More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_13682 on replicon NC_011680
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011680  PHATRDRAFT_13682  predicted protein  100 
 
 		 220 aa  456  1e-127  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03172  40S ribosomal protein S0 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B8F8]  62.04 
 
 		 293 aa  299  2e-80  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.51633 
 
 
-
 
NC_006694  CNI04340  40S ribosomal protein S0, putative  62.98 
 
 		 292 aa  298  5e-80  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.220661  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_12355  Ribosomal protein Sa, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  66.01 
 
 		 290 aa  293  2e-78  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.30496  normal  0.113443 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_76999  ribosomal protein S0A  59.91 
 
 		 261 aa  279  2e-74  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.937942  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1047  ribosomal protein S2  44 
 
 		 226 aa  184  9e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.269348  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2140  30S ribosomal protein S2  44.1 
 
 		 225 aa  177  9e-44  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000050996  hitchhiker  0.0000667505 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0274  30S ribosomal protein S2  45.03 
 
 		 214 aa  177  9e-44  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1693  30S ribosomal protein S2  43.58 
 
 		 221 aa  168  7e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0219  30S ribosomal protein S2  43.58 
 
 		 221 aa  168  7e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.664063  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1302  ribosomal protein S2  43.09 
 
 		 199 aa  167  1e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.29354  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0907  30S ribosomal protein S2  43.58 
 
 		 220 aa  167  1e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1524  30S ribosomal protein S2  42.46 
 
 		 221 aa  167  2e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.524219  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0478  30S ribosomal protein S2  43.46 
 
 		 206 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0061  30S ribosomal protein S2  43.55 
 
 		 208 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.924609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0759  30S ribosomal protein S2  40.8 
 
 		 220 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.817066  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0058  30S ribosomal protein S2  41.94 
 
 		 206 aa  160  1e-38  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0190126 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0027  30S ribosomal protein S2  43.55 
 
 		 208 aa  160  1e-38  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2215  30S ribosomal protein S2  37.88 
 
 		 203 aa  160  1e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1104  30S ribosomal protein S2  41.94 
 
 		 207 aa  160  1e-38  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1810  30S ribosomal protein S2  40.91 
 
 		 205 aa  160  2e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2378  30S ribosomal protein S2  38.27 
 
 		 202 aa  158  6e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00361654  normal  0.260163 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1826  30S ribosomal protein S2  44.25 
 
 		 268 aa  158  7e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2544  ribosomal protein S2  44.02 
 
 		 269 aa  157  9e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2514  30S ribosomal protein S2  44.71 
 
 		 267 aa  154  7e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2599  30S ribosomal protein S2  41.88 
 
 		 259 aa  154  8e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.11317 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0430  ribosomal protein S2  43.1 
 
 		 263 aa  154  1e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.748529  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2393  30S ribosomal protein S2  40.12 
 
 		 214 aa  149  2e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000018478  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1237  30S ribosomal protein S2  39.2 
 
 		 202 aa  150  2e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.161578  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1423  30S ribosomal protein S2  38.51 
 
 		 247 aa  149  3e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.017125 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_2002  30S ribosomal protein S2  40.32 
 
 		 215 aa  146  3e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2892  30S ribosomal protein S2  39.31 
 
 		 202 aa  140  9.999999999999999e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00129354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0316  30S ribosomal protein S2  33.5 
 
 		 207 aa  125  7e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1199  30S ribosomal protein S2  27.8 
 
 		 258 aa  75.5  0.0000000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0195465  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0648  ribosomal protein S2  26.7 
 
 		 324 aa  72.4  0.000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.154128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1316  30S ribosomal protein S2  24.7 
 
 		 255 aa  70.9  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000315088  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3194  ribosomal protein S2  27.06 
 
 		 247 aa  71.2  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.758099  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1341  30S ribosomal protein S2  24.7 
 
 		 255 aa  70.9  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000466794  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2479  30S ribosomal protein S2  26.48 
 
 		 233 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000168536  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0975  SSU ribosomal protein S2P  27.03 
 
 		 260 aa  70.5  0.00000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.000000199149  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0801  30S ribosomal protein S2  27.06 
 
 		 271 aa  70.1  0.00000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000778728  hitchhiker  8.51058e-18 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0823  30S ribosomal protein S2  25 
 
 		 262 aa  69.7  0.00000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3650  30S ribosomal protein S2  26.48 
 
 		 233 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000272591  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3868  30S ribosomal protein S2  26.03 
 
 		 233 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000560898  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3678  30S ribosomal protein S2  26.03 
 
 		 233 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000860084  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3568  30S ribosomal protein S2  26.03 
 
 		 233 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.7831e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3586  30S ribosomal protein S2  26.03 
 
 		 233 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000193043  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3839  30S ribosomal protein S2  26.03 
 
 		 233 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.22661e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3965  30S ribosomal protein S2  26.03 
 
 		 233 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000002868  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3874  30S ribosomal protein S2  26.03 
 
 		 233 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000491144  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2033  30S ribosomal protein S2  27.06 
 
 		 235 aa  68.9  0.00000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3925  30S ribosomal protein S2  26.03 
 
 		 233 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000230027  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1318  30S ribosomal protein S2  26.03 
 
 		 233 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000762012  hitchhiker  4.07369e-17 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1141  30S ribosomal protein S2  26.61 
 
 		 235 aa  68.9  0.00000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000168885  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0442  30S ribosomal protein S2  26.24 
 
 		 252 aa  67.8  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000051714  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0371  30S ribosomal protein S2  25.48 
 
 		 291 aa  66.6  0.0000000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2455  30S ribosomal protein S2  27.48 
 
 		 255 aa  66.6  0.0000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000036372  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32903  predicted protein  23.65 
 
 		 421 aa  66.2  0.0000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.174506 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1610  30S ribosomal protein S2  26.48 
 
 		 254 aa  65.9  0.0000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00150432  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4743  ribosomal protein S2  26.98 
 
 		 277 aa  65.9  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000226587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0424  30S ribosomal protein S2  26.34 
 
 		 256 aa  64.7  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0576373  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2108  30S ribosomal protein S2  24.77 
 
 		 254 aa  64.3  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2924  30S ribosomal protein S2  26.32 
 
 		 271 aa  63.5  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.240537 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0026  30S ribosomal protein S2  26.91 
 
 		 351 aa  63.9  0.000000002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2353  30S ribosomal protein S2  26.75 
 
 		 255 aa  63.9  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00564969  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1398  SSU ribosomal protein S2P  25.75 
 
 		 306 aa  63.9  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000000184086  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04075  30S ribosomal protein S2  26.57 
 
 		 265 aa  63.5  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1954  30S ribosomal protein S2  24.77 
 
 		 233 aa  63.2  0.000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000941341  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1672  30S ribosomal protein S2  24.77 
 
 		 233 aa  63.2  0.000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000487185  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf061  30S ribosomal protein S2  26.01 
 
 		 307 aa  62.4  0.000000005  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.838903  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0377  30S ribosomal protein S2  24.77 
 
 		 281 aa  62.4  0.000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2019  30S ribosomal protein S2  25.48 
 
 		 262 aa  62  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00418742 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1203  30S ribosomal protein S2  26.01 
 
 		 246 aa  62  0.000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000159372  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3495  ribosomal protein S2  25.12 
 
 		 272 aa  62  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000000642119  normal  0.503548 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0957  ribosomal protein S2  24.77 
 
 		 280 aa  61.6  0.000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0684  30S ribosomal protein S2  25.58 
 
 		 262 aa  61.6  0.000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000550841  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1848  ribosomal protein S2  25.23 
 
 		 288 aa  61.6  0.00000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0363359  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3709  30S ribosomal protein S2  24.77 
 
 		 244 aa  60.8  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000237071  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1661  30S ribosomal protein S2  24.66 
 
 		 235 aa  61.2  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000151826  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1941  ribosomal protein S2  24.12 
 
 		 262 aa  60.8  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl561  30S ribosomal protein S2  25.43 
 
 		 283 aa  60.5  0.00000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1006  30S ribosomal protein S2  24.89 
 
 		 252 aa  60.1  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000128012  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1816  30S ribosomal protein S2  23.98 
 
 		 257 aa  60.5  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000541904  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1419  ribosomal protein S2  26.15 
 
 		 233 aa  60.5  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000375862  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2010  30S ribosomal protein S2  25.89 
 
 		 252 aa  60.5  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.281351  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1133  30S ribosomal protein S2  26.98 
 
 		 260 aa  59.7  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1840  SSU ribosomal protein S2P  24.77 
 
 		 262 aa  59.7  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2044  30S ribosomal protein S2  24.55 
 
 		 257 aa  60.1  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000116198  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0112  ribosomal protein S2  26.39 
 
 		 274 aa  60.1  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00000610418  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1966  ribosomal protein S2  25.55 
 
 		 251 aa  59.3  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0450512 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_321  ribosomal protein S2  22.84 
 
 		 245 aa  59.3  0.00000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000000206427  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0403  30S ribosomal protein S2  25.78 
 
 		 253 aa  59.3  0.00000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.489561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1648  30S ribosomal protein S2  24 
 
 		 251 aa  59.3  0.00000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1153  30S ribosomal protein S2  25.66 
 
 		 269 aa  59.3  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0525  30S ribosomal protein S2  25.11 
 
 		 238 aa  59.3  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000167283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1698  30S ribosomal protein S2  24.7 
 
 		 349 aa  59.7  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1832  30S ribosomal protein S2  27.03 
 
 		 256 aa  59.3  0.00000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000152831  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0882  ribosomal protein S2  23.85 
 
 		 236 aa  58.9  0.00000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000183579  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0105  30S ribosomal protein S2  26.03 
 
 		 255 aa  58.9  0.00000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000131996  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3925  30S ribosomal protein S2  25 
 
 		 263 aa  58.9  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0841532 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>