More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_24792 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_24792  predicted protein  100 
 
 
513 aa  1068    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.379342  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42734  predicted protein  53.81 
 
 
437 aa  405  1e-111  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0479124 
 
 
-
 
NC_002620  TC0465  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.98 
 
 
372 aa  355  1e-96  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0735  queuine tRNA-ribosyltransferase  42.22 
 
 
404 aa  319  7.999999999999999e-86  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0662532  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0445  queuine tRNA-ribosyltransferase  39.95 
 
 
396 aa  311  2e-83  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.42206  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0577  queuine/other tRNA- ribosyl transferase  39.7 
 
 
396 aa  306  5.0000000000000004e-82  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0321694  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1302  queuine tRNA-ribosyltransferase  40.8 
 
 
400 aa  298  1e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1658  queuine tRNA-ribosyltransferase  40.74 
 
 
405 aa  294  3e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00193813 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3728  queuine tRNA-ribosyltransferase  37.72 
 
 
403 aa  288  1e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00382778 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12290  queuine tRNA-ribosyltransferase  36.99 
 
 
373 aa  281  2e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000356741  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3622  queuine tRNA-ribosyltransferase  38.36 
 
 
372 aa  280  6e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00110996  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0958  queuine tRNA-ribosyltransferase  36.99 
 
 
374 aa  276  8e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0452051  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0930  queuine tRNA-ribosyltransferase  37.6 
 
 
380 aa  276  9e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2518  queuine tRNA-ribosyltransferase  36.83 
 
 
380 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00624233  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3134  queuine tRNA-ribosyltransferase  36.06 
 
 
379 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.212476  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0016  queuine tRNA-ribosyltransferase  38.73 
 
 
402 aa  273  6e-72  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0530  queuine tRNA-ribosyltransferase  36.67 
 
 
373 aa  273  6e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00176978  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4502  queuine tRNA-ribosyltransferase  36.06 
 
 
379 aa  271  1e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000575969  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4312  queuine tRNA-ribosyltransferase  36.06 
 
 
379 aa  271  1e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000048864  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4150  queuine tRNA-ribosyltransferase  36.06 
 
 
379 aa  271  1e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000148017  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4161  queuine tRNA-ribosyltransferase  36.06 
 
 
379 aa  271  1e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000310592  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4536  queuine tRNA-ribosyltransferase  36.06 
 
 
379 aa  272  1e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000578318  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4647  queuine tRNA-ribosyltransferase  36.06 
 
 
379 aa  271  1e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000256565  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0699  queuine tRNA-ribosyltransferase  36.06 
 
 
379 aa  272  1e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000227158  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4497  queuine tRNA-ribosyltransferase  36.06 
 
 
379 aa  271  1e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000628432 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4551  queuine tRNA-ribosyltransferase  36.06 
 
 
379 aa  271  1e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000170513  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1259  queuine tRNA-ribosyltransferase  38.05 
 
 
379 aa  271  2e-71  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.527316  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1203  queuine tRNA-ribosyltransferase  36.92 
 
 
379 aa  271  2e-71  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.261953  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1120  queuine tRNA-ribosyltransferase  37.34 
 
 
369 aa  271  2e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0231453  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4264  queuine tRNA-ribosyltransferase  35.81 
 
 
379 aa  271  2.9999999999999997e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000851523  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0382  queuine tRNA-ribosyltransferase  36.8 
 
 
357 aa  270  4e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1666  queuine tRNA-ribosyltransferase  37.2 
 
 
370 aa  270  5e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.098612  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0159  queuine tRNA-ribosyltransferase  35.55 
 
 
382 aa  270  5e-71  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.95405  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0931  queuine tRNA-ribosyltransferase  37.56 
 
 
394 aa  270  5.9999999999999995e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0455  queuine tRNA-ribosyltransferase  36.99 
 
 
384 aa  269  8.999999999999999e-71  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1785  queuine tRNA-ribosyltransferase  35.7 
 
 
380 aa  269  1e-70  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0229472  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1457  queuine tRNA-ribosyltransferase  36.32 
 
 
375 aa  269  1e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000844701  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0396  queuine tRNA-ribosyltransferase  35.55 
 
 
380 aa  268  2e-70  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000954967  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1791  queuine tRNA-ribosyltransferase  37.18 
 
 
370 aa  268  2e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000378979  hitchhiker  0.00274251 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1428  queuine tRNA-ribosyltransferase  37.79 
 
 
677 aa  266  5e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0632  queuine tRNA-ribosyltransferase  36.92 
 
 
392 aa  266  8e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2432  queuine tRNA-ribosyltransferase  38.01 
 
 
678 aa  266  8e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.974463  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1694  queuine tRNA-ribosyltransferase  36.43 
 
 
373 aa  266  8e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.556038 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0605  queuine tRNA-ribosyltransferase  36.46 
 
 
395 aa  265  1e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1330  queuine tRNA-ribosyltransferase  37.34 
 
 
365 aa  265  2e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.442991  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2109  queuine tRNA-ribosyltransferase  36.32 
 
 
379 aa  264  2e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0129  queuine tRNA-ribosyltransferase  36.87 
 
 
404 aa  265  2e-69  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1175  queuine tRNA-ribosyltransferase  37.37 
 
 
368 aa  264  3e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0539668  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3755  queuine tRNA-ribosyltransferase  37.15 
 
 
387 aa  264  3e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.145582 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2519  queuine tRNA-ribosyltransferase  38.01 
 
 
679 aa  264  3e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0560  queuine tRNA-ribosyltransferase  39.58 
 
 
424 aa  264  3e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0919  queuine tRNA-ribosyltransferase  37.24 
 
 
381 aa  262  8.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1729  queuine tRNA-ribosyltransferase  36.41 
 
 
379 aa  260  3e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.37523  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3258  queuine tRNA-ribosyltransferase  36.6 
 
 
368 aa  261  3e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000643926  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1696  queuine tRNA-ribosyltransferase  36.41 
 
 
379 aa  260  3e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1228  queuine tRNA-ribosyltransferase  36.5 
 
 
369 aa  261  3e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000114064  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2795  queuine tRNA-ribosyltransferase  36.73 
 
 
366 aa  259  8e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1716  queuine tRNA-ribosyltransferase  35.9 
 
 
371 aa  259  9e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.2965  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5036  queuine tRNA-ribosyltransferase  38.46 
 
 
410 aa  258  1e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.142183  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5329  queuine tRNA-ribosyltransferase  38.46 
 
 
410 aa  258  1e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.380877  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4948  queuine tRNA-ribosyltransferase  38.46 
 
 
410 aa  258  1e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.20255  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3335  queuine tRNA-ribosyltransferase  39.02 
 
 
368 aa  258  2e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00131766  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1228  queuine tRNA-ribosyltransferase  39.39 
 
 
402 aa  258  2e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.486752  normal  0.331498 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3227  queuine tRNA-ribosyltransferase  36.48 
 
 
375 aa  257  3e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.956515 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3305  queuine tRNA-ribosyltransferase  36.48 
 
 
366 aa  257  4e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.423867 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0911  queuine tRNA-ribosyltransferase  38.76 
 
 
368 aa  257  5e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.8642e-32 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1428  queuine tRNA-ribosyltransferase  38.05 
 
 
369 aa  256  8e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00175971  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0049  queuine tRNA-ribosyltransferase  36.41 
 
 
392 aa  256  9e-67  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0707792  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0907  queuine tRNA-ribosyltransferase  35.88 
 
 
372 aa  255  1.0000000000000001e-66  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2476  queuine tRNA-ribosyltransferase  36.96 
 
 
383 aa  255  1.0000000000000001e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1275  queuine tRNA-ribosyltransferase  39.11 
 
 
336 aa  255  1.0000000000000001e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1359  queuine tRNA-ribosyltransferase  35.11 
 
 
372 aa  255  1.0000000000000001e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000569759  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1800  queuine tRNA-ribosyltransferase  36.15 
 
 
374 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2398  queuine tRNA-ribosyltransferase  36.25 
 
 
368 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000165402  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03090  queuine tRNA-ribosyltransferase  36.59 
 
 
441 aa  254  2.0000000000000002e-66  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.576454  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0770  queuine tRNA-ribosyltransferase  36.32 
 
 
376 aa  254  3e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.196276 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0376  queuine/archaeosine tRNA-ribosyltransferase  34.95 
 
 
406 aa  253  4.0000000000000004e-66  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0401753  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0330  queuine tRNA-ribosyltransferase  36.29 
 
 
388 aa  253  5.000000000000001e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00349082 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2011  queuine tRNA-ribosyltransferase  37.15 
 
 
380 aa  253  6e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.638578  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26670  tRNA-guanine transglycosylase  36.56 
 
 
427 aa  252  9.000000000000001e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2997  queuine tRNA-ribosyltransferase  35.62 
 
 
384 aa  252  1e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.804004  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2402  queuine tRNA-ribosyltransferase  36.79 
 
 
726 aa  251  2e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0052  queuine tRNA-ribosyltransferase  35.48 
 
 
392 aa  251  2e-65  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0505  queuine tRNA-ribosyltransferase  35.2 
 
 
394 aa  251  2e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1114  queuine tRNA-ribosyltransferase  36.43 
 
 
373 aa  251  3e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.34463  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4524  queuine tRNA-ribosyltransferase  34.95 
 
 
408 aa  250  4e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_52  queuine tRNA-ribosyltransferase  35.73 
 
 
392 aa  249  7e-65  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000223938  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0727  queuine tRNA-ribosyltransferase  36.74 
 
 
434 aa  249  7e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5580  queuine tRNA-ribosyltransferase  36.93 
 
 
401 aa  249  1e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1343  tRNA-guanine transglycosylase  35.37 
 
 
441 aa  248  1e-64  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.161378 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1347  queuine tRNA-ribosyltransferase  35.81 
 
 
372 aa  249  1e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0144  queuine tRNA-ribosyltransferase  35.91 
 
 
384 aa  248  1e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0518824  decreased coverage  0.000581764 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1782  queuine tRNA-ribosyltransferase  35.66 
 
 
372 aa  248  2e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00114635 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2435  queuine tRNA-ribosyltransferase  35.66 
 
 
372 aa  248  2e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1927  queuine tRNA-ribosyltransferase  36.52 
 
 
383 aa  247  3e-64  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000713351  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2346  queuine tRNA-ribosyltransferase  35.31 
 
 
376 aa  246  4.9999999999999997e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.395355  normal  0.213508 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1606  queuine tRNA-ribosyltransferase  34.02 
 
 
388 aa  247  4.9999999999999997e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.894963  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2456  queuine tRNA-ribosyltransferase  36.22 
 
 
367 aa  247  4.9999999999999997e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.359127  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1354  Queuine/archaeosine tRNA-ribosyltransferase  36.05 
 
 
437 aa  246  6e-64  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1759  queuine tRNA-ribosyltransferase  35.61 
 
 
377 aa  246  6e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>