More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2382 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_2382  transcriptional regulator SlyA  100 
 
 		 145 aa  291  2e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00066282  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2666  transcriptional regulator SlyA  99.31 
 
 		 145 aa  288  2e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0001523  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1722  transcriptional regulator SlyA  84.83 
 
 		 145 aa  254  2e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00118206  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1689  transcriptional regulator SlyA  84.14 
 
 		 145 aa  252  1.0000000000000001e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.245905  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0083  transcriptional regulator SlyA  75.18 
 
 		 144 aa  215  1e-55  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.404027  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01612  transcriptional regulator SlyA  73.76 
 
 		 144 aa  214  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1998  transcriptional regulator, MarR family  73.76 
 
 		 144 aa  214  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000396376  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2560  transcriptional regulator SlyA  74.47 
 
 		 143 aa  214  2.9999999999999998e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000673945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1876  transcriptional regulator SlyA  74.47 
 
 		 143 aa  214  2.9999999999999998e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000000116497  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1718  transcriptional regulator SlyA  73.76 
 
 		 144 aa  214  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.485306  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1852  transcriptional regulator SlyA  73.76 
 
 		 144 aa  214  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00181712  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01602  hypothetical protein  73.76 
 
 		 144 aa  214  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1767  transcriptional regulator SlyA  74.47 
 
 		 143 aa  214  2.9999999999999998e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000697661  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2354  transcriptional regulator SlyA  73.76 
 
 		 144 aa  214  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00255065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1557  transcriptional regulator SlyA  73.76 
 
 		 144 aa  214  4e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.991489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2214  transcriptional regulator SlyA  74.31 
 
 		 144 aa  214  4e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.559997  hitchhiker  0.000464724 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1987  transcriptional regulator SlyA  73.05 
 
 		 146 aa  213  7e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.225625  hitchhiker  0.00131258 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1805  transcriptional regulator SlyA  74.45 
 
 		 146 aa  212  9.999999999999999e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.734426  hitchhiker  0.00344529 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1554  transcriptional regulator SlyA  72.03 
 
 		 146 aa  211  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1541  transcriptional regulator SlyA  72.03 
 
 		 146 aa  211  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.294149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1730  transcriptional regulator SlyA  72.73 
 
 		 146 aa  211  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00443681  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1834  transcriptional regulator SlyA  73.05 
 
 		 144 aa  211  2.9999999999999995e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.397695  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1614  transcriptional regulator SlyA  72.73 
 
 		 146 aa  211  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.550286 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1899  transcriptional regulator SlyA  72.03 
 
 		 146 aa  210  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0947823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2395  transcriptional regulator SlyA  47.79 
 
 		 149 aa  135  3.0000000000000003e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1782  MarR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 159 aa  103  9e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4052  MarR family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 157 aa  100  6e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3435  MarR family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 158 aa  100  7e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3610  MarR family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 158 aa  99.8  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0516  MarR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 158 aa  99  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.716514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3252  transcriptional regulator, MarR family protein  39.16 
 
 		 161 aa  98.6  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000535  putative transcription regulator  36.5 
 
 		 151 aa  97.1  8e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0564  MarR family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 157 aa  95.1  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3772  MarR family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 157 aa  95.1  3e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0540  MarR family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 157 aa  95.1  3e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0569  transcriptional regulator, MarR family  38.52 
 
 		 157 aa  95.1  3e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0620  MarR family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 168 aa  94  6e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1814  MarR family transcriptional regulator  37.69 
 
 		 143 aa  93.6  8e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.571932 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1645  transcriptional regulator, MarR family  36.97 
 
 		 144 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.150607  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32790  Transcriptional regulator MarR family protein  40.34 
 
 		 148 aa  92.8  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3626  MarR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 160 aa  93.2  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00335375  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4021  MarR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 145 aa  92  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.021519 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3804  MarR family transcriptional regulator  36.03 
 
 		 145 aa  92  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.279751  hitchhiker  0.00000113316 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1921  MarR family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 155 aa  92.4  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.153298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3737  regulatory protein, MarR  36.97 
 
 		 144 aa  92  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.366539  normal  0.0258471 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0619  MarR family transcriptional regulator  37.82 
 
 		 156 aa  91.7  3e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1469  MarR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 144 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184271 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4515  MarR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 145 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.934068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1396  MarR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 145 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0579  MarR family transcriptional regulator  41.09 
 
 		 148 aa  90.9  5e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.14462  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 141 aa  90.5  7e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1789  putative transcriptional regulator  41.23 
 
 		 144 aa  90.1  9e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20850  MarR family transcriptional regulator  41.23 
 
 		 144 aa  90.1  9e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5405  MarR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 142 aa  86.3  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.955747 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2898  transcriptional regulator, TrmB  40.35 
 
 		 155 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.334267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0504  MarR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 154 aa  79.7  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.232466 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1008  transcriptional regulator, MarR family  37.93 
 
 		 146 aa  77.4  0.00000000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.167585  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1558  transcriptional regulator, MarR family  42.06 
 
 		 149 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0661  transcriptional regulator, MarR family  33.08 
 
 		 159 aa  73.6  0.0000000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0170  MarR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 142 aa  73.6  0.0000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2359  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 153 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2161  transcriptional regulator, MarR family  34.43 
 
 		 176 aa  73.6  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1843  transcriptional regulator, MarR family  29.6 
 
 		 147 aa  70.9  0.000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2185  transcriptional regulator, MarR family  29.6 
 
 		 147 aa  70.9  0.000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0359  MarR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 154 aa  70.5  0.000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000080599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2658  MarR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 169 aa  69.7  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.563591  normal  0.690586 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1859  transcriptional regulator, MarR family  32.54 
 
 		 151 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3252  transcriptional regulator, MarR family  30.23 
 
 		 151 aa  70.1  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1859  transcriptional regulator, MarR family  38.84 
 
 		 157 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.89352  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0861  MarR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 157 aa  69.3  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0735  MarR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 150 aa  69.3  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711731  normal  0.77844 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0866  transcriptional regulator, MarR family  33.56 
 
 		 159 aa  68.6  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1807  transcriptional regulator, MarR family  31.21 
 
 		 163 aa  68.2  0.00000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1216  hypothetical protein  31.58 
 
 		 139 aa  68.2  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3538  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 153 aa  68.2  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3360  transcriptional regulator, MarR family  29.63 
 
 		 151 aa  67  0.00000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1032  transcriptional regulator, MarR family  35.14 
 
 		 158 aa  66.6  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1111  MarR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 158 aa  66.2  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0196  MarR family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 150 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.149236  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0175  MarR family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 150 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0200  MarR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 150 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.834737 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1210  hypothetical protein  30.83 
 
 		 139 aa  65.9  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1989  MarR family transcriptional regulator  37.19 
 
 		 164 aa  65.5  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.7942 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2070  transcriptional regulator MarR  30.88 
 
 		 151 aa  65.9  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.317078 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5714  MarR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 153 aa  65.1  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00966957 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5688  transcriptional regulator  37.39 
 
 		 154 aa  63.9  0.0000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.153344  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5052  MarR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 150 aa  63.9  0.0000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1511  MarR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 159 aa  63.9  0.0000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3377  regulatory protein, MarR  30.83 
 
 		 150 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0974589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1107  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 145 aa  63.2  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4863  MarR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 157 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.238839  normal  0.273246 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02788  putative transcriptional regulator (MarR family) protein  35 
 
 		 109 aa  62  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0241  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 165 aa  62  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.932018  normal  0.191669 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2587  MarR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 142 aa  61.2  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.443857  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3617  transcriptional regulator, MarR family  32.14 
 
 		 150 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.821242  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3482  MarR family transcriptional regulator  43.53 
 
 		 171 aa  61.2  0.000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1796  MarR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 191 aa  60.8  0.000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.630858  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7721  MarR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 159 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0111  transcriptional regulator, MarR family  34.51 
 
 		 147 aa  60.5  0.000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6147  MarR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 159 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.676081  normal  0.847722 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>