 
 
 
248 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000668061  hitchhiker  0.0000000668977 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2722  hypothetical protein  50.63 
 
 
240 aa  243  1.9999999999999999e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2594  hypothetical protein  49.41 
 
 
252 aa  243  1.9999999999999999e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000460429 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2306  hypothetical protein  49.6 
 
 
248 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00197948  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0536  hypothetical protein  50.41 
 
 
245 aa  243  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.297552  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1899  hypothetical protein  49.2 
 
 
248 aa  243  3e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000661567  hitchhiker  0.000893936 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2079  hypothetical protein  49.2 
 
 
248 aa  243  3e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00551786  hitchhiker  0.0017448 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1936  hypothetical protein  49.6 
 
 
248 aa  243  3e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0314464  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1954  hypothetical protein  49.2 
 
 
248 aa  243  3e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.04417  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3547  protein of unknown function DUF28  47.41 
 
 
250 aa  242  3.9999999999999997e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0132193  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1793  protein of unknown function DUF28  48.21 
 
 
251 aa  242  3.9999999999999997e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.209564  normal  0.104344 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1886  hypothetical protein  49 
 
 
248 aa  242  5e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2432  hypothetical protein  49.2 
 
 
248 aa  241  6e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1634  protein of unknown function DUF28  49 
 
 
252 aa  241  6e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.642601  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2492  hypothetical protein  47.95 
 
 
250 aa  241  7e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2039  hypothetical protein  49.2 
 
 
248 aa  241  7.999999999999999e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000194196  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2399  protein of unknown function DUF28  46.77 
 
 
248 aa  241  9e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.42546  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0816  hypothetical protein  48.36 
 
 
243 aa  240  1e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.177048  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3853  protein of unknown function DUF28  49.17 
 
 
241 aa  241  1e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3629  hypothetical protein  50.2 
 
 
252 aa  240  2e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000422691  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1435  hypothetical protein  48.81 
 
 
251 aa  240  2e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0748903  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3521  hypothetical protein  48.33 
 
 
239 aa  239  4e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0483995  normal  0.126063 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1704  hypothetical protein  50.2 
 
 
252 aa  239  4e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000609953  normal  0.531988 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0181  hypothetical protein  50.63 
 
 
248 aa  238  8e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.641158  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2215  hypothetical protein  48.95 
 
 
243 aa  238  9e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0612934 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1219  protein of unknown function DUF28  48.19 
 
 
250 aa  237  1e-61  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.100847  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1318  hypothetical protein  52.03 
 
 
250 aa  237  1e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0714247  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0618  hypothetical protein  48.1 
 
 
239 aa  237  1e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.979417  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4362  hypothetical protein  50.81 
 
 
255 aa  237  1e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.144565 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1779  hypothetical protein  46.99 
 
 
249 aa  237  1e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00242186 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1220  hypothetical protein  45.97 
 
 
248 aa  237  2e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15350  conserved hypothetical protein TIGR01033  46.4 
 
 
251 aa  235  4e-61  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.144785  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0985  hypothetical protein  46.99 
 
 
252 aa  236  4e-61  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1703  hypothetical protein  47.92 
 
 
239 aa  235  4e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.24862  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0479  hypothetical protein  45.42 
 
 
250 aa  236  4e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000314446  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1898  hypothetical protein  47.92 
 
 
239 aa  235  4e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.484547  normal  0.228214 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1368  hypothetical protein  47.18 
 
 
251 aa  235  6e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.251758 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2066  hypothetical protein  48.19 
 
 
250 aa  234  7e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15040  conserved hypothetical protein TIGR01033  46.75 
 
 
249 aa  234  1.0000000000000001e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.105495  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2096  hypothetical protein  46.99 
 
 
249 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.803403  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1792  hypothetical protein  46.18 
 
 
249 aa  234  1.0000000000000001e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.165315  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17500  conserved hypothetical protein TIGR01033  47.41 
 
 
252 aa  234  1.0000000000000001e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.268105  normal  0.267307 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0718  hypothetical protein  49.6 
 
 
255 aa  233  2.0000000000000002e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0839  DNA-binding regulatory protein, YebC/PmpR family  51.2 
 
 
252 aa  233  3e-60  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2183  hypothetical protein  46.99 
 
 
250 aa  232  3e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6116  hypothetical protein  47.01 
 
 
250 aa  232  5e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.701892  normal  0.165467 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2031  hypothetical protein  48.59 
 
 
248 aa  232  5e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0016605  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1842  hypothetical protein  44.58 
 
 
248 aa  232  5e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.302719 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01835  hypothetical protein  45.97 
 
 
246 aa  231  7.000000000000001e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.712982  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1322  hypothetical protein  45.97 
 
 
246 aa  231  7.000000000000001e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2600  hypothetical protein  45.97 
 
 
246 aa  231  7.000000000000001e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.21652  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01823  hypothetical protein  45.97 
 
 
246 aa  231  7.000000000000001e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.562952  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1957  hypothetical protein  45.97 
 
 
246 aa  231  7.000000000000001e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.522715  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2094  hypothetical protein  45.97 
 
 
246 aa  231  7.000000000000001e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00559066  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1776  protein of unknown function DUF28  45.97 
 
 
246 aa  231  8.000000000000001e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00344475  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1768  hypothetical protein  45.97 
 
 
246 aa  231  8.000000000000001e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.235013  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1989  hypothetical protein  44.62 
 
 
252 aa  230  1e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0129309 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2325  hypothetical protein  46.59 
 
 
248 aa  231  1e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.667141  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3490  hypothetical protein  45.97 
 
 
246 aa  231  1e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0661  hypothetical protein  45.38 
 
 
248 aa  230  1e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.135239  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3398  protein of unknown function DUF28  46.46 
 
 
255 aa  230  1e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00438869  decreased coverage  0.000000218577 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>