53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3338 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_3338  hypothetical protein  100 
 
 
401 aa  791    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0126  hypothetical protein  28.26 
 
 
384 aa  118  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.447116  normal  0.743413 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1408  protein of unknown function DUF214  25.98 
 
 
379 aa  115  1.0000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.485745  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4323  hypothetical protein  28.78 
 
 
378 aa  106  8e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.113559 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08351  ABC-transporter, membrane spanning component  21.23 
 
 
390 aa  70.9  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4445  DevC protein  24.87 
 
 
390 aa  67.4  0.0000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2797  hypothetical protein  23.48 
 
 
415 aa  65.5  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0642464 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7062  putative ABC transporter, permease protein  25.91 
 
 
377 aa  65.1  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.549141  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1553  hypothetical protein  21.87 
 
 
376 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0091  DevC protein  24.21 
 
 
384 aa  64.3  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0600  DevC protein  21.39 
 
 
388 aa  64.7  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1218  DevC protein  22.22 
 
 
389 aa  64.7  0.000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.188524  normal  0.730906 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2783  ABC transporter, membrane spanning subunit, devC-like  25.06 
 
 
393 aa  64.7  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.301274  hitchhiker  0.000609554 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08101  ABC-transporter, membrane spanning component  20.54 
 
 
390 aa  64.3  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0757  ABC transporter transmembrane protein  19.55 
 
 
390 aa  63.9  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.750458  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5155  protein of unknown function DUF214  23.39 
 
 
407 aa  63.5  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08091  ABC-transporter, membrane spanning component  19.6 
 
 
390 aa  63.5  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.270503  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1117  protein of unknown function DUF214  23.74 
 
 
381 aa  62.8  0.000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2092  DevC protein  24.66 
 
 
388 aa  63.2  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000758237 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2891  DevC protein  24.71 
 
 
395 aa  63.2  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.822086  normal  0.492179 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3751  DevC protein  25.87 
 
 
383 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3800  DevC protein  25.87 
 
 
383 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1251  DevC protein  22.54 
 
 
389 aa  62.4  0.00000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0933437  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3639  DevC protein  20.64 
 
 
388 aa  61.6  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.543907  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2730  DevC protein  25.52 
 
 
397 aa  61.6  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.890192 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1233  DevC protein  24.83 
 
 
392 aa  60.1  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000657909  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0009  DevC protein  27.2 
 
 
384 aa  60.5  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.611516 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10141  ABC-transporter, membrane spanning component  21.07 
 
 
390 aa  60.5  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.8535  normal  0.0327944 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3709  protein of unknown function DUF214  23.47 
 
 
406 aa  60.1  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1223  DevC protein  20.15 
 
 
392 aa  58.9  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.933137  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2586  DevC protein  21.96 
 
 
392 aa  57.8  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.131635  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16601  ABC-transporter, membrane spanning component  21.39 
 
 
389 aa  57  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.513807 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0331  DevC protein  21.94 
 
 
385 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3587  DevC protein  23.24 
 
 
385 aa  54.7  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.694594  normal  0.0264093 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2646  ABC transporter, permease component  21.32 
 
 
374 aa  53.9  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2146  protein of unknown function DUF214  22.14 
 
 
392 aa  53.5  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4104  DevC protein  26.61 
 
 
385 aa  52.8  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.312226  normal  0.741195 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07851  ABC-transporter, membrane spanning component  20.2 
 
 
391 aa  52.4  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.165508  normal  0.803737 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0153  ABC transporter transmembrane protein  20.6 
 
 
391 aa  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4023  ABC efflux pump, inner membrane subunit  20.34 
 
 
375 aa  52  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1808  ABC-transporter permease protein, putative  27.08 
 
 
366 aa  51.6  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.218527  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3083  hypothetical protein  23.75 
 
 
376 aa  51.6  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.262583  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1432  hypothetical protein  23.65 
 
 
402 aa  50.8  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.696316  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1152  protein of unknown function DUF214  25.37 
 
 
833 aa  50.8  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2250  DevC protein  21.2 
 
 
385 aa  50.8  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0130513  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0999  protein of unknown function DUF214  21.87 
 
 
414 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.59064  normal  0.175396 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3920  DevC protein  25 
 
 
392 aa  45.8  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2534  protein of unknown function DUF214  22.79 
 
 
406 aa  44.7  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.261611  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0397  protein of unknown function DUF214  36.27 
 
 
856 aa  44.3  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0721103  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5886  hypothetical protein  20.39 
 
 
378 aa  44.3  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2114  hypothetical protein  21.36 
 
 
380 aa  43.5  0.007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000213217  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2373  ABC-type transport system, permease component  26.5 
 
 
407 aa  43.1  0.008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000351897  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0444  ABC transporter, permease protein  22.6 
 
 
378 aa  42.7  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.147924  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>