More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_55603 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001303  ANIA_10557  ATP-dependent RNA helicase ded1 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P0C2M6]  64.67 
 
 
668 aa  681    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.645505 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07860  ATP-dependent RNA helicase ded1, putative  61.16 
 
 
637 aa  635    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55603  ATP-dependent RNA helicase of DEAD box family  100 
 
 
616 aa  1252    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_2097  predicted protein  52.01 
 
 
552 aa  523  1e-147  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.143499  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_87146  predicted protein  57.52 
 
 
480 aa  484  1e-135  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000232549  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05931  ATP-dependent RNA helicase dbp2 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B0J9]  42.79 
 
 
563 aa  333  7.000000000000001e-90  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0111979  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82821  DEAD box RNA helicase  43.31 
 
 
530 aa  311  2.9999999999999997e-83  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.283146  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1257  DEAD/DEAH box helicase-like protein  45.41 
 
 
460 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.41988 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17862  predicted protein  41.81 
 
 
529 aa  305  1.0000000000000001e-81  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.626563  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_1794  predicted protein  44.47 
 
 
421 aa  304  3.0000000000000004e-81  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00327182 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_1537  predicted protein  42.12 
 
 
394 aa  303  6.000000000000001e-81  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.935265 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01240  p68-like protein, putative  40.24 
 
 
540 aa  301  2e-80  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5283  DEAD/DEAH box helicase-like  43.01 
 
 
622 aa  300  7e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1778  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.19 
 
 
479 aa  297  3e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0808  DEAD/DEAH box helicase domain protein  44.76 
 
 
448 aa  295  1e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.133727 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0485  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.01 
 
 
630 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4980  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  43.01 
 
 
626 aa  295  2e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0420  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.56 
 
 
628 aa  295  2e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2015  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.67 
 
 
493 aa  295  2e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.73004  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4853  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.01 
 
 
627 aa  295  2e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.282261  normal  0.0691248 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5029  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.74 
 
 
626 aa  294  3e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0458  helicase, C-terminal:Type III restriction enzyme, res subunit:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  42.2 
 
 
629 aa  294  4e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5070  ATP-dependent RNA helicase rhlE, putative  42.2 
 
 
629 aa  293  8e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05560  ATP-dependent RNA helicase  37.15 
 
 
639 aa  293  9e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.978664  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03540  ATP-dependent RNA helicase, DEAD box family  41.82 
 
 
557 aa  292  1e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.897279  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2409  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.41 
 
 
493 aa  291  2e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.92601 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0899  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  40.5 
 
 
537 aa  291  3e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0528  putative ATP-dependent RNA helicase  41.56 
 
 
635 aa  291  3e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.358611  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03147  ATP-dependent RNA helicase  40.42 
 
 
460 aa  290  4e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.457785  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3204  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.11 
 
 
559 aa  291  4e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4484  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.36 
 
 
498 aa  290  6e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27227  predicted protein  40.99 
 
 
452 aa  289  9e-77  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.689197 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_36611  predicted protein  40.99 
 
 
452 aa  289  9e-77  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.438813  decreased coverage  0.000242961 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2582  DEAD/DEAH box helicase-like protein  42.25 
 
 
556 aa  289  1e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06483  hypothetical protein  43.33 
 
 
527 aa  287  2.9999999999999996e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1743  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.14 
 
 
479 aa  286  5.999999999999999e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.236928 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3310  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  41.48 
 
 
507 aa  286  5.999999999999999e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0221884 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1646  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.95 
 
 
545 aa  286  7e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7020  ATP-dependent RNA helicase  42.98 
 
 
469 aa  286  9e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.325131  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2657  DEAD/DEAH box helicase-like  41.76 
 
 
510 aa  286  1.0000000000000001e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1258  DEAD/DEAH box helicase-like protein  42.9 
 
 
456 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.410672 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0480  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.53 
 
 
471 aa  285  2.0000000000000002e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2723  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.15 
 
 
480 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0181544  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000619  ATP-dependent RNA helicase RhlE  43.06 
 
 
522 aa  284  4.0000000000000003e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2595  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.15 
 
 
479 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.381467  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7234  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.2 
 
 
506 aa  283  5.000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.499446  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3519  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.8 
 
 
436 aa  283  7.000000000000001e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0430  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.36 
 
 
454 aa  283  8.000000000000001e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.208353  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2082  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.8 
 
 
482 aa  282  1e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.162291 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2211  ATP-dependent RNA helicase protein  41.93 
 
 
495 aa  282  1e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1028  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.38 
 
 
441 aa  282  1e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0361604  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3497  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.09 
 
 
511 aa  282  2e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01266  Pre-mRNA-processing ATP-dependent RNA helicase prp5 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BDW4]  38.99 
 
 
1173 aa  282  2e-74  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.505248  normal  0.0523257 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0933  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.36 
 
 
479 aa  281  2e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.461598  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2896  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.9 
 
 
567 aa  281  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.581814 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1641  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.49 
 
 
439 aa  281  2e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00551625  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0631  putative ATP-dependent RNA helicase 2  40.48 
 
 
494 aa  281  3e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.640854  normal  0.233669 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3164  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.11 
 
 
580 aa  281  3e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.536296  normal  0.424534 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2639  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.13 
 
 
525 aa  281  4e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.147285  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0145  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.47 
 
 
446 aa  280  4e-74  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5998  DEAD/DEAH box helicase  40.51 
 
 
484 aa  280  5e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.123523 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3137  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.66 
 
 
423 aa  280  5e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.417065  normal  0.231067 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0370  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.25 
 
 
453 aa  280  6e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000976473  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0681  ATP-dependent RNA helicase  37.88 
 
 
420 aa  280  6e-74  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.365485  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01650  conserved hypothetical protein  36.87 
 
 
615 aa  280  7e-74  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2699  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.62 
 
 
486 aa  280  7e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.411563  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2059  DEAD/DEAH box helicase-like  40.62 
 
 
486 aa  280  7e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.311638  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2670  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.62 
 
 
486 aa  280  7e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0617  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.48 
 
 
479 aa  280  8e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.028654 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10782  predicted protein  41.55 
 
 
417 aa  279  8e-74  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0786  putative ATP-dependent RNA helicase rhlE  37.88 
 
 
411 aa  279  9e-74  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.456558  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2355  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.28 
 
 
497 aa  279  9e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.651471  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0968  ATP-dependent RNA helicase RhlE  40.62 
 
 
453 aa  279  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3851  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.71 
 
 
513 aa  279  1e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00282331 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0883  ATP-dependent RNA helicase RhlE  40.62 
 
 
453 aa  278  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.809863  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1024  ATP-dependent RNA helicase RhlE  42.66 
 
 
451 aa  278  1e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2715  putative ATP-dependent RNA helicase  44 
 
 
434 aa  279  1e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.511993  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0947  ATP-dependent RNA helicase RhlE  40.62 
 
 
453 aa  278  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.283527  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2746  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.83 
 
 
678 aa  278  2e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.633229  normal  0.123801 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0915  ATP-dependent RNA helicase RhlE  40.62 
 
 
453 aa  278  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4573  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.37 
 
 
415 aa  278  2e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0245  DEAD/DEAH box helicase-like protein  39.95 
 
 
463 aa  278  2e-73  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0283018  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0855  ATP-dependent RNA helicase RhlE  40.62 
 
 
453 aa  278  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1974  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.16 
 
 
438 aa  278  2e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000565888  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0015  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.26 
 
 
423 aa  278  3e-73  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0198  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.95 
 
 
418 aa  277  3e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0648  putative ATP-dependent RNA helicase 1  40.51 
 
 
543 aa  278  3e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.498001 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5812  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.83 
 
 
492 aa  277  3e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.441599  hitchhiker  0.00900105 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6484  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.95 
 
 
499 aa  278  3e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685816  normal  0.838885 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1351  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.54 
 
 
452 aa  277  3e-73  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00281492  normal  0.0306725 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_47095  predicted protein  41.54 
 
 
413 aa  277  3e-73  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0903334  normal  0.0377209 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0163  ATP-dependent RNA helicase  39.23 
 
 
446 aa  277  4e-73  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2450  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.02 
 
 
508 aa  277  4e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0131519  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0607  ATP-dependent RNA helicase RhlE  40.62 
 
 
482 aa  277  4e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0604  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.76 
 
 
491 aa  277  4e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.631555 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2535  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.85 
 
 
436 aa  277  4e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1342  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.04 
 
 
426 aa  276  5e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2155  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.96 
 
 
504 aa  277  5e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.659506  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3362  ATP-dependent RNA helicase  41.42 
 
 
484 aa  276  5e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0735  putative ATP-dependent RNA helicase rhlE  39.95 
 
 
485 aa  276  6e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>