More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0465 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002620  TC0465  queuine tRNA-ribosyltransferase  100 
 
 
372 aa  775    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24792  predicted protein  48.98 
 
 
513 aa  356  3.9999999999999996e-97  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.379342  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0445  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.16 
 
 
396 aa  330  2e-89  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.42206  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42734  predicted protein  43.75 
 
 
437 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0479124 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0577  queuine/other tRNA- ribosyl transferase  42.82 
 
 
396 aa  318  1e-85  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0321694  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0735  queuine tRNA-ribosyltransferase  42.78 
 
 
404 aa  317  3e-85  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0662532  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1302  queuine tRNA-ribosyltransferase  42.13 
 
 
400 aa  314  9.999999999999999e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1658  queuine tRNA-ribosyltransferase  42.28 
 
 
405 aa  306  5.0000000000000004e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00193813 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3728  queuine tRNA-ribosyltransferase  39.53 
 
 
403 aa  283  3.0000000000000004e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00382778 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4524  queuine tRNA-ribosyltransferase  39.23 
 
 
408 aa  278  1e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0958  queuine tRNA-ribosyltransferase  38.83 
 
 
374 aa  278  2e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0452051  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0016  queuine tRNA-ribosyltransferase  40.36 
 
 
402 aa  274  2.0000000000000002e-72  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12290  queuine tRNA-ribosyltransferase  37.67 
 
 
373 aa  271  1e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000356741  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0129  queuine tRNA-ribosyltransferase  39.43 
 
 
404 aa  271  2e-71  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1457  queuine tRNA-ribosyltransferase  37.5 
 
 
375 aa  270  4e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000844701  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0382  queuine tRNA-ribosyltransferase  38.16 
 
 
357 aa  269  7e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1606  queuine tRNA-ribosyltransferase  36.9 
 
 
388 aa  266  5e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.894963  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3134  queuine tRNA-ribosyltransferase  37.23 
 
 
379 aa  265  1e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.212476  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1729  queuine tRNA-ribosyltransferase  38.3 
 
 
379 aa  264  2e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.37523  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1696  queuine tRNA-ribosyltransferase  38.3 
 
 
379 aa  264  2e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1330  queuine tRNA-ribosyltransferase  39.39 
 
 
365 aa  264  2e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.442991  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3335  queuine tRNA-ribosyltransferase  38.86 
 
 
368 aa  263  3e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00131766  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0911  queuine tRNA-ribosyltransferase  38.59 
 
 
368 aa  263  4.999999999999999e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.8642e-32 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2518  queuine tRNA-ribosyltransferase  37.33 
 
 
380 aa  262  6e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00624233  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1791  queuine tRNA-ribosyltransferase  37.4 
 
 
370 aa  262  8e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000378979  hitchhiker  0.00274251 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0159  queuine tRNA-ribosyltransferase  37.23 
 
 
382 aa  262  8e-69  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.95405  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2011  queuine tRNA-ribosyltransferase  38.2 
 
 
380 aa  261  2e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.638578  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4264  queuine tRNA-ribosyltransferase  36.97 
 
 
379 aa  261  2e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000851523  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3622  queuine tRNA-ribosyltransferase  37.67 
 
 
372 aa  260  3e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00110996  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1716  queuine tRNA-ribosyltransferase  38.3 
 
 
371 aa  259  4e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.2965  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4551  queuine tRNA-ribosyltransferase  36.7 
 
 
379 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000170513  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4502  queuine tRNA-ribosyltransferase  36.7 
 
 
379 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000575969  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4312  queuine tRNA-ribosyltransferase  36.7 
 
 
379 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000048864  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4150  queuine tRNA-ribosyltransferase  36.7 
 
 
379 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000148017  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4161  queuine tRNA-ribosyltransferase  36.7 
 
 
379 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000310592  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4647  queuine tRNA-ribosyltransferase  36.7 
 
 
379 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000256565  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4497  queuine tRNA-ribosyltransferase  36.7 
 
 
379 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000628432 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1259  queuine tRNA-ribosyltransferase  37.87 
 
 
379 aa  258  8e-68  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.527316  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0699  queuine tRNA-ribosyltransferase  36.44 
 
 
379 aa  258  1e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000227158  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4536  queuine tRNA-ribosyltransferase  36.44 
 
 
379 aa  258  1e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000578318  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1203  queuine tRNA-ribosyltransferase  37.5 
 
 
379 aa  257  2e-67  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.261953  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0930  queuine tRNA-ribosyltransferase  36.8 
 
 
380 aa  257  2e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0565  queuine tRNA-ribosyltransferase  37.77 
 
 
373 aa  257  2e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.005662  normal  0.744875 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0605  queuine tRNA-ribosyltransferase  36.99 
 
 
395 aa  257  3e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1305  queuine tRNA-ribosyltransferase  37.27 
 
 
371 aa  256  4e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0191  queuine tRNA-ribosyltransferase  37.67 
 
 
384 aa  256  5e-67  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3258  queuine tRNA-ribosyltransferase  35.47 
 
 
368 aa  256  6e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000643926  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0907  queuine tRNA-ribosyltransferase  36.94 
 
 
372 aa  255  9e-67  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2109  queuine tRNA-ribosyltransferase  37.07 
 
 
379 aa  255  1.0000000000000001e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1699  queuine tRNA-ribosyltransferase  36.17 
 
 
382 aa  254  1.0000000000000001e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1615  queuine tRNA-ribosyltransferase  36.31 
 
 
376 aa  254  2.0000000000000002e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.214462  normal  0.361776 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3361  queuine tRNA-ribosyltransferase  38.46 
 
 
472 aa  253  3e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0872044  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3328  queuine tRNA-ribosyltransferase  38.36 
 
 
397 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.162119  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2398  queuine tRNA-ribosyltransferase  35.68 
 
 
368 aa  253  5.000000000000001e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000165402  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1165  queuine tRNA-ribosyltransferase  38.36 
 
 
397 aa  252  7e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.179436  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2387  queuine tRNA-ribosyltransferase  38.36 
 
 
397 aa  252  7e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2573  queuine tRNA-ribosyltransferase  38.36 
 
 
397 aa  252  7e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0303  queuine tRNA-ribosyltransferase  38.36 
 
 
397 aa  252  7e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0396  queuine tRNA-ribosyltransferase  35.47 
 
 
380 aa  251  1e-65  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000954967  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1175  queuine tRNA-ribosyltransferase  34.93 
 
 
368 aa  251  2e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0539668  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1347  queuine tRNA-ribosyltransferase  37.84 
 
 
372 aa  250  2e-65  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0167  queuine tRNA-ribosyltransferase  37.13 
 
 
377 aa  250  2e-65  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1428  queuine tRNA-ribosyltransferase  36.49 
 
 
369 aa  251  2e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00175971  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0901  queuine tRNA-ribosyltransferase  37.14 
 
 
373 aa  250  3e-65  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000294135  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3371  queuine tRNA-ribosyltransferase  38.1 
 
 
397 aa  250  3e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1927  queuine tRNA-ribosyltransferase  37.67 
 
 
383 aa  250  3e-65  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000713351  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1278  queuine tRNA-ribosyltransferase  38.1 
 
 
394 aa  250  3e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1800  queuine tRNA-ribosyltransferase  37.27 
 
 
374 aa  250  3e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0218  queuine tRNA-ribosyltransferase  36.59 
 
 
376 aa  250  4e-65  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.989201  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1120  queuine tRNA-ribosyltransferase  37.37 
 
 
369 aa  249  6e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0231453  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2017  queuine tRNA-ribosyltransferase  35.2 
 
 
380 aa  249  7e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000528319  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0530  queuine tRNA-ribosyltransferase  35.37 
 
 
373 aa  248  1e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00176978  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1785  queuine tRNA-ribosyltransferase  35.73 
 
 
380 aa  248  1e-64  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0229472  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2435  queuine tRNA-ribosyltransferase  37.2 
 
 
372 aa  247  2e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0931  queuine tRNA-ribosyltransferase  36.19 
 
 
394 aa  247  2e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0144  queuine tRNA-ribosyltransferase  34.9 
 
 
384 aa  248  2e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0518824  decreased coverage  0.000581764 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1228  queuine tRNA-ribosyltransferase  35.73 
 
 
370 aa  247  2e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2619  queuine tRNA-ribosyltransferase  36.7 
 
 
373 aa  247  3e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3278  queuine tRNA-ribosyltransferase  37.57 
 
 
369 aa  247  3e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.275264  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1307  queuine tRNA-ribosyltransferase  37.7 
 
 
387 aa  246  3e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.99285  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0637  queuine tRNA-ribosyltransferase  38.36 
 
 
395 aa  246  4e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00525  queuine tRNA-ribosyltransferase  36.04 
 
 
381 aa  246  6e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1637  queuine tRNA-ribosyltransferase  35.87 
 
 
376 aa  246  6.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2432  queuine tRNA-ribosyltransferase  36.29 
 
 
678 aa  245  6.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.974463  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2844  queuine tRNA-ribosyltransferase  37.37 
 
 
377 aa  245  9e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1495  queuine tRNA-ribosyltransferase  36.07 
 
 
376 aa  245  9e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.474706 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1694  queuine tRNA-ribosyltransferase  34.84 
 
 
373 aa  245  9e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.556038 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2664  queuine tRNA-ribosyltransferase  38.1 
 
 
399 aa  245  9e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.241217 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1215  queuine tRNA-ribosyltransferase  36.6 
 
 
385 aa  245  9e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.557932 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0690  queuine tRNA-ribosyltransferase  38.1 
 
 
395 aa  245  9e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.265074  normal  0.561084 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0722  queuine tRNA-ribosyltransferase  38.1 
 
 
395 aa  245  9e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1894  queuine tRNA-ribosyltransferase  36.9 
 
 
355 aa  245  9.999999999999999e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.3829100000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1782  queuine tRNA-ribosyltransferase  37.2 
 
 
372 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00114635 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1891  queuine tRNA-ribosyltransferase  36.02 
 
 
380 aa  244  9.999999999999999e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.186331  normal  0.7494 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0238  queuine tRNA-ribosyltransferase  38.1 
 
 
447 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3227  queuine tRNA-ribosyltransferase  35.28 
 
 
375 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.956515 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2075  queuine tRNA-ribosyltransferase  35.95 
 
 
367 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.698983  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1912  queuine tRNA-ribosyltransferase  36.15 
 
 
380 aa  244  1.9999999999999999e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.288264  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1321  queuine tRNA-ribosyltransferase  37.04 
 
 
391 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2484  queuine tRNA-ribosyltransferase  34.93 
 
 
373 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000370638  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>