More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0460 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_0558  TonB-dependent receptor  90.56 
 
 		 657 aa  1207    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2412  TonB-dependent receptor  53.02 
 
 		 662 aa  664    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.115111  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1826  TonB-dependent receptor  54.16 
 
 		 661 aa  669    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0922924  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1935  TonB-dependent receptor  52.53 
 
 		 662 aa  659    Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00717608  normal  0.914131 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1806  TonB-dependent receptor  52.17 
 
 		 649 aa  675    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0460  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 648 aa  1337    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2171  TonB-dependent receptor  52.64 
 
 		 649 aa  674    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1861  TonB-dependent receptor  51.69 
 
 		 653 aa  672    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0473101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2531  TonB-dependent receptor  52.85 
 
 		 680 aa  659    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.276329 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2423  TonB-dependent receptor  52.85 
 
 		 662 aa  660    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.075703  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01404  hypothetical protein  41.94 
 
 		 640 aa  494  9.999999999999999e-139  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1513  TonB-dependent receptor  35.26 
 
 		 649 aa  352  8e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000309269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3290  colicin I receptor  36.98 
 
 		 659 aa  351  2e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359827  normal  0.810258 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02084  ferric iron-catecholate outer membrane transporter  36.76 
 
 		 663 aa  350  4e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02043  hypothetical protein  36.76 
 
 		 663 aa  350  4e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214275  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1503  TonB-dependent receptor plug  36.76 
 
 		 663 aa  350  5e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000115095  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1493  colicin I receptor  36.76 
 
 		 663 aa  350  5e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.351325 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2289  colicin I receptor  36.76 
 
 		 663 aa  350  5e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2302  colicin I receptor  36.93 
 
 		 641 aa  348  1e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.010442 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2756  colicin I receptor  36.65 
 
 		 656 aa  348  1e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2451  colicin I receptor  36.61 
 
 		 663 aa  348  2e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39650  putative TonB-dependent receptor  33.89 
 
 		 653 aa  340  5.9999999999999996e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2434  colicin I receptor  36.07 
 
 		 650 aa  335  2e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.198809 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2390  colicin I receptor  36.07 
 
 		 650 aa  333  5e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.107934 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2438  colicin I receptor  35.86 
 
 		 650 aa  333  6e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.593043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2345  colicin I receptor  35.92 
 
 		 650 aa  333  7.000000000000001e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0748809  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3364  putative TonB-dependent receptor  33.75 
 
 		 635 aa  332  2e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.346597  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2548  colicin I receptor  35.77 
 
 		 650 aa  331  3e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00911927 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3409  TonB-dependent receptor  34.16 
 
 		 698 aa  287  2.9999999999999996e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.19526  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0938  TonB-dependent receptor  34.16 
 
 		 698 aa  287  2.9999999999999996e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00410623  normal  0.440689 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3276  TonB-dependent receptor  34.16 
 
 		 698 aa  287  2.9999999999999996e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2686  TonB-dependent receptor plug  33.01 
 
 		 650 aa  285  2.0000000000000002e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.262602  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3535  TonB-dependent receptor  30.57 
 
 		 681 aa  285  2.0000000000000002e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.243459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1930  TonB-dependent receptor  32.94 
 
 		 702 aa  283  8.000000000000001e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3220  putative outer membrane receptor  31.43 
 
 		 665 aa  280  4e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190191 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0934  putative outer membrane receptor  30.41 
 
 		 655 aa  270  7e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.969279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3738  TonB-dependent receptor  30.17 
 
 		 665 aa  268  2e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.430842  normal  0.0543439 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2666  putative outer membrane receptor  31.89 
 
 		 665 aa  267  4e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1541  putative outer membrane receptor  31.89 
 
 		 665 aa  267  4e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2748  putative outer membrane receptor  31.49 
 
 		 665 aa  266  7e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0028  enterobactin receptor protein  29.58 
 
 		 652 aa  266  8.999999999999999e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000507235  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002470  TonB-dependent receptor  30.96 
 
 		 652 aa  264  4e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.337593  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0784  TonB-dependent siderophore receptor, putative  31.48 
 
 		 656 aa  263  6.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3815  TonB-dependent receptor  31.33 
 
 		 658 aa  261  3e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1357  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  30.56 
 
 		 696 aa  257  5e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0456407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3962  TonB-dependent receptor  30.23 
 
 		 698 aa  256  1.0000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0899  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  30.42 
 
 		 696 aa  255  2.0000000000000002e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4241  enterobactin receptor protein  30.85 
 
 		 666 aa  254  3e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112255  hitchhiker  0.000515179 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0217  enterobactin receptor protein  30.85 
 
 		 666 aa  254  3e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000171736  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0219  enterobactin receptor protein  30.85 
 
 		 666 aa  254  4.0000000000000004e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0246836  normal  0.0975103 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3128  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  30.43 
 
 		 695 aa  253  9.000000000000001e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2678  enterobactin receptor protein  31.31 
 
 		 653 aa  252  1e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4120  enterobactin receptor protein  30.56 
 
 		 666 aa  253  1e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000897059  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1628  TonB-dependent receptor, plug  31.4 
 
 		 680 aa  250  7e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2046  TonB-dependent receptor  30.2 
 
 		 713 aa  249  1e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00183904 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3503  enterobactin receptor protein  30.12 
 
 		 666 aa  244  3e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00217636  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3075  outer membrane receptor FepA  29.84 
 
 		 724 aa  244  5e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.203578  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2242  outer membrane receptor FepA  28.39 
 
 		 744 aa  243  9e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.620188 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3496  outer membrane receptor FepA  28.87 
 
 		 744 aa  243  9e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2972  outer membrane receptor FepA  29.56 
 
 		 724 aa  243  9e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0370731 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2889  outer membrane receptor FepA  29.56 
 
 		 724 aa  243  9e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2953  outer membrane receptor FepA  29.56 
 
 		 724 aa  243  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.246738  hitchhiker  0.000000000736095 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1870  outer membrane receptor FepA  29.01 
 
 		 744 aa  242  2e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3795  TonB-dependent receptor  29.84 
 
 		 740 aa  241  2e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.837422  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3929  enterobactin receptor protein  30.17 
 
 		 663 aa  241  4e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.881798 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1716  outer membrane receptor FepA  29.48 
 
 		 746 aa  240  5e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1450  outer membrane receptor FepA  28.32 
 
 		 740 aa  240  5.999999999999999e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2919  outer membrane receptor FepA  29.28 
 
 		 724 aa  239  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.91274  normal  0.0854265 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1691  TonB-dependent receptor, plug  30.35 
 
 		 732 aa  238  2e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.524758  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1659  TonB-dependent receptor  29.93 
 
 		 714 aa  238  3e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000365717  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4523  enterobactin receptor protein  29.28 
 
 		 663 aa  237  6e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1839  outer membrane receptor FepA  28.55 
 
 		 703 aa  234  5e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.228059  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3964  outer membrane receptor FepA  29.22 
 
 		 746 aa  230  5e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.364367  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5052  TonB-dependent receptor  27.53 
 
 		 726 aa  229  2e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0923716  normal  0.422268 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29350  outer membrane receptor FepA  29.09 
 
 		 746 aa  228  3e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.93217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4281  hypothetical protein  28.08 
 
 		 700 aa  226  9e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4579  outer membrane receptor FepA  28.21 
 
 		 742 aa  226  1e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0633  outer membrane receptor FepA  29.42 
 
 		 746 aa  226  1e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0603  outer membrane receptor FepA  29.56 
 
 		 746 aa  226  1e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0602  outer membrane receptor FepA  29.56 
 
 		 746 aa  226  1e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3061  outer membrane receptor FepA  29.42 
 
 		 746 aa  225  2e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00912473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0667  outer membrane receptor FepA  29.84 
 
 		 746 aa  225  2e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00550  iron-enterobactin outer membrane transporter  29.56 
 
 		 746 aa  225  3e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.0000104738  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00539  hypothetical protein  29.56 
 
 		 746 aa  225  3e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.0000136629  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3043  TonB-dependent siderophore receptor  29.56 
 
 		 746 aa  224  4e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0305175  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0485  outer membrane receptor FepA  29.42 
 
 		 746 aa  224  6e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3294  TonB-dependent receptor, plug  28.61 
 
 		 676 aa  222  9.999999999999999e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52230  outer membrane receptor FepA  28.43 
 
 		 742 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.267722 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4161  TonB-dependent receptor  27.17 
 
 		 799 aa  219  1e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0743  outer membrane receptor FepA  30.34 
 
 		 751 aa  219  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.100086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0624  outer membrane receptor FepA  30.34 
 
 		 751 aa  219  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0681  outer membrane receptor FepA  30.34 
 
 		 751 aa  219  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.757968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1195  outer membrane receptor FepA  27.97 
 
 		 749 aa  219  2e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0821218  normal  0.246562 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37020  outer membrane receptor FepA  28.28 
 
 		 746 aa  218  2.9999999999999998e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.145193  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0697  outer membrane receptor FepA  30.2 
 
 		 751 aa  217  7e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0638  outer membrane receptor FepA  29.91 
 
 		 751 aa  214  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37010  outer membrane receptor FepA  28.88 
 
 		 757 aa  213  9e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0110447  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4233  TonB-dependent receptor  27.13 
 
 		 799 aa  212  2e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1116  outer membrane receptor FepA  27.25 
 
 		 750 aa  212  2e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4368  TonB-dependent receptor  26.98 
 
 		 799 aa  211  3e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>