137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2730 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2730  DevC protein  100 
 
 
397 aa  806    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.890192 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3587  DevC protein  49.61 
 
 
385 aa  408  1e-113  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.694594  normal  0.0264093 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0091  DevC protein  49.1 
 
 
384 aa  400  9.999999999999999e-111  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1223  DevC protein  47.29 
 
 
392 aa  394  1e-108  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.933137  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2250  DevC protein  47.16 
 
 
385 aa  388  1e-107  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0130513  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0331  DevC protein  47.53 
 
 
385 aa  389  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3751  DevC protein  46.51 
 
 
383 aa  377  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3800  DevC protein  46.51 
 
 
383 aa  375  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0009  DevC protein  45.99 
 
 
384 aa  372  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.611516 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2092  DevC protein  44.96 
 
 
388 aa  358  9.999999999999999e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000758237 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3920  DevC protein  46.41 
 
 
392 aa  352  5e-96  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2586  DevC protein  46.41 
 
 
392 aa  352  5.9999999999999994e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.131635  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4445  DevC protein  44.33 
 
 
390 aa  346  3e-94  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1233  DevC protein  41.75 
 
 
392 aa  340  2.9999999999999998e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000657909  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3639  DevC protein  42.38 
 
 
388 aa  334  2e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.543907  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0600  DevC protein  40.31 
 
 
388 aa  332  7.000000000000001e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1218  DevC protein  41.01 
 
 
389 aa  328  1.0000000000000001e-88  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.188524  normal  0.730906 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16601  ABC-transporter, membrane spanning component  40.57 
 
 
389 aa  324  2e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.513807 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2891  DevC protein  41.58 
 
 
395 aa  322  5e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.822086  normal  0.492179 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1251  DevC protein  41.75 
 
 
389 aa  321  9.999999999999999e-87  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0933437  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10141  ABC-transporter, membrane spanning component  40.05 
 
 
390 aa  318  7.999999999999999e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.8535  normal  0.0327944 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0153  ABC transporter transmembrane protein  39.39 
 
 
391 aa  313  2.9999999999999996e-84  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07851  ABC-transporter, membrane spanning component  39.14 
 
 
391 aa  312  6.999999999999999e-84  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.165508  normal  0.803737 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08091  ABC-transporter, membrane spanning component  40.77 
 
 
390 aa  307  2.0000000000000002e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.270503  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08101  ABC-transporter, membrane spanning component  40.62 
 
 
390 aa  306  3e-82  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0757  ABC transporter transmembrane protein  40.15 
 
 
390 aa  303  3.0000000000000004e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.750458  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08351  ABC-transporter, membrane spanning component  39.9 
 
 
390 aa  303  4.0000000000000003e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4104  DevC protein  39.22 
 
 
385 aa  291  1e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.312226  normal  0.741195 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1432  hypothetical protein  34.85 
 
 
402 aa  272  8.000000000000001e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.696316  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2783  ABC transporter, membrane spanning subunit, devC-like  33.16 
 
 
393 aa  234  2.0000000000000002e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.301274  hitchhiker  0.000609554 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2146  protein of unknown function DUF214  28.21 
 
 
392 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4023  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.53 
 
 
375 aa  132  9e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5155  protein of unknown function DUF214  39.66 
 
 
407 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3083  hypothetical protein  28.17 
 
 
376 aa  126  8.000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.262583  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0999  protein of unknown function DUF214  26.65 
 
 
414 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.59064  normal  0.175396 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3709  protein of unknown function DUF214  26.29 
 
 
406 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2797  hypothetical protein  27.76 
 
 
415 aa  110  6e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0642464 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0698  protein of unknown function DUF214  27.23 
 
 
376 aa  108  1e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.112552 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7062  putative ABC transporter, permease protein  27.11 
 
 
377 aa  108  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.549141  normal 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3894  hypothetical protein  25.65 
 
 
402 aa  108  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1808  ABC-transporter permease protein, putative  24.49 
 
 
366 aa  102  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.218527  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1553  hypothetical protein  23.91 
 
 
376 aa  92.8  9e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1117  protein of unknown function DUF214  25 
 
 
381 aa  91.7  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2114  hypothetical protein  23.47 
 
 
380 aa  89.4  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000213217  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0827  ABC transporter, permease protein, putative  24.09 
 
 
410 aa  84  0.000000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2646  ABC transporter, permease component  24.61 
 
 
374 aa  81.6  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0167  hypothetical protein  21.9 
 
 
380 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4558  protein of unknown function DUF214  23.43 
 
 
378 aa  67  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.987497  normal  0.0915843 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4425  protein of unknown function DUF214  23.43 
 
 
378 aa  67  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.144574  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4544  protein of unknown function DUF214  21.66 
 
 
372 aa  66.6  0.0000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0301435  normal  0.636617 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1630  protein of unknown function DUF214  21.82 
 
 
382 aa  66.6  0.0000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0469  protein of unknown function DUF214  20.25 
 
 
386 aa  63.9  0.000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0444  ABC transporter, permease protein  27.89 
 
 
378 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.147924  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2769  ABC transporter, permease protein, putative  27.21 
 
 
378 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.715584  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3338  hypothetical protein  25.52 
 
 
401 aa  60.1  0.00000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1293  hypothetical protein  21.32 
 
 
384 aa  59.3  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0146  ABC transporter, permease protein  26.53 
 
 
378 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1317  efflux ABC transporter, permease protein  26.53 
 
 
378 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2626  efflux ABC transporter, permease protein  26.53 
 
 
378 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0172  efflux ABC transporter, permease protein  26.53 
 
 
378 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.776599  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1222  hypothetical protein  22.67 
 
 
398 aa  57.8  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1034  ABC transporter, permease protein  26.53 
 
 
378 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.778603  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5592  protein of unknown function DUF214  27.59 
 
 
378 aa  57  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00756234  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0126  hypothetical protein  24.5 
 
 
384 aa  56.6  0.0000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.447116  normal  0.743413 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1363  hypothetical protein  22.4 
 
 
381 aa  56.2  0.0000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.222862  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1505  hypothetical protein  21.36 
 
 
378 aa  55.5  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.481293  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5886  hypothetical protein  21 
 
 
378 aa  55.1  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0146  hypothetical protein  25.27 
 
 
401 aa  54.3  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3610  protein of unknown function DUF214  23.98 
 
 
410 aa  53.5  0.000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.411205  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3300  hypothetical protein  22.89 
 
 
377 aa  51.6  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.21339  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0999  protein of unknown function DUF214  25 
 
 
417 aa  52  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000110671 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1835  hypothetical protein  24.18 
 
 
399 aa  50.8  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.515684  normal  0.328379 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3407  hypothetical protein  24.7 
 
 
400 aa  51.2  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.246613  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7011  hypothetical protein  25.33 
 
 
378 aa  50.8  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0792174  normal  0.559457 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0313  protein of unknown function DUF214  23.86 
 
 
380 aa  50.8  0.00004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1942  protein of unknown function DUF214  23.14 
 
 
443 aa  50.4  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4412  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  24.85 
 
 
863 aa  50.4  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.823513  normal  0.01571 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0545  protein of unknown function DUF214  24.77 
 
 
386 aa  50.8  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0457  protein of unknown function DUF214  24.31 
 
 
866 aa  50.4  0.00006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.306104  normal  0.015476 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1686  protein of unknown function DUF214  23.63 
 
 
399 aa  50.1  0.00007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1080  peptide ABC transporter permease  20.71 
 
 
859 aa  50.1  0.00007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0653596  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2393  protein of unknown function DUF214  26.72 
 
 
857 aa  50.1  0.00007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0227275  hitchhiker  0.00295901 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1534  protein of unknown function DUF214  24.8 
 
 
421 aa  50.1  0.00007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0269  protein of unknown function DUF214  25.88 
 
 
430 aa  50.1  0.00007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.36794 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1924  protein of unknown function DUF214  26.44 
 
 
399 aa  49.7  0.00008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.745521  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1185  hypothetical protein  31.82 
 
 
397 aa  49.7  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.291724  normal 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3833  hypothetical protein  23.91 
 
 
401 aa  48.9  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3850  hypothetical protein  23.91 
 
 
401 aa  48.9  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.17644  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1918  hypothetical protein  23.91 
 
 
401 aa  48.9  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4323  hypothetical protein  30.5 
 
 
378 aa  49.7  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.113559 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0381  hypothetical protein  26.51 
 
 
381 aa  48.9  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.199092  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2836  hypothetical protein  23.67 
 
 
397 aa  48.9  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00251794 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1044  hypothetical protein  24.37 
 
 
400 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2684  hypothetical protein  23.91 
 
 
401 aa  48.9  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.613809  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0390  protein of unknown function DUF214  28.06 
 
 
406 aa  48.5  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2522  hypothetical protein  29.36 
 
 
385 aa  47.4  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1408  protein of unknown function DUF214  24.48 
 
 
379 aa  47.4  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.485745  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1360  ABC transporter permease protein  25.29 
 
 
401 aa  47.4  0.0005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3762  protein of unknown function DUF214  24.79 
 
 
452 aa  47.4  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0948  ABC transporter, permease protein, putative  28.57 
 
 
399 aa  47  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>