More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_0799 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0799  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  100 
 
 
266 aa  525  1e-148  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08440  putative short chain alcohol dehydrogenase  92.45 
 
 
266 aa  498  1e-140  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  2.29698e-08 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3938  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  76.95 
 
 
262 aa  407  1e-112  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5106  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  73.18 
 
 
262 aa  382  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.311622  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4572  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  70.88 
 
 
258 aa  369  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0601  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  69.73 
 
 
258 aa  367  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0429  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  64.5 
 
 
260 aa  311  7e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.406504 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0459  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  64.37 
 
 
260 aa  310  1e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.240703 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0462  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  64.37 
 
 
260 aa  310  2e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.767614  hitchhiker  0.00534124 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4774  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.45 
 
 
260 aa  301  8e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.45506 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1572  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.95 
 
 
263 aa  211  1e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.577459 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1378  hypothetical protein  40.86 
 
 
259 aa  207  2e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1382  hypothetical protein  41.25 
 
 
259 aa  206  4e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3911  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42 
 
 
267 aa  196  4e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.322734  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4642  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.19 
 
 
264 aa  190  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79752e-08 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18580  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  39.61 
 
 
258 aa  183  3e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.489964  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1096  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.6 
 
 
256 aa  181  8e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2231  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.65 
 
 
263 aa  181  9e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.19807  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0137  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.54 
 
 
261 aa  181  1e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  7.6045e-07 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3621  short-chain dehydrogenase  40.39 
 
 
258 aa  179  4e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1889  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.5 
 
 
264 aa  179  4e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0188274  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2330  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.45 
 
 
257 aa  179  5e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000620196  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.51 
 
 
271 aa  178  7e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.708878  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1611  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.55 
 
 
262 aa  177  1e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0140  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.15 
 
 
261 aa  178  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3329  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.87 
 
 
256 aa  177  1e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.227726  hitchhiker  0.00265893 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2906  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  36.08 
 
 
257 aa  174  9e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0351  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.43 
 
 
291 aa  174  1e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0353  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.94 
 
 
265 aa  174  1e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.45647  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2585  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.69 
 
 
257 aa  174  1e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6118  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.8 
 
 
275 aa  172  4e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.304156  normal  0.200034 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0344  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase  32.94 
 
 
265 aa  172  6e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2321  dehydrogenase/reductase oxidoreductase protein  39.92 
 
 
275 aa  171  1e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.195083 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1178  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.65 
 
 
259 aa  171  1e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.82399  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1011  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.65 
 
 
258 aa  170  3e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.968961  hitchhiker  0.00922057 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.19 
 
 
271 aa  169  4e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.61951 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3300  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.21 
 
 
272 aa  168  1e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.605078  normal  0.514892 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1836  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.43 
 
 
260 aa  167  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4109  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.55 
 
 
269 aa  167  2e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00421935 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0041  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.35 
 
 
257 aa  166  4e-40  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2864  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.63 
 
 
289 aa  165  6e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.327148 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.75 
 
 
260 aa  163  3e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.756544 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0113  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.24 
 
 
259 aa  162  7e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.886287  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4315  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.3 
 
 
267 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.294207 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1556  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.7 
 
 
261 aa  159  4e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.596662  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0423  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.43 
 
 
259 aa  158  7e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.83571  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3131  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.04 
 
 
258 aa  158  8e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.859893  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2448  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.74 
 
 
257 aa  158  8e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3974  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.86 
 
 
264 aa  158  9e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.036497  normal  0.609933 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1006  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.04 
 
 
257 aa  157  1e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6207  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.55 
 
 
277 aa  157  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4161  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.89 
 
 
267 aa  157  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.209625  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4085  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.89 
 
 
267 aa  157  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5145  putative Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.13 
 
 
267 aa  156  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645114  normal  0.0551529 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.32 
 
 
266 aa  156  3e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1795  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.21 
 
 
264 aa  156  3e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.711928  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1969  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  38.91 
 
 
260 aa  156  3e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4200  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.22 
 
 
271 aa  155  4e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11577  ketoacyl reductase  41.11 
 
 
267 aa  155  5e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0138  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.68 
 
 
273 aa  155  6e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3538  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.41 
 
 
259 aa  155  7e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0177311  normal  0.151964 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0197  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.08 
 
 
262 aa  155  8e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0188  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.08 
 
 
262 aa  155  8e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0177  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.08 
 
 
262 aa  154  1e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.721122 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0523  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.97 
 
 
255 aa  154  1e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0689  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.84 
 
 
259 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2681  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.51 
 
 
261 aa  154  1e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5585  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.85 
 
 
265 aa  154  2e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.892025  normal  0.853623 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0274  short chain dehydrogenase/reductase family protein  38.19 
 
 
259 aa  154  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05256  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.19 
 
 
259 aa  153  3e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2059  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.47 
 
 
260 aa  153  4e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3212  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.89 
 
 
266 aa  152  5e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177624  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5008  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.77 
 
 
298 aa  152  5e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0468951  hitchhiker  0.00252787 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2014  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.11 
 
 
268 aa  152  6e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.700313  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3113  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.51 
 
 
262 aa  152  6e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.999856 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3539  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.35 
 
 
262 aa  151  9e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0684522 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1901  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.99 
 
 
266 aa  151  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1015  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  39.13 
 
 
263 aa  150  2e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1145  short chain dehydrogenase  39.13 
 
 
321 aa  150  2e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1809  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.42 
 
 
263 aa  150  3e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3324  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.5 
 
 
269 aa  150  3e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.377978 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6469  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.68 
 
 
263 aa  149  4e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0477636 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0281  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.77 
 
 
255 aa  149  4e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000634692  hitchhiker  0.00117931 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0055  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.62 
 
 
259 aa  149  5e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1466  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.45 
 
 
253 aa  149  5e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0605466  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4305  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.44 
 
 
281 aa  148  8e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.699263 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3183  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.59 
 
 
260 aa  148  8e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4061  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.44 
 
 
281 aa  148  8e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.786818  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3794  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.87 
 
 
262 aa  148  1e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3912  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.09 
 
 
266 aa  148  1e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4423  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.34 
 
 
276 aa  148  1e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.235547  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12531  short-chain type dehydrogenase/reductase  38.96 
 
 
268 aa  148  1e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00342881 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4202  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.01 
 
 
344 aa  147  1e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1294  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.3 
 
 
266 aa  147  2e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1536  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.73 
 
 
260 aa  147  2e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1706  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.09 
 
 
266 aa  147  2e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.951732  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3849  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.09 
 
 
292 aa  147  2e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.858349  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.18 
 
 
264 aa  146  3e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63890  putative short-chain dehydrogenase  39.45 
 
 
265 aa  146  3e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1539  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.27 
 
 
223 aa  146  3e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.382635  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>