More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_53750 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4705  hypothetical protein  98.31 
 
 		 415 aa  806    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.396867  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53750  hypothetical protein  100 
 
 		 415 aa  820    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000314396  normal  0.0111206 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1213  aminotransferase class V  32.75 
 
 		 393 aa  174  2.9999999999999996e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.145189  normal  0.43356 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5012  aminotransferase class V  29.44 
 
 		 407 aa  169  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1973  aminotransferase class V  31.2 
 
 		 388 aa  164  3e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00000551025  unclonable  0.0000000445037 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5187  class-V aminotransferase  32.66 
 
 		 395 aa  162  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0167126 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4543  aminotransferase class V  25.9 
 
 		 391 aa  160  3e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.119486 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8515  aminotransferase class V  29.77 
 
 		 401 aa  160  3e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.372361  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1811  aminotransferase class V  28.75 
 
 		 395 aa  155  9e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0747034  hitchhiker  0.00000000219699 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17050  selenocysteine lyase  27.5 
 
 		 403 aa  155  1e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0665  aminotransferase class V  29.87 
 
 		 393 aa  152  8.999999999999999e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4802  aminotransferase class V  32.38 
 
 		 391 aa  151  3e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1785  aminotransferase class V  28.75 
 
 		 394 aa  150  3e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.895354  normal  0.926046 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5724  aminotransferase class V  29.44 
 
 		 393 aa  140  3e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4268  class-V aminotransferase  26.88 
 
 		 430 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.51395 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2612  aminotransferase class V  28.93 
 
 		 399 aa  131  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1257  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  32.51 
 
 		 403 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8801  aminotransferase class V  26.86 
 
 		 413 aa  122  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.778555 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3189  aminotransferase class V  27.01 
 
 		 395 aa  115  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0446286 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3537  putative acetyltransferase  26.57 
 
 		 413 aa  110  5e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1367  aminotransferase  28.61 
 
 		 377 aa  102  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.699195  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2373  aminotransferase, class V  29.29 
 
 		 378 aa  94.7  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1763  class V aminotransferase  22.34 
 
 		 381 aa  91.3  3e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1866  aminotransferase class V  27.85 
 
 		 387 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.733686  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04121  putative L-cysteine/cystine lyase  25.54 
 
 		 391 aa  84.3  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0272358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0788  aminotransferase class V  24.3 
 
 		 367 aa  83.2  0.000000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0791  putative L-cysteine/cystine lyase  27.3 
 
 		 388 aa  81.6  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.51384  normal  0.0724988 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1041  aminotransferase, class V  24.92 
 
 		 878 aa  81.3  0.00000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.31514  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1586  putative L-cysteine/cystine lyase  27.23 
 
 		 400 aa  80.1  0.00000000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1295  aminotransferase class V  25.91 
 
 		 430 aa  80.1  0.00000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.35338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1512  aminotransferase class V  25.39 
 
 		 896 aa  79  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0374099 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1637  aminotransferase, class V  29.71 
 
 		 377 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.681858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2318  aminotransferase, class V  27.67 
 
 		 394 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.698487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1941  aminotransferase class V  24.92 
 
 		 394 aa  78.6  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0312599  normal  0.253942 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1984  aminotransferase, class V  23.13 
 
 		 394 aa  76.6  0.0000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.278859  normal  0.836735 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3297  aminotransferase, class V  25.71 
 
 		 393 aa  76.3  0.0000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.245647 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4866  aminotransferase, class V  24.88 
 
 		 401 aa  75.9  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.403598  unclonable  0.000000172014 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1656  aminotransferase, class V  25.83 
 
 		 377 aa  75.5  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000223228  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1255  L-cysteine/cystine lyase  25.97 
 
 		 387 aa  73.9  0.000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0542203  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2647  cysteine desulfurase NifS  26.53 
 
 		 389 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00311085 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1833  aminotransferase, class V  25.37 
 
 		 389 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0175075  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2203  hypothetical protein  33.5 
 
 		 377 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2219  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  23.1 
 
 		 885 aa  71.2  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.911418 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1533  aminotransferase class V  29.63 
 
 		 377 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.172669  normal  0.519626 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25790  hypothetical protein  33.51 
 
 		 377 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.226944 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15030  cysteine desulfurase protein  29.84 
 
 		 377 aa  71.6  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1868  aminotransferase, class V  24.5 
 
 		 380 aa  70.5  0.00000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.583415  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0409  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.32 
 
 		 412 aa  70.5  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2495  cysteine desulfurase family protein  26.8 
 
 		 385 aa  70.5  0.00000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.123711  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1932  cysteine desulfurase family protein  27.3 
 
 		 380 aa  70.5  0.00000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0084  aminotransferase, class V superfamily protein  27.33 
 
 		 422 aa  70.1  0.00000000006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.153468  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0799  cysteine desulfurase  25.72 
 
 		 423 aa  70.1  0.00000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.635677  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0554  aminotransferase, class V  24.09 
 
 		 355 aa  70.1  0.00000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.721131  hitchhiker  0.00373299 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1729  cysteine desulfurase family protein  26.32 
 
 		 385 aa  69.7  0.00000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000242055  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1569  cysteine desulfurase NifS  26.11 
 
 		 389 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00349258  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1720  hypothetical protein  29.09 
 
 		 401 aa  69.3  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0138813  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3914  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  23.88 
 
 		 400 aa  68.6  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2006  cysteine desulphurases, SufS  25.43 
 
 		 395 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1517  aminotransferase, class V  30 
 
 		 387 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.318525 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1038  cysteine desulfurase family protein  25.93 
 
 		 382 aa  68.2  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000028217  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3088  aminotransferase class V  24.87 
 
 		 374 aa  67.8  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38946  predicted protein  25 
 
 		 495 aa  68.2  0.0000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1413  aminotransferase, class V  27.05 
 
 		 381 aa  67.8  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.354567  normal  0.630226 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4350  aminotransferase  29.47 
 
 		 387 aa  67  0.0000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.486483  normal  0.208903 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0618  cysteine desulfurase family protein  20.86 
 
 		 381 aa  67  0.0000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4955  aminotransferase class V  27.49 
 
 		 387 aa  67  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.38029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1324  cysteine desulfurase IscS  28.27 
 
 		 403 aa  66.6  0.0000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00549463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0234  selenocysteine lyase  24.87 
 
 		 400 aa  66.6  0.0000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1356  cysteine desulfurase NifS  23.73 
 
 		 402 aa  65.9  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3442  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.03 
 
 		 420 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000291669 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2068  aminotransferase, class V  20.82 
 
 		 392 aa  65.9  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2036  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  20.1 
 
 		 408 aa  65.9  0.000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3723  aminotransferase class V  22.7 
 
 		 372 aa  66.2  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.15701  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1969  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  29.17 
 
 		 406 aa  65.1  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0908482  hitchhiker  0.0000000737026 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2291  cysteine desulfurase family protein  26.89 
 
 		 380 aa  65.1  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3065  aminotransferase class V  41.58 
 
 		 384 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5541  aminotransferase, class V  25.5 
 
 		 394 aa  65.1  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1280  hypothetical protein  33.33 
 
 		 411 aa  65.5  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.586224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1470  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  29.17 
 
 		 406 aa  65.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.244975  normal  0.102192 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1798  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  29.17 
 
 		 406 aa  65.1  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0228411  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1486  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  29.17 
 
 		 406 aa  65.1  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.199299  hitchhiker  0.000000000797081 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1505  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  29.17 
 
 		 406 aa  65.1  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000304018 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2054  aminotransferase, class V  24.09 
 
 		 880 aa  65.1  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.754406 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  19.58 
 
 		 404 aa  64.3  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99383  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3352  cysteine desulfurase, SufS subfamily  21.3 
 
 		 415 aa  64.7  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.143815 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1881  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  29.59 
 
 		 406 aa  64.7  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000647321  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1687  twin-arginine translocation pathway signal  22.06 
 
 		 440 aa  64.7  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2313  cysteine desulfurase family protein  24.86 
 
 		 380 aa  64.3  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0008  aminotransferase, class V  26.34 
 
 		 376 aa  64.3  0.000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0672811  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1232  SufS subfamily cysteine desulfurase  22.91 
 
 		 629 aa  63.9  0.000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.153291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1300  cysteine desulphurase-like protein  26.11 
 
 		 381 aa  63.9  0.000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0145428  hitchhiker  0.00325394 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1112  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  24.44 
 
 		 417 aa  63.9  0.000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.966588  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3676  aminotransferase class V  33.33 
 
 		 386 aa  63.5  0.000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0159839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2402  cysteine desulfurase family protein  22.83 
 
 		 380 aa  63.5  0.000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5290  aminotransferase class V  29.3 
 
 		 380 aa  63.5  0.000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00731204  normal  0.0470255 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21101  putative L-cysteine/cystine lyase  24.7 
 
 		 428 aa  63.2  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.601707 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0805  aminotransferase class V  28.63 
 
 		 395 aa  62.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4245  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  25.88 
 
 		 398 aa  62.4  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2203  aminotransferase, class V  26.56 
 
 		 393 aa  62.4  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.697874  normal  0.788418 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1122  hypothetical protein  23.3 
 
 		 879 aa  62.8  0.00000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>