More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_5032 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_5032  type IV pilus protein PilI  100 
 
 		 179 aa  364  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0490  CheW-like protein  90.5 
 
 		 179 aa  336  9e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05340  twitching motility protein PilI  58.99 
 
 		 178 aa  214  7e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0405  putative CheW protein  57.47 
 
 		 177 aa  213  9e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0510  twitching motility protein PilI  58.99 
 
 		 178 aa  213  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5306  CheW protein  57.87 
 
 		 179 aa  204  4e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0138969  normal  0.218372 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0474  CheW protein  55.49 
 
 		 184 aa  190  9e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.304474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5040  CheW protein  55.49 
 
 		 184 aa  189  1e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4990  type IV pili signal transduction protein PilI  55.49 
 
 		 184 aa  188  4e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.400912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4864  putative CheW protein  55.49 
 
 		 184 aa  187  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0316337 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3769  putative CheW protein  45.56 
 
 		 181 aa  145  4.0000000000000006e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3632  twitching motility protein PilI  39.2 
 
 		 179 aa  135  3.0000000000000003e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2902  putative CheW protein  37.29 
 
 		 181 aa  123  1e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1816  type IV pili signal transducer  38.82 
 
 		 176 aa  119  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2099  CheW protein  40.82 
 
 		 176 aa  117  9.999999999999999e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0357  CheW protein  32.78 
 
 		 183 aa  108  5e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0717557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2157  putative CheW protein  35.03 
 
 		 179 aa  94.7  6e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0129  CheW-like protein  33.86 
 
 		 178 aa  89  3e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0894  CheW protein  31.25 
 
 		 176 aa  88.2  6e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01604  pilus biogenesis protein  32.2 
 
 		 176 aa  88.2  6e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.329291  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1018  pilus biogenesis protein  31.25 
 
 		 176 aa  88.2  6e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.708664  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3087  CheW protein  30.68 
 
 		 176 aa  75.1  0.0000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.166967 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0516  CheW protein  28.69 
 
 		 171 aa  69.3  0.00000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.1773  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2154  putative CheW protein  29.37 
 
 		 139 aa  68.6  0.00000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1871  CheW protein  30.66 
 
 		 185 aa  65.9  0.0000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.688459 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1773  CheW protein  36.9 
 
 		 161 aa  64.7  0.0000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0284  CheW protein  33.33 
 
 		 158 aa  63.5  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.628672 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  30 
 
 		 183 aa  63.5  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  31.2 
 
 		 163 aa  62.4  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1634  putative CheW protein  33.33 
 
 		 170 aa  62.4  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.443823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0744  CheW protein  30.91 
 
 		 155 aa  61.2  0.000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1259  putative CheW protein  31.37 
 
 		 158 aa  61.2  0.000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0690  purine-binding chemotaxis protein  28.1 
 
 		 466 aa  59.7  0.00000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00466397  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2027  CheW protein  31.43 
 
 		 163 aa  60.1  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1658  purine-binding chemotaxis protein CheW  31.82 
 
 		 165 aa  60.1  0.00000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0193462  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1391  CheW protein  30.23 
 
 		 141 aa  59.3  0.00000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2040  CheW protein  30.39 
 
 		 158 aa  59.3  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0875  CheW protein  30.85 
 
 		 154 aa  59.3  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2236  CheW protein  29.59 
 
 		 478 aa  58.5  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2076  CheW protein  27.45 
 
 		 170 aa  58.9  0.00000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1195  CheW protein  32.61 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0046  CheW protein  33.33 
 
 		 169 aa  58.5  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00918477  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1681  putative CheW protein  33.33 
 
 		 169 aa  58.5  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0157422  hitchhiker  0.0044315 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1450  chemotaxis signal transduction protein  33.33 
 
 		 518 aa  58.5  0.00000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0332  purine-binding chemotaxis protein CheW  32.98 
 
 		 165 aa  58.2  0.00000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0507  CheW protein  30.88 
 
 		 176 aa  57  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.325512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0470  putative CheW protein  28.06 
 
 		 165 aa  57  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.126414  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3073  CheW protein  28.32 
 
 		 136 aa  56.6  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000325581 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2050  putative CheW protein  28.57 
 
 		 154 aa  56.6  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.143061  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1566  putative CheW protein  35.56 
 
 		 169 aa  57  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.173837  normal  0.497426 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  29 
 
 		 162 aa  56.6  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0357  CheW-like protein  26.8 
 
 		 159 aa  56.2  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.269886  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2771  CheW protein  30.61 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0420843  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2676  CheW protein  31.52 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0640816  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1327  CheW protein  28.87 
 
 		 189 aa  55.5  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.893593  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4951  CheW protein  33.64 
 
 		 175 aa  55.5  0.0000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.533301  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1529  CheW protein  32.32 
 
 		 163 aa  55.5  0.0000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1647  CheW protein  29.13 
 
 		 189 aa  55.1  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00542103 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0206  CheW domain protein  33.33 
 
 		 164 aa  55.1  0.0000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00161643  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0792  CheW protein  30.09 
 
 		 164 aa  54.7  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238147 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0218  putative CheW protein  27.37 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4612  CheW protein  31.78 
 
 		 531 aa  54.7  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3023  CheW protein  25 
 
 		 164 aa  54.7  0.0000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3247  CheW protein  28.69 
 
 		 172 aa  54.7  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.529135 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0138  putative CheW protein  27.37 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0706424  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1886  CheW protein  31.87 
 
 		 159 aa  54.7  0.0000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0280  CheW protein  30.43 
 
 		 155 aa  54.3  0.0000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.128089  normal  0.922662 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3106  CheW protein  30.84 
 
 		 165 aa  54.3  0.0000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0297  purine-binding chemotaxis protein CheW  26.36 
 
 		 164 aa  53.9  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1135  CheW protein  29.03 
 
 		 145 aa  53.5  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2175  CheW protein  26.09 
 
 		 166 aa  53.9  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.765903  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2836  CheW protein  27.78 
 
 		 156 aa  54.3  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0103385 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0612  CheW protein  26.85 
 
 		 166 aa  54.3  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.398331 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0468  putative CheW protein  27.78 
 
 		 186 aa  54.3  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0754564  normal  0.870958 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  25 
 
 		 163 aa  53.9  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2575  CheW protein  27.78 
 
 		 156 aa  54.3  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2888  CheW protein  26.89 
 
 		 167 aa  53.1  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2813  CheW protein  27.27 
 
 		 168 aa  53.5  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0491  CheW protein  28.42 
 
 		 154 aa  53.5  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3304  CheW protein  29.41 
 
 		 479 aa  53.5  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.948049 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2285  CheW protein  27.36 
 
 		 141 aa  53.1  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.126917  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2817  CheW protein  28 
 
 		 141 aa  52.8  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4092  chemotaxis protein  28.91 
 
 		 159 aa  53.5  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.410589  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2861  chemotaxis protein  27.78 
 
 		 154 aa  53.1  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.952149  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1368  chemotaxis protein CheW  34.25 
 
 		 172 aa  53.1  0.000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1575  CheW protein  27.84 
 
 		 239 aa  53.5  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0210476  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0299  CheW protein  28.57 
 
 		 155 aa  53.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00727578  normal  0.225748 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2709  putative CheW protein  30.43 
 
 		 154 aa  53.1  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1244  CheW protein  27.97 
 
 		 175 aa  52.8  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.95901  normal  0.252697 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2144  CheW-like protein  32.94 
 
 		 313 aa  53.1  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00213305  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  27.68 
 
 		 163 aa  53.1  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2693  putative CheW protein  26.09 
 
 		 163 aa  53.1  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4076  chemotaxis protein  33.01 
 
 		 155 aa  53.5  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4419  putative CheW protein  27.27 
 
 		 165 aa  53.5  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0211  putative CheW protein  22.38 
 
 		 150 aa  52.8  0.000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1014  putative purine-binding chemotaxis protein CheW  28.87 
 
 		 520 aa  52.8  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2892  putative CheW protein  28.91 
 
 		 159 aa  52.4  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.953703 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1560  putative CheW protein  26.37 
 
 		 146 aa  52.8  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.918027  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1769  CheW protein  28.7 
 
 		 160 aa  52.4  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3245  CheW protein  29.9 
 
 		 528 aa  52.8  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.128469  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>