95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_15570 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_2531  phage transcriptional regulator, AlpA  100 
 
 		 66 aa  137  7e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.334421  hitchhiker  0.000129846 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15570  hypothetical protein  100 
 
 		 66 aa  137  7e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000408648  unclonable  2.14199e-22 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2614  phage transcriptional regulator, AlpA  68.25 
 
 		 75 aa  93.2  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.317776 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3553  phage transcriptional regulator, AlpA  63.49 
 
 		 126 aa  91.3  4e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.654297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1182  phage transcriptional regulator, AlpA  63.49 
 
 		 72 aa  90.1  9e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.592067  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0630  DNA binding domain protein, excisionase family  65.52 
 
 		 93 aa  85.9  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.168372 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2286  DNA binding domain-containing protein  63.79 
 
 		 93 aa  85.1  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1172  phage transcriptional regulator, AlpA  65.52 
 
 		 93 aa  84.3  5e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0279  DNA binding domain-containing protein  64.91 
 
 		 89 aa  82  0.000000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.908043  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0665  excisionase/Xis, DNA-binding  55 
 
 		 73 aa  74.3  0.0000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.950953  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4254  phage transcriptional regulator, AlpA  57.14 
 
 		 62 aa  73.9  0.0000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.631275  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4598  DNA binding domain protein, excisionase family  54.39 
 
 		 76 aa  73.6  0.0000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4353  putative transcriptional regulator  58 
 
 		 74 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0156  DNA binding domain-containing protein  51.67 
 
 		 70 aa  73.2  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000704193 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01114  hypothetical protein  60.78 
 
 		 56 aa  72.4  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2780  phage transcriptional regulator, AlpA  60.42 
 
 		 57 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0923797  normal  0.386289 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0957  excision promoter, Xis  53.57 
 
 		 69 aa  69.3  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.392434  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0271  excisionase/Xis, DNA-binding  48.53 
 
 		 139 aa  67  0.00000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.000397414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1498  DNA binding domain protein, excisionase family  40.74 
 
 		 67 aa  58.9  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0810  DNA binding domain-containing protein  40.74 
 
 		 60 aa  58.2  0.00000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0378139 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0094  DNA binding domain-containing protein  49.06 
 
 		 87 aa  58.2  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0288586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1106  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 180 aa  55.8  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0674112  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1078  DNA-binding response regulator  42.86 
 
 		 180 aa  55.8  0.0000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000000063084  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1294  DNA-binding response regulator  42.86 
 
 		 180 aa  55.8  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000125664  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2677  DNA binding domain protein, excisionase family  42.59 
 
 		 248 aa  52.4  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000367572  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2438  DNA binding domain-containing protein  43.4 
 
 		 291 aa  51.6  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3695  putative helicase  45.65 
 
 		 676 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.783104  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0057  DNA binding domain protein, excisionase family  42 
 
 		 126 aa  49.7  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3301  phage transcriptional regulator, AlpA  31.75 
 
 		 84 aa  48.9  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1683  DNA binding domain protein, excisionase family  34.62 
 
 		 64 aa  48.5  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.629523  decreased coverage  0.0000560234 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6047  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  44.9 
 
 		 380 aa  48.5  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3430  putative transcriptional regulator  32.73 
 
 		 84 aa  47.8  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1923  phage transcriptional regulator, AlpA  44 
 
 		 65 aa  47.4  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.151509  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1079  DNA-binding protein/PTS system, IIA component  38.1 
 
 		 201 aa  47.4  0.00007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0484  DNA binding domain-containing protein  33.96 
 
 		 67 aa  47.4  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.111356  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3099  excision promoter, Xis  30.51 
 
 		 70 aa  46.6  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1862  putative transcriptional regulator  30.36 
 
 		 71 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.382901  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5502  DNA binding domain-containing protein  37.74 
 
 		 291 aa  45.4  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0662  DNA binding domain-containing protein  42.86 
 
 		 84 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.87984 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0669  excisionase/Xis, DNA-binding protein  42.86 
 
 		 84 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.873991  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0682  DNA binding domain-containing protein  42.86 
 
 		 84 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.160899  normal  0.175021 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1468  excisionase/Xis, DNA-binding  33.33 
 
 		 78 aa  45.1  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.118441  normal  0.471472 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8921  DNA binding domain protein, excisionase family  33.96 
 
 		 57 aa  44.7  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0131376  normal  0.135259 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2395  phosphoenolpyruvate-dependent sugar phosphotransferase system EIIA 2  33.96 
 
 		 235 aa  44.7  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3844  phage transcriptional regulator, AlpA  30.36 
 
 		 74 aa  44.3  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.279149 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0554  phage transcriptional regulator, AlpA  28.57 
 
 		 69 aa  43.9  0.0007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0612  phage transcriptional regulator, AlpA  34.55 
 
 		 66 aa  43.9  0.0007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274045  normal  0.0916726 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0533  DNA binding domain, excisionase family  43.14 
 
 		 61 aa  43.9  0.0008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000097622 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10510  hypothetical protein  40.48 
 
 		 78 aa  43.5  0.0008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7292  DNA binding domain-containing protein  36 
 
 		 76 aa  43.5  0.0009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.137944  normal  0.216575 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2745  DNA binding domain-containing protein  47.83 
 
 		 300 aa  43.5  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3717  DNA binding domain protein, excisionase family  38.78 
 
 		 307 aa  43.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.222458  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1174  phage transcriptional regulator, AlpA  29.82 
 
 		 65 aa  43.5  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.195229  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0661  DNA binding domain protein, excisionase family  34.69 
 
 		 80 aa  43.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0074  DNA binding domain-containing protein  40.48 
 
 		 90 aa  43.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1004  DNA binding domain protein, excisionase family  34.69 
 
 		 82 aa  42.4  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4450  DNA binding domain protein, excisionase family  42.22 
 
 		 67 aa  42.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0812  DNA binding domain protein, excisionase family  38.89 
 
 		 308 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0537  hypothetical protein  42.22 
 
 		 67 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0187  DNA binding domain-containing protein  35.59 
 
 		 306 aa  42.4  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5604  hypothetical protein  38.33 
 
 		 68 aa  42.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3033  excisionase/Xis, DNA-binding  36.36 
 
 		 304 aa  42.7  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.627333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2760  putative transcriptional regulator  34.78 
 
 		 67 aa  42.4  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000466966 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04063  VrlI like protein  34.78 
 
 		 65 aa  42.7  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4168  DNA binding domain protein, excisionase family  29.63 
 
 		 80 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0251  excisionase family DNA binding domain-containing protein  42.22 
 
 		 67 aa  42.7  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.23187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0229  putative molybdopterin biosynthesis protein  37.29 
 
 		 306 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0975  DNA binding domain-containing protein  34.48 
 
 		 76 aa  42  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.339599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2705  excisionase/Xis, DNA-binding  32.61 
 
 		 77 aa  41.6  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.34571  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5098  periplasmic molybdate-binding protein  37.29 
 
 		 306 aa  41.2  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2228  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  42 
 
 		 245 aa  41.2  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.193382  normal  0.0677009 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2195  phage transcriptional regulator, AlpA  35.56 
 
 		 70 aa  41.2  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.248245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3682  prophage CP4-57 regulatory protein (AlpA)  32.61 
 
 		 83 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0403  DNA binding domain-containing protein  35.85 
 
 		 118 aa  40.8  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00109148  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1001  DNA-binding excisionase/Xis  40.35 
 
 		 290 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1738  DNA binding domain-containing protein  39.13 
 
 		 272 aa  40.8  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0838  DNA binding domain-containing protein  41.86 
 
 		 90 aa  40.8  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.38625  normal  0.385284 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1532  DNA binding domain-containing protein  40 
 
 		 201 aa  40.8  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  unclonable  0.0000000035753  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2133  DNA binding domain-containing protein  41.3 
 
 		 252 aa  40.8  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1908  excisionase/Xis, DNA-binding  38.78 
 
 		 307 aa  40.8  0.006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3416  DNA binding domain protein, excisionase family  36.73 
 
 		 64 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3263  excision promoter, Xis  31.37 
 
 		 75 aa  40.8  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.174244 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0912  DNA binding domain protein, excisionase family  40.54 
 
 		 78 aa  40.4  0.008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01890  DNA-binding protein, excisionase family  36.54 
 
 		 321 aa  40.4  0.008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0766202 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0194  molybdate-binding protein  35.59 
 
 		 315 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0204  molybdopterin biosynthesis protein  35.59 
 
 		 306 aa  40.4  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02760  DNA-binding protein, excisionase family  33.33 
 
 		 71 aa  40.4  0.008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0205  molybdopterin biosynthesis protein  35.59 
 
 		 306 aa  40.4  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0222  putative molybdopterin biosynthesis protein  35.59 
 
 		 306 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0912  excision promoter, Xis  34.48 
 
 		 76 aa  40  0.009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.5021 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0190  molybdate-binding protein  35.59 
 
 		 315 aa  40.4  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5834  phage transcriptional regulator, AlpA  38.46 
 
 		 78 aa  40  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.577316 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1575  DNA binding domain-containing protein  39.29 
 
 		 293 aa  40  0.01  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.410844  hitchhiker  0.00561125 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4820  DNA binding domain-containing protein  36.36 
 
 		 301 aa  40  0.01  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2744  DNA binding domain protein, excisionase family  36.17 
 
 		 78 aa  40  0.01  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.587836  hitchhiker  0.00613887 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>