More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_14096 on replicon NC_011681
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011681  PHATRDRAFT_14096  predicted protein  100 
 
 
78 aa  158  2e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.830543  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2914  thioredoxin  42.5 
 
 
285 aa  76.3  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5839  thioredoxin  41.56 
 
 
109 aa  75.1  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2793  thioredoxin  41.03 
 
 
107 aa  75.1  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.526009  normal  0.619101 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4442  thioredoxin  39.74 
 
 
119 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.553221 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4956  thioredoxin  38.46 
 
 
106 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.183907 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4906  thioredoxin  39.74 
 
 
106 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.803641  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0139  thioredoxin  43.59 
 
 
106 aa  74.7  0.0000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0639  thioredoxin  41.56 
 
 
108 aa  74.3  0.0000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1199  thioredoxin  39.74 
 
 
107 aa  73.9  0.0000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0000534537  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2636  thioredoxin  46.15 
 
 
280 aa  73.9  0.0000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2847  thioredoxin  41.03 
 
 
106 aa  73.6  0.0000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.300873 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1430  thioredoxin  44.74 
 
 
140 aa  73.6  0.0000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000656365 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3919  thioredoxin  37.18 
 
 
103 aa  73.6  0.0000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.566246  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2469  thioredoxin  49.28 
 
 
289 aa  73.6  0.0000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.744001  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2848  thioredoxin, putative  49.28 
 
 
289 aa  73.6  0.0000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.126765  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1989  thioredoxin  39.74 
 
 
108 aa  72.8  0.000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.154515  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3583  thioredoxin  43.59 
 
 
149 aa  73.2  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.029416  normal  0.0374075 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0473  thioredoxin  38.46 
 
 
107 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.319728  normal  0.0128632 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4067  thioredoxin  41.03 
 
 
106 aa  72.8  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.153402 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2292  thioredoxin  39.74 
 
 
120 aa  72.8  0.000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.345169  normal  0.308955 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23390  thioredoxin  39.74 
 
 
107 aa  72.8  0.000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1344  thioredoxin  39.74 
 
 
107 aa  73.6  0.000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00788637  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1625  thioredoxin  38.46 
 
 
107 aa  73.6  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2950  thioredoxin  42.31 
 
 
106 aa  72.4  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.184197  normal  0.155868 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4561  thioredoxin  44.62 
 
 
302 aa  72.4  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.712523  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  37.18 
 
 
107 aa  72.4  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1307  thioredoxin  38.96 
 
 
108 aa  72  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4105  thioredoxin  37.18 
 
 
109 aa  71.6  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.031473  normal  0.0324646 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2176  thioredoxin  39.74 
 
 
106 aa  71.6  0.000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.275071 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1456  thioredoxin  41.03 
 
 
108 aa  72  0.000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.724668  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2263  thioredoxin  37.18 
 
 
110 aa  71.6  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0816  thioredoxin  37.66 
 
 
107 aa  71.6  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2938  thioredoxin  44.62 
 
 
315 aa  72  0.000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3675  thioredoxin  40.26 
 
 
109 aa  71.6  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.852228 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3219  thioredoxin  43.75 
 
 
282 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0779  putative thioredoxin protein  42.5 
 
 
280 aa  71.6  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.297357  decreased coverage  0.00262303 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1625  thioredoxin  33.33 
 
 
108 aa  71.6  0.000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000550867  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2898  thioredoxin  37.18 
 
 
133 aa  71.6  0.000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.34978  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2105  thioredoxin  37.66 
 
 
107 aa  70.9  0.000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0422234  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2021  thioredoxin  37.66 
 
 
107 aa  70.9  0.000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000945216  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3331  thioredoxin  40 
 
 
287 aa  70.9  0.000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.108459  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0198  thioredoxin  46.15 
 
 
326 aa  70.9  0.000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0743  thioredoxin  43.75 
 
 
282 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.328705  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1925  Thioredoxin domain-containing protein  41.25 
 
 
299 aa  70.9  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0265  thioredoxin  45.31 
 
 
110 aa  70.9  0.000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.28448  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2527  thioredoxin  44.62 
 
 
293 aa  70.5  0.000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0179199 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1529  thioredoxin  41.03 
 
 
106 aa  70.5  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.643867  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0179  thioredoxin  41.03 
 
 
106 aa  70.5  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.292519  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3294  thioredoxin  37.18 
 
 
109 aa  70.5  0.000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00620964  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0516  thioredoxin  45.31 
 
 
282 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.695523 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2894  thioredoxin  43.08 
 
 
304 aa  70.5  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.225286  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0139  thioredoxin  43.08 
 
 
304 aa  70.5  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.115095  normal  0.47686 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2195  thioredoxin  37.18 
 
 
110 aa  70.1  0.000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.173373  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3500  thioredoxin  37.18 
 
 
107 aa  70.5  0.000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0796  thioredoxin  40 
 
 
281 aa  70.5  0.000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0505807  normal  0.147714 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1038  thioredoxin  47.06 
 
 
277 aa  70.5  0.000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0373  thioredoxin  35.9 
 
 
105 aa  70.1  0.000000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0377  thioredoxin  41.33 
 
 
145 aa  70.1  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.655114  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0726  thioredoxin  40 
 
 
281 aa  70.1  0.000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0681266  normal  0.772091 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2590  thioredoxin  38.75 
 
 
282 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.282691  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3378  thioredoxin  37.18 
 
 
107 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal  0.553993 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3849  thioredoxin  35.9 
 
 
108 aa  69.3  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0867  thioredoxin  37.18 
 
 
105 aa  69.7  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.800963  hitchhiker  0.0030343 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0475  thioredoxin  37.18 
 
 
108 aa  69.7  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0156  thioredoxin  39.74 
 
 
106 aa  70.1  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.534304 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1955  thioredoxin  38.75 
 
 
282 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.180401  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2566  thioredoxin  38.75 
 
 
282 aa  69.3  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0730  thioredoxin  40 
 
 
282 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1374  thioredoxin  40 
 
 
286 aa  69.3  0.00000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.187591  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1307  thioredoxin  40 
 
 
286 aa  68.9  0.00000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.334323  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  35.9 
 
 
107 aa  68.9  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1489  thioredoxin domain-containing protein  43.08 
 
 
304 aa  68.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.481302  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01872  thioredoxin  45.31 
 
 
285 aa  68.9  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0053  thioredoxin  38.46 
 
 
146 aa  69.3  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000803765  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3439  thioredoxin  37.18 
 
 
106 aa  69.3  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3584  thioredoxin  37.18 
 
 
108 aa  69.3  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0328783  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5905  thioredoxin  41.43 
 
 
144 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4174  thioredoxin  37.18 
 
 
107 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0456  thioredoxin  36 
 
 
165 aa  68.9  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4155  thioredoxin  33.33 
 
 
107 aa  68.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.853934 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4761  thioredoxin  35.9 
 
 
110 aa  68.6  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0308723  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0888  thioredoxin  39.13 
 
 
141 aa  68.6  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.747507  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0500  thioredoxin  41.43 
 
 
144 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.874633 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2485  thioredoxin  38.75 
 
 
282 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.194267 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4115  thioredoxin  33.33 
 
 
107 aa  68.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26950  thioredoxin  40.26 
 
 
108 aa  68.6  0.00000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.766392  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1323  thioredoxin  35.9 
 
 
107 aa  68.2  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.131811  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0621  thioredoxin  35.9 
 
 
108 aa  68.6  0.00000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000184635  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1818  thioredoxin  43.08 
 
 
293 aa  68.2  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0314014 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0694  thioredoxin  45.16 
 
 
106 aa  68.6  0.00000000003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.690768  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0519  thioredoxin  46.88 
 
 
280 aa  68.2  0.00000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1063  thioredoxin  38.75 
 
 
918 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.460797  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0993  thioredoxin  41.54 
 
 
318 aa  68.2  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.766287 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  35.9 
 
 
124 aa  68.2  0.00000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0422  thioredoxin-related  43.75 
 
 
306 aa  68.2  0.00000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1305  thioredoxin  38.75 
 
 
235 aa  67.8  0.00000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.277929  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4231  thioredoxin  34.62 
 
 
107 aa  68.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000465688 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3931  thioredoxin  40 
 
 
302 aa  68.2  0.00000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2614  thioredoxin  38.75 
 
 
282 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>