More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03139 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_03139  DNA polymerase IV  100 
 
 		 369 aa  749    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0455  DNA polymerase IV  79.26 
 
 		 356 aa  561  1.0000000000000001e-159  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5353  DNA polymerase IV  53.6 
 
 		 378 aa  330  3e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198836  normal  0.299038 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3265  DNA polymerase IV  51.43 
 
 		 354 aa  325  8.000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0473  DNA-directed DNA polymerase  50.28 
 
 		 375 aa  322  4e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3636  DNA polymerase IV  50.14 
 
 		 396 aa  314  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.892851 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2024  DNA-directed DNA polymerase  51.33 
 
 		 373 aa  314  1.9999999999999998e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1272  DNA-directed DNA polymerase  51.92 
 
 		 359 aa  314  1.9999999999999998e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7175  DNA-directed DNA polymerase  46.05 
 
 		 371 aa  310  2e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5155  DNA polymerase IV  52.21 
 
 		 363 aa  310  2e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.702969 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3374  DNA polymerase IV  50.14 
 
 		 385 aa  308  1.0000000000000001e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2097  DNA-directed DNA polymerase  51 
 
 		 373 aa  308  1.0000000000000001e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6078  DNA polymerase IV  51.33 
 
 		 365 aa  306  3e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2663  DNA-directed DNA polymerase  47.38 
 
 		 358 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0579235  normal  0.454418 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3160  DNA-directed DNA polymerase  49.42 
 
 		 359 aa  302  5.000000000000001e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1640  DNA-directed DNA polymerase  48.83 
 
 		 360 aa  302  5.000000000000001e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.582821 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0318  DNA-directed DNA polymerase  48.13 
 
 		 372 aa  301  8.000000000000001e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.154893 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2656  DNA polymerase IV  48.91 
 
 		 378 aa  301  8.000000000000001e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3597  DNA-directed DNA polymerase  49.71 
 
 		 380 aa  301  8.000000000000001e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1185  DNA-directed DNA polymerase  47.59 
 
 		 381 aa  294  1e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.129375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0883  DNA-directed DNA polymerase  47.29 
 
 		 360 aa  295  1e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1330  DNA-directed DNA polymerase  47.75 
 
 		 359 aa  294  2e-78  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.64899  normal  0.124466 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0732  DNA-directed DNA polymerase  49.71 
 
 		 363 aa  293  2e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.833353  normal  0.0993965 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1566  DNA polymerase IV  48.32 
 
 		 369 aa  292  7e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0682981  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3129  damage-inducible protein DinP  46.89 
 
 		 399 aa  291  1e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02810  DNA polymerase IV  47.06 
 
 		 368 aa  286  4e-76  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.495536  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1923  DNA-directed DNA polymerase  46.5 
 
 		 369 aa  286  5.999999999999999e-76  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000722148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1432  DNA-directed DNA polymerase  47.65 
 
 		 374 aa  283  3.0000000000000004e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.517371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1963  DNA polymerase IV  46.15 
 
 		 357 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.148262  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1635  DNA polymerase IV  45.88 
 
 		 357 aa  280  2e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.107243  normal  0.427706 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0756  DNA polymerase IV  48.53 
 
 		 376 aa  280  2e-74  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1726  DNA polymerase IV  41.95 
 
 		 364 aa  278  2e-73  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.503643  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0159  DNA-directed DNA polymerase  45.45 
 
 		 418 aa  277  2e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0148  DNA-directed DNA polymerase  45.17 
 
 		 418 aa  276  4e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0141  DNA-directed DNA polymerase  45.45 
 
 		 418 aa  275  7e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2280  DNA-directed DNA polymerase  47.99 
 
 		 378 aa  275  1.0000000000000001e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.924608  hitchhiker  0.0000031101 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2654  DNA polymerase IV  47.99 
 
 		 378 aa  275  1.0000000000000001e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0662  DNA-directed DNA polymerase  47.66 
 
 		 353 aa  273  2.0000000000000002e-72  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3604  DNA polymerase IV  48.5 
 
 		 364 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.85941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1867  DNA-directed DNA polymerase  48.26 
 
 		 356 aa  272  5.000000000000001e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1859  DNA polymerase IV  44.72 
 
 		 392 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1587  DNA polymerase IV  46.01 
 
 		 362 aa  271  1e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.937216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2775  DNA-directed DNA polymerase  50.44 
 
 		 355 aa  271  1e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2314  DNA polymerase IV  43.73 
 
 		 364 aa  271  1e-71  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.023311  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0961  DNA polymerase IV  50 
 
 		 359 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.215034  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2527  DNA polymerase IV  47.59 
 
 		 355 aa  270  4e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0383  ImpB/MucB/SamB family protein  43.44 
 
 		 357 aa  268  2e-70  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00108419  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2890  DNA-directed DNA polymerase  47.2 
 
 		 386 aa  268  2e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2160  DNA polymerase IV  44.04 
 
 		 408 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.916632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2142  DNA polymerase IV  44.04 
 
 		 361 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5935  DNA polymerase IV  44.04 
 
 		 383 aa  266  4e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0630772  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52310  DNA polymerase IV  55.73 
 
 		 349 aa  266  5e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.88026 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3621  DNA-directed DNA polymerase  47.93 
 
 		 385 aa  265  7e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2179  DNA polymerase IV  43.3 
 
 		 405 aa  264  2e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.288104  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4587  DNA polymerase IV  54.94 
 
 		 349 aa  264  2e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.099232  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3422  DNA polymerase IV  48.15 
 
 		 360 aa  263  3e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3537  DNA-directed DNA polymerase  45.01 
 
 		 357 aa  263  4e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2619  DNA polymerase IV  43.77 
 
 		 403 aa  261  1e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1563  DNA-directed DNA polymerase  44.97 
 
 		 371 aa  261  1e-68  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.233621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3083  DNA polymerase IV  43.77 
 
 		 400 aa  260  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1727  DNA polymerase IV  43.77 
 
 		 404 aa  261  2e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2675  DNA polymerase IV  43.77 
 
 		 406 aa  260  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2751  DNA polymerase IV  43.77 
 
 		 404 aa  260  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2871  DNA polymerase IV  47.67 
 
 		 359 aa  261  2e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2236  DNA polymerase IV  43.77 
 
 		 400 aa  260  2e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.783166  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1508  DNA polymerase IV  43.77 
 
 		 400 aa  260  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.408147  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1128  DNA polymerase IV  43.25 
 
 		 429 aa  260  3e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.456598  normal  0.41428 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5448  DNA polymerase IV  43.49 
 
 		 379 aa  260  3e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0145  DNA-directed DNA polymerase  44.93 
 
 		 399 aa  260  3e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0301883  normal  0.226149 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0738  DNA-directed DNA polymerase  43.18 
 
 		 425 aa  259  4e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.59258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2317  DNA-directed DNA polymerase  44.73 
 
 		 426 aa  259  5.0000000000000005e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0935  DNA polymerase IV  48.65 
 
 		 358 aa  259  6e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3308  DNA polymerase IV  52.57 
 
 		 352 aa  259  6e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00714145  hitchhiker  0.00000429031 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1621  DNA polymerase IV  39.48 
 
 		 367 aa  259  6e-68  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3355  DNA polymerase IV  48.31 
 
 		 358 aa  258  1e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3427  DNA polymerase IV  48.31 
 
 		 358 aa  258  1e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3552  DNA polymerase IV  48.31 
 
 		 358 aa  258  2e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0195  DNA polymerase IV  42.03 
 
 		 389 aa  258  2e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3296  DNA polymerase IV  52.17 
 
 		 352 aa  257  2e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2052  DNA polymerase IV  43.54 
 
 		 407 aa  257  2e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.217696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1818  DNA polymerase IV  42.65 
 
 		 359 aa  258  2e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.432608  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0947  DNA polymerase IV  52.57 
 
 		 359 aa  257  2e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3157  DNA polymerase IV  52.17 
 
 		 352 aa  257  2e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1114  DNA polymerase IV  47.64 
 
 		 357 aa  257  3e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0949  DNA polymerase IV  46.86 
 
 		 359 aa  257  3e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1397  DNA polymerase IV  51.19 
 
 		 354 aa  256  4e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3092  DNA polymerase IV  52.57 
 
 		 358 aa  256  5e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3394  DNA polymerase IV  45.01 
 
 		 364 aa  256  6e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.320161  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1040  DNA polymerase IV  43.6 
 
 		 352 aa  256  7e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0894  DNA polymerase IV  48.84 
 
 		 352 aa  255  1.0000000000000001e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0985  DNA polymerase IV  46.41 
 
 		 359 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1726  DNA polymerase IV  51.59 
 
 		 352 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.000164893  normal  0.305741 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37100  DNA polymerase IV  50.72 
 
 		 353 aa  254  2.0000000000000002e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3990  DNA polymerase IV  50.79 
 
 		 353 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3530  DNA polymerase IV  44.21 
 
 		 421 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2071  DNA-directed DNA polymerase  45.48 
 
 		 348 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.485173  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3291  DNA polymerase IV  51.38 
 
 		 352 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1559  DNA-directed DNA polymerase  42.9 
 
 		 408 aa  253  5.000000000000001e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.195396  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0951  DNA polymerase IV  47.3 
 
 		 379 aa  251  1e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.126406  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0927  DNA polymerase IV  47.84 
 
 		 352 aa  250  2e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.716542  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>