More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_65350 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4896  DNA mismatch repair protein  81.89 
 
 		 632 aa  1044    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4948  DNA mismatch repair protein  82.05 
 
 		 632 aa  1042    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.167425  normal  0.037125 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1692  DNA mismatch repair protein  56.69 
 
 		 611 aa  688    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4944  DNA mismatch repair protein MutL  81.53 
 
 		 645 aa  1036    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4772  DNA mismatch repair protein  81.89 
 
 		 633 aa  1043    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5675  DNA mismatch repair protein  98.74 
 
 		 633 aa  1270    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0570  DNA mismatch repair protein  81.08 
 
 		 648 aa  1034    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.963062 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2771  DNA mismatch repair protein  62.67 
 
 		 629 aa  799    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0521  DNA mismatch repair protein  82.22 
 
 		 635 aa  1039    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0525121  normal  0.511532 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4687  DNA mismatch repair protein  81.42 
 
 		 633 aa  1032    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0633  DNA mismatch repair protein  83.39 
 
 		 623 aa  1059    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.211888 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2634  DNA mismatch repair protein  57.05 
 
 		 641 aa  739    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00330895  unclonable  0.0000000000120627 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2669  DNA mismatch repair protein  58.48 
 
 		 630 aa  765    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.680786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1275  DNA mismatch repair protein  57.58 
 
 		 644 aa  710    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0895  DNA mismatch repair protein MutL  58.45 
 
 		 611 aa  717    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.347619  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65350  DNA mismatch repair protein  100 
 
 		 633 aa  1281    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07520  DNA mismatch repair protein  79.08 
 
 		 641 aa  983    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00410  DNA mismatch repair protein  55 
 
 		 625 aa  641    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0571  DNA mismatch repair protein MutL  53.24 
 
 		 636 aa  627  1e-178  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.707368  hitchhiker  0.00000000963067 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0494  DNA mismatch repair protein MutL  56.08 
 
 		 626 aa  620  1e-176  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.220055  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2754  DNA mismatch repair protein  52.14 
 
 		 634 aa  602  1.0000000000000001e-171  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.679624 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2081  DNA mismatch repair protein  51.96 
 
 		 621 aa  588  1e-167  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1144  DNA mismatch repair protein MutL  50.7 
 
 		 616 aa  586  1e-166  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.513301  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2002  DNA mismatch repair protein  51.8 
 
 		 619 aa  585  1.0000000000000001e-165  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2769  DNA mismatch repair protein  50.08 
 
 		 652 aa  564  1.0000000000000001e-159  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286219  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3853  DNA mismatch repair protein  48.3 
 
 		 661 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.558268  normal  0.998912 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1384  DNA mismatch repair protein MutL  47.87 
 
 		 613 aa  562  1.0000000000000001e-159  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.664684 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1186  DNA mismatch repair protein  46.73 
 
 		 575 aa  563  1.0000000000000001e-159  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00913008  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0845  DNA mismatch repair protein  46.89 
 
 		 574 aa  563  1.0000000000000001e-159  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00243998  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2563  DNA mismatch repair protein  50.55 
 
 		 636 aa  559  1e-158  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1084  DNA mismatch repair protein MutL  47.87 
 
 		 630 aa  560  1e-158  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.967595  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2908  DNA mismatch repair protein  49.31 
 
 		 655 aa  560  1e-158  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0660  DNA mismatch repair protein  47.73 
 
 		 661 aa  558  1e-158  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3164  DNA mismatch repair protein MutL  48.6 
 
 		 615 aa  555  1e-157  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1823  DNA mismatch repair protein MutL  49.77 
 
 		 628 aa  556  1e-157  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000270616  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2621  DNA mismatch repair protein  49.09 
 
 		 662 aa  556  1e-157  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2836  DNA mismatch repair protein  49.45 
 
 		 647 aa  556  1e-157  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0281  DNA mismatch repair protein  47.81 
 
 		 667 aa  558  1e-157  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0765  DNA mismatch repair protein  47.81 
 
 		 667 aa  558  1e-157  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1517  DNA mismatch repair protein MutL  48.66 
 
 		 598 aa  551  1e-155  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.249931 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3308  DNA mismatch repair protein  48.79 
 
 		 681 aa  551  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.554472  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0734  DNA mismatch repair protein  48.11 
 
 		 667 aa  551  1e-155  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2192  DNA mismatch repair protein  48.42 
 
 		 684 aa  545  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2430  DNA mismatch repair protein  49.45 
 
 		 635 aa  548  1e-154  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2314  DNA mismatch repair protein  48.42 
 
 		 684 aa  545  1e-154  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3264  DNA mismatch repair protein  48.79 
 
 		 681 aa  546  1e-154  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.815986  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1320  DNA mismatch repair protein  47.47 
 
 		 705 aa  545  1e-154  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3297  DNA mismatch repair protein  48.42 
 
 		 684 aa  545  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.365803  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1085  DNA mismatch repair protein  48.42 
 
 		 684 aa  545  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0514  DNA mismatch repair protein  48.42 
 
 		 684 aa  545  1e-154  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2485  DNA mismatch repair protein  46.57 
 
 		 691 aa  542  1e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.933999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0668  DNA mismatch repair protein MutL  49.13 
 
 		 620 aa  535  1e-151  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.422126  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1157  DNA mismatch repair protein MutL  46.46 
 
 		 644 aa  530  1e-149  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2015  DNA mismatch repair protein MutL  47.59 
 
 		 617 aa  526  1e-148  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3466  DNA mismatch repair protein MutL  46.35 
 
 		 622 aa  519  1e-146  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.52693  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3209  DNA mismatch repair protein MutL  47.55 
 
 		 660 aa  518  1.0000000000000001e-145  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.230102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1125  DNA mismatch repair protein MutL  46.47 
 
 		 651 aa  514  1e-144  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.279862 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2031  DNA mismatch repair protein MutL  47.16 
 
 		 604 aa  498  1e-139  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.440642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0293  DNA mismatch repair protein  44.88 
 
 		 602 aa  487  1e-136  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1466  DNA mismatch repair protein MutL  45.04 
 
 		 635 aa  488  1e-136  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.643627  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3308  DNA mismatch repair protein MutL  42.98 
 
 		 664 aa  486  1e-136  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0533  DNA mismatch repair protein  45.49 
 
 		 629 aa  475  1e-132  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000857622  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1040  DNA mismatch repair protein MutL  44.83 
 
 		 632 aa  466  9.999999999999999e-131  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.619157 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0198  DNA mismatch repair protein  43.33 
 
 		 623 aa  464  1e-129  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0218  DNA mismatch repair protein  43.33 
 
 		 623 aa  464  1e-129  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0787206  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00096  DNA mismatch repair protein  42.64 
 
 		 681 aa  464  1e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1927  mismatch repair protein MutL  44.22 
 
 		 595 aa  464  1e-129  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3723  DNA mismatch repair protein  43.13 
 
 		 669 aa  463  1e-129  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0150049  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1599  DNA mismatch repair protein MutL  44.22 
 
 		 595 aa  464  1e-129  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.907039  normal  0.222038 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2713  DNA mismatch repair protein  44.03 
 
 		 606 aa  462  9.999999999999999e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3049  DNA mismatch repair protein  42.7 
 
 		 626 aa  459  9.999999999999999e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3921  DNA mismatch repair protein  43.37 
 
 		 661 aa  461  9.999999999999999e-129  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0286731  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0441  DNA mismatch repair protein  42.9 
 
 		 620 aa  459  9.999999999999999e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002257  DNA mismatch repair protein MutL  44.3 
 
 		 670 aa  457  1e-127  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.558957  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0429  DNA mismatch repair protein  45.31 
 
 		 624 aa  456  1e-127  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000237281  hitchhiker  0.000000886041 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2933  DNA mismatch repair protein  44.97 
 
 		 612 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.169061 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0490  DNA mismatch repair protein  43.99 
 
 		 649 aa  451  1e-125  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00424491  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1095  DNA mismatch repair protein  44.65 
 
 		 632 aa  451  1e-125  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.045837  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0428  DNA mismatch repair protein  43.29 
 
 		 605 aa  452  1e-125  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.329312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2946  DNA mismatch repair protein  44.58 
 
 		 629 aa  450  1e-125  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2756  DNA mismatch repair protein  45.5 
 
 		 653 aa  452  1e-125  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.25704  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2758  DNA mismatch repair protein  44.32 
 
 		 616 aa  450  1e-125  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0363  DNA mismatch repair protein  44.57 
 
 		 621 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.127252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0616  DNA mismatch repair protein  42.41 
 
 		 633 aa  448  1.0000000000000001e-124  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0800065 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0895  DNA mismatch repair protein  41.77 
 
 		 617 aa  444  1e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.380086  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2127  DNA mismatch repair protein  43.17 
 
 		 603 aa  442  1e-123  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.633502  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0491  DNA mismatch repair protein  43.29 
 
 		 594 aa  444  1e-123  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0595243  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0539  DNA mismatch repair protein  41.79 
 
 		 600 aa  442  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.111991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0102  DNA mismatch repair protein  42.09 
 
 		 644 aa  442  1e-123  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4062  DNA mismatch repair protein  42.64 
 
 		 643 aa  441  9.999999999999999e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04037  DNA mismatch repair protein  46.52 
 
 		 615 aa  442  9.999999999999999e-123  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0484513  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3823  DNA mismatch repair protein MutL  46.52 
 
 		 615 aa  442  9.999999999999999e-123  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000414583  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4412  DNA mismatch repair protein  46.52 
 
 		 615 aa  442  9.999999999999999e-123  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0194282  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0496  DNA mismatch repair protein  41.36 
 
 		 600 aa  442  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.170626 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3843  DNA mismatch repair protein  46.5 
 
 		 615 aa  440  9.999999999999999e-123  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000795964  hitchhiker  0.000000387336 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4641  DNA mismatch repair protein  46.5 
 
 		 615 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.231193  normal  0.0766044 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4728  DNA mismatch repair protein  46.52 
 
 		 615 aa  442  9.999999999999999e-123  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0929403  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1083  DNA mismatch repair protein  42.04 
 
 		 615 aa  439  9.999999999999999e-123  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4701  DNA mismatch repair protein  46.52 
 
 		 615 aa  440  9.999999999999999e-123  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0915673  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2779  DNA mismatch repair protein  38.84 
 
 		 652 aa  439  9.999999999999999e-123  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.841115  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>