238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4120 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4120  TrkA-N domain protein  100 
 
 
132 aa  259  1e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1489  hypothetical protein  38.89 
 
 
218 aa  108  3e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00984888  normal  0.0109156 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1213  TrkA-N domain protein  34.85 
 
 
228 aa  96.7  9e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2079  TrkA-N domain protein  34.85 
 
 
225 aa  95.9  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1216  TrkA-N domain protein  36.36 
 
 
229 aa  96.7  1e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0505  TrkA domain-containing protein  35.71 
 
 
229 aa  91.7  3e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1944  TrkA domain-containing protein  34.09 
 
 
222 aa  86.3  1e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.772638 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0312  potassium transporter peripheral membrane component  31.85 
 
 
449 aa  75.9  0.0000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0720169  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0806  TrkA-N domain protein  33.08 
 
 
218 aa  70.5  0.000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1685  TrkA domain-containing protein  30.77 
 
 
153 aa  70.1  0.000000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.124287  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_25  cation transport protein, Trk system  31.5 
 
 
221 aa  69.3  0.00000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00178783  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0025  TrkA domain-containing protein  31.5 
 
 
221 aa  68.9  0.00000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0026  potassium uptake protein, putative  31.5 
 
 
221 aa  68.2  0.00000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.311155  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1041  TrkA domain-containing protein  28.99 
 
 
452 aa  65.5  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_29  cation transport protein, Trk system  26.35 
 
 
454 aa  63.9  0.0000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0030  potassium transporter peripheral membrane component  25.68 
 
 
454 aa  62.8  0.000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2082  TrkA-N domain protein  34.68 
 
 
218 aa  63.5  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.124657  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0911  TrkA domain-containing protein  27.27 
 
 
221 aa  62.8  0.000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.347676  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0542  TrkA-N domain protein  28.68 
 
 
215 aa  62.4  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.840001  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0914  potassium transporter peripheral membrane component  27.21 
 
 
450 aa  61.6  0.000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0088  potassium transporter peripheral membrane component  28.89 
 
 
462 aa  62  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5096  TrkA-N domain protein  28.15 
 
 
448 aa  61.6  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1590  potassium transporter peripheral membrane component  27.41 
 
 
449 aa  61.2  0.000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00906485  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0547  K+ transport systems NAD-binding subunit  29.66 
 
 
219 aa  60.8  0.000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1809  TrkA domain-containing protein  26.52 
 
 
221 aa  60.8  0.000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1728  TrkA domain-containing protein  26.72 
 
 
218 aa  60.8  0.000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000194267  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1877  potassium transporter peripheral membrane component  26.15 
 
 
445 aa  60.8  0.000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.113601 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4396  potassium transporter peripheral membrane component  29.32 
 
 
458 aa  60.1  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0641614  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0846  TrkA domain-containing protein  26.52 
 
 
221 aa  59.3  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.391871  normal  0.188053 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1655  TrkA domain-containing protein  25.95 
 
 
218 aa  58.9  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000867889  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1265  hypothetical protein  31 
 
 
237 aa  58.5  0.00000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1071  TrkA domain-containing protein  25.76 
 
 
221 aa  58.5  0.00000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.551527  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4514  potassium transporter peripheral membrane component  29.01 
 
 
458 aa  57.8  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00906883  hitchhiker  0.00000865676 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0243  TrkA-N domain protein  30.77 
 
 
206 aa  57.8  0.00000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1399  TrkA-N domain protein  27.73 
 
 
455 aa  57.4  0.00000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000200171  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0769  TrkA-N domain protein  28.99 
 
 
445 aa  57  0.00000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.601936 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2849  potassium transporter peripheral membrane component  28.99 
 
 
457 aa  56.6  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.336578  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0890  TrkA-C domain protein  25.9 
 
 
446 aa  56.6  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000220881  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1272  potassium transporter peripheral membrane component  26.72 
 
 
443 aa  56.6  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0221885  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3183  potassium transporter peripheral membrane component  25.74 
 
 
465 aa  56.2  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00657284  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1262  TrkA domain-containing protein  25.6 
 
 
141 aa  56.6  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1209  potassium transporter peripheral membrane component  25.19 
 
 
448 aa  55.8  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.356485  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0612  potassium transporter peripheral membrane component  28.24 
 
 
458 aa  55.8  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0369792  normal  0.0559785 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0254  TrkA-N domain protein  26.32 
 
 
221 aa  55.8  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.153232 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3885  potassium transporter peripheral membrane component  28.24 
 
 
458 aa  55.8  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0054195  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0108  potassium transporter peripheral membrane component  28.89 
 
 
462 aa  55.5  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.386766  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0313  potassium transporter peripheral membrane component  28.24 
 
 
458 aa  55.8  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.888467  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1561  TrkA-N domain protein  31.75 
 
 
219 aa  55.1  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.534326  normal  0.490374 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0739  TrkA-N domain protein  34.75 
 
 
630 aa  55.1  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.524407 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03140  potassium transporter peripheral membrane component  28.24 
 
 
458 aa  55.1  0.0000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.946548  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0424  TrkA-N domain protein  28.24 
 
 
458 aa  55.1  0.0000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3674  potassium transporter peripheral membrane component  28.24 
 
 
458 aa  55.1  0.0000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3585  potassium transporter peripheral membrane component  28.24 
 
 
458 aa  55.1  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.931761  normal  0.13042 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3483  potassium transporter peripheral membrane component  28.24 
 
 
458 aa  55.1  0.0000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0624843  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0028  potassium transporter peripheral membrane component  27.48 
 
 
469 aa  54.7  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0424  potassium transporter peripheral membrane component  28.24 
 
 
458 aa  55.1  0.0000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000421391 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4612  potassium transporter peripheral membrane component  28.24 
 
 
458 aa  55.1  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00524775  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03091  hypothetical protein  28.24 
 
 
458 aa  55.1  0.0000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0699  TrkA-N domain protein  23.85 
 
 
444 aa  54.7  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3772  potassium transporter peripheral membrane component  28.24 
 
 
458 aa  55.1  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.241443  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002054  Trk system potassium uptake protein TrkA  28.24 
 
 
458 aa  54.3  0.0000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0029  potassium transporter peripheral membrane component  25.68 
 
 
454 aa  53.9  0.0000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00394  potassium transporter peripheral membrane component  28.24 
 
 
458 aa  53.5  0.0000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1093  potassium transporter peripheral membrane component  27.07 
 
 
458 aa  53.9  0.0000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.915935  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0032  potassium transporter peripheral membrane component  27.48 
 
 
469 aa  53.5  0.0000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0670474 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0035  potassium transporter peripheral membrane component  27.34 
 
 
469 aa  53.5  0.0000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.154438 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3062  TrkA domain-containing protein  32.31 
 
 
227 aa  53.5  0.0000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.793731  hitchhiker  0.00379917 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2085  TrkA-N domain protein  38.27 
 
 
444 aa  53.1  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3722  TrkA-N domain protein  33.62 
 
 
617 aa  53.1  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.207998  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0436  potassium transporter peripheral membrane component  26.72 
 
 
458 aa  52.8  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2455  potassium transporter peripheral membrane component  39.02 
 
 
452 aa  52.8  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.341783  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3713  potassium transporter peripheral membrane component  27.48 
 
 
458 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.461523 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3678  potassium transporter peripheral membrane component  27.48 
 
 
458 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3739  potassium transporter peripheral membrane component  27.34 
 
 
469 aa  53.5  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00764602 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2911  potassium transporter peripheral membrane component  26.87 
 
 
449 aa  53.5  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000908908  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3721  potassium transporter peripheral membrane component  27.48 
 
 
458 aa  53.1  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.455601  hitchhiker  0.00773793 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3606  potassium transporter peripheral membrane component  27.48 
 
 
458 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.454415 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3776  potassium transporter peripheral membrane component  27.48 
 
 
458 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3605  potassium transporter peripheral membrane component  27.48 
 
 
458 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.267887  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1707  TrkA-N domain protein  28.23 
 
 
224 aa  52.8  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.102172  normal  0.0591298 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1929  putative potassium uptake protein  27.2 
 
 
229 aa  52.4  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.123463  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1640  K+ transport systems NAD-binding component, TrkA-N  23.81 
 
 
221 aa  52.4  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0021  potassium transporter peripheral membrane component  26.72 
 
 
469 aa  52.4  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3792  potassium transporter peripheral membrane component  28.24 
 
 
458 aa  52.4  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1454  TrkA-N domain protein  28.79 
 
 
443 aa  52  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1399  TrkA domain-containing protein  30.15 
 
 
233 aa  51.6  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0040  potassium transporter peripheral membrane component  25.95 
 
 
469 aa  52  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.165147 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2267  TrkA-N domain protein  25 
 
 
459 aa  52  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.634076  hitchhiker  0.00765776 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1469  TrkA-N domain protein  28.35 
 
 
454 aa  52  0.000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2030  potassium transporter peripheral membrane component  23.08 
 
 
465 aa  51.2  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0693486  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3126  potassium transporter peripheral membrane component  26.12 
 
 
458 aa  51.2  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.779559 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1184  TrkA-N domain protein  28.8 
 
 
218 aa  51.6  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0544  potassium transporter peripheral membrane component  28.85 
 
 
458 aa  51.2  0.000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.027133  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16160  K+ transport system, NAD-binding component  28.23 
 
 
249 aa  51.6  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.534565  normal  0.109015 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1450  TrkA domain-containing protein  28.8 
 
 
229 aa  51.2  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0807714  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3673  TrkA-N domain protein  22.14 
 
 
444 aa  51.2  0.000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.728396  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1310  potassium transporter peripheral membrane component  30 
 
 
444 aa  51.2  0.000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0021  potassium transporter peripheral membrane component  26.72 
 
 
469 aa  51.2  0.000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1941  TrkA-N domain protein  29.03 
 
 
241 aa  51.2  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0298197 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2907  potassium transporter peripheral membrane component  33.59 
 
 
450 aa  51.2  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000237268  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>