More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_25500 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_25500  hypothetical protein  100 
 
 
146 aa  296  8e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.236019  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2179  hypothetical protein  98.63 
 
 
146 aa  291  2e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14750  Biopolymer transport protein ExbD  66.9 
 
 
142 aa  187  4e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.227679  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1613  biopolymer transport protein ExbD/TolR  63.12 
 
 
142 aa  178  2e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.921592  normal  0.194939 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1634  biopolymer transport protein ExbD/TolR  60.27 
 
 
143 aa  177  4e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0335583  normal  0.448537 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4176  biopolymer transport protein ExbD/TolR  62.41 
 
 
142 aa  177  5e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0268987  normal  0.49506 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3846  biopolymer transport protein ExbD/TolR family  60.27 
 
 
143 aa  176  1e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.661546  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1475  biopolymer transport protein ExbD/TolR  63.27 
 
 
144 aa  143  9e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0605408  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3815  biopolymer transport protein ExbD/TolR  63.27 
 
 
144 aa  140  5e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0446813  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1899  biopolymer transport protein ExbD/TolR  62.59 
 
 
144 aa  140  5e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  5.11207e-05 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1510  biopolymer transport protein ExbD/TolR  61.22 
 
 
144 aa  137  4e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.43562  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1370  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  48.94 
 
 
140 aa  130  6e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1742  biopolymer transport protein ExbD/TolR  46.38 
 
 
141 aa  129  2e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2060  GTP cyclohydrolase I  46.38 
 
 
143 aa  116  1e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.552907 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2151  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.79 
 
 
140 aa  115  2e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0691787  normal  0.335965 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2674  biopolymer transport protein ExbD/TolR  49.6 
 
 
140 aa  110  8e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1435  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.36 
 
 
137 aa  103  5e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.559612  normal  0.665441 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0592  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.01 
 
 
141 aa  103  1e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.127488 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00589  biopolymer transport protein  41.04 
 
 
154 aa  99.8  1e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.265658  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2806  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  40 
 
 
142 aa  97.1  8e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.0047121  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2554  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.06 
 
 
141 aa  95.9  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00133317 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0285  biopolymer transport protein ExbD/TolR  46.36 
 
 
149 aa  96.3  1e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2091  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.69 
 
 
140 aa  95.5  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0833564  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2529  biopolymer transport EXBD-like transmembrane protein  39.19 
 
 
143 aa  95.9  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.161438  normal  0.0831127 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0388  biopolymer transport protein  38.81 
 
 
145 aa  94.7  4e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0352  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.81 
 
 
145 aa  94.7  4e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2400  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.43 
 
 
142 aa  94.7  4e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0584856  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3216  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.86 
 
 
141 aa  94.4  5e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.300081  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0632  biopolymer ExbD/TolR family transporter  35.62 
 
 
141 aa  94.4  5e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1061  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.29 
 
 
158 aa  92.8  1e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1317  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.14 
 
 
143 aa  92.8  1e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.893415  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1397  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.5 
 
 
140 aa  92.4  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0536  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.44 
 
 
143 aa  91.3  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  1.96939e-07  hitchhiker  9.05807e-07 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1028  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.13 
 
 
138 aa  90.1  8e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  3.74903e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3209  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.78 
 
 
137 aa  90.5  8e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  5.37129e-08  normal  0.265512 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0313  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.49 
 
 
158 aa  89.7  1e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0594  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.73 
 
 
143 aa  88.2  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  3.95657e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1509  biopolymer transport exbD-related transmembrane protein  39.58 
 
 
138 aa  87.8  4e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.171101  normal  0.278773 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2484  putative biopolymer transport exbD-related transmembrane protein  41.3 
 
 
147 aa  88.2  4e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0200822  normal  0.641899 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1247  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.68 
 
 
140 aa  87  8e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2642  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.07 
 
 
147 aa  83.6  8e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333418  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4892  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.1 
 
 
144 aa  82.8  2e-15  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.310639 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0486  biopolymer transport protein, ExbD/TolR family  33.33 
 
 
134 aa  81.3  4e-15  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.244667  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0646  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.33 
 
 
134 aa  81.3  4e-15  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.419547  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1730  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.61 
 
 
132 aa  78.6  3e-14  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2304  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.06 
 
 
141 aa  77.8  5e-14  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0677093  normal  0.134165 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1555  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.06 
 
 
141 aa  77.8  5e-14  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.304522  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3154  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.61 
 
 
142 aa  77.4  6e-14  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3571  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.64 
 
 
141 aa  75.9  2e-13  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.161015  decreased coverage  0.00354496 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2948  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.79 
 
 
142 aa  75.5  2e-13  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1924  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.88 
 
 
144 aa  75.1  3e-13  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.645056  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2565  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.94 
 
 
141 aa  73.6  8e-13  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0403619  hitchhiker  0.00490818 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0455  biopolymer transport protein (ExbD2)  29.29 
 
 
134 aa  69.7  1e-11  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0057258  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1369  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.69 
 
 
133 aa  67  8e-11  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2155  biopolymer transport protein (ExbD2)  32.5 
 
 
136 aa  66.6  9e-11  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2392  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.33 
 
 
133 aa  64.3  5e-10  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.791616 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1847  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.64 
 
 
130 aa  62.4  2e-09  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.730316  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1506  biopolymer transport protein  29.71 
 
 
136 aa  62.4  2e-09  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.78844e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0273  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.99 
 
 
136 aa  62  2e-09  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4069  biopolymer transport protein ExbD/TolR  22.39 
 
 
135 aa  62.4  2e-09  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2305  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.29 
 
 
134 aa  62  3e-09  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0487  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.77 
 
 
137 aa  61.2  4e-09  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.181601  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1618  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.01 
 
 
136 aa  61.6  4e-09  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.272583  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3869  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.4 
 
 
136 aa  61.2  4e-09  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2941  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.81 
 
 
140 aa  61.2  5e-09  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000159512  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2417  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.78 
 
 
133 aa  60.8  6e-09  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.978308  normal  0.103563 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3973  biopolymer transport exbD protein  27.42 
 
 
136 aa  60.5  7e-09  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1866  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.52 
 
 
142 aa  59.7  1e-08  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.838345 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1460  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.89 
 
 
138 aa  59.7  1e-08  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0609  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.63 
 
 
136 aa  60.1  1e-08  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000633887  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2615  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.75 
 
 
218 aa  59.7  1e-08  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3007  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.25 
 
 
143 aa  60.1  1e-08  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1063  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.78 
 
 
135 aa  59.7  1e-08  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2475  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.93 
 
 
134 aa  58.2  4e-08  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.71842  hitchhiker  4.57301e-05 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2208  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.21 
 
 
136 aa  57.8  5e-08  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00626384 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2891  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.75 
 
 
135 aa  57.8  5e-08  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00140985 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3076  biopolymer transport protein ExbD/TolR  24.44 
 
 
134 aa  57.8  5e-08  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000935089  hitchhiker  1.53595e-05 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3905  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.77 
 
 
133 aa  57.8  6e-08  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.396754  normal  0.163087 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0915  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.15 
 
 
140 aa  57.4  7e-08  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.574244  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1805  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.4 
 
 
137 aa  57  9e-08  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.654076  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1736  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.06 
 
 
139 aa  56.6  1e-07  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.109286  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2237  biopolymer ExbD/TolR family transporter  30.77 
 
 
134 aa  56.6  1e-07  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.271991  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03432  Biopolymer transport protein  24.22 
 
 
135 aa  56.6  1e-07  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1239  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.78 
 
 
148 aa  56.6  1e-07  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.371549  normal  0.35298 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0560  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.98 
 
 
137 aa  56.2  1e-07  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.326497 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2428  biopolymer transport ExbD like protein  29.57 
 
 
148 aa  55.8  2e-07  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.303812 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00634  biopolymer transport protein  24.59 
 
 
135 aa  55.1  3e-07  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0438  biopolymer ExbD/TolR family transporter  29.01 
 
 
137 aa  55.1  3e-07  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.744335  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2817  biopolymer transport protein (ExbD2)  28.46 
 
 
135 aa  55.1  3e-07  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.276974  hitchhiker  1.82227e-06 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3142  biopolymer transport transmembrane protein, ExbD/TolR like  33.06 
 
 
139 aa  55.5  3e-07  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.421775  normal  0.0460891 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2066  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.61 
 
 
135 aa  55.5  3e-07  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3669  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.71 
 
 
127 aa  54.7  4e-07  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3116  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.13 
 
 
145 aa  54.7  4e-07  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.243499  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3053  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.06 
 
 
136 aa  54.7  4e-07  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1827  TonB system transport protein ExbD2  23.31 
 
 
134 aa  54.3  5e-07  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1656  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.46 
 
 
142 aa  54.7  5e-07  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.310193  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1173  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.52 
 
 
140 aa  54.3  5e-07  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.364458  normal  0.851984 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0453  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.47 
 
 
134 aa  53.9  7e-07  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00775346  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3106  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.36 
 
 
133 aa  53.9  7e-07  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0993721  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3016  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.36 
 
 
133 aa  53.9  7e-07  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>