More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_2886 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2886  cytochrome B561  100 
 
 		 177 aa  338  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0147593  normal  0.995623 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2804  cytochrome B561  98.87 
 
 		 177 aa  334  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.850837  normal  0.374097 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2896  cytochrome B561  94.35 
 
 		 177 aa  280  5.000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.950416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2389  cytochrome B561  84.75 
 
 		 177 aa  263  8.999999999999999e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4984  cytochrome B561  59.32 
 
 		 179 aa  185  3e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0448124 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0073  cytochrome b561, putative  55.23 
 
 		 175 aa  174  5e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.475436  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0086  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  54.65 
 
 		 175 aa  173  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0086  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  54.65 
 
 		 175 aa  173  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.083674  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1272  cytochrome B561  60 
 
 		 190 aa  172  1.9999999999999998e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.900483  normal  0.0192884 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0296  cytochrome B561  55.03 
 
 		 174 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000303628  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0259  cytochrome B561  60.59 
 
 		 178 aa  168  4e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0005  cytochrome B561  57.67 
 
 		 177 aa  165  4e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0183044 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3195  cytochrome B561  57.67 
 
 		 176 aa  164  6.9999999999999995e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.0000000000038673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0006  cytochrome B561  55.83 
 
 		 176 aa  159  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000161036  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0030  cytochrome B561  55.83 
 
 		 177 aa  159  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000693928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0062  cytochrome B561  55.83 
 
 		 176 aa  159  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000272347  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0009  cytochrome B561  55.83 
 
 		 176 aa  159  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000000853372  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0014  cytochrome B561  55.21 
 
 		 176 aa  159  3e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02863  cytochrome B561  62.87 
 
 		 177 aa  158  4e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3664  cytochrome B561  59.77 
 
 		 181 aa  155  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000237228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1667  putative type-b cytochrome  61.18 
 
 		 179 aa  151  4e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0500145 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1538  cytochrome B561  50.3 
 
 		 191 aa  143  1e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.757647 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3174  cytochrome B561  51.96 
 
 		 188 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0189588 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4986  cytochrome B561  51.96 
 
 		 188 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4644  cytochrome B561  52.41 
 
 		 178 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3459  putative cytochrome B561  48.81 
 
 		 177 aa  122  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.422444 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6723  cytochrome B561  50 
 
 		 180 aa  122  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0175  cytochrome B561  58.9 
 
 		 188 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.276444  normal  0.139015 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0231  cytochrome B561  57.67 
 
 		 188 aa  119  3e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.827972  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5485  cytochrome B561  45.88 
 
 		 177 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4409  cytochrome B561  53.85 
 
 		 200 aa  100  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.57191  normal  0.183403 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2358  cytochrome B561  39.66 
 
 		 178 aa  97.1  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.289419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4169  cytochrome B561  41.67 
 
 		 185 aa  96.3  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0139606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2179  cytochrome B561  36.61 
 
 		 203 aa  95.5  3e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3670  cytochrome B561  41.95 
 
 		 178 aa  95.5  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.380007  normal  0.0318656 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1861  cytochrome B561  42.17 
 
 		 178 aa  95.5  4e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.846018  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0296  cytochrome B561  52.63 
 
 		 174 aa  95.1  4e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.351873  normal  0.703442 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0252  cytochrome B561  37.7 
 
 		 180 aa  95.1  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0173258  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3478  cytochrome B561  38.46 
 
 		 180 aa  92  4e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.579466  hitchhiker  0.000371098 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01688  cytochrome B561  36.09 
 
 		 187 aa  92  4e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.883966  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0302  cytochrome B561  37.29 
 
 		 181 aa  91.7  4e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4185  cytochrome B561  37.71 
 
 		 189 aa  91.7  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1636  hypothetical protein  41.04 
 
 		 184 aa  90.9  8e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0965469  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2023  cytochrome B561  41.86 
 
 		 186 aa  90.9  8e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.971591  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0201  putative cytochrome b-561 protein  35.68 
 
 		 222 aa  90.5  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7083  cytochrome B561  35.14 
 
 		 199 aa  89.7  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.280542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2322  cytochrome B561  38.37 
 
 		 203 aa  89.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2745  putative cytochrome B561  38.33 
 
 		 191 aa  86.3  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.227394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0469  cytochrome B561  37.71 
 
 		 175 aa  85.1  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2963  cytochrome B561  40 
 
 		 193 aa  84.7  6e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1513  cytochrome b561  38.95 
 
 		 181 aa  84.7  7e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.141112 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1934  cytochrome B561  35 
 
 		 190 aa  84.7  7e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.48407  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2553  cytochrome B561  39.02 
 
 		 193 aa  84.7  7e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.885989  normal  0.411403 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0508  cytochrome B561  37.87 
 
 		 191 aa  84.3  8e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6306  cytochrome B561  39.53 
 
 		 191 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0706  cytochrome B561  36.42 
 
 		 186 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.404491  normal  0.794115 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2064  putative cytochrome b-561 membrane protein  37.14 
 
 		 184 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.913396  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1169  cytochrome b561, putative  30.67 
 
 		 173 aa  83.2  0.000000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.840411  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1610  cytochrome B561  34.73 
 
 		 176 aa  83.2  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1521  cytochrome B561  37.71 
 
 		 182 aa  83.2  0.000000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0459  cytochrome B561  37.28 
 
 		 189 aa  83.2  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3997  putative cytochrome b-561 membrane protein  36.42 
 
 		 186 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.50922  normal  0.334764 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0761  cytochrome B561  34.88 
 
 		 204 aa  82.8  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.599963 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5356  putative cytochrome b561  31.21 
 
 		 180 aa  82  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00398289 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5858  cytochrome B561  36.93 
 
 		 184 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3507  cytochrome B561  34.64 
 
 		 185 aa  81.6  0.000000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.563423 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2719  putative cytochrome B-561 transmembrane protein  37.2 
 
 		 195 aa  81.3  0.000000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.12151 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2794  cytochrome B561  38.92 
 
 		 174 aa  81.3  0.000000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5081  cytochrome B561  36 
 
 		 175 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.601961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1049  cytochrome B561  32.64 
 
 		 410 aa  80.5  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.183438  normal  0.102385 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0714  cytochrome B561  35.37 
 
 		 186 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6508  cytochrome B561  36.99 
 
 		 188 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0286753 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0973  cytochrome b561 family protein  28.65 
 
 		 181 aa  79.7  0.00000000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.304775  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0230  cytochrome B561  35.37 
 
 		 186 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249542  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0681  cytochrome B561  35.37 
 
 		 186 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.400799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3202  cytochrome B561  40.12 
 
 		 197 aa  79  0.00000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.30143 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0605  cytochrome B561  35.43 
 
 		 186 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1464  cytochrome B561  32.56 
 
 		 179 aa  78.6  0.00000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1661  cytochrome B561  35.67 
 
 		 179 aa  78.2  0.00000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.142328  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1333  cytochrome B561  38.41 
 
 		 183 aa  77.8  0.00000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.666388  normal  0.933151 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3013  cytochrome B561  37.93 
 
 		 183 aa  77.8  0.00000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00637618 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0833  cytochrome B561  31.43 
 
 		 192 aa  77.4  0.00000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.383328  hitchhiker  0.00227976 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0295  cytochrome b561  37.5 
 
 		 416 aa  77  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0256942  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2711  cytochrome B561  37.36 
 
 		 183 aa  77  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3152  cytochrome B561  37.93 
 
 		 197 aa  77.4  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.159258  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1906  cytochrome b561 family protein  30.36 
 
 		 183 aa  76.3  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0629  cytochrome B561  34.86 
 
 		 186 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2228  cytochrome B561  36.53 
 
 		 197 aa  75.5  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000575966  hitchhiker  0.00851734 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3802  cytochrome B561  34.29 
 
 		 186 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0098  putative cytochrome B561  35.47 
 
 		 191 aa  74.7  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4356  cytochrome B561  40.48 
 
 		 182 aa  74.7  0.0000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1445  hypothetical protein  31.07 
 
 		 182 aa  74.3  0.0000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7129  putative cytochrome b561  36.9 
 
 		 176 aa  73.9  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.815078 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1538  hypothetical protein  31.07 
 
 		 182 aa  73.9  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2465  putative cytochrome b561  38.04 
 
 		 188 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.104825 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2671  cytochrome B561  35.63 
 
 		 186 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3044  cytochrome B561  35.03 
 
 		 190 aa  72.4  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1056  cytochrome B561  33.54 
 
 		 181 aa  72.4  0.000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.52465  normal  0.404456 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1714  cytochrome B561  34.86 
 
 		 182 aa  72  0.000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00452879  normal  0.140891 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1026  cytochrome B561  34.08 
 
 		 188 aa  72.4  0.000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>